data_8Q1U
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_model_server_result.job_id            ZpPU6G-jDuNXv_Fq7UvZsg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 05:17:16' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8q1u 
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_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"JB","auth_seq_id":202}' 
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_entry.id    8Q1U 
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_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          47 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
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_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    45-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      45 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 47 WA N N 
? 47 AB N N 
? 47 BB N N 
? 47 CB N N 
? 47 IB N N 
? 47 JB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 X SG CYS 46 X CYS 45 1_555 X SG CYS 56 X CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf2 Y SG CYS 18 Y CYS 17 1_555 Y SG CYS 75 Y CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf3 Y SG CYS 95 Y CYS 94 1_555 Y SG CYS 115 Y CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf4 EA SG CYS 33 e CYS 32 1_555 EA SG CYS 66 e CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf5 EA SG CYS 43 e CYS 42 1_555 EA SG CYS 56 e CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf6 PA SG CYS 113 p CYS 112 1_555 PA SG CYS 125 p CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
covale ? covale1 A C FME 1 A FME 1 1_555 A N ASN 2 A ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale2 D C HIS 117 D HIS 84 1_555 D N 2MR 118 D 2MR 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale3 D C 2MR 118 D 2MR 85 1_555 D N GLY 119 D GLY 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale4 H C FME 1 H FME 1 1_555 H N PHE 2 H PHE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 J C FME 1 J FME 1 1_555 J N MET 2 J MET 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale6 K C FME 1 K FME 1 1_555 K N SER 2 K SER 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale7 L C FME 1 L FME 1 1_555 L N ASN 2 L ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale8 M C FME 1 M FME 1 1_555 M N LEU 2 M LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale9 N C FME 1 N FME 1 1_555 N N ASN 2 N ASN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale10 KC C3H PC1 . P PC1 502 1_555 LD C2E PC1 . q PC1 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? 
covale ? covale11 T OG SER 112 T SER 44 1_555 MC P1 EHZ . T EHZ 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.642 ? 
covale ? covale12 U OG SER 112 U SER 44 1_555 NC P1 EHZ . U EHZ 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.64 ? 
covale ? covale13 Y C AYA 2 Y AYA 1 1_555 Y N LYS 3 Y LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale14 BA C AYA 2 b AYA 1 1_555 BA N GLU 3 b GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale15 DA C AME 1 d AME 1 1_555 DA N MET 2 d MET 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale16 IA C SAC 2 i SAC 1 1_555 IA N GLY 3 i GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale17 MA C SAC 2 m SAC 1 1_555 MA N PHE 3 m PHE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale18 OA N GLY 2 o GLY 1 1_555 ID C1 MYR . o MYR 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.361 ? 
covale ? covale19 QA C AME 1 q AME 1 1_555 QA N GLU 2 q GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale20 RA C AYA 2 r AYA 1 1_555 RA N SER 3 r SER 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
metalc ? metalc1 B SG CYS 91 B CYS 54 1_555 WA FE3 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 92 B CYS 55 1_555 WA FE4 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 156 B CYS 119 1_555 WA FE1 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 186 B CYS 149 1_555 WA FE2 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc5 E SG CYS 135 E CYS 103 1_555 YA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc6 E SG CYS 140 E CYS 108 1_555 YA FE1 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc7 E SG CYS 176 E CYS 144 1_555 YA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc8 E SG CYS 180 E CYS 148 1_555 YA FE2 FES . E FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? 
metalc ? metalc9 F SG CYS 379 F CYS 359 1_555 AB FE1 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc10 F SG CYS 382 F CYS 362 1_555 AB FE4 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc11 F SG CYS 385 F CYS 365 1_555 AB FE2 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc12 F SG CYS 425 F CYS 405 1_555 AB FE3 SF4 . F SF4 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc13 G SG CYS 64 G CYS 41 1_555 DB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc14 G SG CYS 75 G CYS 52 1_555 DB FE1 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc15 G SG CYS 78 G CYS 55 1_555 DB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc16 G SG CYS 92 G CYS 69 1_555 DB FE2 FES . G FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc17 G NE2 HIS 124 G HIS 101 1_555 BB FE3 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? 
metalc ? metalc18 G SG CYS 128 G CYS 105 1_555 BB FE1 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 131 G CYS 108 1_555 BB FE4 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc20 G OE1 GLN 133 G GLN 110 1_555 EB K K . G K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
metalc ? metalc21 G SG CYS 137 G CYS 114 1_555 BB FE2 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc22 G SG CYS 176 G CYS 153 1_555 CB FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc23 G SG CYS 179 G CYS 156 1_555 CB FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? 
metalc ? metalc24 G SG CYS 182 G CYS 159 1_555 CB FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc25 G O ILE 223 G ILE 200 1_555 EB K K . G K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? 
metalc ? metalc26 G SG CYS 226 G CYS 203 1_555 CB FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc27 G O CYS 226 G CYS 203 1_555 EB K K . G K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc28 G O VAL 228 G VAL 205 1_555 EB K K . G K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc29 G O LEU 231 G LEU 208 1_555 EB K K . G K 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.194 ? 
metalc ? metalc30 I SG CYS 113 I CYS 77 1_555 JB FE2 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc31 I SG CYS 116 I CYS 80 1_555 JB FE4 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc32 I SG CYS 119 I CYS 83 1_555 JB FE3 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc33 I SG CYS 123 I CYS 87 1_555 IB FE2 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc34 I SG CYS 152 I CYS 116 1_555 IB FE4 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc35 I SG CYS 155 I CYS 119 1_555 IB FE1 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc36 I SG CYS 158 I CYS 122 1_555 IB FE3 SF4 . I SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc37 I SG CYS 162 I CYS 126 1_555 JB FE1 SF4 . I SF4 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc38 M O GLU 335 M GLU 335 1_555 XB ZN ZN . M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc39 M NE2 HIS 338 M HIS 338 1_555 XB ZN ZN . M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc40 XB ZN ZN . M ZN 601 1_555 GA OD2 ASP 63 g ASP 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc41 HC O1G DGT . O DGT 401 1_555 IC MG MG . O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc42 HC O1B DGT . O DGT 401 1_555 IC MG MG . O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.838 ? 
metalc ? metalc43 HC O1A DGT . O DGT 401 1_555 IC MG MG . O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? 
metalc ? metalc44 R SG CYS 87 R CYS 59 1_555 LC ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc45 R NE2 HIS 96 R HIS 68 1_555 LC ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
metalc ? metalc46 R SG CYS 112 R CYS 84 1_555 LC ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc47 R SG CYS 115 R CYS 87 1_555 LC ZN ZN . R ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 1423 n n 
FE1 S3 SF4 sing 1424 n n 
FE1 S4 SF4 sing 1425 n n 
FE2 S1 SF4 sing 1426 n n 
FE2 S3 SF4 sing 1427 n n 
FE2 S4 SF4 sing 1428 n n 
FE3 S1 SF4 sing 1429 n n 
FE3 S2 SF4 sing 1430 n n 
FE3 S4 SF4 sing 1431 n n 
FE4 S1 SF4 sing 1432 n n 
FE4 S2 SF4 sing 1433 n n 
FE4 S3 SF4 sing 1434 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8Q1U 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
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ZA 50 FMN F 1 501 501 FMN FMN . 
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QB 53 CDL L 1 701 701 CDL CDL . 
RB 45 3PE L 1 702 17 3PE 3PE . 
SB 45 3PE L 1 703 48 3PE 3PE . 
TB 45 3PE L 1 704 52 3PE 3PE . 
UB 45 3PE L 1 705 67 3PE 3PE . 
VB 46 PC1 L 1 706 83 PC1 PC1 . 
WB 48 PLC L 1 707 53 PLC PLC . 
XB 54 ZN M 1 601 601 ZN ZN . 
YB 53 CDL M 1 602 57 CDL CDL . 
ZB 45 3PE M 1 603 35 3PE 3PE . 
AC 46 PC1 M 1 604 34 PC1 PC1 . 
BC 46 PC1 M 1 605 56 PC1 PC1 . 
CC 53 CDL N 1 401 60 CDL CDL . 
DC 45 3PE N 1 402 54 3PE 3PE . 
EC 45 3PE N 1 403 55 3PE 3PE . 
FC 45 3PE N 1 404 71 3PE 3PE . 
GC 48 PLC N 1 405 61 PLC PLC . 
HC 55 DGT O 1 401 401 DGT DGT . 
IC 56 MG O 1 402 402 MG MG . 
JC 57 NDP P 1 501 501 NDP NDP . 
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OC 53 CDL X 1 201 58 CDL CDL . 
PC 45 3PE Y 1 201 66 3PE 3PE . 
QC 45 3PE Y 1 202 68 3PE 3PE . 
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SC 45 3PE Y 1 204 70 3PE 3PE . 
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WC 48 PLC b 1 102 8 PLC PLC . 
XC 53 CDL d 1 201 33 CDL CDL . 
YC 45 3PE d 1 202 31 3PE 3PE . 
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ID 60 MYR o 1 201 201 MYR MYR . 
JD 45 3PE o 1 202 24 3PE 3PE . 
KD 53 CDL q 1 201 43 CDL CDL . 
LD 46 PC1 q 1 202 40 PC1 PC1 . 
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