data_8R1Z # _model_server_result.job_id ucAdq2ERWjxmEPl6ySCZZw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-12 15:46:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8r1z # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1401}' # _entry.id 8R1Z # _exptl.entry_id 8R1Z _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8R1Z _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8R1Z _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 25 A CYS 903 1_555 A SG CYS 158 A CYS 1036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 47 A CYS 925 1_555 A SG CYS 193 A CYS 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 56 A CYS 934 1_555 A SG CYS 155 A CYS 1033 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 75 A CYS 953 1_555 A SG CYS 82 A CYS 960 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 203 A CYS 1081 1_555 A SG CYS 246 A CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 217 A CYS 1095 1_555 A SG CYS 241 A CYS 1119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 228 A CYS 1106 1_555 A SG CYS 268 A CYS 1146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 248 A CYS 1126 1_555 A SG CYS 256 A CYS 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 258 A CYS 1136 1_555 A SG CYS 283 A CYS 1161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 274 A CYS 1152 1_555 A SG CYS 303 A CYS 1181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 287 A CYS 1165 1_555 A SG CYS 328 A CYS 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 307 A CYS 1185 1_555 A SG CYS 318 A CYS 1196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 311 A CYS 1189 1_555 A SG CYS 350 A CYS 1228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 332 A CYS 1210 1_555 A SG CYS 346 A CYS 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 25 B CYS 903 1_555 B SG CYS 158 B CYS 1036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 47 B CYS 925 1_555 B SG CYS 193 B CYS 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 56 B CYS 934 1_555 B SG CYS 155 B CYS 1033 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 75 B CYS 953 1_555 B SG CYS 82 B CYS 960 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 203 B CYS 1081 1_555 B SG CYS 246 B CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 217 B CYS 1095 1_555 B SG CYS 241 B CYS 1119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 228 B CYS 1106 1_555 B SG CYS 268 B CYS 1146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 248 B CYS 1126 1_555 B SG CYS 256 B CYS 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 258 B CYS 1136 1_555 B SG CYS 283 B CYS 1161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 274 B CYS 1152 1_555 B SG CYS 303 B CYS 1181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 287 B CYS 1165 1_555 B SG CYS 328 B CYS 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 307 B CYS 1185 1_555 B SG CYS 318 B CYS 1196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 311 B CYS 1189 1_555 B SG CYS 350 B CYS 1228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 332 B CYS 1210 1_555 B SG CYS 346 B CYS 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 37 A ASP 915 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 160 A ASN 1038 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 162 A ASP 1040 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.187 ? metalc ? metalc4 A O ILE 164 A ILE 1042 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc5 A O ASN 167 A ASN 1045 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.154 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASN 167 A ASN 1045 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 168 A ASP 1046 1_555 C CA CA . A CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 37 B ASP 915 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc9 B OD1 ASN 160 B ASN 1038 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASP 162 B ASP 1040 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.181 ? metalc ? metalc11 B O ILE 164 B ILE 1042 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc12 B O ASN 167 B ASN 1045 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.158 ? metalc ? metalc13 B OD1 ASN 167 B ASN 1045 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc14 B OD1 ASP 168 B ASP 1046 1_555 D CA CA . B CA 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8R1Z _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 1401 1230 CA CA . D 2 CA B 1 1401 1230 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 80.508 _atom_site.Cartn_y 134.598 _atom_site.Cartn_z 102.878 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 55.94 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1401 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #