data_8SAK # _model_server_result.job_id S6hRu5ndqoqyMziBKDoMeg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:00:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8sak # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":1303}' # _entry.id 8SAK # _exptl.entry_id 8SAK _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 V N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n F NAG 1 E 1 NAG A 2052 NAG 4 n F NAG 2 E 2 NAG A 2053 NAG 4 n G NAG 1 K 1 NAG A 2226 NAG 4 n G NAG 2 K 2 NAG A 2227 NAG 5 n H NAG 1 Q 1 NAG A 2623 NAG 5 n H NAG 2 Q 2 NAG A 2624 NAG 5 n H FUC 3 Q 3 FUC A 2625 FUC 4 n I NAG 1 U 1 NAG A 2866 NAG 4 n I NAG 2 U 2 NAG A 2867 NAG 4 n J NAG 1 X 1 NAG B 2052 NAG 4 n J NAG 2 X 2 NAG B 2053 NAG 4 n K NAG 1 c 1 NAG B 2226 NAG 4 n K NAG 2 c 2 NAG B 2227 NAG 4 n L NAG 1 f 1 NAG B 2414 NAG 4 n L NAG 2 f 2 NAG B 2415 NAG 5 n M NAG 1 h 1 NAG B 2623 NAG 5 n M NAG 2 h 2 NAG B 2624 NAG 5 n M FUC 3 h 3 FUC B 2625 FUC 4 n N NAG 1 l 1 NAG B 2866 NAG 4 n N NAG 2 l 2 NAG B 2867 NAG 4 n O NAG 1 n 1 NAG B 3211 NAG 4 n O NAG 2 n 2 NAG B 3212 NAG 4 n P NAG 1 p 1 NAG C 2052 NAG 4 n P NAG 2 p 2 NAG C 2053 NAG 6 n Q NAG 1 t 1 NAG C 2170 NAG 6 n Q NAG 2 t 2 NAG C 2171 NAG 6 n Q BMA 3 t 3 BMA C 2172 BMA 6 n Q MAN 4 t 4 MAN C 2174 MAN 6 n Q MAN 5 t 5 MAN C 2173 MAN 4 n R NAG 1 y 1 NAG C 2226 NAG 4 n R NAG 2 y 2 NAG C 2227 NAG 5 n S NAG 1 1 1 NAG C 2623 NAG 5 n S NAG 2 1 2 NAG C 2624 NAG 5 n S FUC 3 1 3 FUC C 2625 FUC 4 n T NAG 1 5 1 NAG C 2866 NAG 4 n T NAG 2 5 2 NAG C 2867 NAG 4 n U NAG 1 7 1 NAG C 3211 NAG 4 n U NAG 2 7 2 NAG C 3212 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 30 A CYS 30 1_555 A SG CYS 199 A CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 189 A CYS 189 1_555 A SG CYS 241 A CYS 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 343 A CYS 343 1_555 A SG CYS 353 A CYS 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 387 A CYS 387 1_555 A SG CYS 411 A CYS 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 429 A CYS 429 1_555 A SG CYS 482 A CYS 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 441 A CYS 441 1_555 A SG CYS 589 A CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 506 A CYS 506 1_555 A SG CYS 530 A CYS 530 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 607 A CYS 607 1_555 A SG CYS 658 A CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 624 A CYS 624 1_555 A SG CYS 654 A CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 683 A CYS 683 1_555 A SG CYS 718 A CYS 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 732 A CYS 732 1_555 A SG CYS 741 A CYS 741 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 802 A CYS 802 1_555 A SG CYS 824 A CYS 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 807 A CYS 807 1_555 A SG CYS 813 A CYS 813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 908 A CYS 908 1_555 A SG CYS 921 A CYS 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1102 A CYS 1102 1_555 A SG CYS 1113 A CYS 1113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 1152 A CYS 1152 1_555 A SG CYS 1160 A CYS 1160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 30 B CYS 30 1_555 B SG CYS 199 B CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 189 B CYS 189 1_555 B SG CYS 241 B CYS 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 343 B CYS 343 1_555 B SG CYS 353 B CYS 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 387 B CYS 387 1_555 B SG CYS 411 B CYS 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 429 B CYS 429 1_555 B SG CYS 482 B CYS 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 441 B CYS 441 1_555 B SG CYS 589 B CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 506 B CYS 506 1_555 B SG CYS 530 B CYS 530 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 607 B CYS 607 1_555 B SG CYS 658 B CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 624 B CYS 624 1_555 B SG CYS 654 B CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 683 B CYS 683 1_555 B SG CYS 718 B CYS 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 732 B CYS 732 1_555 B SG CYS 741 B CYS 741 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 802 B CYS 802 1_555 B SG CYS 824 B CYS 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 807 B CYS 807 1_555 B SG CYS 813 B CYS 813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 908 B CYS 908 1_555 B SG CYS 921 B CYS 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 1102 B CYS 1102 1_555 B SG CYS 1113 B CYS 1113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 1152 B CYS 1152 1_555 B SG CYS 1160 B CYS 1160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 30 C CYS 30 1_555 C SG CYS 199 C CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 189 C CYS 189 1_555 C SG CYS 241 C CYS 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 343 C CYS 343 1_555 C SG CYS 353 C CYS 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 387 C CYS 387 1_555 C SG CYS 411 C CYS 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 429 C CYS 429 1_555 C SG CYS 482 C CYS 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 441 C CYS 441 1_555 C SG CYS 589 C CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 506 C CYS 506 1_555 C SG CYS 530 C CYS 530 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 607 C CYS 607 1_555 C SG CYS 658 C CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 624 C CYS 624 1_555 C SG CYS 654 C CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 683 C CYS 683 1_555 C SG CYS 718 C CYS 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 C SG CYS 732 C CYS 732 1_555 C SG CYS 741 C CYS 741 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf44 C SG CYS 802 C CYS 802 1_555 C SG CYS 824 C CYS 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf45 C SG CYS 807 C CYS 807 1_555 C SG CYS 813 C CYS 813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf46 C SG CYS 908 C CYS 908 1_555 C SG CYS 921 C CYS 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf47 C SG CYS 1102 C CYS 1102 1_555 C SG CYS 1113 C CYS 1113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf48 C SG CYS 1152 C CYS 1152 1_555 C SG CYS 1160 C CYS 1160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf49 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 97 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf50 D SG CYS 105 H CYS 100 1_555 D SG CYS 110 H CYS 100 1_555 ? ? ? E ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf51 E SG CYS 26 L CYS 23 1_555 E SG CYS 91 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 37 A ASN 37 1_555 V C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 52 A ASN 52 1_555 F C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 69 A ASN 69 1_555 W C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 159 A ASN 159 1_555 X C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 170 A ASN 170 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 226 A ASN 226 1_555 G C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 240 A ASN 240 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 248 A ASN 248 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 414 A ASN 414 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 623 A ASN 623 1_555 H C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 724 A ASN 724 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 866 A ASN 866 1_555 I C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1211 A ASN 1211 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 52 B ASN 52 1_555 J C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 69 B ASN 69 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 159 B ASN 159 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 170 B ASN 170 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 226 B ASN 226 1_555 K C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 248 B ASN 248 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 414 B ASN 414 1_555 L C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 623 B ASN 623 1_555 M C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 724 B ASN 724 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 866 B ASN 866 1_555 N C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 1211 B ASN 1211 1_555 O C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 52 C ASN 52 1_555 P C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 69 C ASN 69 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 159 C ASN 159 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 170 C ASN 170 1_555 Q C1 NAG . t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 226 C ASN 226 1_555 R C1 NAG . y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 240 C ASN 240 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 623 C ASN 623 1_555 S C1 NAG . 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 724 C ASN 724 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 866 C ASN 866 1_555 T C1 NAG . 5 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 1211 C ASN 1211 1_555 U C1 NAG . 7 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 F O4 NAG . E NAG 1 1_555 F C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale36 G O4 NAG . K NAG 1 1_555 G C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale37 H O4 NAG . Q NAG 1 1_555 H C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 H O6 NAG . Q NAG 1 1_555 H C1 FUC . Q FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale39 I O4 NAG . U NAG 1 1_555 I C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 J O4 NAG . X NAG 1 1_555 J C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale41 K O4 NAG . c NAG 1 1_555 K C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 L O4 NAG . f NAG 1 1_555 L C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale43 M O4 NAG . h NAG 1 1_555 M C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale44 M O6 NAG . h NAG 1 1_555 M C1 FUC . h FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale45 N O4 NAG . l NAG 1 1_555 N C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale46 O O4 NAG . n NAG 1 1_555 O C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale47 P O4 NAG . p NAG 1 1_555 P C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale48 Q O4 NAG . t NAG 1 1_555 Q C1 NAG . t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale49 Q O4 NAG . t NAG 2 1_555 Q C1 BMA . t BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale50 Q O3 BMA . t BMA 3 1_555 Q C1 MAN . t MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale51 Q O6 BMA . t BMA 3 1_555 Q C1 MAN . t MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale52 R O4 NAG . y NAG 1 1_555 R C1 NAG . y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale53 S O4 NAG . 1 NAG 1 1_555 S C1 NAG . 1 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale54 S O6 NAG . 1 NAG 1 1_555 S C1 FUC . 1 FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 T O4 NAG . 5 NAG 1 1_555 T C1 NAG . 5 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale56 U O4 NAG . 7 NAG 1 1_555 U C1 NAG . 7 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 306 n n C1 O1 NAG sing 307 n n C1 O5 NAG sing 308 n n C1 H1 NAG sing 309 n n C2 C3 NAG sing 310 n n C2 N2 NAG sing 311 n n C2 H2 NAG sing 312 n n C3 C4 NAG sing 313 n n C3 O3 NAG sing 314 n n C3 H3 NAG sing 315 n n C4 C5 NAG sing 316 n n C4 O4 NAG sing 317 n n C4 H4 NAG sing 318 n n C5 C6 NAG sing 319 n n C5 O5 NAG sing 320 n n C5 H5 NAG sing 321 n n C6 O6 NAG sing 322 n n C6 H61 NAG sing 323 n n C6 H62 NAG sing 324 n n C7 C8 NAG sing 325 n n C7 N2 NAG sing 326 n n C7 O7 NAG doub 327 n n C8 H81 NAG sing 328 n n C8 H82 NAG sing 329 n n C8 H83 NAG sing 330 n n N2 HN2 NAG sing 331 n n O1 HO1 NAG sing 332 n n O3 HO3 NAG sing 333 n n O4 HO4 NAG sing 334 n n O6 HO6 NAG sing 335 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8SAK _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 7 NAG A 1 1301 2037 NAG NAG . W 7 NAG A 1 1302 2069 NAG NAG . X 7 NAG A 1 1303 2159 NAG NAG . Y 7 NAG A 1 1304 2170 NAG NAG . Z 7 NAG A 1 1305 2240 NAG NAG . AA 7 NAG A 1 1306 2248 NAG NAG . BA 7 NAG A 1 1307 2414 NAG NAG . CA 7 NAG A 1 1308 2724 NAG NAG . DA 7 NAG A 1 1309 3211 NAG NAG . EA 7 NAG B 1 1301 2069 NAG NAG . FA 7 NAG B 1 1302 2159 NAG NAG . GA 7 NAG B 1 1303 2170 NAG NAG . HA 7 NAG B 1 1304 2248 NAG NAG . IA 7 NAG B 1 1305 2724 NAG NAG . JA 7 NAG C 1 1301 2069 NAG NAG . KA 7 NAG C 1 1302 2159 NAG NAG . LA 7 NAG C 1 1303 2240 NAG NAG . MA 7 NAG C 1 1304 2724 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . LA 7 130.567 169.761 120.741 1 116.94 0 C1 NAG 1303 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . LA 7 131.722 168.859 120.319 1 118.55 0 C2 NAG 1303 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . LA 7 131.926 168.939 118.81 1 120.02 0 C3 NAG 1303 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . LA 7 130.623 168.638 118.081 1 120.18 0 C4 NAG 1303 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . LA 7 129.504 169.537 118.6 1 119.31 0 C5 NAG 1303 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . LA 7 128.155 169.2 118.012 1 118.91 0 C6 NAG 1303 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . LA 7 133.477 168.461 121.988 1 119.25 0 C7 NAG 1303 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . LA 7 134.742 168.978 122.602 1 118.26 0 C8 NAG 1303 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . LA 7 132.945 169.214 121.02 1 119.15 0 N2 NAG 1303 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . LA 7 132.929 168.008 118.416 1 120.41 0 O3 NAG 1303 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . LA 7 130.786 168.853 116.683 1 120.16 0 O4 NAG 1303 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . LA 7 129.383 169.395 120.024 1 118.73 0 O5 NAG 1303 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . LA 7 128.091 167.84 117.607 1 119.13 0 O6 NAG 1303 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . LA 7 132.96 167.409 122.351 1 118.76 0 O7 NAG 1303 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 244 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #