data_8SJ0 # _model_server_result.job_id Npz5dCjNsASm6cRX9Wa5WA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-15 12:19:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8sj0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":601}' # _entry.id 8SJ0 # _exptl.entry_id 8SJ0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 491.182 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8SJ0 _cell.length_a 77.503 _cell.length_b 98.3 _cell.length_c 143.205 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8SJ0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 G N N ? 3 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 68 A GLU 211 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 235 A HIS 378 1_555 H ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 241 A CYS 384 1_555 H ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 242 A CYS 385 1_555 H ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 249 A CYS 392 1_555 H ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc6 G O3G DTP . A DTP 601 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc7 G O2B DTP . A DTP 601 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc8 B OG SER 56 C SER 199 1_555 L MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc ? metalc9 B OE1 GLU 68 C GLU 211 1_555 L MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc10 B NE2 HIS 235 C HIS 378 1_555 K ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 241 C CYS 384 1_555 K ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 242 C CYS 385 1_555 K ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 249 C CYS 392 1_555 K ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc14 J O3G DTP . C DTP 601 1_555 L MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? metalc ? metalc15 J O2B DTP . C DTP 601 1_555 L MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc16 L MG MG . C MG 603 1_555 N O HOH . C HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N1 DA 1 E DA 1 1_555 D N3 DT 18 F DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N6 DA 1 E DA 1 1_555 D O4 DT 18 F DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N3 DT 2 E DT 2 1_555 D N1 DA 17 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C O4 DT 2 E DT 2 1_555 D N6 DA 17 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N3 DC 3 E DC 3 1_555 D N1 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N4 DC 3 E DC 3 1_555 D O6 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O2 DC 3 E DC 3 1_555 D N2 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N3 DT 4 E DT 4 1_555 D N1 DA 15 F DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C O4 DT 4 E DT 4 1_555 D N6 DA 15 F DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N1 DG 5 E DG 5 1_555 D N3 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N2 DG 5 E DG 5 1_555 D O2 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C O6 DG 5 E DG 5 1_555 D N4 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N3 DT 6 E DT 6 1_555 D N1 DA 13 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O4 DT 6 E DT 6 1_555 D N6 DA 13 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N1 DA 7 E DA 7 1_555 D N3 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N6 DA 7 E DA 7 1_555 D O4 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N3 DC 8 E DC 8 1_555 D N1 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N4 DC 8 E DC 8 1_555 D O6 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O2 DC 8 E DC 8 1_555 D N2 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 DA 9 E DA 9 1_555 D N3 DT 10 F DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N6 DA 9 E DA 9 1_555 D O4 DT 10 F DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N3 DT 10 E DT 10 1_555 D N1 DA 9 F DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O4 DT 10 E DT 10 1_555 D N6 DA 9 F DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N1 DG 11 E DG 11 1_555 D N3 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N2 DG 11 E DG 11 1_555 D O2 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C O6 DG 11 E DG 11 1_555 D N4 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N3 DT 12 E DT 12 1_555 D N1 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O4 DT 12 E DT 12 1_555 D N6 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N1 DA 13 E DA 13 1_555 D N3 DT 6 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N6 DA 13 E DA 13 1_555 D O4 DT 6 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N3 DC 14 E DC 14 1_555 D N1 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N4 DC 14 E DC 14 1_555 D O6 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C O2 DC 14 E DC 14 1_555 D N2 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N1 DA 15 E DA 15 1_555 D N3 DT 4 F DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N6 DA 15 E DA 15 1_555 D O4 DT 4 F DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N1 DG 16 E DG 16 1_555 D N3 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N2 DG 16 E DG 16 1_555 D O2 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O6 DG 16 E DG 16 1_555 D N4 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N1 DA 17 E DA 17 1_555 D N3 DT 2 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N6 DA 17 E DA 17 1_555 D O4 DT 2 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C N3 DT 18 E DT 18 1_555 D N1 DA 1 F DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C O4 DT 18 E DT 18 1_555 D N6 DA 1 F DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 E N1 DA 1 I DA 1 1_555 F N3 DT 18 J DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 E N6 DA 1 I DA 1 1_555 F O4 DT 18 J DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 E N3 DT 2 I DT 2 1_555 F N1 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 E O4 DT 2 I DT 2 1_555 F N6 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 E N3 DC 3 I DC 3 1_555 F N1 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 E N4 DC 3 I DC 3 1_555 F O6 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 E O2 DC 3 I DC 3 1_555 F N2 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 E N3 DT 4 I DT 4 1_555 F N1 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 E O4 DT 4 I DT 4 1_555 F N6 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 E N1 DG 5 I DG 5 1_555 F N3 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 E N2 DG 5 I DG 5 1_555 F O2 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 E O6 DG 5 I DG 5 1_555 F N4 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 E N3 DT 6 I DT 6 1_555 F N1 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 E O4 DT 6 I DT 6 1_555 F N6 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 E N1 DA 7 I DA 7 1_555 F N3 DT 12 J DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 E N6 DA 7 I DA 7 1_555 F O4 DT 12 J DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 E N3 DC 8 I DC 8 1_555 F N1 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 E N4 DC 8 I DC 8 1_555 F O6 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 E O2 DC 8 I DC 8 1_555 F N2 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 E N1 DA 9 I DA 9 1_555 F N3 DT 10 J DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 E N6 DA 9 I DA 9 1_555 F O4 DT 10 J DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 E N3 DT 10 I DT 10 1_555 F N1 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 E O4 DT 10 I DT 10 1_555 F N6 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 E N1 DG 11 I DG 11 1_555 F N3 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 E N2 DG 11 I DG 11 1_555 F O2 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 E O6 DG 11 I DG 11 1_555 F N4 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 E N3 DT 12 I DT 12 1_555 F N1 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 E O4 DT 12 I DT 12 1_555 F N6 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 E N1 DA 13 I DA 13 1_555 F N3 DT 6 J DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 E N6 DA 13 I DA 13 1_555 F O4 DT 6 J DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 E N3 DC 14 I DC 14 1_555 F N1 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 E N4 DC 14 I DC 14 1_555 F O6 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 E O2 DC 14 I DC 14 1_555 F N2 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 E N1 DA 15 I DA 15 1_555 F N3 DT 4 J DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 E N6 DA 15 I DA 15 1_555 F O4 DT 4 J DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 E N1 DG 16 I DG 16 1_555 F N3 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 E N2 DG 16 I DG 16 1_555 F O2 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 E O6 DG 16 I DG 16 1_555 F N4 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 E N1 DA 17 I DA 17 1_555 F N3 DT 2 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 E N6 DA 17 I DA 17 1_555 F O4 DT 2 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 E N3 DT 18 I DT 18 1_555 F N1 DA 1 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 E O4 DT 18 I DT 18 1_555 F N6 DA 1 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H16 N5 O12 P3' _chem_comp.formula_weight 491.182 _chem_comp.id DTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PG O1G DTP doub 232 n n PG O2G DTP sing 233 n n PG O3G DTP sing 234 n n PG O3B DTP sing 235 n n O2G HOG2 DTP sing 236 n n O3G HOG3 DTP sing 237 n n PB O1B DTP doub 238 n n PB O2B DTP sing 239 n n PB O3B DTP sing 240 n n PB O3A DTP sing 241 n n O2B HOB2 DTP sing 242 n n PA O1A DTP doub 243 n n PA O2A DTP sing 244 n n PA O3A DTP sing 245 n n PA O5' DTP sing 246 n n O2A HOA2 DTP sing 247 n n O5' C5' DTP sing 248 n n C5' C4' DTP sing 249 n n C5' "H5'1" DTP sing 250 n n C5' "H5'2" DTP sing 251 n n C4' O4' DTP sing 252 n n C4' C3' DTP sing 253 n n C4' H4' DTP sing 254 n n O4' C1' DTP sing 255 n n C3' O3' DTP sing 256 n n C3' C2' DTP sing 257 n n C3' H3' DTP sing 258 n n O3' HO3' DTP sing 259 n n C2' C1' DTP sing 260 n n C2' "H2'1" DTP sing 261 n n C2' "H2'2" DTP sing 262 n n C1' N9 DTP sing 263 n n C1' H1' DTP sing 264 n n N9 C8 DTP sing 265 n y N9 C4 DTP sing 266 n y C8 N7 DTP doub 267 n y C8 H8 DTP sing 268 n n N7 C5 DTP sing 269 n y C5 C6 DTP sing 270 n y C5 C4 DTP doub 271 n y C6 N6 DTP sing 272 n n C6 N1 DTP doub 273 n y N6 HN61 DTP sing 274 n n N6 HN62 DTP sing 275 n n N1 C2 DTP sing 276 n y C2 N3 DTP doub 277 n y C2 H2 DTP sing 278 n n N3 C4 DTP sing 279 n y # _atom_sites.entry_id 8SJ0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012903 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010173 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006983 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 DTP A 1 601 601 DTP ATP . H 4 ZN A 1 602 1 ZN ZN . I 5 MG A 1 603 1 MG MG . J 3 DTP C 1 601 601 DTP ATP . K 4 ZN C 1 602 2 ZN ZN . L 5 MG C 1 603 2 MG MG . M 6 HOH A 1 701 34 HOH HOH . M 6 HOH A 2 702 25 HOH HOH . M 6 HOH A 3 703 23 HOH HOH . M 6 HOH A 4 704 4 HOH HOH . M 6 HOH A 5 705 14 HOH HOH . M 6 HOH A 6 706 20 HOH HOH . M 6 HOH A 7 707 6 HOH HOH . M 6 HOH A 8 708 32 HOH HOH . M 6 HOH A 9 709 22 HOH HOH . M 6 HOH A 10 710 37 HOH HOH . M 6 HOH A 11 711 11 HOH HOH . M 6 HOH A 12 712 13 HOH HOH . M 6 HOH A 13 713 12 HOH HOH . M 6 HOH A 14 714 16 HOH HOH . M 6 HOH A 15 715 29 HOH HOH . N 6 HOH C 1 701 17 HOH HOH . N 6 HOH C 2 702 18 HOH HOH . N 6 HOH C 3 703 27 HOH HOH . N 6 HOH C 4 704 30 HOH HOH . N 6 HOH C 5 705 33 HOH HOH . N 6 HOH C 6 706 26 HOH HOH . N 6 HOH C 7 707 7 HOH HOH . N 6 HOH C 8 708 15 HOH HOH . N 6 HOH C 9 709 9 HOH HOH . N 6 HOH C 10 710 21 HOH HOH . N 6 HOH C 11 711 36 HOH HOH . N 6 HOH C 12 712 19 HOH HOH . N 6 HOH C 13 713 28 HOH HOH . N 6 HOH C 14 714 35 HOH HOH . N 6 HOH C 15 715 24 HOH HOH . N 6 HOH C 16 716 31 HOH HOH . N 6 HOH C 17 717 38 HOH HOH . O 6 HOH E 1 101 10 HOH HOH . P 6 HOH I 1 101 8 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PG DTP . . . J 3 -31.313 -13.856 -15.993 1 61.76 ? PG DTP 601 C 1 HETATM 2 O O1G DTP . . . J 3 -32.608 -14.462 -15.526 1 61.79 ? O1G DTP 601 C 1 HETATM 3 O O2G DTP . . . J 3 -30.156 -13.908 -14.994 1 55.41 ? O2G DTP 601 C 1 HETATM 4 O O3G DTP . . . J 3 -30.786 -14.439 -17.362 1 64.01 ? O3G DTP 601 C 1 HETATM 5 P PB DTP . . . J 3 -31.405 -11.265 -17.498 1 64.68 ? PB DTP 601 C 1 HETATM 6 O O1B DTP . . . J 3 -31.25 -9.844 -17.002 1 63.17 ? O1B DTP 601 C 1 HETATM 7 O O2B DTP . . . J 3 -30.289 -11.806 -18.45 1 59.99 ? O2B DTP 601 C 1 HETATM 8 O O3B DTP . . . J 3 -31.517 -12.309 -16.279 1 59.13 ? O3B DTP 601 C 1 HETATM 9 P PA DTP . . . J 3 -33.237 -12.424 -19.526 1 69.2 ? PA DTP 601 C 1 HETATM 10 O O1A DTP . . . J 3 -32.306 -13.575 -19.602 1 65.8 ? O1A DTP 601 C 1 HETATM 11 O O2A DTP . . . J 3 -33.29 -11.494 -20.736 1 65.39 ? O2A DTP 601 C 1 HETATM 12 O O3A DTP . . . J 3 -32.772 -11.528 -18.276 1 67.33 ? O3A DTP 601 C 1 HETATM 13 O O5' DTP . . . J 3 -34.711 -12.87 -19.161 1 69.27 ? O5' DTP 601 C 1 HETATM 14 C C5' DTP . . . J 3 -35.072 -13.25 -17.812 1 71.41 ? C5' DTP 601 C 1 HETATM 15 C C4' DTP . . . J 3 -36.576 -13.159 -17.647 1 74.47 ? C4' DTP 601 C 1 HETATM 16 O O4' DTP . . . J 3 -36.906 -11.753 -17.573 1 73.35 ? O4' DTP 601 C 1 HETATM 17 C C3' DTP . . . J 3 -37.269 -13.693 -18.902 1 72.85 ? C3' DTP 601 C 1 HETATM 18 O O3' DTP . . . J 3 -38.49 -14.273 -18.452 1 72.99 ? O3' DTP 601 C 1 HETATM 19 C C2' DTP . . . J 3 -37.611 -12.424 -19.69 1 71.41 ? C2' DTP 601 C 1 HETATM 20 C C1' DTP . . . J 3 -37.824 -11.394 -18.585 1 71.53 ? C1' DTP 601 C 1 HETATM 21 N N9 DTP . . . J 3 -37.432 -10.06 -19.043 1 69.8 ? N9 DTP 601 C 1 HETATM 22 C C8 DTP . . . J 3 -36.154 -9.609 -19.283 1 69.72 ? C8 DTP 601 C 1 HETATM 23 N N7 DTP . . . J 3 -36.089 -8.362 -19.683 1 66.13 ? N7 DTP 601 C 1 HETATM 24 C C5 DTP . . . J 3 -37.416 -7.964 -19.721 1 66.15 ? C5 DTP 601 C 1 HETATM 25 C C6 DTP . . . J 3 -38.029 -6.746 -20.071 1 66.86 ? C6 DTP 601 C 1 HETATM 26 N N6 DTP . . . J 3 -37.351 -5.66 -20.46 1 64.84 ? N6 DTP 601 C 1 HETATM 27 N N1 DTP . . . J 3 -39.383 -6.676 -19.992 1 70.92 ? N1 DTP 601 C 1 HETATM 28 C C2 DTP . . . J 3 -40.065 -7.758 -19.589 1 71.71 ? C2 DTP 601 C 1 HETATM 29 N N3 DTP . . . J 3 -39.594 -8.963 -19.242 1 73.81 ? N3 DTP 601 C 1 HETATM 30 C C4 DTP . . . J 3 -38.256 -9 -19.329 1 69.32 ? C4 DTP 601 C 1 HETATM 31 H "H5'1" DTP . . . J 3 -34.641 -12.652 -17.181 1 85.73 ? "H5'1" DTP 601 C 1 HETATM 32 H "H5'2" DTP . . . J 3 -34.783 -14.161 -17.644 1 85.73 ? "H5'2" DTP 601 C 1 HETATM 33 H H4' DTP . . . J 3 -36.913 -13.596 -16.85 1 89.41 ? H4' DTP 601 C 1 HETATM 34 H H3' DTP . . . J 3 -36.691 -14.274 -19.42 1 87.46 ? H3' DTP 601 C 1 HETATM 35 H HO3' DTP . . . J 3 -39.069 -13.649 -18.418 1 87.63 ? HO3' DTP 601 C 1 HETATM 36 H "H2'1" DTP . . . J 3 -37.256 -12.215 -20.568 1 85.74 ? "H2'1" DTP 601 C 1 HETATM 37 H H1' DTP . . . J 3 -38.732 -11.412 -18.244 1 85.88 ? H1' DTP 601 C 1 HETATM 38 H H8 DTP . . . J 3 -35.401 -10.143 -19.171 1 83.71 ? H8 DTP 601 C 1 HETATM 39 H HN61 DTP . . . J 3 -37.761 -4.913 -20.578 1 77.85 ? HN61 DTP 601 C 1 HETATM 40 H HN62 DTP . . . J 3 -36.501 -5.714 -20.583 1 77.85 ? HN62 DTP 601 C 1 HETATM 41 H H2 DTP . . . J 3 -40.988 -7.658 -19.546 1 86.1 ? H2 DTP 601 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 306 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 41 #