data_8K0W # _model_server_result.job_id dKfp8NvcP8_fUEo1TAnC6g _model_server_result.datetime_utc '2025-07-27 17:25:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8k0w # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":107}' # _entry.id 8K0W # _exptl.entry_id 8K0W _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 8K0W _cell.length_a 50.117 _cell.length_b 50.117 _cell.length_c 50.81 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8K0W _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 32 2"' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id H _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 D NA NA . A NA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc2 A OP1 DA 15 A DA 15 1_555 F NA NA . A NA 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc3 A OP1 DA 17 A DA 17 1_555 C NA NA . A NA 102 3_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc4 A OP1 DG 21 A DG 21 1_555 C NA NA . A NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc5 A OP2 DT 22 A DT 22 1_555 C NA NA . A NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc6 C NA NA . A NA 102 1_555 I O HOH . A HOH 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc7 C NA NA . A NA 102 1_555 I O HOH . A HOH 244 2_544 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc8 C NA NA . A NA 102 1_555 I O HOH . A HOH 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc9 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 225 6_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc10 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc11 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc12 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc13 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 269 6_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc14 D NA NA . A NA 103 1_555 I O HOH . A HOH 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc15 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc16 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc17 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 246 4_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc18 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 248 4_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc19 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 252 4_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc20 E NA NA . A NA 104 1_555 I O HOH . A HOH 255 4_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc21 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 201 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc22 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 211 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc23 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 222 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc24 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 226 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc25 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc26 F NA NA . A NA 105 1_555 I O HOH . A HOH 251 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc27 G NA NA . A NA 106 1_555 I O HOH . A HOH 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc28 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc29 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc30 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? metalc ? metalc31 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? metalc ? metalc32 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 275 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? metalc ? metalc33 H MG MG . A MG 107 1_555 I O HOH . A HOH 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 DG 1 A DG 1 1_555 A N3 DC 29 A DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 DG 1 A DG 1 1_555 A O2 DC 29 A DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 DG 1 A DG 1 1_555 A N4 DC 29 A DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 DC 2 A DC 2 1_555 A N1 DG 28 A DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 DC 2 A DC 2 1_555 A O6 DG 28 A DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 DC 2 A DC 2 1_555 A N2 DG 28 A DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 DG 3 A DG 3 1_555 A N3 DC 27 A DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 DG 3 A DG 3 1_555 A O2 DC 27 A DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 DG 3 A DG 3 1_555 A N4 DC 27 A DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 DG 4 A DG 4 1_555 A N3 DC 26 A DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N2 DG 4 A DG 4 1_555 A O2 DC 26 A DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 A N4 DC 26 A DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog13 A N3 DT 5 A DT 5 1_555 A O6 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog14 A O2 DT 5 A DT 5 1_555 A N1 DG 25 A DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog15 A N7 DG 6 A DG 6 1_555 A N1 DG 19 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog16 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 A N2 DG 19 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 DG 6 A DG 6 1_555 A N3 DC 24 A DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 A O2 DC 24 A DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 A N4 DC 24 A DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog20 A N7 DG 7 A DG 7 1_555 A N1 DG 18 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_7_PAIR hydrog21 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 A N2 DG 18 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N1 DG 7 A DG 7 1_555 A N3 DC 23 A DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N2 DG 7 A DG 7 1_555 A O2 DC 23 A DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O6 DG 7 A DG 7 1_555 A N4 DC 23 A DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N3 DC 9 A DC 9 1_555 A N1 DG 21 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N4 DC 9 A DC 9 1_555 A O6 DG 21 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A O2 DC 9 A DC 9 1_555 A N2 DG 21 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N1 DA 11 A DA 11 1_555 A N3 DT 16 A DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N6 DA 11 A DA 11 1_555 A O4 DT 16 A DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog30 A N3 DT 12 A DT 12 1_555 A N7 DA 15 A DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog HOOGSTEEN hydrog31 A O4 DT 12 A DT 12 1_555 A N6 DA 15 A DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8K0W _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019953 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.01152 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.02304 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.019681 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 TEP A 1 101 101 TEP TEP . C 3 NA A 1 102 1 NA NA . D 3 NA A 1 103 2 NA NA . E 3 NA A 1 104 3 NA NA . F 3 NA A 1 105 4 NA NA . G 3 NA A 1 106 5 NA NA . H 4 MG A 1 107 1 MG MG . I 5 HOH A 1 201 43 HOH HOH . I 5 HOH A 2 202 63 HOH HOH . I 5 HOH A 3 203 80 HOH HOH . I 5 HOH A 4 204 76 HOH HOH . I 5 HOH A 5 205 81 HOH HOH . I 5 HOH A 6 206 58 HOH HOH . I 5 HOH A 7 207 24 HOH HOH . I 5 HOH A 8 208 75 HOH HOH . I 5 HOH A 9 209 64 HOH HOH . I 5 HOH A 10 210 47 HOH HOH . I 5 HOH A 11 211 57 HOH HOH . I 5 HOH A 12 212 39 HOH HOH . I 5 HOH A 13 213 8 HOH HOH . I 5 HOH A 14 214 9 HOH HOH . I 5 HOH A 15 215 28 HOH HOH . I 5 HOH A 16 216 17 HOH HOH . I 5 HOH A 17 217 77 HOH HOH . I 5 HOH A 18 218 42 HOH HOH . I 5 HOH A 19 219 19 HOH HOH . I 5 HOH A 20 220 82 HOH HOH . I 5 HOH A 21 221 74 HOH HOH . I 5 HOH A 22 222 20 HOH HOH . I 5 HOH A 23 223 49 HOH HOH . I 5 HOH A 24 224 31 HOH HOH . I 5 HOH A 25 225 73 HOH HOH . I 5 HOH A 26 226 32 HOH HOH . I 5 HOH A 27 227 18 HOH HOH . I 5 HOH A 28 228 37 HOH HOH . I 5 HOH A 29 229 61 HOH HOH . I 5 HOH A 30 230 26 HOH HOH . I 5 HOH A 31 231 30 HOH HOH . I 5 HOH A 32 232 14 HOH HOH . I 5 HOH A 33 233 13 HOH HOH . I 5 HOH A 34 234 3 HOH HOH . I 5 HOH A 35 235 41 HOH HOH . I 5 HOH A 36 236 16 HOH HOH . I 5 HOH A 37 237 7 HOH HOH . I 5 HOH A 38 238 6 HOH HOH . I 5 HOH A 39 239 15 HOH HOH . I 5 HOH A 40 240 1 HOH HOH . I 5 HOH A 41 241 5 HOH HOH . I 5 HOH A 42 242 48 HOH HOH . I 5 HOH A 43 243 53 HOH HOH . I 5 HOH A 44 244 2 HOH HOH . I 5 HOH A 45 245 23 HOH HOH . I 5 HOH A 46 246 45 HOH HOH . I 5 HOH A 47 247 27 HOH HOH . I 5 HOH A 48 248 10 HOH HOH . I 5 HOH A 49 249 33 HOH HOH . I 5 HOH A 50 250 66 HOH HOH . I 5 HOH A 51 251 40 HOH HOH . I 5 HOH A 52 252 56 HOH HOH . I 5 HOH A 53 253 38 HOH HOH . I 5 HOH A 54 254 34 HOH HOH . I 5 HOH A 55 255 50 HOH HOH . I 5 HOH A 56 256 22 HOH HOH . I 5 HOH A 57 257 44 HOH HOH . I 5 HOH A 58 258 78 HOH HOH . I 5 HOH A 59 259 62 HOH HOH . I 5 HOH A 60 260 60 HOH HOH . I 5 HOH A 61 261 59 HOH HOH . I 5 HOH A 62 262 21 HOH HOH . I 5 HOH A 63 263 51 HOH HOH . I 5 HOH A 64 264 79 HOH HOH . I 5 HOH A 65 265 71 HOH HOH . I 5 HOH A 66 266 4 HOH HOH . I 5 HOH A 67 267 67 HOH HOH . I 5 HOH A 68 268 69 HOH HOH . I 5 HOH A 69 269 52 HOH HOH . I 5 HOH A 70 270 68 HOH HOH . I 5 HOH A 71 271 29 HOH HOH . I 5 HOH A 72 272 25 HOH HOH . I 5 HOH A 73 273 55 HOH HOH . I 5 HOH A 74 274 12 HOH HOH . I 5 HOH A 75 275 36 HOH HOH . I 5 HOH A 76 276 83 HOH HOH . I 5 HOH A 77 277 72 HOH HOH . I 5 HOH A 78 278 11 HOH HOH . I 5 HOH A 79 279 46 HOH HOH . I 5 HOH A 80 280 35 HOH HOH . I 5 HOH A 81 281 65 HOH HOH . I 5 HOH A 82 282 70 HOH HOH . I 5 HOH A 83 283 54 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 19.987 _atom_site.Cartn_y -14.437 _atom_site.Cartn_z 5.302 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 21.23 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 107 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 373 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #