data_8Q8P # _model_server_result.job_id MPGvE92cwvpL2kXJR8q7ew _model_server_result.datetime_utc '2024-12-12 04:56:57' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8q8p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":601}' # _entry.id 8Q8P # _exptl.entry_id 8Q8P _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8Q8P _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8Q8P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG SER 214 A SER 328 1_555 I MG MG . A MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 260 A GLU 374 1_555 F MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 264 A GLU 378 1_555 F MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? metalc ? metalc4 B OG SER 214 B SER 328 1_555 N MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc5 B OE2 GLU 260 B GLU 374 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc6 B OE2 GLU 264 B GLU 378 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? metalc ? metalc7 C OG SER 214 C SER 328 1_555 Q MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc8 C OE1 GLN 218 C GLN 332 1_555 R MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.975 ? metalc ? metalc9 C OE2 GLU 260 C GLU 374 1_555 S MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc10 C OE2 GLU 264 C GLU 378 1_555 S MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? metalc ? metalc11 D OG SER 214 D SER 328 1_555 V MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc12 D OE1 GLN 218 D GLN 332 1_555 W MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc13 D OE2 GLU 260 D GLU 374 1_555 X MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc14 D OE2 GLU 264 D GLU 378 1_555 X MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? metalc ? metalc15 E OG SER 214 E SER 328 1_555 Z MG MG . E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc16 E OE1 GLN 218 E GLN 332 1_555 AA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.996 ? metalc ? metalc17 E OE2 GLU 260 E GLU 374 1_555 BA MG MG . E MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc18 E OE2 GLU 264 E GLU 378 1_555 BA MG MG . E MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8Q8P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 2 MG A 1 601 501 MG MG . G 2 MG A 1 602 502 MG MG . H 2 MG A 1 603 504 MG MG . I 2 MG A 1 604 503 MG MG . J 2 MG A 1 605 504 MG MG . K 2 MG A 1 606 601 MG MG . L 2 MG A 1 607 602 MG MG . M 2 MG A 1 608 603 MG MG . N 2 MG B 1 601 503 MG MG . O 2 MG B 1 602 501 MG MG . P 2 MG B 1 603 502 MG MG . Q 2 MG C 1 601 503 MG MG . R 2 MG C 1 602 504 MG MG . S 2 MG C 1 603 501 MG MG . T 2 MG C 1 604 502 MG MG . U 2 MG C 1 605 604 MG MG . V 2 MG D 1 601 503 MG MG . W 2 MG D 1 602 504 MG MG . X 2 MG D 1 603 501 MG MG . Y 2 MG D 1 604 502 MG MG . Z 2 MG E 1 601 503 MG MG . AA 2 MG E 1 602 504 MG MG . BA 2 MG E 1 603 501 MG MG . CA 2 MG E 1 604 502 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 187.857 _atom_site.Cartn_y 178.221 _atom_site.Cartn_z 230.167 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 21.84 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 601 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 31 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 309 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #