data_8S0B # _model_server_result.job_id 23lvxKCPFfqJvXTAL3M5pw _model_server_result.datetime_utc '2025-04-01 21:33:49' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8s0b # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":901}' # _entry.id 8S0B # _exptl.entry_id 8S0B _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 13 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8S0B _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8S0B _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 M N N ? 13 P N N ? 13 Q N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B SG CYS 329 2 CYS 329 1_555 L ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 332 2 CYS 332 1_555 L ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 352 2 CYS 352 1_555 L ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 355 2 CYS 355 1_555 L ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc5 B OG SER 530 2 SER 530 1_555 K MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc ? metalc6 J O2G AGS . 2 AGS 1001 1_555 K MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.85 ? metalc ? metalc7 J O1B AGS . 2 AGS 1001 1_555 K MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? metalc ? metalc8 C OG SER 354 3 SER 352 1_555 N MG MG . 3 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASP 411 3 ASP 409 1_555 N MG MG . 3 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc10 C OD2 ASP 411 3 ASP 409 1_555 N MG MG . 3 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 306 4 CYS 306 1_555 O ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc12 D SG CYS 309 4 CYS 309 1_555 O ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc13 D SG CYS 328 4 CYS 328 1_555 O ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc14 D SG CYS 331 4 CYS 331 1_555 O ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc15 P O1B ADP . 4 ADP 902 1_555 W MG MG . 7 MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc16 P O2B ADP . 4 ADP 902 1_555 W MG MG . 7 MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc17 P O3B ADP . 4 ADP 902 1_555 W MG MG . 7 MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc18 E SG CYS 172 5 CYS 172 1_555 S ZN ZN . 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc19 E SG CYS 175 5 CYS 175 1_555 S ZN ZN . 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc20 E SG CYS 197 5 CYS 197 1_555 S ZN ZN . 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc21 E OG SER 388 5 SER 388 1_555 R MG MG . 5 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc22 Q O1B ADP . 5 ADP 801 1_555 R MG MG . 5 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 158 6 CYS 158 1_555 V ZN ZN . 6 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc24 F SG CYS 161 6 CYS 161 1_555 V ZN ZN . 6 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc25 F SG CYS 180 6 CYS 180 1_555 V ZN ZN . 6 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc26 F SG CYS 185 6 CYS 185 1_555 V ZN ZN . 6 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc27 F OG SER 403 6 SER 403 1_555 U MG MG . 6 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc28 T O2G AGS . 6 AGS 901 1_555 U MG MG . 6 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? metalc ? metalc29 T O1B AGS . 6 AGS 901 1_555 U MG MG . 6 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc30 G SG CYS 184 7 CYS 184 1_555 Z ZN ZN . 7 ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc31 G SG CYS 187 7 CYS 187 1_555 Z ZN ZN . 7 ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc32 G SG CYS 206 7 CYS 206 1_555 Z ZN ZN . 7 ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc33 G OG SER 208 7 SER 208 1_555 Z ZN ZN . 7 ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc34 G SG CYS 211 7 CYS 211 1_555 Z ZN ZN . 7 ZN 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc35 G OG SER 388 7 SER 388 1_555 Y MG MG . 7 MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc ? metalc36 G OE1 GLU 463 7 GLU 463 1_555 W MG MG . 7 MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? metalc ? metalc37 X O3G AGS . 7 AGS 802 1_555 Y MG MG . 7 MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 H N3 DC 1 X DC 14 1_555 I N1 DG 45 Y DG 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 H N4 DC 1 X DC 14 1_555 I O6 DG 45 Y DG 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 H O2 DC 1 X DC 14 1_555 I N2 DG 45 Y DG 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 H N3 DT 2 X DT 15 1_555 I N1 DA 44 Y DA 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 H O4 DT 2 X DT 15 1_555 I N6 DA 44 Y DA 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 H N1 DG 3 X DG 16 1_555 I N3 DC 43 Y DC 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 H N2 DG 3 X DG 16 1_555 I O2 DC 43 Y DC 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 H O6 DG 3 X DG 16 1_555 I N4 DC 43 Y DC 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 H N1 DA 4 X DA 17 1_555 I N3 DT 42 Y DT 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 H N6 DA 4 X DA 17 1_555 I O4 DT 42 Y DT 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 H N3 DC 5 X DC 18 1_555 I N1 DG 41 Y DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 H N4 DC 5 X DC 18 1_555 I O6 DG 41 Y DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 H O2 DC 5 X DC 18 1_555 I N2 DG 41 Y DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 H N3 DT 6 X DT 19 1_555 I N1 DA 40 Y DA 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 H O4 DT 6 X DT 19 1_555 I N6 DA 40 Y DA 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 H N1 DG 7 X DG 20 1_555 I N3 DC 39 Y DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 H N2 DG 7 X DG 20 1_555 I O2 DC 39 Y DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 H O6 DG 7 X DG 20 1_555 I N4 DC 39 Y DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 H N1 DA 8 X DA 21 1_555 I N3 DT 38 Y DT 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 H N6 DA 8 X DA 21 1_555 I O4 DT 38 Y DT 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 H N3 DC 9 X DC 22 1_555 I N1 DG 37 Y DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 H N4 DC 9 X DC 22 1_555 I O6 DG 37 Y DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 H O2 DC 9 X DC 22 1_555 I N2 DG 37 Y DG 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 H N3 DT 10 X DT 23 1_555 I N1 DA 36 Y DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 H O4 DT 10 X DT 23 1_555 I N6 DA 36 Y DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 H N1 DG 11 X DG 24 1_555 I N3 DC 35 Y DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 H N2 DG 11 X DG 24 1_555 I O2 DC 35 Y DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 H O6 DG 11 X DG 24 1_555 I N4 DC 35 Y DC 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 H N1 DA 12 X DA 25 1_555 I N3 DT 34 Y DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 H N6 DA 12 X DA 25 1_555 I O4 DT 34 Y DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 H N1 DA 13 X DA 26 1_555 I N3 DT 33 Y DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 H N6 DA 13 X DA 26 1_555 I O4 DT 33 Y DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 H N3 DC 14 X DC 27 1_555 I N1 DG 32 Y DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 H N4 DC 14 X DC 27 1_555 I O6 DG 32 Y DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 H O2 DC 14 X DC 27 1_555 I N2 DG 32 Y DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 H N3 DT 15 X DT 28 1_555 I N1 DA 31 Y DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 H O4 DT 15 X DT 28 1_555 I N6 DA 31 Y DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 H N1 DA 16 X DA 29 1_555 I N3 DT 30 Y DT 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 H N6 DA 16 X DA 29 1_555 I O4 DT 30 Y DT 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 H N3 DT 17 X DT 30 1_555 I N1 DA 29 Y DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 H O4 DT 17 X DT 30 1_555 I N6 DA 29 Y DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 H N1 DG 18 X DG 31 1_555 I N3 DC 28 Y DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 H N2 DG 18 X DG 31 1_555 I O2 DC 28 Y DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 H O6 DG 18 X DG 31 1_555 I N4 DC 28 Y DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 H N3 DC 19 X DC 32 1_555 I N1 DG 27 Y DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 H N4 DC 19 X DC 32 1_555 I O6 DG 27 Y DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 H O2 DC 19 X DC 32 1_555 I N2 DG 27 Y DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 H N1 DA 20 X DA 33 1_555 I N3 DT 26 Y DT 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 H N6 DA 20 X DA 33 1_555 I O4 DT 26 Y DT 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 H N3 DT 21 X DT 34 1_555 I N1 DA 25 Y DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 H O4 DT 21 X DT 34 1_555 I N6 DA 25 Y DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 H N1 DG 22 X DG 35 1_555 I N3 DC 24 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 H N2 DG 22 X DG 35 1_555 I O2 DC 24 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 H O6 DG 22 X DG 35 1_555 I N4 DC 24 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 H N3 DC 23 X DC 36 1_555 I N1 DG 23 Y DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 H N4 DC 23 X DC 36 1_555 I O6 DG 23 Y DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 H O2 DC 23 X DC 36 1_555 I N2 DG 23 Y DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 H N1 DA 24 X DA 37 1_555 I N3 DT 22 Y DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 H N6 DA 24 X DA 37 1_555 I O4 DT 22 Y DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 H N3 DT 25 X DT 38 1_555 I N1 DA 21 Y DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 H O4 DT 25 X DT 38 1_555 I N6 DA 21 Y DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 H N1 DG 26 X DG 39 1_555 I N3 DC 20 Y DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 H N2 DG 26 X DG 39 1_555 I O2 DC 20 Y DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 H O6 DG 26 X DG 39 1_555 I N4 DC 20 Y DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 H N3 DC 27 X DC 40 1_555 I N1 DG 19 Y DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 H N4 DC 27 X DC 40 1_555 I O6 DG 19 Y DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 H O2 DC 27 X DC 40 1_555 I N2 DG 19 Y DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 H N1 DG 28 X DG 41 1_555 I N3 DC 18 Y DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 H N2 DG 28 X DG 41 1_555 I O2 DC 18 Y DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 H O6 DG 28 X DG 41 1_555 I N4 DC 18 Y DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 H N3 DC 29 X DC 42 1_555 I N1 DG 17 Y DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 H N4 DC 29 X DC 42 1_555 I O6 DG 17 Y DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 H O2 DC 29 X DC 42 1_555 I N2 DG 17 Y DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 H N1 DA 30 X DA 43 1_555 I N3 DT 16 Y DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 H N6 DA 30 X DA 43 1_555 I O4 DT 16 Y DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 H N3 DT 31 X DT 44 1_555 I N1 DA 15 Y DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 H O4 DT 31 X DT 44 1_555 I N6 DA 15 Y DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 H N1 DG 32 X DG 45 1_555 I N3 DC 14 Y DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 H N2 DG 32 X DG 45 1_555 I O2 DC 14 Y DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 H O6 DG 32 X DG 45 1_555 I N4 DC 14 Y DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 H N3 DC 33 X DC 46 1_555 I N1 DG 13 Y DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 H N4 DC 33 X DC 46 1_555 I O6 DG 13 Y DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 H O2 DC 33 X DC 46 1_555 I N2 DG 13 Y DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 H N1 DA 34 X DA 47 1_555 I N3 DT 12 Y DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 H N6 DA 34 X DA 47 1_555 I O4 DT 12 Y DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 H N3 DT 35 X DT 48 1_555 I N1 DA 11 Y DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 H O4 DT 35 X DT 48 1_555 I N6 DA 11 Y DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 H N1 DG 36 X DG 49 1_555 I N3 DC 10 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 H N2 DG 36 X DG 49 1_555 I O2 DC 10 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 H O6 DG 36 X DG 49 1_555 I N4 DC 10 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 H N3 DC 37 X DC 50 1_555 I N1 DG 9 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 H N4 DC 37 X DC 50 1_555 I O6 DG 9 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 H O2 DC 37 X DC 50 1_555 I N2 DG 9 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 H N1 DA 38 X DA 51 1_555 I N3 DT 8 Y DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 H N6 DA 38 X DA 51 1_555 I O4 DT 8 Y DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 H N3 DT 39 X DT 52 1_555 I N1 DA 7 Y DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 H O4 DT 39 X DT 52 1_555 I N6 DA 7 Y DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 H N1 DG 40 X DG 53 1_555 I N3 DC 6 Y DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 H N2 DG 40 X DG 53 1_555 I O2 DC 6 Y DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 H O6 DG 40 X DG 53 1_555 I N4 DC 6 Y DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 H N3 DC 41 X DC 54 1_555 I N1 DG 5 Y DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 H N4 DC 41 X DC 54 1_555 I O6 DG 5 Y DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 H O2 DC 41 X DC 54 1_555 I N2 DG 5 Y DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 H N1 DA 42 X DA 55 1_555 I N3 DT 4 Y DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 H N6 DA 42 X DA 55 1_555 I O4 DT 4 Y DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 H N3 DT 43 X DT 56 1_555 I N1 DA 3 Y DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 H O4 DT 43 X DT 56 1_555 I N6 DA 3 Y DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 H N1 DG 44 X DG 57 1_555 I N3 DC 2 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 H N2 DG 44 X DG 57 1_555 I O2 DC 2 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 H O6 DG 44 X DG 57 1_555 I N4 DC 2 Y DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 H N3 DC 45 X DC 58 1_555 I N1 DG 1 Y DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 H N4 DC 45 X DC 58 1_555 I O6 DG 1 Y DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 H O2 DC 45 X DC 58 1_555 I N2 DG 1 Y DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 1 n n PB O2B ADP sing 2 n n PB O3B ADP sing 3 n n PB O3A ADP sing 4 n n O2B HOB2 ADP sing 5 n n O3B HOB3 ADP sing 6 n n PA O1A ADP doub 7 n n PA O2A ADP sing 8 n n PA O3A ADP sing 9 n n PA O5' ADP sing 10 n n O2A HOA2 ADP sing 11 n n O5' C5' ADP sing 12 n n C5' C4' ADP sing 13 n n C5' "H5'1" ADP sing 14 n n C5' "H5'2" ADP sing 15 n n C4' O4' ADP sing 16 n n C4' C3' ADP sing 17 n n C4' H4' ADP sing 18 n n O4' C1' ADP sing 19 n n C3' O3' ADP sing 20 n n C3' C2' ADP sing 21 n n C3' H3' ADP sing 22 n n O3' HO3' ADP sing 23 n n C2' O2' ADP sing 24 n n C2' C1' ADP sing 25 n n C2' H2' ADP sing 26 n n O2' HO2' ADP sing 27 n n C1' N9 ADP sing 28 n n C1' H1' ADP sing 29 n n N9 C8 ADP sing 30 n y N9 C4 ADP sing 31 n y C8 N7 ADP doub 32 n y C8 H8 ADP sing 33 n n N7 C5 ADP sing 34 n y C5 C6 ADP sing 35 n y C5 C4 ADP doub 36 n y C6 N6 ADP sing 37 n n C6 N1 ADP doub 38 n y N6 HN61 ADP sing 39 n n N6 HN62 ADP sing 40 n n N1 C2 ADP sing 41 n y C2 N3 ADP doub 42 n y C2 H2 ADP sing 43 n n N3 C4 ADP sing 44 n y # _atom_sites.entry_id 8S0B _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 10 AGS 2 1 1001 1001 AGS AGS . K 11 MG 2 1 1002 1002 MG MG . L 12 ZN 2 1 1003 1003 ZN ZN . M 13 ADP 3 1 901 901 ADP ADP . N 11 MG 3 1 902 902 MG MG . O 12 ZN 4 1 901 901 ZN ZN . P 13 ADP 4 1 902 902 ADP ADP . Q 13 ADP 5 1 801 801 ADP ADP . R 11 MG 5 1 802 802 MG MG . S 12 ZN 5 1 803 803 ZN ZN . T 10 AGS 6 1 901 901 AGS AGS . U 11 MG 6 1 902 902 MG MG . V 12 ZN 6 1 903 903 ZN ZN . W 11 MG 7 1 801 801 MG MG . X 10 AGS 7 1 802 802 AGS AGS . Y 11 MG 7 1 803 803 MG MG . Z 12 ZN 7 1 804 804 ZN ZN . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . M 13 149.042 234.449 193.885 1 68.61 ? PB ADP 901 3 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . M 13 150.21 234.821 193.008 1 68.61 ? O1B ADP 901 3 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . M 13 147.836 235.341 193.731 1 68.61 ? O2B ADP 901 3 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . M 13 149.404 234.123 195.313 1 68.61 ? O3B ADP 901 3 1 HETATM 5 P PA ADP . . . M 13 149.636 231.966 192.777 1 68.61 ? PA ADP 901 3 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . M 13 150.086 232.368 191.395 1 68.61 ? O1A ADP 901 3 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . M 13 150.661 231.759 193.863 1 68.61 ? O2A ADP 901 3 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . M 13 148.558 233.045 193.279 1 68.61 ? O3A ADP 901 3 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . M 13 148.748 230.632 192.647 1 68.61 ? O5' ADP 901 3 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . M 13 147.655 230.615 191.734 1 68.61 ? C5' ADP 901 3 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . M 13 147.377 229.2 191.258 1 68.61 ? C4' ADP 901 3 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . M 13 146.137 229.197 190.553 1 68.61 ? O4' ADP 901 3 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . M 13 148.458 228.733 190.304 1 68.61 ? C3' ADP 901 3 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . M 13 148.981 227.476 190.739 1 68.61 ? O3' ADP 901 3 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . M 13 147.783 228.565 188.962 1 68.61 ? C2' ADP 901 3 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . M 13 147.996 227.236 188.482 1 68.61 ? O2' ADP 901 3 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . M 13 146.302 228.794 189.196 1 68.61 ? C1' ADP 901 3 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . M 13 145.845 229.908 188.337 1 68.61 ? N9 ADP 901 3 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . M 13 145.415 231.101 188.782 1 68.61 ? C8 ADP 901 3 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . M 13 145.062 231.909 187.75 1 68.61 ? N7 ADP 901 3 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . M 13 145.268 231.222 186.613 1 68.61 ? C5 ADP 901 3 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . M 13 145.102 231.483 185.165 1 68.61 ? C6 ADP 901 3 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . M 13 144.633 232.671 184.719 1 68.61 ? N6 ADP 901 3 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . M 13 145.432 230.497 184.305 1 68.61 ? N1 ADP 901 3 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . M 13 145.898 229.312 184.737 1 68.61 ? C2 ADP 901 3 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . M 13 146.074 229.005 186.034 1 68.61 ? N3 ADP 901 3 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . M 13 145.78 229.902 187.005 1 68.61 ? C4 ADP 901 3 1 # _model_server_stats.io_time_ms 93 _model_server_stats.parse_time_ms 41 _model_server_stats.create_model_time_ms 86 _model_server_stats.query_time_ms 1451 _model_server_stats.encode_time_ms 36 _model_server_stats.element_count 27 #