data_8J7B
#
_model_server_result.job_id            PVkbE-axy-GcyqLLAE_ieg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 19:30:00' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8j7b 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"VF","auth_seq_id":852}' 
#
_entry.id    8J7B 
#
_exptl.entry_id    8J7B 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              722.97 
_entity.id                          20 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8J7B 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8J7B 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      16 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 20 EA N N 
? 20 UA N N 
? 20 JD N N 
? 20 VD N N 
? 20 LF N N 
? 20 VF N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O TRP 48 1 TRP 48 1_555 Q MG CHL . 1 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 87 1 GLU 87 1_555 R MG CLA . 1 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 153 1 GLU 153 1_555 X MG CLA . 1 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc4 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O3 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc5 Z MG CLA . 1 CLA 610 1_555 EA O4 LHG . 1 LHG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? 
metalc ? metalc6 B O TRP 55 2 TRP 55 1_555 JA MG CHL . 2 CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 94 2 GLU 94 1_555 PA MG CLA . 2 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 168 2 ASP 168 1_555 HA MG CHL . 2 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc9 B OE1 GLN 226 2 GLN 226 1_555 LA MG CLA . 2 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? 
metalc ? metalc10 VA MG CLA . 2 CLA 610 1_555 UA O5 LHG . 2 LHG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc11 D O TRP 57 4 TRP 57 1_555 PB MG CLA . 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc12 D OE2 GLU 96 4 GLU 96 1_555 OB MG CLA . 4 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
metalc ? metalc13 D OE1 GLU 154 4 GLU 154 1_555 SB MG CLA . 4 CLA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc14 D OD2 ASP 170 4 ASP 170 1_555 RB MG CHL . 4 CHL 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc15 E OE1 GLN 121 A GLN 121 1_555 VC MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc16 E O THR 495 A THR 495 1_555 IE MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc17 ED MG CLA . A CLA 845 1_555 JD O4 LHG . A LHG 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? 
metalc ? metalc18 F OE1 GLN 53 B GLN 53 1_555 MF MG CLA . B CLA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc19 F OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 YE MG CLA . B CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc20 CF MG CLA . B CLA 841 1_555 LF O4 LHG . B LHG 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc21 J O ASN 141 F ASN 141 1_555 LG MG CLA . F CLA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? 
metalc ? metalc22 K OD2 ASP 123 G ASP 123 1_555 SG MG CLA . G CLA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
metalc ? metalc23 O O LEU 72 K LEU 72 1_555 XG MG CLA . K CLA 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc24 O OD2 ASP 97 K ASP 97 1_555 YG MG CLA . K CLA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? 
#
_chem_comp.formula           'C38 H75 O10 P' 
_chem_comp.formula_weight    722.97 
_chem_comp.id                LHG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 C1 LHG sing 886 n n 
O1 HO1 LHG sing 887 n n 
C1 C2 LHG sing 888 n n 
C1 HC11 LHG sing 889 n n 
C1 HC12 LHG sing 890 n n 
C2 O2 LHG sing 891 n n 
C2 C3 LHG sing 892 n n 
C2 HC2 LHG sing 893 n n 
O2 H02 LHG sing 894 n n 
C3 O3 LHG sing 895 n n 
C3 HC31 LHG sing 896 n n 
C3 HC32 LHG sing 897 n n 
O3 P LHG sing 898 n n 
P O4 LHG sing 899 n n 
P O5 LHG doub 900 n n 
P O6 LHG sing 901 n n 
O4 HO4 LHG sing 902 n n 
O6 C4 LHG sing 903 n n 
C4 C5 LHG sing 904 n n 
C4 HC41 LHG sing 905 n n 
C4 HC42 LHG sing 906 n n 
C5 C6 LHG sing 907 n n 
C5 O7 LHG sing 908 n n 
C5 HC5 LHG sing 909 n n 
C6 O8 LHG sing 910 n n 
C6 HC61 LHG sing 911 n n 
C6 HC62 LHG sing 912 n n 
O7 C7 LHG sing 913 n n 
C7 O9 LHG doub 914 n n 
C7 C8 LHG sing 915 n n 
C8 C9 LHG sing 916 n n 
C8 HC81 LHG sing 917 n n 
C8 HC82 LHG sing 918 n n 
C9 C10 LHG sing 919 n n 
C9 HC91 LHG sing 920 n n 
C9 HC92 LHG sing 921 n n 
C10 C11 LHG sing 922 n n 
C10 H101 LHG sing 923 n n 
C10 H102 LHG sing 924 n n 
O8 C23 LHG sing 925 n n 
C23 O10 LHG doub 926 n n 
C23 C24 LHG sing 927 n n 
C24 C25 LHG sing 928 n n 
C24 H241 LHG sing 929 n n 
C24 H242 LHG sing 930 n n 
C11 C12 LHG sing 931 n n 
C11 H111 LHG sing 932 n n 
C11 H112 LHG sing 933 n n 
C12 C13 LHG sing 934 n n 
C12 H121 LHG sing 935 n n 
C12 H122 LHG sing 936 n n 
C13 C14 LHG sing 937 n n 
C13 H131 LHG sing 938 n n 
C13 H132 LHG sing 939 n n 
C14 C15 LHG sing 940 n n 
C14 H141 LHG sing 941 n n 
C14 H142 LHG sing 942 n n 
C15 C16 LHG sing 943 n n 
C15 H151 LHG sing 944 n n 
C15 H152 LHG sing 945 n n 
C16 C17 LHG sing 946 n n 
C16 H161 LHG sing 947 n n 
C16 H162 LHG sing 948 n n 
C17 C18 LHG sing 949 n n 
C17 H171 LHG sing 950 n n 
C17 H172 LHG sing 951 n n 
C18 C19 LHG sing 952 n n 
C18 H181 LHG sing 953 n n 
C18 H182 LHG sing 954 n n 
C19 C20 LHG sing 955 n n 
C19 H191 LHG sing 956 n n 
C19 H192 LHG sing 957 n n 
C20 C21 LHG sing 958 n n 
C20 H201 LHG sing 959 n n 
C20 H202 LHG sing 960 n n 
C21 C22 LHG sing 961 n n 
C21 H211 LHG sing 962 n n 
C21 H212 LHG sing 963 n n 
C22 H221 LHG sing 964 n n 
C22 H222 LHG sing 965 n n 
C22 H223 LHG sing 966 n n 
C25 C26 LHG sing 967 n n 
C25 H251 LHG sing 968 n n 
C25 H252 LHG sing 969 n n 
C26 C27 LHG sing 970 n n 
C26 H261 LHG sing 971 n n 
C26 H262 LHG sing 972 n n 
C27 C28 LHG sing 973 n n 
C27 H271 LHG sing 974 n n 
C27 H272 LHG sing 975 n n 
C28 C29 LHG sing 976 n n 
C28 H281 LHG sing 977 n n 
C28 H282 LHG sing 978 n n 
C29 C30 LHG sing 979 n n 
C29 H291 LHG sing 980 n n 
C29 H292 LHG sing 981 n n 
C30 C31 LHG sing 982 n n 
C30 H301 LHG sing 983 n n 
C30 H302 LHG sing 984 n n 
C31 C32 LHG sing 985 n n 
C31 H311 LHG sing 986 n n 
C31 H312 LHG sing 987 n n 
C32 C33 LHG sing 988 n n 
C32 H321 LHG sing 989 n n 
C32 H322 LHG sing 990 n n 
C33 C34 LHG sing 991 n n 
C33 H331 LHG sing 992 n n 
C33 H332 LHG sing 993 n n 
C34 C35 LHG sing 994 n n 
C34 H341 LHG sing 995 n n 
C34 H342 LHG sing 996 n n 
C35 C36 LHG sing 997 n n 
C35 H351 LHG sing 998 n n 
C35 H352 LHG sing 999 n n 
C36 C37 LHG sing 1000 n n 
C36 H361 LHG sing 1001 n n 
C36 H362 LHG sing 1002 n n 
C37 C38 LHG sing 1003 n n 
C37 H371 LHG sing 1004 n n 
C37 H372 LHG sing 1005 n n 
C38 H381 LHG sing 1006 n n 
C38 H382 LHG sing 1007 n n 
C38 H383 LHG sing 1008 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8J7B 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Q 17 CHL 1 1 601 601 CHL CHL . 
R 18 CLA 1 1 602 602 CLA CLA . 
S 18 CLA 1 1 603 603 CLA CLA . 
T 18 CLA 1 1 604 604 CLA CLA . 
U 18 CLA 1 1 605 605 CLA CLA . 
V 17 CHL 1 1 606 606 CHL CHL . 
W 18 CLA 1 1 607 607 CLA CLA . 
X 18 CLA 1 1 608 608 CLA CLA . 
Y 18 CLA 1 1 609 609 CLA CLA . 
Z 18 CLA 1 1 610 610 CLA CLA . 
AA 18 CLA 1 1 611 611 CLA CLA . 
BA 18 CLA 1 1 612 612 CLA CLA . 
CA 18 CLA 1 1 613 613 CLA CLA . 
DA 19 XAT 1 1 614 614 XAT XAT . 
EA 20 LHG 1 1 615 615 LHG LHG . 
FA 21 LUT 1 1 616 616 LUT LUT . 
GA 17 CHL 2 1 605 605 CHL CHL . 
HA 17 CHL 2 1 615 615 CHL CHL . 
IA 18 CLA 2 1 611 611 CLA CLA . 
JA 17 CHL 2 1 601 601 CHL CHL . 
KA 21 LUT 2 1 616 616 LUT LUT . 
LA 18 CLA 2 1 612 612 CLA CLA . 
MA 21 LUT 2 1 619 619 LUT LUT . 
NA 17 CHL 2 1 606 606 CHL CHL . 
OA 18 CLA 2 1 609 609 CLA CLA . 
PA 18 CLA 2 1 602 602 CLA CLA . 
QA 17 CHL 2 1 607 607 CHL CHL . 
RA 18 CLA 2 1 604 604 CLA CLA . 
SA 19 XAT 2 1 617 617 XAT XAT . 
TA 18 CLA 2 1 613 613 CLA CLA . 
UA 20 LHG 2 1 618 618 LHG LHG . 
VA 18 CLA 2 1 610 610 CLA CLA . 
WA 18 CLA 2 1 608 608 CLA CLA . 
XA 18 CLA 2 1 603 603 CLA CLA . 
YA 18 CLA 3 1 605 605 CLA CLA . 
ZA 17 CHL 3 1 606 606 CHL CHL . 
AB 18 CLA 3 1 611 611 CLA CLA . 
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