data_8R1A
#
_model_server_result.job_id            OcEmqIwGd3_Wz96_RWzqGg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-16 11:23:33' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8r1a 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    8R1A 
#
_exptl.entry_id    8R1A 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 H N N 
? 3 K N N 
? 3 N N N 
? 3 Q N N 
? 3 T N N 
? 3 W N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG SER 63 A SER 52 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.908 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 86 A THR 75 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc3 H MG MG . A MG 601 1_555 I O1A GDP . A GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? 
metalc ? metalc4 H MG MG . A MG 601 1_555 I O2B GDP . A GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc5 B OG1 THR 86 B THR 75 1_555 K MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc6 K MG MG . B MG 601 1_555 L O2B GDP . B GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
metalc ? metalc7 C OG SER 63 C SER 52 1_555 N MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? 
metalc ? metalc8 C OG1 THR 86 C THR 75 1_555 N MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc9 N MG MG . C MG 601 1_555 O O2B GDP . C GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc10 N MG MG . C MG 601 1_555 O O1A GDP . C GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? 
metalc ? metalc11 D OG1 THR 86 D THR 75 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc12 Q MG MG . D MG 601 1_555 R O2B GDP . D GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
metalc ? metalc13 E OG SER 63 E SER 52 1_555 T MG MG . E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? 
metalc ? metalc14 E OG1 THR 86 E THR 75 1_555 T MG MG . E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc15 T MG MG . E MG 601 1_555 U O1A GDP . E GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? 
metalc ? metalc16 T MG MG . E MG 601 1_555 U O2B GDP . E GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc17 F OG1 THR 86 F THR 75 1_555 W MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc18 W MG MG . F MG 601 1_555 X O2B GDP . F GDP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8R1A 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
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_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 AF3 A 1 600 600 AF3 AF3 . 
H 3 MG A 1 601 601 MG MG . 
I 4 GDP A 1 602 602 GDP GDP . 
J 2 AF3 B 1 600 600 AF3 AF3 . 
K 3 MG B 1 601 601 MG MG . 
L 4 GDP B 1 602 602 GDP GDP . 
M 2 AF3 C 1 600 600 AF3 AF3 . 
N 3 MG C 1 601 601 MG MG . 
O 4 GDP C 1 602 602 GDP GDP . 
P 2 AF3 D 1 600 600 AF3 AF3 . 
Q 3 MG D 1 601 601 MG MG . 
R 4 GDP D 1 602 602 GDP GDP . 
S 2 AF3 E 1 600 600 AF3 AF3 . 
T 3 MG E 1 601 601 MG MG . 
U 4 GDP E 1 602 602 GDP GDP . 
V 2 AF3 F 1 600 600 AF3 AF3 . 
W 3 MG F 1 601 601 MG MG . 
X 4 GDP F 1 602 602 GDP GDP . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         K 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               217.602 
_atom_site.Cartn_y               242.04 
_atom_site.Cartn_z               452.311 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        100 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           601 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
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_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#