data_8SRI # _model_server_result.job_id UiwgZyMlxYEMS7JpQhf8jg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 23:43:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8sri # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":1703}' # _entry.id 8SRI # _exptl.entry_id 8SRI _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 16 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8SRI _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8SRI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 X N N ? 3 Y N N ? 3 Z N N ? 3 AA N N ? 3 IA N N ? 3 JA N N ? 3 KA N N ? 3 LA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 997 A CYS 997 1_555 A SG CYS 1006 A CYS 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 997 B CYS 997 1_555 B SG CYS 1006 B CYS 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 997 C CYS 997 1_555 C SG CYS 1006 C CYS 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 997 D CYS 997 1_555 D SG CYS 1006 D CYS 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 850 A GLU 850 1_555 F MG MG . A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLN 853 A GLN 853 1_555 F MG MG . A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASN 869 A ASN 869 1_555 F MG MG . A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 872 A ASP 872 1_555 F MG MG . A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc5 A O GLY 1370 A GLY 1370 1_555 G MG MG . A MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 1386 A GLU 1386 1_555 H MG MG . A MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 1386 A GLU 1386 1_555 I MG MG . A MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 1386 A GLU 1386 1_555 I MG MG . A MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 1390 A GLU 1390 1_555 G MG MG . A MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 1390 A GLU 1390 1_555 G MG MG . A MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc11 A OE2 GLU 1390 A GLU 1390 1_555 H MG MG . A MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 1460 A ASP 1460 1_555 H MG MG . A MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc13 G MG MG . A MG 1703 1_555 K O2B APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc14 H MG MG . A MG 1704 1_555 K O5' APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc15 H MG MG . A MG 1704 1_555 K O1A APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc16 I MG MG . A MG 1705 1_555 K O5' APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc17 I MG MG . A MG 1705 1_555 K O1A APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc18 I MG MG . A MG 1705 1_555 K O2A APR . A APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc19 B OE2 GLU 850 B GLU 850 1_555 P MG MG . B MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc20 B OE1 GLN 853 B GLN 853 1_555 P MG MG . B MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc21 B OD1 ASN 869 B ASN 869 1_555 P MG MG . B MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc22 B OD2 ASP 872 B ASP 872 1_555 P MG MG . B MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc23 B O GLY 1370 B GLY 1370 1_555 Q MG MG . B MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc24 B OE1 GLU 1386 B GLU 1386 1_555 R MG MG . B MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc25 B OE1 GLU 1386 B GLU 1386 1_555 S MG MG . B MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc26 B OE2 GLU 1386 B GLU 1386 1_555 S MG MG . B MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc ? metalc27 B OE1 GLU 1390 B GLU 1390 1_555 Q MG MG . B MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc28 B OE2 GLU 1390 B GLU 1390 1_555 Q MG MG . B MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc29 B OE2 GLU 1390 B GLU 1390 1_555 R MG MG . B MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc30 B OD1 ASP 1460 B ASP 1460 1_555 R MG MG . B MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc31 Q MG MG . B MG 1703 1_555 T O2B APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc32 R MG MG . B MG 1704 1_555 T O5' APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc33 R MG MG . B MG 1704 1_555 T O1A APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc ? metalc34 S MG MG . B MG 1705 1_555 T O5' APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc35 S MG MG . B MG 1705 1_555 T O1A APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc36 S MG MG . B MG 1705 1_555 T O2A APR . B APR 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc37 C OE2 GLU 850 C GLU 850 1_555 X MG MG . C MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc38 C OE1 GLN 853 C GLN 853 1_555 X MG MG . C MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc39 C OD1 ASN 869 C ASN 869 1_555 X MG MG . C MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc40 C OD2 ASP 872 C ASP 872 1_555 X MG MG . C MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc41 C O GLY 1370 C GLY 1370 1_555 Y MG MG . C MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc42 C OE1 GLU 1386 C GLU 1386 1_555 Z MG MG . C MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc43 C OE1 GLU 1386 C GLU 1386 1_555 AA MG MG . C MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc44 C OE2 GLU 1386 C GLU 1386 1_555 AA MG MG . C MG 1705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc ? metalc45 C OE1 GLU 1390 C GLU 1390 1_555 Y MG MG . C MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc46 C OE2 GLU 1390 C GLU 1390 1_555 Y MG MG . C MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc47 C OE2 GLU 1390 C GLU 1390 1_555 Z MG MG . C MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc48 C OD1 ASP 1460 C ASP 1460 1_555 Z MG MG . C MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc49 Y MG MG . C MG 1703 1_555 CA O2B APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc50 Z MG MG . C MG 1704 1_555 CA O5' APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc51 Z MG MG . C MG 1704 1_555 CA O1A APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc52 AA MG MG . C MG 1705 1_555 CA O5' APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc53 AA MG MG . C MG 1705 1_555 CA O1A APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc54 AA MG MG . C MG 1705 1_555 CA O2A APR . C APR 1707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc55 D OE2 GLU 850 D GLU 850 1_555 IA MG MG . D MG 6004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc ? metalc56 D OE1 GLN 853 D GLN 853 1_555 IA MG MG . D MG 6004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc57 D OD1 ASN 869 D ASN 869 1_555 IA MG MG . D MG 6004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc58 D OD2 ASP 872 D ASP 872 1_555 IA MG MG . D MG 6004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc59 D O GLY 1370 D GLY 1370 1_555 JA MG MG . D MG 6005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc60 D OE1 GLU 1386 D GLU 1386 1_555 KA MG MG . D MG 6006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc61 D OE1 GLU 1386 D GLU 1386 1_555 LA MG MG . D MG 6007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc62 D OE2 GLU 1386 D GLU 1386 1_555 LA MG MG . D MG 6007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc ? metalc63 D OE1 GLU 1390 D GLU 1390 1_555 JA MG MG . D MG 6005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc64 D OE2 GLU 1390 D GLU 1390 1_555 JA MG MG . D MG 6005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc65 D OE2 GLU 1390 D GLU 1390 1_555 KA MG MG . D MG 6006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc66 D OD1 ASP 1460 D ASP 1460 1_555 KA MG MG . D MG 6006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc67 JA MG MG . D MG 6005 1_555 NA O2B APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc68 KA MG MG . D MG 6006 1_555 NA O5' APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc69 KA MG MG . D MG 6006 1_555 NA O1A APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc70 LA MG MG . D MG 6007 1_555 NA O5' APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc71 LA MG MG . D MG 6007 1_555 NA O1A APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc72 LA MG MG . D MG 6007 1_555 NA O2A APR . D APR 6009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8SRI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 APR A 1 1701 1701 APR APR . F 3 MG A 1 1702 3001 MG MG . G 3 MG A 1 1703 3101 MG MG . H 3 MG A 1 1704 3102 MG MG . I 3 MG A 1 1705 3103 MG MG . J 4 CLR A 1 1706 6003 CLR CLR . K 2 APR A 1 1707 1702 APR APR . L 4 CLR A 1 1708 6001 CLR CLR . M 4 CLR A 1 1709 6002 CLR CLR . N 4 CLR A 1 1710 6003 CLR CLR . O 2 APR B 1 1701 1701 APR APR . P 3 MG B 1 1702 3001 MG MG . Q 3 MG B 1 1703 3101 MG MG . R 3 MG B 1 1704 3102 MG MG . S 3 MG B 1 1705 3103 MG MG . T 2 APR B 1 1706 1702 APR APR . U 4 CLR B 1 1707 6001 CLR CLR . V 4 CLR B 1 1708 6002 CLR CLR . W 2 APR C 1 1701 1701 APR APR . X 3 MG C 1 1702 3001 MG MG . Y 3 MG C 1 1703 3101 MG MG . Z 3 MG C 1 1704 3102 MG MG . AA 3 MG C 1 1705 3103 MG MG . BA 4 CLR C 1 1706 6003 CLR CLR . CA 2 APR C 1 1707 1702 APR APR . DA 4 CLR C 1 1708 6001 CLR CLR . EA 4 CLR C 1 1709 6002 CLR CLR . FA 4 CLR D 1 6001 6001 CLR CLR . GA 4 CLR D 1 6002 6002 CLR CLR . HA 2 APR D 1 6003 1701 APR APR . IA 3 MG D 1 6004 3001 MG MG . JA 3 MG D 1 6005 3101 MG MG . KA 3 MG D 1 6006 3102 MG MG . LA 3 MG D 1 6007 3103 MG MG . MA 4 CLR D 1 6008 6003 CLR CLR . NA 2 APR D 1 6009 1702 APR APR . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Q _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 200.136 _atom_site.Cartn_y 218.885 _atom_site.Cartn_z 257.912 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 190.02 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1703 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 48 _model_server_stats.query_time_ms 323 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #