data_8JB0 # _model_server_result.job_id MgTDBEt7X8YBcjsUD0rN7g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 11:51:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8jb0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CB","auth_seq_id":202}' # _entry.id 8JB0 # _exptl.entry_id 8JB0 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 55.845 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 36 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8JB0 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8JB0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N ? 2 HA N N ? 2 IA N N ? 2 JA N N ? 2 KA N N ? 2 LA N N ? 2 MA N N ? 2 NA N N ? 2 OA N N ? 2 PA N N ? 2 QA N N ? 2 RA N N ? 2 SA N N ? 2 TA N N ? 2 UA N N ? 2 VA N N ? 2 WA N N ? 2 XA N N ? 2 YA N N ? 2 ZA N N ? 2 AB N N ? 2 BB N N ? 2 CB N N ? 2 DB N N ? 2 EB N N ? 2 FB N N ? 2 GB N N ? 2 HB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 18 A GLU 18 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 18 A GLU 18 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 51 A GLU 51 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 127 A GLU 127 1_555 Y FE FE2 . A FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc5 D OE2 GLU 18 D GLU 18 1_555 DA FE FE2 . D FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc6 D OE1 GLU 51 D GLU 51 1_555 DA FE FE2 . D FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? metalc ? metalc7 F OE2 GLU 18 E GLU 18 1_555 GA FE FE2 . E FE2 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc8 F OE2 GLU 127 E GLU 127 1_555 GA FE FE2 . E FE2 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc9 G OE1 GLU 18 G GLU 18 1_555 HA FE FE2 . G FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc10 G OE1 GLU 51 G GLU 51 1_555 HA FE FE2 . G FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc ? metalc11 I OE1 GLU 18 I GLU 18 1_555 LA FE FE2 . I FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? metalc ? metalc12 I OE2 GLU 18 I GLU 18 1_555 LA FE FE2 . I FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc ? metalc13 I OE2 GLU 127 I GLU 127 1_555 LA FE FE2 . I FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc14 J OE2 GLU 18 J GLU 18 1_555 MA FE FE2 . J FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc15 J OE2 GLU 127 J GLU 127 1_555 MA FE FE2 . J FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc ? metalc16 K OE1 GLU 18 K GLU 18 1_555 NA FE FE2 . K FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc17 K OE2 GLU 18 K GLU 18 1_555 NA FE FE2 . K FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? metalc ? metalc18 K OE1 GLU 51 K GLU 51 1_555 NA FE FE2 . K FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc19 K OE2 GLU 51 K GLU 51 1_555 NA FE FE2 . K FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc ? metalc20 K OE2 GLU 127 K GLU 127 1_555 NA FE FE2 . K FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? metalc ? metalc21 L OE1 GLU 18 L GLU 18 1_555 PA FE FE2 . L FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc ? metalc22 L OE2 GLU 18 L GLU 18 1_555 PA FE FE2 . L FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc ? metalc23 L OE1 GLU 51 L GLU 51 1_555 PA FE FE2 . L FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc24 L ND1 HIS 54 L HIS 54 1_555 PA FE FE2 . L FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc25 N OE1 GLU 18 N GLU 18 1_555 SA FE FE2 . N FE2 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? metalc ? metalc26 N OE2 GLU 127 N GLU 127 1_555 SA FE FE2 . N FE2 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc27 O OE1 GLU 18 O GLU 18 1_555 TA FE FE2 . O FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? metalc ? metalc28 O OE2 GLU 127 O GLU 127 1_555 TA FE FE2 . O FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc29 P OE1 GLU 18 P GLU 18 1_555 VA FE FE2 . P FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc30 P OE2 GLU 127 P GLU 127 1_555 VA FE FE2 . P FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc ? metalc31 Q OE1 GLU 47 Q GLU 47 1_555 WA FE FE2 . Q FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc32 S OE1 GLU 18 S GLU 18 1_555 ZA FE FE2 . S FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? metalc ? metalc33 S OE2 GLU 18 S GLU 18 1_555 ZA FE FE2 . S FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc34 S OE1 GLU 51 S GLU 51 1_555 ZA FE FE2 . S FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc ? metalc35 S OE2 GLU 127 S GLU 127 1_555 ZA FE FE2 . S FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.69 ? metalc ? metalc36 T OE1 GLU 51 T GLU 51 1_555 BB FE FE2 . T FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc37 U OE2 GLU 51 U GLU 51 1_555 DB FE FE2 . U FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? metalc ? metalc38 V OE1 GLU 18 V GLU 18 1_555 EB FE FE2 . V FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc39 V OE2 GLU 18 V GLU 18 1_555 EB FE FE2 . V FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc40 V OE1 GLU 51 V GLU 51 1_555 EB FE FE2 . V FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? metalc ? metalc41 V OE2 GLU 127 V GLU 127 1_555 EB FE FE2 . V FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? metalc ? metalc42 W OE1 GLU 18 W GLU 18 1_555 FB FE FE2 . W FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc43 W OE2 GLU 18 W GLU 18 1_555 FB FE FE2 . W FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc44 W OE1 GLU 51 W GLU 51 1_555 FB FE FE2 . W FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc45 W OE2 GLU 127 W GLU 127 1_555 FB FE FE2 . W FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc46 X OE2 GLU 18 X GLU 18 1_555 HB FE FE2 . X FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc47 X OE2 GLU 51 X GLU 51 1_555 HB FE FE2 . X FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc ? metalc48 X OE2 GLU 127 X GLU 127 1_555 HB FE FE2 . X FE2 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? # _chem_comp.formula 'Fe 2' _chem_comp.formula_weight 55.845 _chem_comp.id FE2 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8JB0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 2 FE2 A 1 201 201 FE2 FE2 . Z 2 FE2 A 1 202 202 FE2 FE2 . AA 2 FE2 B 1 200 200 FE2 FE2 . BA 2 FE2 C 1 201 201 FE2 FE2 . CA 2 FE2 C 1 202 202 FE2 FE2 . DA 2 FE2 D 1 201 302 FE2 FE2 . EA 2 FE2 F 1 201 201 FE2 FE2 . FA 2 FE2 E 1 201 202 FE2 FE2 . GA 2 FE2 E 1 202 201 FE2 FE2 . HA 2 FE2 G 1 201 201 FE2 FE2 . IA 2 FE2 G 1 202 202 FE2 FE2 . JA 2 FE2 H 1 201 201 FE2 FE2 . KA 2 FE2 H 1 202 202 FE2 FE2 . LA 2 FE2 I 1 201 201 FE2 FE2 . MA 2 FE2 J 1 201 201 FE2 FE2 . NA 2 FE2 K 1 201 302 FE2 FE2 . OA 2 FE2 K 1 202 303 FE2 FE2 . PA 2 FE2 L 1 201 201 FE2 FE2 . QA 2 FE2 M 1 201 201 FE2 FE2 . RA 2 FE2 M 1 202 202 FE2 FE2 . SA 2 FE2 N 1 200 200 FE2 FE2 . TA 2 FE2 O 1 201 201 FE2 FE2 . UA 2 FE2 O 1 202 202 FE2 FE2 . VA 2 FE2 P 1 201 201 FE2 FE2 . WA 2 FE2 Q 1 201 201 FE2 FE2 . XA 2 FE2 R 1 201 202 FE2 FE2 . YA 2 FE2 R 1 202 302 FE2 FE2 . ZA 2 FE2 S 1 201 201 FE2 FE2 . AB 2 FE2 S 1 202 202 FE2 FE2 . BB 2 FE2 T 1 201 201 FE2 FE2 . CB 2 FE2 T 1 202 202 FE2 FE2 . DB 2 FE2 U 1 201 201 FE2 FE2 . EB 2 FE2 V 1 201 201 FE2 FE2 . FB 2 FE2 W 1 201 201 FE2 FE2 . GB 2 FE2 W 1 202 202 FE2 FE2 . HB 2 FE2 X 1 201 201 FE2 FE2 . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol FE _atom_site.label_atom_id FE _atom_site.label_comp_id FE2 _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id CB _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 79.934 _atom_site.Cartn_y 110.221 _atom_site.Cartn_z 138.932 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 137.88 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id FE _atom_site.auth_comp_id FE2 _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id T _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 57 _model_server_stats.query_time_ms 298 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #