data_8OPN # _model_server_result.job_id j5FSEQSULFhe4wYtArP4LA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:47:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8opn # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":1404}' # _entry.id 8OPN # _exptl.entry_id 8OPN _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 26 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8OPN _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8OPN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 Q N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 5N6 SIA C2 O2 . O8 HO8 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1227 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1228 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG B 1231 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG B 1232 NAG 2 n F NAG 1 F 1 NAG C 1230 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG C 1233 NAG 2 n G NAG 1 G 1 NAG C 1231 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG C 1232 NAG 3 n H SIA 1 H 1 SIA D 1300 SIA 3 n H 5N6 2 H 2 5N6 D 1299 MJJ 3 n I SIA 1 I 1 SIA E 1300 SIA 3 n I 5N6 2 I 2 5N6 E 1299 MJJ 3 n J SIA 1 J 1 SIA F 1300 SIA 3 n J 5N6 2 J 2 5N6 F 1299 MJJ # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 31 A CYS 20 1_555 A SG CYS 167 A CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 162 A CYS 151 1_555 A SG CYS 194 A CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 174 A CYS 163 1_555 A SG CYS 253 A CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 293 A CYS 282 1_555 A SG CYS 303 A CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 338 A CYS 327 1_555 A SG CYS 363 A CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 381 A CYS 370 1_555 A SG CYS 434 A CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 393 A CYS 382 1_555 A SG CYS 616 A CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 477 A CYS 466 1_555 A SG CYS 557 A CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 485 A CYS 474 1_555 A SG CYS 506 A CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 487 A CYS 476 1_555 A SG CYS 578 A CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 496 A CYS 485 1_555 A SG CYS 527 A CYS 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 515 A CYS 504 1_555 A SG CYS 529 A CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 531 A CYS 520 1_555 A SG CYS 544 A CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 567 A CYS 556 1_555 A SG CYS 580 A CYS 569 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 593 A CYS 582 1_555 A SG CYS 599 A CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 632 A CYS 621 1_555 A SG CYS 685 A CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 710 A CYS 699 1_555 A SG CYS 731 A CYS 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf18 A SG CYS 746 A CYS 735 1_555 A SG CYS 755 A CYS 744 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 A SG CYS 829 A CYS 818 1_555 A SG CYS 851 A CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf20 A SG CYS 834 A CYS 823 1_555 A SG CYS 840 A CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf21 A SG CYS 940 A CYS 929 1_555 A SG CYS 951 A CYS 940 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf22 A SG CYS 1128 A CYS 1117 1_555 A SG CYS 1139 A CYS 1128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf23 A SG CYS 1178 A CYS 1167 1_555 A SG CYS 1223 A CYS 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 31 B CYS 20 1_555 B SG CYS 167 B CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 162 B CYS 151 1_555 B SG CYS 194 B CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 174 B CYS 163 1_555 B SG CYS 253 B CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 293 B CYS 282 1_555 B SG CYS 303 B CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 338 B CYS 327 1_555 B SG CYS 363 B CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 381 B CYS 370 1_555 B SG CYS 434 B CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 393 B CYS 382 1_555 B SG CYS 616 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 477 B CYS 466 1_555 B SG CYS 557 B CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 485 B CYS 474 1_555 B SG CYS 506 B CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 487 B CYS 476 1_555 B SG CYS 578 B CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 496 B CYS 485 1_555 B SG CYS 527 B CYS 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 515 B CYS 504 1_555 B SG CYS 529 B CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 531 B CYS 520 1_555 B SG CYS 544 B CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf37 B SG CYS 567 B CYS 556 1_555 B SG CYS 580 B CYS 569 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf38 B SG CYS 593 B CYS 582 1_555 B SG CYS 599 B CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 B SG CYS 632 B CYS 621 1_555 B SG CYS 685 B CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf40 B SG CYS 710 B CYS 699 1_555 B SG CYS 731 B CYS 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf41 B SG CYS 746 B CYS 735 1_555 B SG CYS 755 B CYS 744 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 B SG CYS 829 B CYS 818 1_555 B SG CYS 851 B CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 B SG CYS 834 B CYS 823 1_555 B SG CYS 840 B CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf44 B SG CYS 940 B CYS 929 1_555 B SG CYS 951 B CYS 940 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf45 B SG CYS 1128 B CYS 1117 1_555 B SG CYS 1139 B CYS 1128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf46 B SG CYS 1178 B CYS 1167 1_555 B SG CYS 1223 B CYS 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf47 C SG CYS 31 C CYS 20 1_555 C SG CYS 167 C CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf48 C SG CYS 162 C CYS 151 1_555 C SG CYS 194 C CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf49 C SG CYS 174 C CYS 163 1_555 C SG CYS 253 C CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf50 C SG CYS 293 C CYS 282 1_555 C SG CYS 303 C CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf51 C SG CYS 338 C CYS 327 1_555 C SG CYS 363 C CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf52 C SG CYS 381 C CYS 370 1_555 C SG CYS 434 C CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf53 C SG CYS 393 C CYS 382 1_555 C SG CYS 616 C CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf54 C SG CYS 477 C CYS 466 1_555 C SG CYS 557 C CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf55 C SG CYS 485 C CYS 474 1_555 C SG CYS 506 C CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf56 C SG CYS 487 C CYS 476 1_555 C SG CYS 578 C CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf57 C SG CYS 496 C CYS 485 1_555 C SG CYS 527 C CYS 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf58 C SG CYS 515 C CYS 504 1_555 C SG CYS 529 C CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf59 C SG CYS 531 C CYS 520 1_555 C SG CYS 544 C CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf60 C SG CYS 567 C CYS 556 1_555 C SG CYS 580 C CYS 569 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf61 C SG CYS 593 C CYS 582 1_555 C SG CYS 599 C CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf62 C SG CYS 632 C CYS 621 1_555 C SG CYS 685 C CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf63 C SG CYS 710 C CYS 699 1_555 C SG CYS 731 C CYS 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf64 C SG CYS 746 C CYS 735 1_555 C SG CYS 755 C CYS 744 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf65 C SG CYS 829 C CYS 818 1_555 C SG CYS 851 C CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf66 C SG CYS 834 C CYS 823 1_555 C SG CYS 840 C CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf67 C SG CYS 940 C CYS 929 1_555 C SG CYS 951 C CYS 940 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf68 C SG CYS 1128 C CYS 1117 1_555 C SG CYS 1139 C CYS 1128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf69 C SG CYS 1178 C CYS 1167 1_555 C SG CYS 1223 C CYS 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 69 A ASN 58 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 199 A ASN 188 1_555 K C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 203 A ASN 192 1_555 O C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 677 A ASN 666 1_555 L C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 697 A ASN 686 1_555 P C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 737 A ASN 726 1_555 M C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 808 A ASN 797 1_555 N C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 1226 A ASN 1215 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 40 B ASN 29 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 69 B ASN 58 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 182 B ASN 171 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 199 B ASN 188 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 203 B ASN 192 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 444 B ASN 433 1_555 T C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 677 B ASN 666 1_555 X C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 697 B ASN 686 1_555 U C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 737 B ASN 726 1_555 V C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 786 B ASN 775 1_555 R C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 808 B ASN 797 1_555 S C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 939 B ASN 928 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 1226 B ASN 1215 1_555 W C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 69 C ASN 58 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 199 C ASN 188 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 203 C ASN 192 1_555 DA C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 366 C ASN 355 1_555 GA C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 677 C ASN 666 1_555 EA C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 697 C ASN 686 1_555 HA C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 737 C ASN 726 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 808 C ASN 797 1_555 FA C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 1226 C ASN 1215 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale32 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale33 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale34 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale35 H O8 SIA . H SIA 1 1_555 H C2 5N6 . H 5N6 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.38 ? covale ? covale36 I O8 SIA . I SIA 1 1_555 I C2 5N6 . I 5N6 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.38 ? covale ? covale37 J O8 SIA . J SIA 1 1_555 J C2 5N6 . J 5N6 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.381 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 280 n n C1 O1 NAG sing 281 n n C1 O5 NAG sing 282 n n C1 H1 NAG sing 283 n n C2 C3 NAG sing 284 n n C2 N2 NAG sing 285 n n C2 H2 NAG sing 286 n n C3 C4 NAG sing 287 n n C3 O3 NAG sing 288 n n C3 H3 NAG sing 289 n n C4 C5 NAG sing 290 n n C4 O4 NAG sing 291 n n C4 H4 NAG sing 292 n n C5 C6 NAG sing 293 n n C5 O5 NAG sing 294 n n C5 H5 NAG sing 295 n n C6 O6 NAG sing 296 n n C6 H61 NAG sing 297 n n C6 H62 NAG sing 298 n n C7 C8 NAG sing 299 n n C7 N2 NAG sing 300 n n C7 O7 NAG doub 301 n n C8 H81 NAG sing 302 n n C8 H82 NAG sing 303 n n C8 H83 NAG sing 304 n n N2 HN2 NAG sing 305 n n O1 HO1 NAG sing 306 n n O3 HO3 NAG sing 307 n n O4 HO4 NAG sing 308 n n O6 HO6 NAG sing 309 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8OPN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 4 NAG A 1 1401 1223 NAG NAG . L 4 NAG A 1 1402 1224 NAG NAG . M 4 NAG A 1 1403 1225 NAG NAG . N 4 NAG A 1 1404 1226 NAG NAG . O 4 NAG A 1 1405 1229 NAG NAG . P 4 NAG A 1 1406 1230 NAG NAG . Q 4 NAG A 1 1407 1231 NAG NAG . R 4 NAG B 1 1401 1225 NAG NAG . S 4 NAG B 1 1402 1226 NAG NAG . T 4 NAG B 1 1403 1227 NAG NAG . U 4 NAG B 1 1404 1228 NAG NAG . V 4 NAG B 1 1405 1229 NAG NAG . W 4 NAG B 1 1406 1230 NAG NAG . X 4 NAG B 1 1407 1233 NAG NAG . Y 4 NAG B 1 1408 1234 NAG NAG . Z 4 NAG B 1 1409 1235 NAG NAG . AA 4 NAG B 1 1410 1236 NAG NAG . BA 4 NAG B 1 1411 1237 NAG NAG . CA 4 NAG B 1 1412 1238 NAG NAG . DA 4 NAG C 1 1401 1224 NAG NAG . EA 4 NAG C 1 1402 1225 NAG NAG . FA 4 NAG C 1 1403 1226 NAG NAG . GA 4 NAG C 1 1404 1227 NAG NAG . HA 4 NAG C 1 1405 1228 NAG NAG . IA 4 NAG C 1 1406 1229 NAG NAG . JA 4 NAG C 1 1407 1234 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . U 4 171.326 205.914 141.801 1 388.93 ? C1 NAG 1404 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . U 4 171.146 205.929 140.283 1 388.93 ? C2 NAG 1404 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . U 4 172.368 205.314 139.601 1 388.93 ? C3 NAG 1404 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . U 4 173.646 206.005 140.06 1 388.93 ? C4 NAG 1404 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . U 4 173.737 205.995 141.585 1 388.93 ? C5 NAG 1404 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . U 4 174.914 206.782 142.111 1 388.93 ? C6 NAG 1404 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . U 4 168.817 205.858 139.514 1 388.93 ? C7 NAG 1404 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . U 4 167.662 204.98 139.139 1 388.93 ? C8 NAG 1404 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . U 4 169.935 205.228 139.891 1 388.93 ? N2 NAG 1404 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . U 4 172.232 205.432 138.189 1 388.93 ? O3 NAG 1404 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . U 4 174.781 205.339 139.518 1 388.93 ? O4 NAG 1404 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . U 4 172.557 206.587 142.151 1 388.93 ? O5 NAG 1404 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . U 4 175.041 208.03 141.443 1 388.93 ? O6 NAG 1404 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . U 4 168.743 207.082 139.479 1 388.93 ? O7 NAG 1404 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 80 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 237 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #