data_8R9W # _model_server_result.job_id h1_UEaOcA3E80DFzTj1n9w _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 01:26:12' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8r9w # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":1102}' # _entry.id 8R9W # _exptl.entry_id 8R9W _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8R9W _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8R9W _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG A 1025 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG A 1026 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG A 1029 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG A 1030 NAG 5 n K BMA 3 J 3 BMA A 1031 BMA 4 n L NAG 1 K 1 NAG A 1034 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG A 1035 NAG 6 n M NAG 1 M 1 NAG A 1215 NAG 6 n M NAG 2 M 2 NAG A 1216 NAG 6 n M BMA 3 M 3 BMA A 1217 BMA 6 n M MAN 4 M 4 MAN A 1220 MAN 6 n M MAN 5 M 5 MAN A 1221 MAN 4 n N NAG 1 N 1 NAG A 2001 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG A 2002 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG B 1025 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG B 1026 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG B 1029 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG B 1030 NAG 5 n P BMA 3 P 3 BMA B 1031 BMA 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 1034 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 1035 NAG 6 n R NAG 1 R 1 NAG B 1215 NAG 6 n R NAG 2 R 2 NAG B 1216 NAG 6 n R BMA 3 R 3 BMA B 1217 BMA 6 n R MAN 4 R 4 MAN B 1220 MAN 6 n R MAN 5 R 5 MAN B 1221 MAN 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 2001 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 2002 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG C 1025 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG C 1026 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG C 1029 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG C 1030 NAG 5 n U BMA 3 U 3 BMA C 1031 BMA 4 n V NAG 1 V 1 NAG C 1034 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG C 1035 NAG 6 n W NAG 1 W 1 NAG C 1215 NAG 6 n W NAG 2 W 2 NAG C 1216 NAG 6 n W BMA 3 W 3 BMA C 1217 BMA 6 n W MAN 4 W 4 MAN C 1220 MAN 6 n W MAN 5 W 5 MAN C 1221 MAN 4 n X NAG 1 X 1 NAG C 2001 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG C 2002 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 A SG CYS 97 A CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 138 A CYS 157 1_555 A SG CYS 162 A CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 241 A CYS 260 1_555 A SG CYS 251 A CYS 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 316 A CYS 335 1_555 A SG CYS 359 A CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 330 A CYS 349 1_555 A SG CYS 333 A CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 414 A CYS 433 1_555 A SG CYS 465 A CYS 484 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 513 A CYS 532 1_555 A SG CYS 526 A CYS 545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 578 A CYS 597 1_555 A SG CYS 600 A CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 583 A CYS 602 1_555 A SG CYS 589 A CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 680 A CYS 699 1_555 A SG CYS 691 A CYS 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 882 A CYS 901 1_555 A SG CYS 893 A CYS 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 932 A CYS 951 1_555 A SG CYS 978 A CYS 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 H SG CYS 74 B CYS 93 1_555 H SG CYS 97 B CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 H SG CYS 138 B CYS 157 1_555 H SG CYS 162 B CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 H SG CYS 241 B CYS 260 1_555 H SG CYS 251 B CYS 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 H SG CYS 316 B CYS 335 1_555 H SG CYS 359 B CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 H SG CYS 330 B CYS 349 1_555 H SG CYS 333 B CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 H SG CYS 414 B CYS 433 1_555 H SG CYS 465 B CYS 484 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 H SG CYS 513 B CYS 532 1_555 H SG CYS 526 B CYS 545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 H SG CYS 578 B CYS 597 1_555 H SG CYS 600 B CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 H SG CYS 583 B CYS 602 1_555 H SG CYS 589 B CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 H SG CYS 680 B CYS 699 1_555 H SG CYS 691 B CYS 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 H SG CYS 882 B CYS 901 1_555 H SG CYS 893 B CYS 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 932 B CYS 951 1_555 H SG CYS 978 B CYS 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 74 C CYS 93 1_555 I SG CYS 97 C CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 138 C CYS 157 1_555 I SG CYS 162 C CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 241 C CYS 260 1_555 I SG CYS 251 C CYS 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 316 C CYS 335 1_555 I SG CYS 359 C CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 330 C CYS 349 1_555 I SG CYS 333 C CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 414 C CYS 433 1_555 I SG CYS 465 C CYS 484 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 513 C CYS 532 1_555 I SG CYS 526 C CYS 545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 578 C CYS 597 1_555 I SG CYS 600 C CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 583 C CYS 602 1_555 I SG CYS 589 C CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 I SG CYS 680 C CYS 699 1_555 I SG CYS 691 C CYS 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 I SG CYS 882 C CYS 901 1_555 I SG CYS 893 C CYS 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 I SG CYS 932 C CYS 951 1_555 I SG CYS 978 C CYS 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 55 A ASN 74 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 80 A ASN 99 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 143 A ASN 162 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 165 A ASN 184 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 222 A ASN 241 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 232 A ASN 251 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 292 A ASN 311 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 453 A ASN 472 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 475 A ASN 494 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 507 A ASN 526 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 633 A ASN 652 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 642 A ASN 661 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 769 A ASN 788 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 895 A ASN 914 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 926 A ASN 945 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 984 A ASN 1003 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 H ND2 ASN 55 B ASN 74 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale18 H ND2 ASN 80 B ASN 99 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 H ND2 ASN 143 B ASN 162 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale20 H ND2 ASN 165 B ASN 184 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 H ND2 ASN 222 B ASN 241 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale22 H ND2 ASN 232 B ASN 251 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 H ND2 ASN 292 B ASN 311 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 H ND2 ASN 453 B ASN 472 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 H ND2 ASN 475 B ASN 494 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 H ND2 ASN 507 B ASN 526 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale27 H ND2 ASN 633 B ASN 652 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 H ND2 ASN 642 B ASN 661 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale29 H ND2 ASN 769 B ASN 788 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 H ND2 ASN 895 B ASN 914 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 H ND2 ASN 926 B ASN 945 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 H ND2 ASN 984 B ASN 1003 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 55 C ASN 74 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 80 C ASN 99 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 143 C ASN 162 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 I ND2 ASN 165 C ASN 184 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 I ND2 ASN 222 C ASN 241 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale38 I ND2 ASN 232 C ASN 251 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale39 I ND2 ASN 292 C ASN 311 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 I ND2 ASN 453 C ASN 472 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale41 I ND2 ASN 475 C ASN 494 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 I ND2 ASN 507 C ASN 526 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale43 I ND2 ASN 633 C ASN 652 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 I ND2 ASN 642 C ASN 661 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale45 I ND2 ASN 769 C ASN 788 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale46 I ND2 ASN 895 C ASN 914 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale47 I ND2 ASN 926 C ASN 945 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale48 I ND2 ASN 984 C ASN 1003 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale49 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale50 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale51 K O4 NAG . J NAG 2 1_555 K C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale52 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale53 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale54 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale55 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale56 M O6 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale57 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale58 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale59 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale60 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale61 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale62 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale63 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale64 R O3 BMA . R BMA 3 1_555 R C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale65 R O6 BMA . R BMA 3 1_555 R C1 MAN . R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale66 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale67 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale68 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale70 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale71 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale72 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 W O3 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale74 W O6 BMA . W BMA 3 1_555 W C1 MAN . W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale75 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8R9W _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 7 NAG A 1 1101 1018 NAG NAG . Z 7 NAG A 1 1102 1027 NAG NAG . AA 7 NAG A 1 1103 1032 NAG NAG . BA 7 NAG A 1 1104 1036 NAG NAG . CA 7 NAG A 1 1105 1037 NAG NAG . DA 7 NAG A 1 1106 1039 NAG NAG . EA 7 NAG A 1 1107 1040 NAG NAG . FA 7 NAG A 1 1108 1206 NAG NAG . GA 7 NAG A 1 1109 1208 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 1110 1211 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 1111 1214 NAG NAG . JA 7 NAG B 1 1101 1018 NAG NAG . KA 7 NAG B 1 1102 1027 NAG NAG . LA 7 NAG B 1 1103 1032 NAG NAG . MA 7 NAG B 1 1104 1036 NAG NAG . NA 7 NAG B 1 1105 1037 NAG NAG . OA 7 NAG B 1 1106 1039 NAG NAG . PA 7 NAG B 1 1107 1040 NAG NAG . QA 7 NAG B 1 1108 1206 NAG NAG . RA 7 NAG B 1 1109 1208 NAG NAG . SA 7 NAG B 1 1110 1211 NAG NAG . TA 7 NAG B 1 1111 1214 NAG NAG . UA 7 NAG C 1 1101 1018 NAG NAG . VA 7 NAG C 1 1102 1027 NAG NAG . WA 7 NAG C 1 1103 1032 NAG NAG . XA 7 NAG C 1 1104 1036 NAG NAG . YA 7 NAG C 1 1105 1037 NAG NAG . ZA 7 NAG C 1 1106 1039 NAG NAG . AB 7 NAG C 1 1107 1040 NAG NAG . BB 7 NAG C 1 1108 1206 NAG NAG . CB 7 NAG C 1 1109 1208 NAG NAG . DB 7 NAG C 1 1110 1211 NAG NAG . EB 7 NAG C 1 1111 1214 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . KA 7 205.363 154.006 225.875 1 122.01 ? C1 NAG 1102 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . KA 7 205.856 154.125 224.435 1 123.55 ? C2 NAG 1102 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . KA 7 206.447 152.798 223.968 1 131.08 ? C3 NAG 1102 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . KA 7 207.514 152.317 224.943 1 131.43 ? C4 NAG 1102 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . KA 7 206.954 152.275 226.361 1 126.92 ? C5 NAG 1102 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . KA 7 207.995 151.927 227.399 1 123.61 ? C6 NAG 1102 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . KA 7 204.617 155.811 223.152 1 129.3 ? C7 NAG 1102 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . KA 7 203.457 156.066 222.238 1 128.77 ? C8 NAG 1102 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . KA 7 204.784 154.545 223.55 1 124.15 ? N2 NAG 1102 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . KA 7 207.011 152.962 222.672 1 135.03 ? O3 NAG 1102 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . KA 7 207.956 151.015 224.576 1 131.45 ? O4 NAG 1102 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . KA 7 206.434 153.565 226.716 1 124.26 ? O5 NAG 1102 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . KA 7 208.144 152.969 228.354 1 120.41 ? O6 NAG 1102 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . KA 7 205.37 156.71 223.516 1 132.07 ? O7 NAG 1102 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 43 _model_server_stats.query_time_ms 274 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #