data_8RXB # _model_server_result.job_id tR5NbGJyfmVCqs8BSPTYzw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 10:11:52' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8rxb # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":202}' # _entry.id 8RXB # _exptl.entry_id 8RXB _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 13 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 113.361 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8RXB _cell.length_a 87.165 _cell.length_b 90.677 _cell.length_c 92.291 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8RXB _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 2yb' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N ? 3 W N N ? 3 X N N ? 3 Y N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 9 E CYS 9 1_555 M ZN ZN . E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 12 E CYS 12 1_555 M ZN ZN . E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 31 E CYS 31 1_555 M ZN ZN . E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc4 A ND1 HIS 41 E HIS 41 1_555 M ZN ZN . E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 69 E CYS 69 1_555 N ZN ZN . E ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 72 E CYS 72 1_555 N ZN ZN . E ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 95 E CYS 95 1_555 N ZN ZN . E ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 99 E CYS 99 1_555 N ZN ZN . E ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc9 C SG CYS 9 A CYS 9 1_555 P ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc10 C SG CYS 12 A CYS 12 1_555 P ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc11 C SG CYS 31 A CYS 31 1_555 P ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc12 C ND1 HIS 41 A HIS 41 1_555 P ZN ZN . A ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc13 C SG CYS 69 A CYS 69 1_555 Q ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc14 C SG CYS 72 A CYS 72 1_555 Q ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 95 A CYS 95 1_555 Q ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc16 C SG CYS 99 A CYS 99 1_555 Q ZN ZN . A ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc17 E SG CYS 9 D CYS 9 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc18 E SG CYS 12 D CYS 12 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc19 E SG CYS 31 D CYS 31 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc20 E ND1 HIS 41 D HIS 41 1_555 R ZN ZN . D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? metalc ? metalc21 E SG CYS 69 D CYS 69 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc22 E SG CYS 72 D CYS 72 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc23 E SG CYS 95 D CYS 95 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc24 E SG CYS 99 D CYS 99 1_555 S ZN ZN . D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc25 G SG CYS 9 I CYS 9 1_555 T ZN ZN . I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc26 G SG CYS 12 I CYS 12 1_555 T ZN ZN . I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc27 G SG CYS 31 I CYS 31 1_555 T ZN ZN . I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc28 G ND1 HIS 41 I HIS 41 1_555 T ZN ZN . I ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc29 G SG CYS 69 I CYS 69 1_555 U ZN ZN . I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc30 G SG CYS 72 I CYS 72 1_555 U ZN ZN . I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc31 G SG CYS 95 I CYS 95 1_555 U ZN ZN . I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc32 G SG CYS 99 I CYS 99 1_555 U ZN ZN . I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc33 I SG CYS 9 L CYS 9 1_555 V ZN ZN . L ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc34 I SG CYS 12 L CYS 12 1_555 V ZN ZN . L ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc35 I SG CYS 31 L CYS 31 1_555 V ZN ZN . L ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc36 I ND1 HIS 41 L HIS 41 1_555 V ZN ZN . L ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? metalc ? metalc37 I SG CYS 69 L CYS 69 1_555 W ZN ZN . L ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc38 I SG CYS 72 L CYS 72 1_555 W ZN ZN . L ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc39 I SG CYS 95 L CYS 95 1_555 W ZN ZN . L ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc40 I SG CYS 99 L CYS 99 1_555 W ZN ZN . L ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc41 K SG CYS 9 P CYS 9 1_555 X ZN ZN . P ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc42 K SG CYS 12 P CYS 12 1_555 X ZN ZN . P ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc43 K SG CYS 31 P CYS 31 1_555 X ZN ZN . P ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc44 K ND1 HIS 41 P HIS 41 1_555 X ZN ZN . P ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc45 K SG CYS 69 P CYS 69 1_555 Y ZN ZN . P ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc46 K SG CYS 72 P CYS 72 1_555 Y ZN ZN . P ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc47 K SG CYS 95 P CYS 95 1_555 Y ZN ZN . P ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc48 K SG CYS 99 P CYS 99 1_555 Y ZN ZN . P ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8RXB _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011472 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004955 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011028 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011803 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 3 ZN E 1 201 1163 ZN ZN . N 3 ZN E 1 202 1165 ZN ZN . O 3 ZN E 1 203 3 ZN ZN . P 3 ZN A 1 201 1163 ZN ZN . Q 3 ZN A 1 202 1165 ZN ZN . R 3 ZN D 1 201 1163 ZN ZN . S 3 ZN D 1 202 1165 ZN ZN . T 3 ZN I 1 201 1163 ZN ZN . U 3 ZN I 1 202 1165 ZN ZN . V 3 ZN L 1 201 1163 ZN ZN . W 3 ZN L 1 202 1165 ZN ZN . X 3 ZN P 1 201 1163 ZN ZN . Y 3 ZN P 1 202 1165 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Y _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 17.077 _atom_site.Cartn_y 27.839 _atom_site.Cartn_z 79.909 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 45.84 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id P _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #