data_8SQN
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8sqn 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    8SQN 
#
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_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8SQN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    nonameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      9 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 J N N 
? 4 K N N 
? 4 L N N 
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
? 4 R N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 B SG CYS 114 B CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 62 B CYS 62 1_555 B SG CYS 94 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 63 B CYS 63 1_555 B SG CYS 96 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 68 B CYS 68 1_555 B SG CYS 78 B CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf5 B SG CYS 259 B CYS 259 1_555 B SG CYS 271 B CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf6 B SG CYS 301 B CYS 301 1_555 B SG CYS 376 B CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf7 B SG CYS 306 B CYS 306 1_555 B SG CYS 380 B CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 328 B CYS 328 1_555 B SG CYS 370 B CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
disulf ? disulf9 C SG CYS 15 D CYS 19 1_555 C SG CYS 123 D CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf10 C SG CYS 18 D CYS 22 1_555 C SG CYS 24 D CYS 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf11 C SG CYS 90 D CYS 94 1_555 C SG CYS 104 D CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf12 C SG CYS 151 D CYS 155 1_555 C SG CYS 265 D CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf13 C SG CYS 200 D CYS 204 1_555 C SG CYS 225 D CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf14 C SG CYS 202 D CYS 206 1_555 C SG CYS 219 D CYS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
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disulf ? disulf21 D SG CYS 306 F CYS 306 1_555 D SG CYS 380 F CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
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disulf ? disulf23 E SG CYS 15 H CYS 19 1_555 E SG CYS 123 H CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
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disulf ? disulf33 F SG CYS 259 J CYS 259 1_555 F SG CYS 271 J CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf34 F SG CYS 301 J CYS 301 1_555 F SG CYS 376 J CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf35 F SG CYS 306 J CYS 306 1_555 F SG CYS 380 J CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf36 F SG CYS 328 J CYS 328 1_555 F SG CYS 370 J CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf37 G SG CYS 15 L CYS 19 1_555 G SG CYS 123 L CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf38 G SG CYS 18 L CYS 22 1_555 G SG CYS 24 L CYS 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf39 G SG CYS 90 L CYS 94 1_555 G SG CYS 104 L CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf40 G SG CYS 151 L CYS 155 1_555 G SG CYS 265 L CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf41 G SG CYS 200 L CYS 204 1_555 G SG CYS 225 L CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf42 G SG CYS 202 L CYS 206 1_555 G SG CYS 219 L CYS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf43 H SG CYS 49 N CYS 49 1_555 H SG CYS 114 N CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf44 H SG CYS 62 N CYS 62 1_555 H SG CYS 94 N CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf45 H SG CYS 63 N CYS 63 1_555 H SG CYS 96 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf46 H SG CYS 68 N CYS 68 1_555 H SG CYS 78 N CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf47 H SG CYS 259 N CYS 259 1_555 H SG CYS 271 N CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf48 H SG CYS 301 N CYS 301 1_555 H SG CYS 376 N CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf49 H SG CYS 306 N CYS 306 1_555 H SG CYS 380 N CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf50 H SG CYS 328 N CYS 328 1_555 H SG CYS 370 N CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf51 I SG CYS 15 P CYS 19 1_555 I SG CYS 123 P CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf52 I SG CYS 18 P CYS 22 1_555 I SG CYS 24 P CYS 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
disulf ? disulf53 I SG CYS 90 P CYS 94 1_555 I SG CYS 104 P CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf54 I SG CYS 151 P CYS 155 1_555 I SG CYS 265 P CYS 269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf55 I SG CYS 200 P CYS 204 1_555 I SG CYS 225 P CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf56 I SG CYS 202 P CYS 206 1_555 I SG CYS 219 P CYS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
covale ? covale1 B ND2 ASN 139 B ASN 139 1_555 K C1 NAG . B NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale2 C ND2 ASN 195 D ASN 199 1_555 L C1 NAG . D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale3 D ND2 ASN 139 F ASN 139 1_555 M C1 NAG . F NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale4 E ND2 ASN 195 H ASN 199 1_555 N C1 NAG . H NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale5 F ND2 ASN 139 J ASN 139 1_555 O C1 NAG . J NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? 
covale ? covale6 G ND2 ASN 195 L ASN 199 1_555 P C1 NAG . L NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? 
covale ? covale7 H ND2 ASN 139 N ASN 139 1_555 Q C1 NAG . N NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale8 I ND2 ASN 195 P ASN 199 1_555 R C1 NAG . P NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H15 N O6' 
_chem_comp.formula_weight    221.208 
_chem_comp.id                NAG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 
_chem_comp.type              'd-saccharide, beta linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 NAG sing 235 n n 
C1 O1 NAG sing 236 n n 
C1 O5 NAG sing 237 n n 
C1 H1 NAG sing 238 n n 
C2 C3 NAG sing 239 n n 
C2 N2 NAG sing 240 n n 
C2 H2 NAG sing 241 n n 
C3 C4 NAG sing 242 n n 
C3 O3 NAG sing 243 n n 
C3 H3 NAG sing 244 n n 
C4 C5 NAG sing 245 n n 
C4 O4 NAG sing 246 n n 
C4 H4 NAG sing 247 n n 
C5 C6 NAG sing 248 n n 
C5 O5 NAG sing 249 n n 
C5 H5 NAG sing 250 n n 
C6 O6 NAG sing 251 n n 
C6 H61 NAG sing 252 n n 
C6 H62 NAG sing 253 n n 
C7 C8 NAG sing 254 n n 
C7 N2 NAG sing 255 n n 
C7 O7 NAG doub 256 n n 
C8 H81 NAG sing 257 n n 
C8 H82 NAG sing 258 n n 
C8 H83 NAG sing 259 n n 
N2 HN2 NAG sing 260 n n 
O1 HO1 NAG sing 261 n n 
O3 HO3 NAG sing 262 n n 
O4 HO4 NAG sing 263 n n 
O6 HO6 NAG sing 264 n n 
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 
NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 
NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
#
_atom_sites.entry_id                     8SQN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
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J 4 NAG A 1 301 297 NAG NAG . 
K 4 NAG B 1 501 439 NAG NAG . 
L 4 NAG D 1 501 420 NAG NAG . 
M 4 NAG F 1 501 439 NAG NAG . 
N 4 NAG H 1 501 420 NAG NAG . 
O 4 NAG J 1 501 439 NAG NAG . 
P 4 NAG L 1 501 420 NAG NAG . 
Q 4 NAG N 1 501 439 NAG NAG . 
R 4 NAG P 1 501 420 NAG NAG . 
#
loop_
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HETATM 2 C C2 NAG . . . O 4 199.964 110.793 197.005 1 101.74 ? C2 NAG 501 J 1 
HETATM 3 C C3 NAG . . . O 4 200.977 109.908 197.726 1 101.74 ? C3 NAG 501 J 1 
HETATM 4 C C4 NAG . . . O 4 201.755 109.064 196.726 1 101.74 ? C4 NAG 501 J 1 
HETATM 5 C C5 NAG . . . O 4 202.384 109.96 195.665 1 101.74 ? C5 NAG 501 J 1 
HETATM 6 C C6 NAG . . . O 4 203.087 109.182 194.577 1 101.74 ? C6 NAG 501 J 1 
HETATM 7 C C7 NAG . . . O 4 197.963 111.585 198.188 1 101.74 ? C7 NAG 501 J 1 
HETATM 8 C C8 NAG . . . O 4 197.425 112.551 199.2 1 101.74 ? C8 NAG 501 J 1 
HETATM 9 N N2 NAG . . . O 4 199.277 111.655 197.954 1 101.74 ? N2 NAG 501 J 1 
HETATM 10 O O3 NAG . . . O 4 200.298 109.066 198.65 1 101.74 ? O3 NAG 501 J 1 
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HETATM 14 O O7 NAG . . . O 4 197.241 110.78 197.61 1 101.74 ? O7 NAG 501 J 1 
#
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