data_8S9V # _model_server_result.job_id nqWMyS1fb_luIYnyIB8MJg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 05:21:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8s9v # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":602}' # _entry.id 8S9V # _exptl.entry_id 8S9V _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8S9V _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8S9V _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 H N N ? 8 I N N ? 8 J N N ? 8 K N N ? 8 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 26 A ASP 26 1_555 I MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.906 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 26 A ASP 26 1_555 I MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.817 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 140 A ASP 140 1_555 H MG MG . A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? metalc ? metalc4 H MG MG . A MG 801 1_555 M O HOH . A HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.792 ? metalc ? metalc5 H MG MG . A MG 801 1_555 G OP1 A 43 G A 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc6 H MG MG . A MG 801 1_555 O O HOH . G HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.725 ? metalc ? metalc7 H MG MG . A MG 801 1_555 O O HOH . G HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? metalc ? metalc8 I MG MG . A MG 802 1_555 M O HOH . A HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.717 ? metalc ? metalc9 M O HOH . A HOH 905 1_555 J MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc10 M O HOH . A HOH 906 1_555 J MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.854 ? metalc ? metalc11 D O LEU 397 D LEU 397 1_555 K MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc12 J MG MG . D MG 601 1_555 O O HOH . G HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.835 ? metalc ? metalc13 K MG MG . D MG 602 1_555 N O HOH . D HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.785 ? metalc ? metalc14 K MG MG . D MG 602 1_555 G O4' C 32 G C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc15 N O HOH . D HOH 702 1_555 L MG MG . G MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.73 ? metalc ? metalc16 G OP2 C 32 G C 32 1_555 L MG MG . G MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc17 L MG MG . G MG 101 1_555 O O HOH . G HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc ? metalc18 L MG MG . G MG 101 1_555 O O HOH . G HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 F N1 A 5 F A 5 1_555 G N3 U 52 G U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 F N6 A 5 F A 5 1_555 G O4 U 52 G U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog3 F N1 A 6 F A 6 1_555 G N3 U 51 G U 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 F N1 A 7 F A 7 1_555 G N3 U 50 G U 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 F N6 A 7 F A 7 1_555 G O4 U 50 G U 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 F N3 U 9 F U 9 1_555 G N1 A 48 G A 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 F O4 U 9 F U 9 1_555 G N6 A 48 G A 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 F N1 G 10 F G 10 1_555 G N3 C 47 G C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 F N2 G 10 F G 10 1_555 G O2 C 47 G C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 F O6 G 10 F G 10 1_555 G N4 C 47 G C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 F N3 U 11 F U 11 1_555 G N1 A 46 G A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 F O4 U 11 F U 11 1_555 G N6 A 46 G A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 F N1 A 12 F A 12 1_555 G N3 U 45 G U 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 F N6 A 12 F A 12 1_555 G O4 U 45 G U 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 F N1 G 13 F G 13 1_555 G N3 C 44 G C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 F N2 G 13 F G 13 1_555 G O2 C 44 G C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 F O6 G 13 F G 13 1_555 G N4 C 44 G C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 F N1 A 15 F A 15 1_555 G N3 U 42 G U 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 F N6 A 15 F A 15 1_555 G O4 U 42 G U 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 F N1 G 16 F G 16 1_555 G N3 C 41 G C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 F N2 G 16 F G 16 1_555 G O2 C 41 G C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 F O6 G 16 F G 16 1_555 G N4 C 41 G C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 F N1 A 17 F A 17 1_555 G N3 U 40 G U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 F N6 A 17 F A 17 1_555 G O4 U 40 G U 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 F N1 A 18 F A 18 1_555 G N3 U 39 G U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 F N6 A 18 F A 18 1_555 G O4 U 39 G U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 F N3 C 19 F C 19 1_555 G N1 G 38 G G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 F N4 C 19 F C 19 1_555 G O6 G 38 G G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 F O2 C 19 F C 19 1_555 G N2 G 38 G G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 F N1 A 21 F A 21 1_555 G N3 U 36 G U 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 F N6 A 21 F A 21 1_555 G O4 U 36 G U 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 F N1 A 22 F A 22 1_555 G N3 U 35 G U 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 F N6 A 22 F A 22 1_555 G O4 U 35 G U 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 F N3 U 23 F U 23 1_555 G N1 A 34 G A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 F O4 U 23 F U 23 1_555 G N6 A 34 G A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 F N3 C 24 F C 24 1_555 G N1 G 33 G G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 F N4 C 24 F C 24 1_555 G O6 G 33 G G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 F O2 C 24 F C 24 1_555 G N2 G 33 G G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 F N1 G 25 F G 25 1_555 G N3 C 32 G C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 F N2 G 25 F G 25 1_555 G O2 C 32 G C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 F O6 G 25 F G 25 1_555 G N4 C 32 G C 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 F N1 G 27 F G 27 1_555 G N3 C 30 G C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 F N2 G 27 F G 27 1_555 G O2 C 30 G C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 F O6 G 27 F G 27 1_555 G N4 C 30 G C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 F N1 G 28 F G 28 1_555 G N3 C 29 G C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 F N2 G 28 F G 28 1_555 G O2 C 29 G C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 F O6 G 28 F G 28 1_555 G N4 C 29 G C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 F N3 U 29 F U 29 1_555 G N1 A 28 G A 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 F O4 U 29 F U 29 1_555 G N6 A 28 G A 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog50 F O2 C 30 F C 30 1_555 G N2 G 27 G G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 F N1 G 31 F G 31 1_555 G N3 C 26 G C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 F N2 G 31 F G 31 1_555 G O2 C 26 G C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 F O6 G 31 F G 31 1_555 G N4 C 26 G C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 F N3 U 32 F U 32 1_555 G N1 A 25 G A 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 F O4 U 32 F U 32 1_555 G N6 A 25 G A 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 F N3 C 33 F C 33 1_555 G N1 G 24 G G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 F N4 C 33 F C 33 1_555 G O6 G 24 G G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 F O2 C 33 F C 33 1_555 G N2 G 24 G G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 F N1 A 34 F A 34 1_555 G N3 U 23 G U 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 F N6 A 34 F A 34 1_555 G O4 U 23 G U 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 F N1 A 35 F A 35 1_555 G N3 U 22 G U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 F N6 A 35 F A 35 1_555 G O4 U 22 G U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 F N3 U 36 F U 36 1_555 G N1 A 21 G A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 F O4 U 36 F U 36 1_555 G N6 A 21 G A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 F N1 A 37 F A 37 1_555 G N3 U 20 G U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 F N6 A 37 F A 37 1_555 G O4 U 20 G U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8S9V _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code H 8 MG A 1 801 1 MG MG . I 8 MG A 1 802 3 MG MG . J 8 MG D 1 601 4 MG MG . K 8 MG D 1 602 5 MG MG . L 8 MG G 1 101 6 MG MG . M 9 HOH A 1 901 14 HOH HOH . M 9 HOH A 2 902 11 HOH HOH . M 9 HOH A 3 903 15 HOH HOH . M 9 HOH A 4 904 19 HOH HOH . M 9 HOH A 5 905 29 HOH HOH . M 9 HOH A 6 906 8 HOH HOH . N 9 HOH D 1 701 21 HOH HOH . N 9 HOH D 2 702 24 HOH HOH . N 9 HOH D 3 703 22 HOH HOH . O 9 HOH G 1 201 28 HOH HOH . O 9 HOH G 2 202 7 HOH HOH . O 9 HOH G 3 203 10 HOH HOH . O 9 HOH G 4 204 26 HOH HOH . O 9 HOH G 5 205 9 HOH HOH . O 9 HOH G 6 206 25 HOH HOH . O 9 HOH G 7 207 18 HOH HOH . O 9 HOH G 8 208 23 HOH HOH . O 9 HOH G 9 209 27 HOH HOH . O 9 HOH G 10 210 12 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 8 _atom_site.Cartn_x 192.087 _atom_site.Cartn_y 179.391 _atom_site.Cartn_z 143.596 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 24.77 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 602 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 28 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 39 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #