data_8QWF # _model_server_result.job_id cKjclEHMD4VQ_BGFdgb6Uw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-11 03:14:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8qwf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":1302}' # _entry.id 8QWF # _exptl.entry_id 8QWF _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8QWF _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8QWF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 H N N ? 5 I N N ? 5 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O LYS 761 A LYS 761 1_555 I MG MG . C MG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 878 A ASP 878 1_555 G MG MG . A MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 878 A ASP 878 1_555 G MG MG . A MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc4 A OG SER 1044 A SER 1044 1_555 H MG MG . A MG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? metalc ? metalc5 F MG MG . A MG 1302 1_555 D OP2 DA 8 N DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? metalc ? metalc6 B OP2 A 17 C A -3 1_555 I MG MG . C MG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog1 B N6 A 3 C A -17 1_555 B O2 U 11 C U -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog2 B N7 A 3 C A -17 1_555 B N3 U 11 C U -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog3 B N3 U 5 C U -15 1_555 B O2 U 20 C U 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog4 B O4 U 5 C U -15 1_555 B N3 U 20 C U 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog5 B O4 U 6 C U -14 1_555 B N6 A 19 C A -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N3 C 7 C C -13 1_555 B N1 G 18 C G -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N4 C 7 C C -13 1_555 B O6 G 18 C G -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B O2 C 7 C C -13 1_555 B N2 G 18 C G -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N3 U 8 C U -12 1_555 B N1 A 17 C A -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B O4 U 8 C U -12 1_555 B N6 A 17 C A -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N1 A 9 C A -11 1_555 B N3 U 16 C U -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N6 A 9 C A -11 1_555 B O4 U 16 C U -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N3 C 10 C C -10 1_555 B N1 G 15 C G -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N4 C 10 C C -10 1_555 B O6 G 15 C G -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O2 C 10 C C -10 1_555 B N2 G 15 C G -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 U 21 C U 1 1_555 C N1 DA 27 T DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O4 U 21 C U 1 1_555 C N6 DA 27 T DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N3 C 22 C C 2 1_555 C N1 DG 26 T DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N4 C 22 C C 2 1_555 C O6 DG 26 T DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O2 C 22 C C 2 1_555 C N2 DG 26 T DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 C 23 C C 3 1_555 C N1 DG 25 T DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N4 C 23 C C 3 1_555 C O6 DG 25 T DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O2 C 23 C C 3 1_555 C N2 DG 25 T DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N3 U 24 C U 4 1_555 C N1 DA 24 T DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B O4 U 24 C U 4 1_555 C N6 DA 24 T DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N1 A 25 C A 5 1_555 C N3 DT 23 T DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N6 A 25 C A 5 1_555 C O4 DT 23 T DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N1 A 26 C A 6 1_555 C N3 DT 22 T DT -6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N6 A 26 C A 6 1_555 C O4 DT 22 T DT -6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N1 G 27 C G 7 1_555 C N3 DC 21 T DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N2 G 27 C G 7 1_555 C O2 DC 21 T DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O6 G 27 C G 7 1_555 C N4 DC 21 T DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N1 G 28 C G 8 1_555 C N3 DC 20 T DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N2 G 28 C G 8 1_555 C O2 DC 20 T DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B O6 G 28 C G 8 1_555 C N4 DC 20 T DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N3 C 29 C C 9 1_555 C N1 DG 19 T DG -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N4 C 29 C C 9 1_555 C O6 DG 19 T DG -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O2 C 29 C C 9 1_555 C N2 DG 19 T DG -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N1 G 30 C G 10 1_555 C N3 DC 18 T DC -10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N2 G 30 C G 10 1_555 C O2 DC 18 T DC -10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O6 G 30 C G 10 1_555 C N4 DC 18 T DC -10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N3 U 31 C U 11 1_555 C N1 DA 17 T DA -11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B O4 U 31 C U 11 1_555 C N6 DA 17 T DA -11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B N3 U 32 C U 12 1_555 C N1 DA 16 T DA -12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B O4 U 32 C U 12 1_555 C N6 DA 16 T DA -12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-DT PAIR' hydrog46 B N6 A 33 C A 13 1_555 C O2 DT 15 T DT -13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C N3 DT 28 T DT 0 1_555 D N1 DA 12 N DA 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C O4 DT 28 T DT 0 1_555 D N6 DA 12 N DA 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C N1 DA 29 T DA 1 1_555 D N3 DT 11 N DT -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 C N6 DA 29 T DA 1 1_555 D O4 DT 11 N DT -1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 C N1 DA 30 T DA 2 1_555 D N3 DT 10 N DT -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 C N6 DA 30 T DA 2 1_555 D O4 DT 10 N DT -2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 C N1 DA 31 T DA 3 1_555 D N3 DT 9 N DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 C N6 DA 31 T DA 3 1_555 D O4 DT 9 N DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 C N3 DT 32 T DT 4 1_555 D N1 DA 8 N DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 C O4 DT 32 T DT 4 1_555 D N6 DA 8 N DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 C N1 DA 33 T DA 5 1_555 D N3 DT 7 N DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 C N6 DA 33 T DA 5 1_555 D O4 DT 7 N DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 C N3 DT 34 T DT 6 1_555 D N1 DA 6 N DA -6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 C O4 DT 34 T DT 6 1_555 D N6 DA 6 N DA -6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 C N1 DG 35 T DG 7 1_555 D N3 DC 5 N DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 C N2 DG 35 T DG 7 1_555 D O2 DC 5 N DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 C O6 DG 35 T DG 7 1_555 D N4 DC 5 N DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 C N3 DC 36 T DC 8 1_555 D N1 DG 4 N DG -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 C N4 DC 36 T DC 8 1_555 D O6 DG 4 N DG -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 C O2 DC 36 T DC 8 1_555 D N2 DG 4 N DG -8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 C N3 DT 37 T DT 9 1_555 D N1 DA 3 N DA -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 C O4 DT 37 T DT 9 1_555 D N6 DA 3 N DA -9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog69 C N2 DG 39 T DG 11 1_555 D O2 DC 1 N DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8QWF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 MG A 1 1301 1402 MG MG . F 5 MG A 1 1302 1403 MG MG . G 5 MG A 1 1303 1405 MG MG . H 5 MG A 1 1304 1406 MG MG . I 5 MG C 1 1401 1401 MG MG . J 5 MG C 1 1402 1404 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 132.632 _atom_site.Cartn_y 137.881 _atom_site.Cartn_z 95.631 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 18.43 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1302 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #