data_8SJ2 # _model_server_result.job_id tTWQgLdB-XmfIxB85G_XVw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 19:35:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8sj2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":602}' # _entry.id 8SJ2 # _exptl.entry_id 8SJ2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 507.181 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8SJ2 _cell.length_a 78.634 _cell.length_b 98.851 _cell.length_c 142.778 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8SJ2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 68 A GLU 211 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 70 A ASP 213 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc3 A NE2 HIS 235 A HIS 378 1_555 J ZN ZN . A ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 241 A CYS 384 1_555 J ZN ZN . A ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 242 A CYS 385 1_555 J ZN ZN . A ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 249 A CYS 392 1_555 J ZN ZN . A ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc7 G O3G ATP . A ATP 601 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.965 ? metalc ? metalc8 G O2B ATP . A ATP 601 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc9 G O2A ATP . A ATP 601 1_555 I MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc10 I MG MG . A MG 603 1_555 O O HOH . A HOH 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc11 B OE1 GLU 68 C GLU 211 1_555 M MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc12 B OD2 ASP 70 C ASP 213 1_555 M MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc13 B NE2 HIS 235 C HIS 378 1_555 N ZN ZN . C ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 241 C CYS 384 1_555 N ZN ZN . C ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 242 C CYS 385 1_555 N ZN ZN . C ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 249 C CYS 392 1_555 N ZN ZN . C ZN 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc17 K O3G ATP . C ATP 601 1_555 M MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc18 K O2B ATP . C ATP 601 1_555 M MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? metalc ? metalc19 K O2A ATP . C ATP 601 1_555 M MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc20 M MG MG . C MG 603 1_555 P O HOH . C HOH 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N1 DA 1 E DA 1 1_555 D N3 DT 18 F DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N6 DA 1 E DA 1 1_555 D O4 DT 18 F DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N3 DT 2 E DT 2 1_555 D N1 DA 17 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C O4 DT 2 E DT 2 1_555 D N6 DA 17 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N3 DC 3 E DC 3 1_555 D N1 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N4 DC 3 E DC 3 1_555 D O6 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O2 DC 3 E DC 3 1_555 D N2 DG 16 F DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N3 DT 4 E DT 4 1_555 D N1 DA 15 F DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C O4 DT 4 E DT 4 1_555 D N6 DA 15 F DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N1 DG 5 E DG 5 1_555 D N3 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N2 DG 5 E DG 5 1_555 D O2 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C O6 DG 5 E DG 5 1_555 D N4 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N3 DT 6 E DT 6 1_555 D N1 DA 13 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O4 DT 6 E DT 6 1_555 D N6 DA 13 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N1 DA 7 E DA 7 1_555 D N3 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N6 DA 7 E DA 7 1_555 D O4 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N3 DC 8 E DC 8 1_555 D N1 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N4 DC 8 E DC 8 1_555 D O6 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O2 DC 8 E DC 8 1_555 D N2 DG 11 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 DA 9 E DA 9 1_555 D N3 DT 10 F DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N6 DA 9 E DA 9 1_555 D O4 DT 10 F DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N3 DT 10 E DT 10 1_555 D N1 DA 9 F DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O4 DT 10 E DT 10 1_555 D N6 DA 9 F DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N1 DG 11 E DG 11 1_555 D N3 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N2 DG 11 E DG 11 1_555 D O2 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C O6 DG 11 E DG 11 1_555 D N4 DC 8 F DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N3 DT 12 E DT 12 1_555 D N1 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O4 DT 12 E DT 12 1_555 D N6 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N1 DA 13 E DA 13 1_555 D N3 DT 6 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N6 DA 13 E DA 13 1_555 D O4 DT 6 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N3 DC 14 E DC 14 1_555 D N1 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N4 DC 14 E DC 14 1_555 D O6 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C O2 DC 14 E DC 14 1_555 D N2 DG 5 F DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N1 DA 15 E DA 15 1_555 D N3 DT 4 F DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N6 DA 15 E DA 15 1_555 D O4 DT 4 F DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N1 DG 16 E DG 16 1_555 D N3 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N2 DG 16 E DG 16 1_555 D O2 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O6 DG 16 E DG 16 1_555 D N4 DC 3 F DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N1 DA 17 E DA 17 1_555 D N3 DT 2 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N6 DA 17 E DA 17 1_555 D O4 DT 2 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C N3 DT 18 E DT 18 1_555 D N1 DA 1 F DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C O4 DT 18 E DT 18 1_555 D N6 DA 1 F DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 E N1 DA 1 I DA 1 1_555 F N3 DT 18 J DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 E N6 DA 1 I DA 1 1_555 F O4 DT 18 J DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 E N3 DT 2 I DT 2 1_555 F N1 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 E O4 DT 2 I DT 2 1_555 F N6 DA 17 J DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 E N3 DC 3 I DC 3 1_555 F N1 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 E N4 DC 3 I DC 3 1_555 F O6 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 E O2 DC 3 I DC 3 1_555 F N2 DG 16 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 E N3 DT 4 I DT 4 1_555 F N1 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 E O4 DT 4 I DT 4 1_555 F N6 DA 15 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 E N1 DG 5 I DG 5 1_555 F N3 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 E N2 DG 5 I DG 5 1_555 F O2 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 E O6 DG 5 I DG 5 1_555 F N4 DC 14 J DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 E N3 DT 6 I DT 6 1_555 F N1 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 E O4 DT 6 I DT 6 1_555 F N6 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 E N1 DA 7 I DA 7 1_555 F N3 DT 12 J DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 E N6 DA 7 I DA 7 1_555 F O4 DT 12 J DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 E N3 DC 8 I DC 8 1_555 F N1 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 E N4 DC 8 I DC 8 1_555 F O6 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 E O2 DC 8 I DC 8 1_555 F N2 DG 11 J DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 E N1 DA 9 I DA 9 1_555 F N3 DT 10 J DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 E N6 DA 9 I DA 9 1_555 F O4 DT 10 J DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 E N3 DT 10 I DT 10 1_555 F N1 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 E O4 DT 10 I DT 10 1_555 F N6 DA 9 J DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 E N1 DG 11 I DG 11 1_555 F N3 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 E N2 DG 11 I DG 11 1_555 F O2 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 E O6 DG 11 I DG 11 1_555 F N4 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 E N3 DT 12 I DT 12 1_555 F N1 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 E O4 DT 12 I DT 12 1_555 F N6 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 E N1 DA 13 I DA 13 1_555 F N3 DT 6 J DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 E N6 DA 13 I DA 13 1_555 F O4 DT 6 J DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 E N3 DC 14 I DC 14 1_555 F N1 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 E N4 DC 14 I DC 14 1_555 F O6 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 E O2 DC 14 I DC 14 1_555 F N2 DG 5 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 E N1 DA 15 I DA 15 1_555 F N3 DT 4 J DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 E N6 DA 15 I DA 15 1_555 F O4 DT 4 J DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 E N1 DG 16 I DG 16 1_555 F N3 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 E N2 DG 16 I DG 16 1_555 F O2 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 E O6 DG 16 I DG 16 1_555 F N4 DC 3 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 E N1 DA 17 I DA 17 1_555 F N3 DT 2 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 E N6 DA 17 I DA 17 1_555 F O4 DT 2 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 E N3 DT 18 I DT 18 1_555 F N1 DA 1 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 E O4 DT 18 I DT 18 1_555 F N6 DA 1 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H16 N5 O13 P3' _chem_comp.formula_weight 507.181 _chem_comp.id DGT _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PG O1G DGT sing 244 n n PG O2G DGT sing 245 n n O1G HO1G DGT sing 246 n n O2G HO2G DGT sing 247 n n O3G PG DGT doub 248 n n O3B PG DGT sing 249 n n PB O3B DGT sing 250 n n PB O1B DGT sing 251 n n PB O3A DGT sing 252 n n O1B HO1B DGT sing 253 n n O2B PB DGT doub 254 n n PA O3A DGT sing 255 n n PA O1A DGT sing 256 n n O1A HO1A DGT sing 257 n n O2A PA DGT doub 258 n n O5' PA DGT sing 259 n n O5' C5' DGT sing 260 n n C5' H5' DGT sing 261 n n C5' "H5'A" DGT sing 262 n n C4' C5' DGT sing 263 n n C4' H4' DGT sing 264 n n O4' C4' DGT sing 265 n n C3' C4' DGT sing 266 n n C3' O3' DGT sing 267 n n C3' H3' DGT sing 268 n n O3' HO3' DGT sing 269 n n C2' C3' DGT sing 270 n n C2' C1' DGT sing 271 n n C2' H2' DGT sing 272 n n C2' "H2'A" DGT sing 273 n n C1' O4' DGT sing 274 n n C1' H1' DGT sing 275 n n N9 C1' DGT sing 276 n n N9 C4 DGT sing 277 n y C8 N9 DGT sing 278 n y C8 H8 DGT sing 279 n n N7 C8 DGT doub 280 n y N7 C5 DGT sing 281 n y C5 C6 DGT sing 282 n n C5 C4 DGT doub 283 n y C6 N1 DGT sing 284 n n O6 C6 DGT doub 285 n n N1 C2 DGT sing 286 n n C2 N3 DGT doub 287 n n C2 N2 DGT sing 288 n n N2 HN2 DGT sing 289 n n N2 HN2A DGT sing 290 n n C4 N3 DGT sing 291 n n N1 H16 DGT sing 292 n n # _atom_sites.entry_id 8SJ2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012717 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010116 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007004 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 ATP A 1 601 601 ATP ATP . H 4 DGT A 1 602 602 DGT 2dG . I 5 MG A 1 603 1 MG MG . J 6 ZN A 1 604 2 ZN ZN . K 3 ATP C 1 601 601 ATP ATP . L 4 DGT C 1 602 602 DGT 2dG . M 5 MG C 1 603 3 MG MG . N 6 ZN C 1 604 1 ZN ZN . O 7 HOH A 1 701 9 HOH HOH . O 7 HOH A 2 702 44 HOH HOH . O 7 HOH A 3 703 106 HOH HOH . O 7 HOH A 4 704 119 HOH HOH . O 7 HOH A 5 705 59 HOH HOH . O 7 HOH A 6 706 101 HOH HOH . O 7 HOH A 7 707 37 HOH HOH . O 7 HOH A 8 708 15 HOH HOH . O 7 HOH A 9 709 71 HOH HOH . O 7 HOH A 10 710 87 HOH HOH . O 7 HOH A 11 711 20 HOH HOH . O 7 HOH A 12 712 6 HOH HOH . O 7 HOH A 13 713 5 HOH HOH . O 7 HOH A 14 714 11 HOH HOH . O 7 HOH A 15 715 104 HOH HOH . O 7 HOH A 16 716 16 HOH HOH . O 7 HOH A 17 717 120 HOH HOH . O 7 HOH A 18 718 14 HOH HOH . O 7 HOH A 19 719 41 HOH HOH . O 7 HOH A 20 720 43 HOH HOH . O 7 HOH A 21 721 118 HOH HOH . O 7 HOH A 22 722 47 HOH HOH . O 7 HOH A 23 723 36 HOH HOH . O 7 HOH A 24 724 28 HOH HOH . O 7 HOH A 25 725 8 HOH HOH . O 7 HOH A 26 726 81 HOH HOH . O 7 HOH A 27 727 83 HOH HOH . O 7 HOH A 28 728 49 HOH HOH . O 7 HOH A 29 729 33 HOH HOH . O 7 HOH A 30 730 80 HOH HOH . O 7 HOH A 31 731 30 HOH HOH . O 7 HOH A 32 732 50 HOH HOH . O 7 HOH A 33 733 69 HOH HOH . O 7 HOH A 34 734 102 HOH HOH . O 7 HOH A 35 735 32 HOH HOH . O 7 HOH A 36 736 45 HOH HOH . O 7 HOH A 37 737 51 HOH HOH . O 7 HOH A 38 738 117 HOH HOH . O 7 HOH A 39 739 108 HOH HOH . O 7 HOH A 40 740 10 HOH HOH . O 7 HOH A 41 741 34 HOH HOH . O 7 HOH A 42 742 122 HOH HOH . O 7 HOH A 43 743 21 HOH HOH . O 7 HOH A 44 744 93 HOH HOH . O 7 HOH A 45 745 121 HOH HOH . O 7 HOH A 46 746 75 HOH HOH . O 7 HOH A 47 747 125 HOH HOH . O 7 HOH A 48 748 18 HOH HOH . O 7 HOH A 49 749 110 HOH HOH . O 7 HOH A 50 750 64 HOH HOH . O 7 HOH A 51 751 76 HOH HOH . O 7 HOH A 52 752 91 HOH HOH . O 7 HOH A 53 753 103 HOH HOH . O 7 HOH A 54 754 95 HOH HOH . P 7 HOH C 1 701 105 HOH HOH . P 7 HOH C 2 702 130 HOH HOH . P 7 HOH C 3 703 2 HOH HOH . P 7 HOH C 4 704 38 HOH HOH . P 7 HOH C 5 705 54 HOH HOH . P 7 HOH C 6 706 67 HOH HOH . P 7 HOH C 7 707 25 HOH HOH . P 7 HOH C 8 708 56 HOH HOH . P 7 HOH C 9 709 48 HOH HOH . P 7 HOH C 10 710 1 HOH HOH . P 7 HOH C 11 711 13 HOH HOH . P 7 HOH C 12 712 109 HOH HOH . P 7 HOH C 13 713 12 HOH HOH . P 7 HOH C 14 714 7 HOH HOH . P 7 HOH C 15 715 84 HOH HOH . P 7 HOH C 16 716 3 HOH HOH . P 7 HOH C 17 717 35 HOH HOH . P 7 HOH C 18 718 4 HOH HOH . P 7 HOH C 19 719 40 HOH HOH . P 7 HOH C 20 720 22 HOH HOH . P 7 HOH C 21 721 72 HOH HOH . P 7 HOH C 22 722 26 HOH HOH . P 7 HOH C 23 723 131 HOH HOH . P 7 HOH C 24 724 58 HOH HOH . P 7 HOH C 25 725 70 HOH HOH . P 7 HOH C 26 726 61 HOH HOH . P 7 HOH C 27 727 27 HOH HOH . P 7 HOH C 28 728 116 HOH HOH . P 7 HOH C 29 729 68 HOH HOH . P 7 HOH C 30 730 107 HOH HOH . P 7 HOH C 31 731 42 HOH HOH . P 7 HOH C 32 732 55 HOH HOH . P 7 HOH C 33 733 89 HOH HOH . P 7 HOH C 34 734 19 HOH HOH . P 7 HOH C 35 735 23 HOH HOH . P 7 HOH C 36 736 31 HOH HOH . P 7 HOH C 37 737 99 HOH HOH . P 7 HOH C 38 738 46 HOH HOH . P 7 HOH C 39 739 17 HOH HOH . P 7 HOH C 40 740 57 HOH HOH . P 7 HOH C 41 741 66 HOH HOH . P 7 HOH C 42 742 100 HOH HOH . P 7 HOH C 43 743 111 HOH HOH . Q 7 HOH E 1 101 65 HOH HOH . Q 7 HOH E 2 102 52 HOH HOH . Q 7 HOH E 3 103 128 HOH HOH . Q 7 HOH E 4 104 78 HOH HOH . Q 7 HOH E 5 105 123 HOH HOH . Q 7 HOH E 6 106 79 HOH HOH . Q 7 HOH E 7 107 82 HOH HOH . Q 7 HOH E 8 108 113 HOH HOH . Q 7 HOH E 9 109 53 HOH HOH . Q 7 HOH E 10 110 124 HOH HOH . R 7 HOH F 1 101 90 HOH HOH . R 7 HOH F 2 102 62 HOH HOH . R 7 HOH F 3 103 39 HOH HOH . S 7 HOH I 1 101 92 HOH HOH . S 7 HOH I 2 102 73 HOH HOH . S 7 HOH I 3 103 29 HOH HOH . S 7 HOH I 4 104 63 HOH HOH . S 7 HOH I 5 105 77 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PG DGT . . . H 4 3.121 33.528 -19.239 1 136.5 ? PG DGT 602 A 1 HETATM 2 O O1G DGT . . . H 4 3.648 32.268 -18.579 1 116.64 ? O1G DGT 602 A 1 HETATM 3 O O2G DGT . . . H 4 3.51 34.788 -18.483 1 109.9 ? O2G DGT 602 A 1 HETATM 4 O O3G DGT . . . H 4 1.632 33.455 -19.52 1 143.3 ? O3G DGT 602 A 1 HETATM 5 O O3B DGT . . . H 4 3.844 33.629 -20.691 1 138.11 ? O3B DGT 602 A 1 HETATM 6 P PB DGT . . . H 4 3.911 32.679 -21.983 1 134.63 ? PB DGT 602 A 1 HETATM 7 O O1B DGT . . . H 4 4.68 33.358 -23.072 1 120.62 ? O1B DGT 602 A 1 HETATM 8 O O2B DGT . . . H 4 4.331 31.313 -21.538 1 133.84 ? O2B DGT 602 A 1 HETATM 9 O O3A DGT . . . H 4 2.371 32.618 -22.431 1 136.47 ? O3A DGT 602 A 1 HETATM 10 P PA DGT . . . H 4 1.567 31.533 -23.304 1 131.65 ? PA DGT 602 A 1 HETATM 11 O O1A DGT . . . H 4 2.465 31.08 -24.408 1 131.07 ? O1A DGT 602 A 1 HETATM 12 O O2A DGT . . . H 4 1.015 30.499 -22.376 1 131.97 ? O2A DGT 602 A 1 HETATM 13 O O5' DGT . . . H 4 0.353 32.391 -23.921 1 119.5 ? O5' DGT 602 A 1 HETATM 14 C C5' DGT . . . H 4 -0.86 32.559 -23.137 1 109.35 ? C5' DGT 602 A 1 HETATM 15 C C4' DGT . . . H 4 -2.071 32.368 -24.021 1 99.68 ? C4' DGT 602 A 1 HETATM 16 O O4' DGT . . . H 4 -1.775 31.398 -25.052 1 92.21 ? O4' DGT 602 A 1 HETATM 17 C C3' DGT . . . H 4 -3.325 31.887 -23.288 1 93.03 ? C3' DGT 602 A 1 HETATM 18 O O3' DGT . . . H 4 -4.195 32.97 -22.954 1 68.72 ? O3' DGT 602 A 1 HETATM 19 C C2' DGT . . . H 4 -3.971 30.921 -24.28 1 90.37 ? C2' DGT 602 A 1 HETATM 20 C C1' DGT . . . H 4 -2.8 30.404 -25.11 1 87.17 ? C1' DGT 602 A 1 HETATM 21 N N9 DGT . . . H 4 -2.196 29.101 -24.746 1 79.88 ? N9 DGT 602 A 1 HETATM 22 C C8 DGT . . . H 4 -0.924 28.895 -24.258 1 79.49 ? C8 DGT 602 A 1 HETATM 23 N N7 DGT . . . H 4 -0.662 27.619 -24.067 1 77.15 ? N7 DGT 602 A 1 HETATM 24 C C5 DGT . . . H 4 -1.817 26.953 -24.473 1 67.22 ? C5 DGT 602 A 1 HETATM 25 C C6 DGT . . . H 4 -2.113 25.563 -24.491 1 63.66 ? C6 DGT 602 A 1 HETATM 26 O O6 DGT . . . H 4 -1.395 24.61 -24.144 1 66.22 ? O6 DGT 602 A 1 HETATM 27 N N1 DGT . . . H 4 -3.402 25.324 -24.967 1 58.75 ? N1 DGT 602 A 1 HETATM 28 C C2 DGT . . . H 4 -4.288 26.291 -25.376 1 62.74 ? C2 DGT 602 A 1 HETATM 29 N N2 DGT . . . H 4 -5.486 25.856 -25.796 1 59.43 ? N2 DGT 602 A 1 HETATM 30 N N3 DGT . . . H 4 -4.015 27.601 -25.365 1 67.9 ? N3 DGT 602 A 1 HETATM 31 C C4 DGT . . . H 4 -2.766 27.858 -24.899 1 69.26 ? C4 DGT 602 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 311 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 31 #