data_8SHP # _model_server_result.job_id nj0X_uZeBH1Jk-vkAgZc8A _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 05:44:11' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8shp # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"JB","auth_seq_id":602}' # _entry.id 8SHP # _exptl.entry_id 8SHP _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 12 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 16 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8SHP _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8SHP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 12 T N N ? 12 W N N ? 12 Z N N ? 12 CA N N ? 12 FA N N ? 12 IA N N ? 12 LA N N ? 12 OA N N ? 12 RA N N ? 12 UA N N ? 12 XA N N ? 12 AB N N ? 12 DB N N ? 12 GB N N ? 12 JB N N ? 12 MB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B OD1 ASP 87 A ASP 88 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc2 S O3B ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.788 ? metalc ? metalc3 S O2A ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc ? metalc4 S O3A ADP . A ADP 601 1_555 T MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc5 C OD1 ASP 96 B ASP 97 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc6 C OD2 ASP 96 B ASP 97 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc7 V O2A ADP . B ADP 601 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc8 V O3A ADP . B ADP 601 1_555 W MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc9 D OD1 ASP 86 D ASP 104 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc10 D OD2 ASP 86 D ASP 104 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? metalc ? metalc11 Y O2A ADP . D ADP 601 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc12 Y O3A ADP . D ADP 601 1_555 Z MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? metalc ? metalc13 E OD1 ASP 103 E ASP 104 1_555 CA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc14 BA O2A ADP . E ADP 601 1_555 CA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc15 BA O3A ADP . E ADP 601 1_555 CA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? metalc ? metalc16 EA O2B ADP . G ADP 601 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc ? metalc17 EA O3B ADP . G ADP 601 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc18 EA O2A ADP . G ADP 601 1_555 FA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc19 G OD1 ASP 92 H ASP 92 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc20 G OD2 ASP 92 H ASP 92 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc21 HA O2A ADP . H ADP 601 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? metalc ? metalc22 HA O3A ADP . H ADP 601 1_555 IA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc23 H OD1 ASP 98 Q ASP 99 1_555 LA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc24 H OD2 ASP 98 Q ASP 99 1_555 LA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc25 KA O2B ADP . Q ADP 601 1_555 LA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc26 KA O3B ADP . Q ADP 601 1_555 LA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc27 KA O2A ADP . Q ADP 601 1_555 LA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.981 ? metalc ? metalc28 I OD1 ASP 90 Z ASP 90 1_555 OA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc29 I OD2 ASP 90 Z ASP 90 1_555 OA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.936 ? metalc ? metalc30 NA O2B ADP . Z ADP 601 1_555 OA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc31 NA O3B ADP . Z ADP 601 1_555 OA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? metalc ? metalc32 NA O2A ADP . Z ADP 601 1_555 OA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? metalc ? metalc33 J OD1 ASP 87 a ASP 88 1_555 RA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc34 QA O1B ADP . a ADP 601 1_555 RA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc35 QA O3A ADP . a ADP 601 1_555 RA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc36 K OD1 ASP 96 b ASP 97 1_555 UA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc37 K OD2 ASP 96 b ASP 97 1_555 UA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc38 TA O1B ADP . b ADP 601 1_555 UA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc ? metalc39 TA O1A ADP . b ADP 601 1_555 UA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc40 L OD2 ASP 86 d ASP 104 1_555 XA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc41 WA O1B ADP . d ADP 601 1_555 XA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc42 WA O1A ADP . d ADP 601 1_555 XA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? metalc ? metalc43 M OD1 ASP 103 e ASP 104 1_555 AB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc44 ZA O1A ADP . e ADP 601 1_555 AB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc45 ZA O3A ADP . e ADP 601 1_555 AB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? metalc ? metalc46 N OD1 ASP 91 g ASP 93 1_555 DB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc47 CB O1B ADP . g ADP 601 1_555 DB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc48 CB O3B ADP . g ADP 601 1_555 DB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc49 CB O1A ADP . g ADP 601 1_555 DB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc50 O OD1 ASP 92 h ASP 92 1_555 GB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc51 O OD2 ASP 92 h ASP 92 1_555 GB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? metalc ? metalc52 FB O1A ADP . h ADP 601 1_555 GB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc53 FB O3A ADP . h ADP 601 1_555 GB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? metalc ? metalc54 P OD1 ASP 98 q ASP 99 1_555 JB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? metalc ? metalc55 P OD2 ASP 98 q ASP 99 1_555 JB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc56 IB O1B ADP . q ADP 601 1_555 JB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc57 IB O3B ADP . q ADP 601 1_555 JB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc58 IB O1A ADP . q ADP 601 1_555 JB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.973 ? metalc ? metalc59 Q OD1 ASP 90 z ASP 90 1_555 MB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc60 LB O1B ADP . z ADP 601 1_555 MB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc61 LB O3B ADP . z ADP 601 1_555 MB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc62 LB O1A ADP . z ADP 601 1_555 MB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8SHP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 11 ADP A 1 601 601 ADP ADP . T 12 MG A 1 602 602 MG MG . U 13 AF3 A 1 603 603 AF3 AF3 . V 11 ADP B 1 601 601 ADP ADP . W 12 MG B 1 602 602 MG MG . X 13 AF3 B 1 603 603 AF3 AF3 . Y 11 ADP D 1 601 601 ADP ADP . Z 12 MG D 1 602 602 MG MG . AA 13 AF3 D 1 603 603 AF3 AF3 . BA 11 ADP E 1 601 601 ADP ADP . CA 12 MG E 1 602 602 MG MG . DA 13 AF3 E 1 603 603 AF3 AF3 . EA 11 ADP G 1 601 601 ADP ADP . FA 12 MG G 1 602 602 MG MG . GA 13 AF3 G 1 603 603 AF3 AF3 . HA 11 ADP H 1 601 601 ADP ADP . IA 12 MG H 1 602 602 MG MG . JA 13 AF3 H 1 603 603 AF3 AF3 . KA 11 ADP Q 1 601 601 ADP ADP . LA 12 MG Q 1 602 602 MG MG . MA 13 AF3 Q 1 603 603 AF3 AF3 . NA 11 ADP Z 1 601 601 ADP ADP . OA 12 MG Z 1 602 602 MG MG . PA 13 AF3 Z 1 603 603 AF3 AF3 . QA 11 ADP a 1 601 601 ADP ADP . RA 12 MG a 1 602 602 MG MG . SA 13 AF3 a 1 603 603 AF3 AF3 . TA 11 ADP b 1 601 601 ADP ADP . UA 12 MG b 1 602 602 MG MG . VA 13 AF3 b 1 603 603 AF3 AF3 . WA 11 ADP d 1 601 601 ADP ADP . XA 12 MG d 1 602 602 MG MG . YA 13 AF3 d 1 603 603 AF3 AF3 . ZA 11 ADP e 1 601 601 ADP ADP . AB 12 MG e 1 602 602 MG MG . BB 13 AF3 e 1 603 603 AF3 AF3 . CB 11 ADP g 1 601 601 ADP ADP . DB 12 MG g 1 602 602 MG MG . EB 13 AF3 g 1 603 603 AF3 AF3 . FB 11 ADP h 1 601 601 ADP ADP . GB 12 MG h 1 602 602 MG MG . HB 13 AF3 h 1 603 603 AF3 AF3 . IB 11 ADP q 1 601 601 ADP ADP . JB 12 MG q 1 602 602 MG MG . KB 13 AF3 q 1 603 603 AF3 AF3 . LB 11 ADP z 1 601 601 ADP ADP . MB 12 MG z 1 602 602 MG MG . NB 13 AF3 z 1 603 603 AF3 AF3 . OB 14 HOH A 1 701 702 HOH HOH . OB 14 HOH A 2 702 701 HOH HOH . PB 14 HOH B 1 701 701 HOH HOH . PB 14 HOH B 2 702 702 HOH HOH . QB 14 HOH D 1 701 701 HOH HOH . RB 14 HOH E 1 701 701 HOH HOH . SB 14 HOH G 1 701 701 HOH HOH . TB 14 HOH H 1 701 701 HOH HOH . UB 14 HOH Q 1 701 701 HOH HOH . VB 14 HOH Z 1 701 701 HOH HOH . WB 14 HOH a 1 701 702 HOH HOH . WB 14 HOH a 2 702 701 HOH HOH . XB 14 HOH b 1 701 701 HOH HOH . YB 14 HOH d 1 701 701 HOH HOH . ZB 14 HOH e 1 701 701 HOH HOH . AC 14 HOH g 1 701 701 HOH HOH . BC 14 HOH h 1 701 701 HOH HOH . CC 14 HOH q 1 701 701 HOH HOH . DC 14 HOH z 1 701 701 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id JB _atom_site.label_entity_id 12 _atom_site.Cartn_x 110.33 _atom_site.Cartn_y 137.539 _atom_site.Cartn_z 129.328 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 102.09 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 602 _atom_site.auth_asym_id q _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 27 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 91 _model_server_stats.query_time_ms 266 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #