data_8T2F # _model_server_result.job_id D0qyp7-HMrStnrwJ84Bbuw _model_server_result.datetime_utc '2025-02-26 05:32:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8t2f # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":608}' # _entry.id 8T2F # _exptl.entry_id 8T2F _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 43 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8T2F _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8T2F _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 N N N ? 7 O N N ? 7 P N N ? 7 Q N N ? 7 R N N ? 7 S N N ? 7 T N N ? 7 U N N ? 7 V N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG A 512 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG A 513 NAG 6 n J NAG 1 I 1 NAG A 517 NAG 6 n J NAG 2 I 2 NAG A 518 NAG 6 n J BMA 3 I 3 BMA A 519 BMA 5 n K NAG 1 J 1 NAG A 522 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG A 527 NAG 6 n L NAG 1 K 1 NAG E 514 NAG 6 n L NAG 2 K 2 NAG E 515 NAG 6 n L BMA 3 K 3 BMA E 516 BMA 6 n M NAG 1 M 1 NAG F 514 NAG 6 n M NAG 2 M 2 NAG F 515 NAG 6 n M BMA 3 M 3 BMA F 516 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 54 1_555 A SG CYS 78 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 124 A CYS 119 1_555 A SG CYS 210 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 131 A CYS 126 1_555 A SG CYS 201 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 136 A CYS 131 1_555 A SG CYS 154 A CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 223 A CYS 218 1_555 A SG CYS 252 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 233 A CYS 228 1_555 A SG CYS 244 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 301 A CYS 296 1_555 A SG CYS 335 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 382 A CYS 378 1_555 A SG CYS 448 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 389 A CYS 385 1_555 A SG CYS 421 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 504 A CYS 501 1_555 B SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 87 B CYS 598 1_555 B SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 87 C CYS 598 1_555 C SG CYS 93 C CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 59 E CYS 54 1_555 D SG CYS 78 E CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 124 E CYS 119 1_555 D SG CYS 210 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 131 E CYS 126 1_555 D SG CYS 201 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 136 E CYS 131 1_555 D SG CYS 154 E CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 223 E CYS 218 1_555 D SG CYS 252 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 D SG CYS 233 E CYS 228 1_555 D SG CYS 244 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 301 E CYS 296 1_555 D SG CYS 335 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 389 E CYS 385 1_555 D SG CYS 421 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 87 D CYS 598 1_555 E SG CYS 93 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf22 E SG CYS 94 D CYS 605 1_555 F SG CYS 504 F CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 59 F CYS 54 1_555 F SG CYS 78 F CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 124 F CYS 119 1_555 F SG CYS 210 F CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf25 F SG CYS 131 F CYS 126 1_555 F SG CYS 201 F CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 136 F CYS 131 1_555 F SG CYS 154 F CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf27 F SG CYS 223 F CYS 218 1_555 F SG CYS 252 F CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf28 F SG CYS 233 F CYS 228 1_555 F SG CYS 244 F CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 F SG CYS 301 F CYS 296 1_555 F SG CYS 335 F CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 F SG CYS 382 F CYS 378 1_555 F SG CYS 448 F CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf31 F SG CYS 389 F CYS 385 1_555 F SG CYS 421 F CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 93 A ASN 88 1_555 N C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 153 A ASN 148 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 157 A ASN 152 1_555 O C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 202 A ASN 197 1_555 P C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 239 A ASN 234 1_555 Q C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 246 A ASN 241 1_555 R C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 267 A ASN 262 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 281 A ASN 276 1_555 S C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 300 A ASN 295 1_555 W C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 336 A ASN 332 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 343 A ASN 339 1_555 Z C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 359 A ASN 355 1_555 X C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 367 A ASN 363 1_555 T C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 390 A ASN 386 1_555 U C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 396 A ASN 392 1_555 Y C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 451 A ASN 448 1_555 V C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 AA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 BA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 126 C ASN 637 1_555 CA C1 NAG . C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 157 E ASN 152 1_555 DA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 239 E ASN 234 1_555 EA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 267 E ASN 262 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 281 E ASN 276 1_555 FA C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 300 E ASN 295 1_555 KA C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 306 E ASN 301 1_555 GA C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 336 E ASN 332 1_555 HA C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 343 E ASN 339 1_555 IA C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 390 E ASN 386 1_555 LA C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 451 E ASN 448 1_555 JA C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 100 D ASN 611 1_555 MA C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 126 D ASN 637 1_555 NA C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.538 ? covale ? covale32 F ND2 ASN 93 F ASN 88 1_555 OA C1 NAG . F NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale33 F ND2 ASN 138 F ASN 133 1_555 CB C1 NAG . F NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale34 F ND2 ASN 153 F ASN 148 1_555 QA C1 NAG . F NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 157 F ASN 152 1_555 PA C1 NAG . F NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 202 F ASN 197 1_555 RA C1 NAG . F NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? covale ? covale37 F ND2 ASN 239 F ASN 234 1_555 SA C1 NAG . F NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale38 F ND2 ASN 246 F ASN 241 1_555 TA C1 NAG . F NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale39 F ND2 ASN 267 F ASN 262 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale40 F ND2 ASN 281 F ASN 276 1_555 UA C1 NAG . F NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale41 F ND2 ASN 294 F ASN 289 1_555 VA C1 NAG . F NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale42 F ND2 ASN 300 F ASN 295 1_555 WA C1 NAG . F NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale43 F ND2 ASN 306 F ASN 301 1_555 DB C1 NAG . F NAG 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale44 F ND2 ASN 336 F ASN 332 1_555 XA C1 NAG . F NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale45 F ND2 ASN 359 F ASN 355 1_555 YA C1 NAG . F NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale46 F ND2 ASN 367 F ASN 363 1_555 ZA C1 NAG . F NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale47 F ND2 ASN 390 F ASN 386 1_555 AB C1 NAG . F NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale48 F ND2 ASN 451 F ASN 448 1_555 BB C1 NAG . F NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale49 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale50 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale51 J O4 NAG . I NAG 2 1_555 J C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale52 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale53 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale54 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale55 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale56 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8T2F _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 7 NAG A 1 601 508 NAG NAG . O 7 NAG A 1 602 511 NAG NAG . P 7 NAG A 1 603 514 NAG NAG . Q 7 NAG A 1 604 515 NAG NAG . R 7 NAG A 1 605 516 NAG NAG . S 7 NAG A 1 606 520 NAG NAG . T 7 NAG A 1 607 523 NAG NAG . U 7 NAG A 1 608 524 NAG NAG . V 7 NAG A 1 609 525 NAG NAG . W 7 NAG A 1 610 526 NAG NAG . X 7 NAG A 1 611 528 NAG NAG . Y 7 NAG A 1 612 529 NAG NAG . Z 7 NAG A 1 613 530 NAG NAG . AA 7 NAG B 1 701 665 NAG NAG . BA 7 NAG B 1 702 667 NAG NAG . CA 7 NAG C 1 701 666 NAG NAG . DA 7 NAG E 1 601 510 NAG NAG . EA 7 NAG E 1 602 512 NAG NAG . FA 7 NAG E 1 603 517 NAG NAG . GA 7 NAG E 1 604 518 NAG NAG . HA 7 NAG E 1 605 519 NAG NAG . IA 7 NAG E 1 606 520 NAG NAG . JA 7 NAG E 1 607 521 NAG NAG . KA 7 NAG E 1 608 522 NAG NAG . LA 7 NAG E 1 609 523 NAG NAG . MA 7 NAG D 1 701 665 NAG NAG . NA 7 NAG D 1 702 667 NAG NAG . OA 7 NAG F 1 601 508 NAG NAG . PA 7 NAG F 1 602 509 NAG NAG . QA 7 NAG F 1 603 510 NAG NAG . RA 7 NAG F 1 604 511 NAG NAG . SA 7 NAG F 1 605 512 NAG NAG . TA 7 NAG F 1 606 513 NAG NAG . UA 7 NAG F 1 607 517 NAG NAG . VA 7 NAG F 1 608 518 NAG NAG . WA 7 NAG F 1 609 519 NAG NAG . XA 7 NAG F 1 610 521 NAG NAG . YA 7 NAG F 1 611 523 NAG NAG . ZA 7 NAG F 1 612 524 NAG NAG . AB 7 NAG F 1 613 525 NAG NAG . BB 7 NAG F 1 614 526 NAG NAG . CB 7 NAG F 1 615 527 NAG NAG . DB 7 NAG F 1 616 528 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . KA 7 200.324 231.45 198.366 1 74.52 ? C1 NAG 608 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . KA 7 201.519 230.45 198.037 1 73.73 ? C2 NAG 608 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . KA 7 202.694 231.284 197.422 1 77.06 ? C3 NAG 608 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . KA 7 202.184 232.003 196.123 1 78.52 ? C4 NAG 608 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . KA 7 200.955 232.923 196.478 1 82.76 ? C5 NAG 608 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . KA 7 200.336 233.59 195.25 1 86.37 ? C6 NAG 608 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . KA 7 201.88 228.396 199.402 1 72.7 ? C7 NAG 608 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . KA 7 202.025 227.742 200.746 1 67.23 ? C8 NAG 608 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . KA 7 201.886 229.741 199.297 1 75.11 ? N2 NAG 608 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . KA 7 203.78 230.412 197.076 1 78.7 ? O3 NAG 608 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . KA 7 203.25 232.789 195.588 1 80.15 ? O4 NAG 608 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . KA 7 199.876 232.107 197.126 1 78.24 ? O5 NAG 608 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . KA 7 201.248 234.473 194.598 1 80.83 ? O6 NAG 608 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . KA 7 201.777 227.675 198.397 1 75.95 ? O7 NAG 608 E 1 HETATM 15 H H2 NAG . . . KA 7 201.276 229.773 197.386 1 73.73 ? H2 NAG 608 E 1 HETATM 16 H H3 NAG . . . KA 7 202.999 231.938 198.07 1 77.06 ? H3 NAG 608 E 1 HETATM 17 H H4 NAG . . . KA 7 201.902 231.348 195.466 1 78.52 ? H4 NAG 608 E 1 HETATM 18 H H5 NAG . . . KA 7 201.297 233.61 197.071 1 82.76 ? H5 NAG 608 E 1 HETATM 19 H H61 NAG . . . KA 7 199.545 234.084 195.517 1 86.37 ? H61 NAG 608 E 1 HETATM 20 H H62 NAG . . . KA 7 200.047 232.907 194.625 1 86.37 ? H62 NAG 608 E 1 HETATM 21 H H81 NAG . . . KA 7 202 226.778 200.641 1 67.23 ? H81 NAG 608 E 1 HETATM 22 H H82 NAG . . . KA 7 201.298 228.023 201.323 1 67.23 ? H82 NAG 608 E 1 HETATM 23 H H83 NAG . . . KA 7 202.871 228.002 201.143 1 67.23 ? H83 NAG 608 E 1 HETATM 24 H HN2 NAG . . . KA 7 202.11 230.208 199.983 1 75.11 ? HN2 NAG 608 E 1 HETATM 25 H HO3 NAG . . . KA 7 204.142 230.682 196.368 1 78.7 ? HO3 NAG 608 E 1 HETATM 26 H HO4 NAG . . . KA 7 202.943 233.511 195.288 1 80.15 ? HO4 NAG 608 E 1 HETATM 27 H HO6 NAG . . . KA 7 200.874 234.818 193.93 1 80.83 ? HO6 NAG 608 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 216 _model_server_stats.encode_time_ms 21 _model_server_stats.element_count 27 #