data_8T4D # _model_server_result.job_id LstlKvj8d5SxamKN6ZSQUQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 09:20:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8t4d # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"SA","auth_seq_id":604}' # _entry.id 8T4D # _exptl.entry_id 8T4D _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 42 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8T4D _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8T4D _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 BA N N ? 9 CA N N ? 9 DA N N ? 9 EA N N ? 9 FA N N ? 9 GA N N ? 9 HA N N ? 9 IA N N ? 9 JA N N ? 9 KA N N ? 9 LA N N ? 9 MA N N ? 9 NA N N ? 9 OA N N ? 9 PA N N ? 9 QA N N ? 9 RA N N ? 9 SA N N ? 9 TA N N ? 9 UA N N ? 9 VA N N ? 9 WA N N ? 9 XA N N ? 9 YA N N ? 9 ZA N N ? 9 AB N N ? 9 BB N N ? 9 CB N N ? 9 DB N N ? 9 EB N N ? 9 FB N N ? 9 GB N N ? 9 HB N N ? 9 IB N N ? 9 JB N N ? 9 KB N N ? 9 LB N N ? 9 MB N N ? 9 NB N N ? 9 OB N N ? 9 PB N N ? 9 QB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n S NAG 1 S 1 NAG A 509 NAG 7 n S NAG 2 S 2 NAG A 510 NAG 7 n T NAG 1 T 1 NAG A 513 NAG 7 n T NAG 2 T 2 NAG A 711 NAG 8 n U NAG 1 U 1 NAG A 517 NAG 8 n U NAG 2 U 2 NAG A 518 NAG 8 n U BMA 3 U 3 BMA A 519 BMA 7 n V NAG 1 V 1 NAG E 509 NAG 7 n V NAG 2 V 2 NAG E 510 NAG 7 n W NAG 1 W 1 NAG E 513 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG E 711 NAG 8 n X NAG 1 X 1 NAG E 517 NAG 8 n X NAG 2 X 2 NAG E 518 NAG 8 n X BMA 3 X 3 BMA E 519 BMA 7 n Y NAG 1 Y 1 NAG F 509 NAG 7 n Y NAG 2 Y 2 NAG F 510 NAG 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG F 513 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG F 711 NAG 8 n AA NAG 1 a 1 NAG F 517 NAG 8 n AA NAG 2 a 2 NAG F 518 NAG 8 n AA BMA 3 a 3 BMA F 519 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 24 A CYS 54 1_555 A SG CYS 44 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 89 A CYS 119 1_555 A SG CYS 175 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 96 A CYS 126 1_555 A SG CYS 166 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 101 A CYS 131 1_555 A SG CYS 119 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 188 A CYS 218 1_555 A SG CYS 217 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 198 A CYS 228 1_555 A SG CYS 209 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 266 A CYS 296 1_555 A SG CYS 300 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 347 A CYS 378 1_555 A SG CYS 413 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 354 A CYS 385 1_555 A SG CYS 386 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 469 A CYS 501 1_555 D SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 22 C CYS 22 1_555 B SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 20 D CYS 23 1_555 C SG CYS 88 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 87 B CYS 598 1_555 D SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 22 H CYS 22 1_555 E SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 103 H CYS 99 1_555 E SG CYS 108 H CYS 100 1_555 ? ? ? D ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 23 L CYS 23 1_555 F SG CYS 94 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf17 G SG CYS 24 E CYS 54 1_555 G SG CYS 44 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 89 E CYS 119 1_555 G SG CYS 175 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 96 E CYS 126 1_555 G SG CYS 166 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 101 E CYS 131 1_555 G SG CYS 119 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 188 E CYS 218 1_555 G SG CYS 217 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 198 E CYS 228 1_555 G SG CYS 209 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 266 E CYS 296 1_555 G SG CYS 300 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 347 E CYS 378 1_555 G SG CYS 413 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 354 E CYS 385 1_555 G SG CYS 386 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 469 E CYS 501 1_555 J SG CYS 94 G CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf27 H SG CYS 22 J CYS 22 1_555 H SG CYS 96 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 20 M CYS 23 1_555 I SG CYS 88 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf29 J SG CYS 87 G CYS 598 1_555 J SG CYS 93 G CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf30 K SG CYS 22 O CYS 22 1_555 K SG CYS 96 O CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 103 O CYS 99 1_555 K SG CYS 108 O CYS 100 1_555 ? ? ? D ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf32 L SG CYS 23 Q CYS 23 1_555 L SG CYS 94 Q CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf33 M SG CYS 24 F CYS 54 1_555 M SG CYS 44 F CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf34 M SG CYS 89 F CYS 119 1_555 M SG CYS 175 F CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf35 M SG CYS 96 F CYS 126 1_555 M SG CYS 166 F CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf36 M SG CYS 101 F CYS 131 1_555 M SG CYS 119 F CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 M SG CYS 188 F CYS 218 1_555 M SG CYS 217 F CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf38 M SG CYS 198 F CYS 228 1_555 M SG CYS 209 F CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 266 F CYS 296 1_555 M SG CYS 300 F CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 M SG CYS 347 F CYS 378 1_555 M SG CYS 413 F CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf41 M SG CYS 354 F CYS 385 1_555 M SG CYS 386 F CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 M SG CYS 469 F CYS 501 1_555 P SG CYS 94 I CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf43 N SG CYS 22 K CYS 22 1_555 N SG CYS 96 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf44 O SG CYS 20 N CYS 23 1_555 O SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf45 P SG CYS 87 I CYS 598 1_555 P SG CYS 93 I CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf46 Q SG CYS 22 P CYS 22 1_555 Q SG CYS 96 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf47 Q SG CYS 103 P CYS 99 1_555 Q SG CYS 108 P CYS 100 1_555 ? ? ? D ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf48 R SG CYS 23 R CYS 23 1_555 R SG CYS 94 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 88 1_555 CA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 118 A ASN 156 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 122 A ASN 160 1_555 DA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 167 A ASN 197 1_555 EA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 204 A ASN 234 1_555 FA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 211 A ASN 241 1_555 MA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 232 A ASN 262 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 246 A ASN 276 1_555 GA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 259 A ASN 289 1_555 LA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 265 A ASN 295 1_555 HA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 271 A ASN 301 1_555 BA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 301 A ASN 332 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 308 A ASN 339 1_555 IA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 324 A ASN 355 1_555 NA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 355 A ASN 386 1_555 JA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 416 A ASN 448 1_555 KA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 OA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale18 G ND2 ASN 58 E ASN 88 1_555 QA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 G ND2 ASN 118 E ASN 156 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale20 G ND2 ASN 122 E ASN 160 1_555 RA C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 G ND2 ASN 167 E ASN 197 1_555 SA C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale22 G ND2 ASN 204 E ASN 234 1_555 TA C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale23 G ND2 ASN 211 E ASN 241 1_555 AB C1 NAG . E NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale24 G ND2 ASN 232 E ASN 262 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 G ND2 ASN 246 E ASN 276 1_555 UA C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 G ND2 ASN 259 E ASN 289 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 265 E ASN 295 1_555 VA C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 G ND2 ASN 271 E ASN 301 1_555 PA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 G ND2 ASN 301 E ASN 332 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale30 G ND2 ASN 308 E ASN 339 1_555 WA C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 324 E ASN 355 1_555 BB C1 NAG . E NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 355 E ASN 386 1_555 XA C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 416 E ASN 448 1_555 YA C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale34 J ND2 ASN 100 G ASN 611 1_555 CB C1 NAG . G NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale35 M ND2 ASN 58 F ASN 88 1_555 EB C1 NAG . F NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale36 M ND2 ASN 118 F ASN 156 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale37 M ND2 ASN 122 F ASN 160 1_555 FB C1 NAG . F NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale38 M ND2 ASN 167 F ASN 197 1_555 GB C1 NAG . F NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale39 M ND2 ASN 204 F ASN 234 1_555 HB C1 NAG . F NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale40 M ND2 ASN 211 F ASN 241 1_555 OB C1 NAG . F NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale41 M ND2 ASN 232 F ASN 262 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 M ND2 ASN 246 F ASN 276 1_555 IB C1 NAG . F NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 M ND2 ASN 259 F ASN 289 1_555 NB C1 NAG . F NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale44 M ND2 ASN 265 F ASN 295 1_555 JB C1 NAG . F NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale45 M ND2 ASN 271 F ASN 301 1_555 DB C1 NAG . F NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 M ND2 ASN 301 F ASN 332 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale47 M ND2 ASN 308 F ASN 339 1_555 KB C1 NAG . F NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale48 M ND2 ASN 324 F ASN 355 1_555 PB C1 NAG . F NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale49 M ND2 ASN 355 F ASN 386 1_555 LB C1 NAG . F NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale50 M ND2 ASN 416 F ASN 448 1_555 MB C1 NAG . F NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale51 P ND2 ASN 100 I ASN 611 1_555 QB C1 NAG . I NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale52 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale53 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale54 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale56 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale57 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale58 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale59 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale60 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale61 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale63 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8T4D _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 9 NAG A 1 601 508 NAG NAG . CA 9 NAG A 1 602 512 NAG NAG . DA 9 NAG A 1 603 514 NAG NAG . EA 9 NAG A 1 604 515 NAG NAG . FA 9 NAG A 1 605 516 NAG NAG . GA 9 NAG A 1 606 521 NAG NAG . HA 9 NAG A 1 607 522 NAG NAG . IA 9 NAG A 1 608 523 NAG NAG . JA 9 NAG A 1 609 524 NAG NAG . KA 9 NAG A 1 610 525 NAG NAG . LA 9 NAG A 1 611 707 NAG NAG . MA 9 NAG A 1 612 708 NAG NAG . NA 9 NAG A 1 613 713 NAG NAG . OA 9 NAG B 1 701 765 NAG NAG . PA 9 NAG E 1 601 508 NAG NAG . QA 9 NAG E 1 602 512 NAG NAG . RA 9 NAG E 1 603 514 NAG NAG . SA 9 NAG E 1 604 515 NAG NAG . TA 9 NAG E 1 605 516 NAG NAG . UA 9 NAG E 1 606 521 NAG NAG . VA 9 NAG E 1 607 522 NAG NAG . WA 9 NAG E 1 608 523 NAG NAG . XA 9 NAG E 1 609 524 NAG NAG . YA 9 NAG E 1 610 525 NAG NAG . ZA 9 NAG E 1 611 707 NAG NAG . AB 9 NAG E 1 612 708 NAG NAG . BB 9 NAG E 1 613 713 NAG NAG . CB 9 NAG G 1 701 765 NAG NAG . DB 9 NAG F 1 601 508 NAG NAG . EB 9 NAG F 1 602 512 NAG NAG . FB 9 NAG F 1 603 514 NAG NAG . GB 9 NAG F 1 604 515 NAG NAG . HB 9 NAG F 1 605 516 NAG NAG . IB 9 NAG F 1 606 521 NAG NAG . JB 9 NAG F 1 607 522 NAG NAG . KB 9 NAG F 1 608 523 NAG NAG . LB 9 NAG F 1 609 524 NAG NAG . MB 9 NAG F 1 610 525 NAG NAG . NB 9 NAG F 1 611 707 NAG NAG . OB 9 NAG F 1 612 708 NAG NAG . PB 9 NAG F 1 613 713 NAG NAG . QB 9 NAG I 1 701 765 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . SA 9 231.357 210.718 172.519 1 46.12 ? C1 NAG 604 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . SA 9 232.472 211.748 172.634 1 43.25 ? C2 NAG 604 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . SA 9 233.787 211.039 172.901 1 48.25 ? C3 NAG 604 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . SA 9 233.661 210.21 174.169 1 53.14 ? C4 NAG 604 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . SA 9 232.507 209.222 174.003 1 51.92 ? C5 NAG 604 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . SA 9 232.246 208.397 175.239 1 52.51 ? C6 NAG 604 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . SA 9 232.998 213.82 171.429 1 43.49 ? C7 NAG 604 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . SA 9 233.017 214.506 170.098 1 45.82 ? C8 NAG 604 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . SA 9 232.559 212.558 171.43 1 40.57 ? N2 NAG 604 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . SA 9 234.824 212.002 173.043 1 47.82 ? O3 NAG 604 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . SA 9 234.866 209.492 174.403 1 52.11 ? O4 NAG 604 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . SA 9 231.296 209.943 173.723 1 46.63 ? O5 NAG 604 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . SA 9 230.94 207.836 175.211 1 50.74 ? O6 NAG 604 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . SA 9 233.365 214.382 172.455 1 49.65 ? O7 NAG 604 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 21 _model_server_stats.query_time_ms 280 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #