data_8JYO # _model_server_result.job_id e6nUuPO7wbspmEM7boG3AA _model_server_result.datetime_utc '2025-07-19 05:09:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8jyo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"EA","auth_seq_id":1313}' # _entry.id 8JYO # _exptl.entry_id 8JYO _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 42 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8JYO _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8JYO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 S N N ? 6 T N N ? 6 U N N ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N ? 6 GB N N ? 6 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 5 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 F 1 NAG A 1312 NAG 3 n F NAG 2 F 2 NAG A 1313 NAG 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 1314 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 1315 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG B 1312 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG B 1313 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG B 1314 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG B 1315 NAG 3 n J NAG 1 J 1 NAG C 1303 NAG 3 n J NAG 2 J 2 NAG C 1320 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG C 1312 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG C 1313 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG C 1314 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG C 1315 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG E 704 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG E 715 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG E 705 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG E 706 NAG 4 n N BMA 3 N 3 BMA E 707 BMA 5 n O NAG 1 O 1 NAG E 709 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG E 710 NAG 5 n O BMA 3 O 3 BMA E 711 BMA 5 n O MAN 4 O 4 MAN E 712 MAN 5 n O MAN 5 O 5 MAN E 713 MAN 3 n P NAG 1 P 1 NAG D 704 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG D 715 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG D 705 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG D 706 NAG 4 n Q BMA 3 Q 3 BMA D 707 BMA 5 n R NAG 1 R 1 NAG D 709 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG D 710 NAG 5 n R BMA 3 R 3 BMA D 711 BMA 5 n R MAN 4 R 4 MAN D 712 MAN 5 n R MAN 5 R 5 MAN D 713 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 127 A CYS 131 1_555 A SG CYS 161 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 286 A CYS 291 1_555 A SG CYS 296 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 331 A CYS 336 1_555 A SG CYS 356 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 374 A CYS 379 1_555 A SG CYS 427 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 386 A CYS 391 1_555 A SG CYS 520 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 475 A CYS 480 1_555 A SG CYS 483 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 533 A CYS 538 1_555 A SG CYS 585 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 612 A CYS 617 1_555 A SG CYS 644 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 657 A CYS 662 1_555 A SG CYS 666 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 733 A CYS 738 1_555 A SG CYS 755 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 738 A CYS 743 1_555 A SG CYS 744 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1027 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1038 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1077 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1121 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 127 B CYS 131 1_555 B SG CYS 161 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 286 B CYS 291 1_555 B SG CYS 296 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 331 B CYS 336 1_555 B SG CYS 356 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 374 B CYS 379 1_555 B SG CYS 427 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 386 B CYS 391 1_555 B SG CYS 520 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 475 B CYS 480 1_555 B SG CYS 483 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 533 B CYS 538 1_555 B SG CYS 585 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 612 B CYS 617 1_555 B SG CYS 644 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 657 B CYS 662 1_555 B SG CYS 666 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 733 B CYS 738 1_555 B SG CYS 755 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 738 B CYS 743 1_555 B SG CYS 744 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1027 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1038 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1077 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1121 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 127 C CYS 131 1_555 C SG CYS 161 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 286 C CYS 291 1_555 C SG CYS 296 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 331 C CYS 336 1_555 C SG CYS 356 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 374 C CYS 379 1_555 C SG CYS 427 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 386 C CYS 391 1_555 C SG CYS 520 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 533 C CYS 538 1_555 C SG CYS 585 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 612 C CYS 617 1_555 C SG CYS 644 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 657 C CYS 662 1_555 C SG CYS 666 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 733 C CYS 738 1_555 C SG CYS 755 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 738 C CYS 743 1_555 C SG CYS 744 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 1027 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1038 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1077 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1121 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 115 E CYS 133 1_555 D SG CYS 123 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 326 E CYS 344 1_555 D SG CYS 343 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 512 E CYS 530 1_555 D SG CYS 524 E CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 E SG CYS 115 D CYS 133 1_555 E SG CYS 123 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 326 D CYS 344 1_555 E SG CYS 343 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 512 D CYS 530 1_555 E SG CYS 524 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 57 A ASN 61 1_555 S C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 118 A ASN 122 1_555 T C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 160 A ASN 165 1_555 U C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 229 A ASN 234 1_555 V C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 277 A ASN 282 1_555 W C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 326 A ASN 331 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 338 A ASN 343 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 611 A ASN 616 1_555 X C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 652 A ASN 657 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 704 A ASN 709 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 712 A ASN 717 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 796 A ASN 801 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1069 A ASN 1074 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1093 A ASN 1098 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1129 A ASN 1134 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 118 B ASN 122 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 160 B ASN 165 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 229 B ASN 234 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 277 B ASN 282 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 326 B ASN 331 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 338 B ASN 343 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 611 B ASN 616 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 652 B ASN 657 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 704 B ASN 709 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 712 B ASN 717 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 796 B ASN 801 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1069 B ASN 1074 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1093 B ASN 1098 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 1129 B ASN 1134 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 57 C ASN 61 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 118 C ASN 122 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 160 C ASN 165 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 229 C ASN 234 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 277 C ASN 282 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 326 C ASN 331 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 611 C ASN 616 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 652 C ASN 657 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 704 C ASN 709 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 712 C ASN 717 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 796 C ASN 801 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 1069 C ASN 1074 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 1093 C ASN 1098 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 1129 C ASN 1134 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale44 D ND2 ASN 35 E ASN 53 1_555 EB C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale45 D ND2 ASN 72 E ASN 90 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale46 D ND2 ASN 85 E ASN 103 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale47 D ND2 ASN 304 E ASN 322 1_555 CB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale48 D ND2 ASN 414 E ASN 432 1_555 DB C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale49 D ND2 ASN 528 E ASN 546 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 35 D ASN 53 1_555 HB C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale51 E ND2 ASN 72 D ASN 90 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale52 E ND2 ASN 85 D ASN 103 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale53 E ND2 ASN 304 D ASN 322 1_555 FB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale54 E ND2 ASN 414 D ASN 432 1_555 GB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 528 D ASN 546 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale56 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale57 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale58 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale59 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale60 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale61 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale63 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale64 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale65 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale67 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale68 O O3 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 O O6 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale70 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale71 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale72 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale74 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale75 R O3 BMA . R BMA 3 1_555 R C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale76 R O6 BMA . R BMA 3 1_555 R C1 MAN . R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8JYO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 6 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . T 6 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . U 6 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . V 6 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . W 6 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . X 6 NAG A 1 1306 1309 NAG NAG . Y 6 NAG A 1 1307 1310 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 1308 1311 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 1309 1316 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 1310 1317 NAG NAG . CA 6 NAG A 1 1311 1319 NAG NAG . DA 6 NAG A 1 1312 1322 NAG NAG . EA 6 NAG A 1 1313 1323 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1301 1302 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1302 1303 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1303 1304 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1304 1305 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1305 1309 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1306 1310 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1307 1311 NAG NAG . MA 6 NAG B 1 1308 1316 NAG NAG . NA 6 NAG B 1 1309 1317 NAG NAG . OA 6 NAG B 1 1310 1319 NAG NAG . PA 6 NAG B 1 1311 1320 NAG NAG . QA 6 NAG B 1 1312 1323 NAG NAG . RA 6 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . SA 6 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . TA 6 NAG C 1 1303 1304 NAG NAG . UA 6 NAG C 1 1304 1305 NAG NAG . VA 6 NAG C 1 1305 1309 NAG NAG . WA 6 NAG C 1 1306 1310 NAG NAG . XA 6 NAG C 1 1307 1311 NAG NAG . YA 6 NAG C 1 1308 1316 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1309 1317 NAG NAG . AB 6 NAG C 1 1310 1319 NAG NAG . BB 6 NAG C 1 1311 1321 NAG NAG . CB 6 NAG E 1 701 703 NAG NAG . DB 6 NAG E 1 702 714 NAG NAG . EB 6 NAG E 1 703 716 NAG NAG . FB 6 NAG D 1 701 703 NAG NAG . GB 6 NAG D 1 702 714 NAG NAG . HB 6 NAG D 1 703 716 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . EA 6 201.262 147.208 243.25 1 158.02 ? C1 NAG 1313 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . EA 6 202.276 146.349 243.994 1 158.41 ? C2 NAG 1313 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . EA 6 201.739 144.932 244.16 1 159.19 ? C3 NAG 1313 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . EA 6 200.367 144.961 244.82 1 161.27 ? C4 NAG 1313 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . EA 6 199.429 145.903 244.067 1 160.78 ? C5 NAG 1313 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . EA 6 198.098 146.085 244.756 1 160.11 ? C6 NAG 1313 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . EA 6 204.718 146.596 243.909 1 157.87 ? C7 NAG 1313 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . EA 6 204.643 146.904 245.374 1 155.76 ? C8 NAG 1313 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . EA 6 203.555 146.336 243.302 1 157.4 ? N2 NAG 1313 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . EA 6 202.645 144.173 244.951 1 157.95 ? O3 NAG 1313 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . EA 6 199.806 143.653 244.83 1 159.98 ? O4 NAG 1313 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . EA 6 200.021 147.207 243.958 1 160.92 ? O5 NAG 1313 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . EA 6 197.506 144.834 245.078 1 159.65 ? O6 NAG 1313 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . EA 6 205.784 146.58 243.302 1 160.02 ? O7 NAG 1313 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 82 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 49 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #