data_8KHC # _model_server_result.job_id kWGqjrl0yg-tXvMkGbImbw _model_server_result.datetime_utc '2025-08-31 17:48:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8khc # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":1307}' # _entry.id 8KHC # _exptl.entry_id 8KHC _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 36 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8KHC _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8KHC _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 J N N ? 5 K N N ? 5 L N N ? 5 M N N ? 5 N N N ? 5 O N N ? 5 P N N ? 5 Q N N ? 5 R N N ? 5 S N N ? 5 T N N ? 5 U N N ? 5 V N N ? 5 W N N ? 5 X N N ? 5 Y N N ? 5 Z N N ? 5 AA N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n H NAG 1 D 1 NAG D 1 NAG 4 n H NAG 2 D 2 NAG D 2 NAG 4 n I NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 4 n I NAG 2 E 2 NAG E 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 105 A CYS 131 1_555 A SG CYS 140 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 265 A CYS 294 1_555 A SG CYS 275 A CYS 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 310 A CYS 336 1_555 A SG CYS 335 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 353 A CYS 379 1_555 A SG CYS 406 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 365 A CYS 391 1_555 A SG CYS 499 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 454 A CYS 480 1_555 A SG CYS 462 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 512 A CYS 541 1_555 A SG CYS 564 A CYS 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 591 A CYS 620 1_555 A SG CYS 623 A CYS 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 636 A CYS 665 1_555 A SG CYS 645 A CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 712 A CYS 741 1_555 A SG CYS 734 A CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 717 A CYS 746 1_555 A SG CYS 723 A CYS 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1006 A CYS 1035 1_555 A SG CYS 1017 A CYS 1046 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1056 A CYS 1085 1_555 A SG CYS 1100 A CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 105 B CYS 131 1_555 B SG CYS 140 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 265 B CYS 294 1_555 B SG CYS 275 B CYS 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 310 B CYS 336 1_555 B SG CYS 335 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 353 B CYS 379 1_555 B SG CYS 406 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 365 B CYS 391 1_555 B SG CYS 499 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 454 B CYS 480 1_555 B SG CYS 462 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 512 B CYS 541 1_555 B SG CYS 564 B CYS 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 591 B CYS 620 1_555 B SG CYS 623 B CYS 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 636 B CYS 665 1_555 B SG CYS 645 B CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 712 B CYS 741 1_555 B SG CYS 734 B CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 717 B CYS 746 1_555 B SG CYS 723 B CYS 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1006 B CYS 1035 1_555 B SG CYS 1017 B CYS 1046 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1056 B CYS 1085 1_555 B SG CYS 1100 B CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 105 C CYS 131 1_555 C SG CYS 140 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 265 C CYS 294 1_555 C SG CYS 275 C CYS 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 310 C CYS 339 1_555 C SG CYS 335 C CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 353 C CYS 382 1_555 C SG CYS 406 C CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 365 C CYS 394 1_555 C SG CYS 499 C CYS 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 454 C CYS 483 1_555 C SG CYS 462 C CYS 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 512 C CYS 541 1_555 C SG CYS 564 C CYS 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 591 C CYS 620 1_555 C SG CYS 623 C CYS 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 636 C CYS 665 1_555 C SG CYS 645 C CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 712 C CYS 741 1_555 C SG CYS 734 C CYS 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 717 C CYS 746 1_555 C SG CYS 723 C CYS 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1006 C CYS 1035 1_555 C SG CYS 1017 C CYS 1046 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 1056 C CYS 1085 1_555 C SG CYS 1100 C CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 22 F CYS 22 1_555 D SG CYS 98 F CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 E SG CYS 20 G CYS 22 1_555 E SG CYS 85 G CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 22 H CYS 22 1_555 F SG CYS 98 H CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 G SG CYS 20 J CYS 22 1_555 G SG CYS 85 J CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 139 A ASN 165 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 208 A ASN 237 1_555 L C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 256 A ASN 285 1_555 U C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 308 A ASN 334 1_555 K C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 577 A ASN 606 1_555 M C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 590 A ASN 619 1_555 R C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 631 A ASN 660 1_555 J C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 683 A ASN 712 1_555 S C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 691 A ASN 720 1_555 H C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 775 A ASN 804 1_555 T C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 1048 A ASN 1077 1_555 N C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 1072 A ASN 1101 1_555 P C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1108 A ASN 1137 1_555 O C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 139 B ASN 165 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 208 B ASN 237 1_555 W C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 256 B ASN 285 1_555 X C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 308 B ASN 334 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 577 B ASN 606 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 590 B ASN 619 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 631 B ASN 660 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 683 B ASN 712 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 691 B ASN 720 1_555 I C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 775 B ASN 804 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 1048 B ASN 1077 1_555 V C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 1072 B ASN 1101 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 1108 B ASN 1137 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 139 C ASN 165 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 208 C ASN 237 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 256 C ASN 285 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 305 C ASN 334 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 577 C ASN 606 1_555 HA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 590 C ASN 619 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 631 C ASN 660 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 683 C ASN 712 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 775 C ASN 804 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 1048 C ASN 1077 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 1072 C ASN 1101 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 1108 C ASN 1137 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale39 H O4 NAG . D NAG 1 1_555 H C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale40 I O4 NAG . E NAG 1 1_555 I C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 237 n n C1 O1 NAG sing 238 n n C1 O5 NAG sing 239 n n C1 H1 NAG sing 240 n n C2 C3 NAG sing 241 n n C2 N2 NAG sing 242 n n C2 H2 NAG sing 243 n n C3 C4 NAG sing 244 n n C3 O3 NAG sing 245 n n C3 H3 NAG sing 246 n n C4 C5 NAG sing 247 n n C4 O4 NAG sing 248 n n C4 H4 NAG sing 249 n n C5 C6 NAG sing 250 n n C5 O5 NAG sing 251 n n C5 H5 NAG sing 252 n n C6 O6 NAG sing 253 n n C6 H61 NAG sing 254 n n C6 H62 NAG sing 255 n n C7 C8 NAG sing 256 n n C7 N2 NAG sing 257 n n C7 O7 NAG doub 258 n n C8 H81 NAG sing 259 n n C8 H82 NAG sing 260 n n C8 H83 NAG sing 261 n n N2 HN2 NAG sing 262 n n O1 HO1 NAG sing 263 n n O3 HO3 NAG sing 264 n n O4 HO4 NAG sing 265 n n O6 HO6 NAG sing 266 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8KHC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 5 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . K 5 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . L 5 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . M 5 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . N 5 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . O 5 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . P 5 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . Q 5 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . R 5 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . S 5 NAG A 1 1310 1310 NAG NAG . T 5 NAG A 1 1311 1311 NAG NAG . U 5 NAG A 1 1312 1312 NAG NAG . V 5 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . W 5 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . X 5 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . Y 5 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . Z 5 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . AA 5 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . BA 5 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . CA 5 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . DA 5 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . EA 5 NAG B 1 1310 1310 NAG NAG . FA 5 NAG B 1 1311 1311 NAG NAG . GA 5 NAG B 1 1312 1312 NAG NAG . HA 5 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . IA 5 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . JA 5 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . KA 5 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . LA 5 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . MA 5 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . NA 5 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . OA 5 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . PA 5 NAG C 1 1309 1309 NAG NAG . QA 5 NAG C 1 1310 1310 NAG NAG . RA 5 NAG C 1 1311 1311 NAG NAG . SA 5 NAG C 1 1312 1312 NAG NAG . TA 6 HOH A 1 1401 330 HOH HOH . TA 6 HOH A 2 1402 325 HOH HOH . TA 6 HOH A 3 1403 306 HOH HOH . TA 6 HOH A 4 1404 308 HOH HOH . TA 6 HOH A 5 1405 320 HOH HOH . UA 6 HOH B 1 1401 308 HOH HOH . UA 6 HOH B 2 1402 320 HOH HOH . UA 6 HOH B 3 1403 330 HOH HOH . UA 6 HOH B 4 1404 325 HOH HOH . VA 6 HOH F 1 201 310 HOH HOH . VA 6 HOH F 2 202 309 HOH HOH . VA 6 HOH F 3 203 316 HOH HOH . VA 6 HOH F 4 204 304 HOH HOH . VA 6 HOH F 5 205 314 HOH HOH . VA 6 HOH F 6 206 306 HOH HOH . VA 6 HOH F 7 207 324 HOH HOH . VA 6 HOH F 8 208 318 HOH HOH . VA 6 HOH F 9 209 322 HOH HOH . VA 6 HOH F 10 210 302 HOH HOH . VA 6 HOH F 11 211 326 HOH HOH . VA 6 HOH F 12 212 313 HOH HOH . VA 6 HOH F 13 213 321 HOH HOH . VA 6 HOH F 14 214 319 HOH HOH . VA 6 HOH F 15 215 331 HOH HOH . VA 6 HOH F 16 216 307 HOH HOH . VA 6 HOH F 17 217 328 HOH HOH . VA 6 HOH F 18 218 312 HOH HOH . VA 6 HOH F 19 219 303 HOH HOH . WA 6 HOH G 1 201 311 HOH HOH . WA 6 HOH G 2 202 315 HOH HOH . WA 6 HOH G 3 203 329 HOH HOH . WA 6 HOH G 4 204 327 HOH HOH . WA 6 HOH G 5 205 323 HOH HOH . WA 6 HOH G 6 206 317 HOH HOH . XA 6 HOH H 1 201 321 HOH HOH . XA 6 HOH H 2 202 309 HOH HOH . XA 6 HOH H 3 203 310 HOH HOH . XA 6 HOH H 4 204 304 HOH HOH . XA 6 HOH H 5 205 324 HOH HOH . XA 6 HOH H 6 206 316 HOH HOH . XA 6 HOH H 7 207 318 HOH HOH . XA 6 HOH H 8 208 302 HOH HOH . XA 6 HOH H 9 209 313 HOH HOH . XA 6 HOH H 10 210 326 HOH HOH . XA 6 HOH H 11 211 331 HOH HOH . XA 6 HOH H 12 212 319 HOH HOH . XA 6 HOH H 13 213 307 HOH HOH . XA 6 HOH H 14 214 328 HOH HOH . XA 6 HOH H 15 215 312 HOH HOH . XA 6 HOH H 16 216 303 HOH HOH . YA 6 HOH J 1 201 314 HOH HOH . YA 6 HOH J 2 202 322 HOH HOH . YA 6 HOH J 3 203 311 HOH HOH . YA 6 HOH J 4 204 315 HOH HOH . YA 6 HOH J 5 205 329 HOH HOH . YA 6 HOH J 6 206 327 HOH HOH . YA 6 HOH J 7 207 323 HOH HOH . YA 6 HOH J 8 208 317 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . P 5 199.162 161.441 111.842 1 0 ? C1 NAG 1307 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . P 5 198.811 160.026 111.388 1 0 ? C2 NAG 1307 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . P 5 198.777 159.955 109.865 1 0 ? C3 NAG 1307 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . P 5 197.844 161.02 109.304 1 0 ? C4 NAG 1307 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . P 5 198.226 162.395 109.845 1 0 ? C5 NAG 1307 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . P 5 197.263 163.482 109.429 1 0 ? C6 NAG 1307 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . P 5 199.383 158.052 112.728 1 0 ? C7 NAG 1307 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . P 5 200.482 157.143 113.188 1 0 ? C8 NAG 1307 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . P 5 199.75 159.055 111.924 1 0 ? N2 NAG 1307 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . P 5 198.338 158.663 109.461 1 0 ? O3 NAG 1307 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . P 5 197.923 161.037 107.884 1 0 ? O4 NAG 1307 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . P 5 198.23 162.373 111.28 1 0 ? O5 NAG 1307 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . P 5 197.087 163.508 108.019 1 0 ? O6 NAG 1307 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . P 5 198.217 157.887 113.07 1 0 ? O7 NAG 1307 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 22 _model_server_stats.query_time_ms 390 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 14 #