data_8SGL
#
_model_server_result.job_id            S8oE5MIwZPAGiEYv4ehPWA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-21 22:52:11' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8sgl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"EA","auth_seq_id":602}' 
#
_entry.id    8SGL 
#
_exptl.entry_id    8SGL 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          11 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    16 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8SGL 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8SGL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      17 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 11 S N N 
? 11 V N N 
? 11 Y N N 
? 11 BA N N 
? 11 EA N N 
? 11 HA N N 
? 11 KA N N 
? 11 NA N N 
? 11 QA N N 
? 11 TA N N 
? 11 WA N N 
? 11 ZA N N 
? 11 CB N N 
? 11 FB N N 
? 11 IB N N 
? 11 LB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 87 A ASP 88 1_555 S MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc2 R O3B ADP . A ADP 601 1_555 S MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc3 R O2A ADP . A ADP 601 1_555 S MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.907 ? 
metalc ? metalc4 R O3A ADP . A ADP 601 1_555 S MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
metalc ? metalc5 B OD1 ASP 96 B ASP 97 1_555 V MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? 
metalc ? metalc6 U O2A ADP . B ADP 601 1_555 V MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? 
metalc ? metalc7 U O3A ADP . B ADP 601 1_555 V MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? 
metalc ? metalc8 C OD1 ASP 86 D ASP 104 1_555 Y MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
metalc ? metalc9 C OD2 ASP 86 D ASP 104 1_555 Y MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? 
metalc ? metalc10 X O2A ADP . D ADP 601 1_555 Y MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc11 X O3A ADP . D ADP 601 1_555 Y MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
metalc ? metalc12 D OD1 ASP 103 E ASP 104 1_555 BA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc13 AA O2A ADP . E ADP 601 1_555 BA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? 
metalc ? metalc14 AA O3A ADP . E ADP 601 1_555 BA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc15 DA O3B ADP . G ADP 601 1_555 EA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? 
metalc ? metalc16 DA O2A ADP . G ADP 601 1_555 EA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc17 F OD1 ASP 92 H ASP 92 1_555 HA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? 
metalc ? metalc18 F OD2 ASP 92 H ASP 92 1_555 HA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc19 GA O2A ADP . H ADP 601 1_555 HA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? 
metalc ? metalc20 GA O3A ADP . H ADP 601 1_555 HA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc21 G OD1 ASP 98 Q ASP 99 1_555 KA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? 
metalc ? metalc22 G OD2 ASP 98 Q ASP 99 1_555 KA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? 
metalc ? metalc23 JA O2B ADP . Q ADP 601 1_555 KA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc24 JA O3B ADP . Q ADP 601 1_555 KA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? 
metalc ? metalc25 JA O2A ADP . Q ADP 601 1_555 KA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.974 ? 
metalc ? metalc26 H OD1 ASP 90 Z ASP 90 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.979 ? 
metalc ? metalc27 H OD2 ASP 90 Z ASP 90 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? 
metalc ? metalc28 MA O2B ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc29 MA O3B ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? 
metalc ? metalc30 MA O2A ADP . Z ADP 601 1_555 NA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.981 ? 
metalc ? metalc31 I OD1 ASP 87 a ASP 88 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc32 PA O1B ADP . a ADP 601 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? 
metalc ? metalc33 PA O3A ADP . a ADP 601 1_555 QA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc34 J OD1 ASP 96 b ASP 97 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.954 ? 
metalc ? metalc35 SA O1A ADP . b ADP 601 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc36 SA O3A ADP . b ADP 601 1_555 TA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
metalc ? metalc37 VA O2B ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
metalc ? metalc38 VA O1A ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? 
metalc ? metalc39 VA O3A ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? 
metalc ? metalc40 VA O5' ADP . d ADP 601 1_555 WA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? 
metalc ? metalc41 L OD1 ASP 103 e ASP 104 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? 
metalc ? metalc42 L OD2 ASP 103 e ASP 104 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? 
metalc ? metalc43 YA O1A ADP . e ADP 601 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc44 YA O3A ADP . e ADP 601 1_555 ZA MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc45 M OD1 ASP 91 g ASP 93 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc46 BB O1B ADP . g ADP 601 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.95 ? 
metalc ? metalc47 BB O3B ADP . g ADP 601 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? 
metalc ? metalc48 BB O1A ADP . g ADP 601 1_555 CB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
metalc ? metalc49 N OD1 ASP 92 h ASP 92 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? 
metalc ? metalc50 N OD2 ASP 92 h ASP 92 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? 
metalc ? metalc51 EB O1A ADP . h ADP 601 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc52 EB O3A ADP . h ADP 601 1_555 FB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? 
metalc ? metalc53 O OD1 ASP 98 q ASP 99 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc54 O OD2 ASP 98 q ASP 99 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc55 HB O1B ADP . q ADP 601 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc56 HB O3B ADP . q ADP 601 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? 
metalc ? metalc57 HB O1A ADP . q ADP 601 1_555 IB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.965 ? 
metalc ? metalc58 P OD1 ASP 90 z ASP 90 1_555 LB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? 
metalc ? metalc59 KB O1B ADP . z ADP 601 1_555 LB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc60 KB O3B ADP . z ADP 601 1_555 LB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.946 ? 
metalc ? metalc61 KB O1A ADP . z ADP 601 1_555 LB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8SGL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
R 10 ADP A 1 601 601 ADP ADP . 
S 11 MG A 1 602 602 MG MG . 
T 12 AF3 A 1 603 603 AF3 AF3 . 
U 10 ADP B 1 601 601 ADP ADP . 
V 11 MG B 1 602 602 MG MG . 
W 12 AF3 B 1 603 603 AF3 AF3 . 
X 10 ADP D 1 601 601 ADP ADP . 
Y 11 MG D 1 602 602 MG MG . 
Z 12 AF3 D 1 603 603 AF3 AF3 . 
AA 10 ADP E 1 601 601 ADP ADP . 
BA 11 MG E 1 602 602 MG MG . 
CA 12 AF3 E 1 603 603 AF3 AF3 . 
DA 10 ADP G 1 601 601 ADP ADP . 
EA 11 MG G 1 602 602 MG MG . 
FA 12 AF3 G 1 603 603 AF3 AF3 . 
GA 10 ADP H 1 601 601 ADP ADP . 
HA 11 MG H 1 602 602 MG MG . 
IA 12 AF3 H 1 603 603 AF3 AF3 . 
JA 10 ADP Q 1 601 601 ADP ADP . 
KA 11 MG Q 1 602 602 MG MG . 
LA 12 AF3 Q 1 603 603 AF3 AF3 . 
MA 10 ADP Z 1 601 601 ADP ADP . 
NA 11 MG Z 1 602 602 MG MG . 
OA 12 AF3 Z 1 603 603 AF3 AF3 . 
PA 10 ADP a 1 601 601 ADP ADP . 
QA 11 MG a 1 602 602 MG MG . 
RA 12 AF3 a 1 603 603 AF3 AF3 . 
SA 10 ADP b 1 601 601 ADP ADP . 
TA 11 MG b 1 602 602 MG MG . 
UA 12 AF3 b 1 603 603 AF3 AF3 . 
VA 10 ADP d 1 601 601 ADP ADP . 
WA 11 MG d 1 602 602 MG MG . 
XA 12 AF3 d 1 603 603 AF3 AF3 . 
YA 10 ADP e 1 601 601 ADP ADP . 
ZA 11 MG e 1 602 602 MG MG . 
AB 12 AF3 e 1 603 603 AF3 AF3 . 
BB 10 ADP g 1 601 601 ADP ADP . 
CB 11 MG g 1 602 602 MG MG . 
DB 12 AF3 g 1 603 603 AF3 AF3 . 
EB 10 ADP h 1 601 601 ADP ADP . 
FB 11 MG h 1 602 602 MG MG . 
GB 12 AF3 h 1 603 603 AF3 AF3 . 
HB 10 ADP q 1 601 601 ADP ADP . 
IB 11 MG q 1 602 602 MG MG . 
JB 12 AF3 q 1 603 603 AF3 AF3 . 
KB 10 ADP z 1 601 601 ADP ADP . 
LB 11 MG z 1 602 602 MG MG . 
MB 12 AF3 z 1 603 603 AF3 AF3 . 
NB 13 HOH A 1 701 701 HOH HOH . 
NB 13 HOH A 2 702 702 HOH HOH . 
OB 13 HOH B 1 701 701 HOH HOH . 
OB 13 HOH B 2 702 702 HOH HOH . 
PB 13 HOH D 1 701 701 HOH HOH . 
QB 13 HOH E 1 701 701 HOH HOH . 
RB 13 HOH G 1 701 701 HOH HOH . 
SB 13 HOH H 1 701 701 HOH HOH . 
TB 13 HOH Q 1 701 701 HOH HOH . 
UB 13 HOH Z 1 701 701 HOH HOH . 
VB 13 HOH a 1 701 702 HOH HOH . 
VB 13 HOH a 2 702 701 HOH HOH . 
WB 13 HOH b 1 701 701 HOH HOH . 
XB 13 HOH d 1 701 701 HOH HOH . 
YB 13 HOH e 1 701 701 HOH HOH . 
ZB 13 HOH g 1 701 701 HOH HOH . 
AC 13 HOH h 1 701 701 HOH HOH . 
BC 13 HOH q 1 701 701 HOH HOH . 
CC 13 HOH z 1 701 701 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         EA 
_atom_site.label_entity_id       11 
_atom_site.Cartn_x               114.218 
_atom_site.Cartn_y               126.283 
_atom_site.Cartn_z               184.105 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        78.48 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           602 
_atom_site.auth_asym_id          G 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              27 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    98 
_model_server_stats.query_time_ms           296 
_model_server_stats.encode_time_ms          10 
_model_server_stats.element_count           1 
#