data_8J7B
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_model_server_result.job_id            1Dme37cQq4z5zOqOysmP3w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 10:56:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8j7b 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"VB","auth_seq_id":619}' 
#
_entry.id    8J7B 
#
_exptl.entry_id    8J7B 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          23 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE 
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_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.entry_id                 8J7B 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      16 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 23 VB N N 
? 23 XB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O TRP 48 1 TRP 48 1_555 Q MG CHL . 1 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 87 1 GLU 87 1_555 R MG CLA . 1 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 153 1 GLU 153 1_555 X MG CLA . 1 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc4 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O3 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc5 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O4 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? 
metalc ? metalc6 B O TRP 55 2 TRP 55 1_555 JA MG CHL . 2 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 94 2 GLU 94 1_555 PA MG CLA . 2 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 168 2 ASP 168 1_555 HA MG CHL . 2 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc9 B OE1 GLN 226 2 GLN 226 1_555 LA MG CLA . 2 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? 
metalc ? metalc10 VA MG CLA . 2 CLA 610 1_555 UA O5 LHG . 2 LHG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc11 D O TRP 57 4 TRP 57 1_555 PB MG CLA . 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc12 D OE2 GLU 96 4 GLU 96 1_555 OB MG CLA . 4 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
metalc ? metalc13 D OE1 GLU 154 4 GLU 154 1_555 SB MG CLA . 4 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc14 D OD2 ASP 170 4 ASP 170 1_555 RB MG CHL . 4 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc15 E OE1 GLN 121 A GLN 121 1_555 VC MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc16 E O THR 495 A THR 495 1_555 IE MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc17 ED MG CLA . A CLA 845 1_555 JD O4 LHG . A LHG 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? 
metalc ? metalc18 F OE1 GLN 53 B GLN 53 1_555 MF MG CLA . B CLA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc19 F OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 YE MG CLA . B CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc20 CF MG CLA . B CLA 841 1_555 LF O4 LHG . B LHG 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc21 J O ASN 141 F ASN 141 1_555 LG MG CLA . F CLA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? 
metalc ? metalc22 K OD2 ASP 123 G ASP 123 1_555 SG MG CLA . G CLA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
metalc ? metalc23 O O LEU 72 K LEU 72 1_555 XG MG CLA . K CLA 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc24 O OD2 ASP 97 K ASP 97 1_555 YG MG CLA . K CLA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? 
#
_chem_comp.formula           'C45 H86 O10' 
_chem_comp.formula_weight    787.158 
_chem_comp.id                LMG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 LMG sing 1009 n n 
C1 C2 LMG sing 1010 n n 
C1 O6 LMG sing 1011 n n 
C1 HC1 LMG sing 1012 n n 
O1 C7 LMG sing 1013 n n 
C2 O2 LMG sing 1014 n n 
C2 C3 LMG sing 1015 n n 
C2 HC2 LMG sing 1016 n n 
O2 HO2 LMG sing 1017 n n 
C3 O3 LMG sing 1018 n n 
C3 C4 LMG sing 1019 n n 
C3 HC3 LMG sing 1020 n n 
O3 HO3 LMG sing 1021 n n 
C4 O4 LMG sing 1022 n n 
C4 C5 LMG sing 1023 n n 
C4 HC4 LMG sing 1024 n n 
O4 HO4 LMG sing 1025 n n 
C5 C6 LMG sing 1026 n n 
C5 O6 LMG sing 1027 n n 
C5 HC5 LMG sing 1028 n n 
O5 C6 LMG sing 1029 n n 
O5 HO5 LMG sing 1030 n n 
C6 HC61 LMG sing 1031 n n 
C6 HC62 LMG sing 1032 n n 
C7 C8 LMG sing 1033 n n 
C7 HC71 LMG sing 1034 n n 
C7 HC72 LMG sing 1035 n n 
C8 C9 LMG sing 1036 n n 
C8 O7 LMG sing 1037 n n 
C8 HC8 LMG sing 1038 n n 
C9 O8 LMG sing 1039 n n 
C9 HC91 LMG sing 1040 n n 
C9 HC92 LMG sing 1041 n n 
O7 C10 LMG sing 1042 n n 
C10 O9 LMG doub 1043 n n 
C10 C11 LMG sing 1044 n n 
C11 C12 LMG sing 1045 n n 
C11 H111 LMG sing 1046 n n 
C11 H112 LMG sing 1047 n n 
C12 C13 LMG sing 1048 n n 
C12 H121 LMG sing 1049 n n 
C12 H122 LMG sing 1050 n n 
C13 C14 LMG sing 1051 n n 
C13 H131 LMG sing 1052 n n 
C13 H132 LMG sing 1053 n n 
C14 C15 LMG sing 1054 n n 
C14 H141 LMG sing 1055 n n 
C14 H142 LMG sing 1056 n n 
C15 C16 LMG sing 1057 n n 
C15 H151 LMG sing 1058 n n 
C15 H152 LMG sing 1059 n n 
C16 C17 LMG sing 1060 n n 
C16 H161 LMG sing 1061 n n 
C16 H162 LMG sing 1062 n n 
C17 C18 LMG sing 1063 n n 
C17 H171 LMG sing 1064 n n 
C17 H172 LMG sing 1065 n n 
C18 C19 LMG sing 1066 n n 
C18 H181 LMG sing 1067 n n 
C18 H182 LMG sing 1068 n n 
C19 C20 LMG sing 1069 n n 
C19 H191 LMG sing 1070 n n 
C19 H192 LMG sing 1071 n n 
C20 C21 LMG sing 1072 n n 
C20 H201 LMG sing 1073 n n 
C20 H202 LMG sing 1074 n n 
C21 C22 LMG sing 1075 n n 
C21 H211 LMG sing 1076 n n 
C21 H212 LMG sing 1077 n n 
C22 C23 LMG sing 1078 n n 
C22 H221 LMG sing 1079 n n 
C22 H222 LMG sing 1080 n n 
C23 C24 LMG sing 1081 n n 
C23 H231 LMG sing 1082 n n 
C23 H232 LMG sing 1083 n n 
C24 C25 LMG sing 1084 n n 
C24 H241 LMG sing 1085 n n 
C24 H242 LMG sing 1086 n n 
C25 C26 LMG sing 1087 n n 
C25 H251 LMG sing 1088 n n 
C25 H252 LMG sing 1089 n n 
C26 C27 LMG sing 1090 n n 
C26 H261 LMG sing 1091 n n 
C26 H262 LMG sing 1092 n n 
C27 H271 LMG sing 1093 n n 
C27 H272 LMG sing 1094 n n 
C27 H273 LMG sing 1095 n n 
O8 C28 LMG sing 1096 n n 
C28 O10 LMG doub 1097 n n 
C28 C29 LMG sing 1098 n n 
C29 C30 LMG sing 1099 n n 
C29 H291 LMG sing 1100 n n 
C29 H292 LMG sing 1101 n n 
C30 C31 LMG sing 1102 n n 
C30 H301 LMG sing 1103 n n 
C30 H302 LMG sing 1104 n n 
C31 C32 LMG sing 1105 n n 
C31 H311 LMG sing 1106 n n 
C31 H312 LMG sing 1107 n n 
C32 C33 LMG sing 1108 n n 
C32 H321 LMG sing 1109 n n 
C32 H322 LMG sing 1110 n n 
C33 C34 LMG sing 1111 n n 
C33 H331 LMG sing 1112 n n 
C33 H332 LMG sing 1113 n n 
C34 C35 LMG sing 1114 n n 
C34 H341 LMG sing 1115 n n 
C34 H342 LMG sing 1116 n n 
C35 C36 LMG sing 1117 n n 
C35 H351 LMG sing 1118 n n 
C35 H352 LMG sing 1119 n n 
C36 C37 LMG sing 1120 n n 
C36 H361 LMG sing 1121 n n 
C36 H362 LMG sing 1122 n n 
C37 C38 LMG sing 1123 n n 
C37 H371 LMG sing 1124 n n 
C37 H372 LMG sing 1125 n n 
C38 C39 LMG sing 1126 n n 
C38 H381 LMG sing 1127 n n 
C38 H382 LMG sing 1128 n n 
C39 C40 LMG sing 1129 n n 
C39 H391 LMG sing 1130 n n 
C39 H392 LMG sing 1131 n n 
C40 C41 LMG sing 1132 n n 
C40 H401 LMG sing 1133 n n 
C40 H402 LMG sing 1134 n n 
C41 C42 LMG sing 1135 n n 
C41 H411 LMG sing 1136 n n 
C41 H412 LMG sing 1137 n n 
C42 C43 LMG sing 1138 n n 
C42 H421 LMG sing 1139 n n 
C42 H422 LMG sing 1140 n n 
C43 C44 LMG sing 1141 n n 
C43 H431 LMG sing 1142 n n 
C43 H432 LMG sing 1143 n n 
C44 C45 LMG sing 1144 n n 
C44 H441 LMG sing 1145 n n 
C44 H442 LMG sing 1146 n n 
C45 H451 LMG sing 1147 n n 
C45 H452 LMG sing 1148 n n 
C45 H453 LMG sing 1149 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8J7B 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Q 17 CHL 1 1 601 601 CHL CHL . 
R 18 CLA 1 1 602 602 CLA CLA . 
S 18 CLA 1 1 603 603 CLA CLA . 
T 18 CLA 1 1 604 604 CLA CLA . 
U 18 CLA 1 1 605 605 CLA CLA . 
V 17 CHL 1 1 606 606 CHL CHL . 
W 18 CLA 1 1 607 607 CLA CLA . 
X 18 CLA 1 1 608 608 CLA CLA . 
Y 18 CLA 1 1 609 609 CLA CLA . 
Z 18 CLA 1 1 610 610 CLA CLA . 
AA 18 CLA 1 1 611 611 CLA CLA . 
BA 18 CLA 1 1 612 612 CLA CLA . 
CA 18 CLA 1 1 613 613 CLA CLA . 
DA 19 XAT 1 1 614 614 XAT XAT . 
EA 20 LHG 1 1 615 615 LHG LHG . 
FA 21 LUT 1 1 616 616 LUT LUT . 
GA 17 CHL 2 1 605 605 CHL CHL . 
HA 17 CHL 2 1 615 615 CHL CHL . 
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