data_8K5H # _model_server_result.job_id LCuYk2fyHfb87dZaxhZnQA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-25 20:27:41' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8k5h # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":1303}' # _entry.id 8K5H # _exptl.entry_id 8K5H _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 34 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8K5H _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8K5H _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 N N N ? 5 O N N ? 5 P N N ? 5 Q N N ? 5 R N N ? 5 S N N ? 5 T N N ? 5 U N N ? 5 V N N ? 5 W N N ? 5 X N N ? 5 Y N N ? 5 Z N N ? 5 AA N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n F NAG 1 D 1 NAG B 1311 NAG 4 n F NAG 2 D 2 NAG B 1312 NAG 4 n G NAG 1 E 1 NAG B 1313 NAG 4 n G NAG 2 E 2 NAG B 1314 NAG 4 n H NAG 1 F 1 NAG A 1304 NAG 4 n H NAG 2 F 2 NAG A 1305 NAG 4 n I NAG 1 G 1 NAG A 1312 NAG 4 n I NAG 2 G 2 NAG A 1313 NAG 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1314 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1315 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG C 1303 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG C 1304 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG C 1310 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG C 1311 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG C 1312 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG C 1313 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 120 B CYS 129 1_555 A SG CYS 152 B CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 279 B CYS 288 1_555 A SG CYS 289 B CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 324 B CYS 333 1_555 A SG CYS 349 B CYS 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 367 B CYS 376 1_555 A SG CYS 420 B CYS 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 379 B CYS 388 1_555 A SG CYS 513 B CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 468 B CYS 477 1_555 A SG CYS 476 B CYS 485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 526 B CYS 535 1_555 A SG CYS 578 B CYS 587 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 605 B CYS 614 1_555 A SG CYS 637 B CYS 646 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 650 B CYS 659 1_555 A SG CYS 659 B CYS 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 726 B CYS 735 1_555 A SG CYS 748 B CYS 757 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 731 B CYS 740 1_555 A SG CYS 737 B CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1020 B CYS 1029 1_555 A SG CYS 1031 B CYS 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1070 B CYS 1079 1_555 A SG CYS 1114 B CYS 1123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 120 A CYS 129 1_555 B SG CYS 152 A CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 279 A CYS 288 1_555 B SG CYS 289 A CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 324 A CYS 333 1_555 B SG CYS 349 A CYS 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 367 A CYS 376 1_555 B SG CYS 420 A CYS 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 379 A CYS 388 1_555 B SG CYS 513 A CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 468 A CYS 477 1_555 B SG CYS 476 A CYS 485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 526 A CYS 535 1_555 B SG CYS 578 A CYS 587 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 605 A CYS 614 1_555 B SG CYS 637 A CYS 646 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 650 A CYS 659 1_555 B SG CYS 659 A CYS 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 726 A CYS 735 1_555 B SG CYS 748 A CYS 757 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 731 A CYS 740 1_555 B SG CYS 737 A CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1020 A CYS 1029 1_555 B SG CYS 1031 A CYS 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1070 A CYS 1079 1_555 B SG CYS 1114 A CYS 1123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 120 C CYS 129 1_555 C SG CYS 152 C CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 279 C CYS 288 1_555 C SG CYS 289 C CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 526 C CYS 535 1_555 C SG CYS 578 C CYS 587 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 650 C CYS 659 1_555 C SG CYS 659 C CYS 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 726 C CYS 735 1_555 C SG CYS 748 C CYS 757 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 731 C CYS 740 1_555 C SG CYS 737 C CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 1020 C CYS 1029 1_555 C SG CYS 1031 C CYS 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 1070 C CYS 1079 1_555 C SG CYS 1114 C CYS 1123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf35 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 101 H CYS 101 1_555 D SG CYS 105 H CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 43 L CYS 23 1_555 E SG CYS 109 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 52 B ASN 61 1_555 N C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 111 B ASN 120 1_555 O C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 151 B ASN 160 1_555 P C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 222 B ASN 231 1_555 Q C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 270 B ASN 279 1_555 R C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 319 B ASN 328 1_555 S C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 331 B ASN 340 1_555 T C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 604 B ASN 613 1_555 U C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 697 B ASN 706 1_555 V C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 705 B ASN 714 1_555 F C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 789 B ASN 798 1_555 G C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 1062 B ASN 1071 1_555 W C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1086 B ASN 1095 1_555 X C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1122 B ASN 1131 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 52 A ASN 61 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 111 A ASN 120 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 151 A ASN 160 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 222 A ASN 231 1_555 H C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 270 A ASN 279 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 319 A ASN 328 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 331 A ASN 340 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 591 A ASN 600 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 604 A ASN 613 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 697 A ASN 706 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 705 A ASN 714 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 789 A ASN 798 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1062 A ASN 1071 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1086 A ASN 1095 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 1122 A ASN 1131 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 52 C ASN 61 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 151 C ASN 160 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 222 C ASN 231 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 270 C ASN 279 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 319 C ASN 328 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 591 C ASN 600 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 604 C ASN 613 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 697 C ASN 706 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 705 C ASN 714 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 789 C ASN 798 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 1062 C ASN 1071 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 1086 C ASN 1095 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 1122 C ASN 1131 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale43 F O4 NAG . D NAG 1 1_555 F C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale44 G O4 NAG . E NAG 1 1_555 G C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale45 H O4 NAG . F NAG 1 1_555 H C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale46 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale47 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale48 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale49 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale50 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8K5H _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 5 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . O 5 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . P 5 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . Q 5 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . R 5 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . S 5 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . T 5 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . U 5 NAG B 1 1308 1309 NAG NAG . V 5 NAG B 1 1309 1310 NAG NAG . W 5 NAG B 1 1310 1315 NAG NAG . X 5 NAG B 1 1311 1316 NAG NAG . Y 5 NAG B 1 1312 1317 NAG NAG . Z 5 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . AA 5 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . BA 5 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . CA 5 NAG A 1 1304 1306 NAG NAG . DA 5 NAG A 1 1305 1307 NAG NAG . EA 5 NAG A 1 1306 1308 NAG NAG . FA 5 NAG A 1 1307 1309 NAG NAG . GA 5 NAG A 1 1308 1310 NAG NAG . HA 5 NAG A 1 1309 1311 NAG NAG . IA 5 NAG A 1 1310 1316 NAG NAG . JA 5 NAG A 1 1311 1317 NAG NAG . KA 5 NAG A 1 1312 1318 NAG NAG . LA 5 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . MA 5 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . NA 5 NAG C 1 1303 1305 NAG NAG . OA 5 NAG C 1 1304 1306 NAG NAG . PA 5 NAG C 1 1305 1307 NAG NAG . QA 5 NAG C 1 1306 1308 NAG NAG . RA 5 NAG C 1 1307 1309 NAG NAG . SA 5 NAG C 1 1308 1314 NAG NAG . TA 5 NAG C 1 1309 1315 NAG NAG . UA 5 NAG C 1 1310 1316 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . P 5 169.865 219.863 154.39 1 193.6 ? C1 NAG 1303 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . P 5 171.196 219.18 154.685 1 193.6 ? C2 NAG 1303 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . P 5 172.128 219.296 153.483 1 193.6 ? C3 NAG 1303 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . P 5 171.442 218.784 152.223 1 193.6 ? C4 NAG 1303 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . P 5 170.087 219.461 152.035 1 193.6 ? C5 NAG 1303 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . P 5 169.285 218.866 150.903 1 193.6 ? C6 NAG 1303 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . P 5 172.459 219.007 156.783 1 193.6 ? C7 NAG 1303 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . P 5 173.036 219.756 157.946 1 193.6 ? C8 NAG 1303 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . P 5 171.817 219.745 155.871 1 193.6 ? N2 NAG 1303 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . P 5 173.309 218.542 153.729 1 193.6 ? O3 NAG 1303 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . P 5 172.256 219.05 151.086 1 193.6 ? O4 NAG 1303 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . P 5 169.291 219.303 153.218 1 193.6 ? O5 NAG 1303 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . P 5 168.094 218.262 151.388 1 193.6 ? O6 NAG 1303 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . P 5 172.569 217.79 156.673 1 193.6 ? O7 NAG 1303 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 262 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #