data_8OJ7 # _model_server_result.job_id xxkrDm2g1r_7oWl0nIl00w _model_server_result.datetime_utc '2025-07-04 15:14:36' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8oj7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1301}' # _entry.id 8OJ7 # _exptl.entry_id 8OJ7 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8OJ7 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8OJ7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 C O3' DA 52 C DA 52 1_555 C P DOC 53 C DOC 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.611 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 368 A ASP 368 1_555 F MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 717 A ASP 717 1_555 E MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc3 A O PHE 718 A PHE 718 1_555 E MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 888 A ASP 888 1_555 E MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc5 E MG MG . A MG 1301 1_555 G O1G DTP . A DTP 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 1301 1_555 G O1B DTP . A DTP 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? metalc ? metalc7 E MG MG . A MG 1301 1_555 G O1A DTP . A DTP 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N3 DC 25 C DC 25 1_555 D N1 DG 43 D DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N4 DC 25 C DC 25 1_555 D O6 DG 43 D DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O2 DC 25 C DC 25 1_555 D N2 DG 43 D DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N1 DG 26 C DG 26 1_555 D N3 DC 42 D DC 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N2 DG 26 C DG 26 1_555 D O2 DC 42 D DC 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C O6 DG 26 C DG 26 1_555 D N4 DC 42 D DC 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N3 DC 27 C DC 27 1_555 D N1 DG 41 D DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N4 DC 27 C DC 27 1_555 D O6 DG 41 D DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C O2 DC 27 C DC 27 1_555 D N2 DG 41 D DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N1 DA 28 C DA 28 1_555 D N3 DT 40 D DT 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N6 DA 28 C DA 28 1_555 D O4 DT 40 D DT 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N1 DG 29 C DG 29 1_555 D N3 DC 39 D DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N2 DG 29 C DG 29 1_555 D O2 DC 39 D DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O6 DG 29 C DG 29 1_555 D N4 DC 39 D DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N3 DC 30 C DC 30 1_555 D N1 DG 38 D DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N4 DC 30 C DC 30 1_555 D O6 DG 38 D DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C O2 DC 30 C DC 30 1_555 D N2 DG 38 D DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N3 DC 31 C DC 31 1_555 D N1 DG 37 D DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N4 DC 31 C DC 31 1_555 D O6 DG 37 D DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C O2 DC 31 C DC 31 1_555 D N2 DG 37 D DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N1 DG 32 C DG 32 1_555 D N3 DC 36 D DC 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N2 DG 32 C DG 32 1_555 D O2 DC 36 D DC 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O6 DG 32 C DG 32 1_555 D N4 DC 36 D DC 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N3 DT 33 C DT 33 1_555 D N1 DA 35 D DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C O4 DT 33 C DT 33 1_555 D N6 DA 35 D DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N3 DC 34 C DC 34 1_555 D N1 DG 34 D DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N4 DC 34 C DC 34 1_555 D O6 DG 34 D DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O2 DC 34 C DC 34 1_555 D N2 DG 34 D DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N3 DC 35 C DC 35 1_555 D N1 DG 33 D DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N4 DC 35 C DC 35 1_555 D O6 DG 33 D DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C O2 DC 35 C DC 35 1_555 D N2 DG 33 D DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N1 DA 36 C DA 36 1_555 D N3 DT 32 D DT 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N6 DA 36 C DA 36 1_555 D O4 DT 32 D DT 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N1 DA 37 C DA 37 1_555 D N3 DT 31 D DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N6 DA 37 C DA 37 1_555 D O4 DT 31 D DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N3 DC 38 C DC 38 1_555 D N1 DG 30 D DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N4 DC 38 C DC 38 1_555 D O6 DG 30 D DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O2 DC 38 C DC 38 1_555 D N2 DG 30 D DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N3 DC 39 C DC 39 1_555 D N1 DG 29 D DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N4 DC 39 C DC 39 1_555 D O6 DG 29 D DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C O2 DC 39 C DC 39 1_555 D N2 DG 29 D DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N1 DA 40 C DA 40 1_555 D N3 DT 28 D DT 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C N6 DA 40 C DA 40 1_555 D O4 DT 28 D DT 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C N1 DA 41 C DA 41 1_555 D N3 DT 27 D DT 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 C N6 DA 41 C DA 41 1_555 D O4 DT 27 D DT 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 C N3 DC 42 C DC 42 1_555 D N1 DG 26 D DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C N4 DC 42 C DC 42 1_555 D O6 DG 26 D DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C O2 DC 42 C DC 42 1_555 D N2 DG 26 D DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C N3 DT 43 C DT 43 1_555 D N1 DA 25 D DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 C O4 DT 43 C DT 43 1_555 D N6 DA 25 D DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 C N3 DC 44 C DC 44 1_555 D N1 DG 24 D DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 C N4 DC 44 C DC 44 1_555 D O6 DG 24 D DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 C O2 DC 44 C DC 44 1_555 D N2 DG 24 D DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 C N1 DA 45 C DA 45 1_555 D N3 DT 23 D DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 C N6 DA 45 C DA 45 1_555 D O4 DT 23 D DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 C N1 DA 46 C DA 46 1_555 D N3 DT 22 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 C N6 DA 46 C DA 46 1_555 D O4 DT 22 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 C N3 DT 47 C DT 47 1_555 D N1 DA 21 D DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 C O4 DT 47 C DT 47 1_555 D N6 DA 21 D DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 C N3 DT 48 C DT 48 1_555 D N1 DA 20 D DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 C O4 DT 48 C DT 48 1_555 D N6 DA 20 D DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 C N1 DA 49 C DA 49 1_555 D N3 DT 19 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 C N6 DA 49 C DA 49 1_555 D O4 DT 19 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 C N1 DG 50 C DG 50 1_555 D N3 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 C N2 DG 50 C DG 50 1_555 D O2 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 C O6 DG 50 C DG 50 1_555 D N4 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 C N1 DA 51 C DA 51 1_555 D N3 DT 17 D DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 C N6 DA 51 C DA 51 1_555 D O4 DT 17 D DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 C N1 DA 52 C DA 52 1_555 D N3 DT 16 D DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 C N6 DA 52 C DA 52 1_555 D O4 DT 16 D DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 C N3 DOC 53 C DOC 53 1_555 D N1 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 C N4 DOC 53 C DOC 53 1_555 D O6 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 C O2 DOC 53 C DOC 53 1_555 D N2 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8OJ7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 MG A 1 1301 1 MG MG . F 5 MG A 1 1302 3 MG MG . G 6 DTP A 1 1303 1301 DTP DTP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 175.363 _atom_site.Cartn_y 202.516 _atom_site.Cartn_z 179.311 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 10.12 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1301 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 319 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #