data_8TBR # _model_server_result.job_id mlP-EgzhJe4K_mbmaDIOnQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 02:41:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8tbr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":202}' # _entry.id 8TBR # _exptl.entry_id 8TBR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 408.45 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '3-(2-{3-[(2,4-diamino-6-phenylpyrimidin-5-yl)oxy]propoxy}phenyl)propanoic acid' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 91.16 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TBR _cell.length_a 28.606 _cell.length_b 66.332 _cell.length_c 43.973 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TBR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C22 H24 N4 O4' _chem_comp.formula_weight 408.45 _chem_comp.id HIJ _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '3-(2-{3-[(2,4-diamino-6-phenylpyrimidin-5-yl)oxy]propoxy}phenyl)propanoic acid' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C14 HIJ sing 129 n n N2 C14 HIJ doub 130 n y N2 C15 HIJ sing 131 n y C14 C13 HIJ sing 132 n y N3 C15 HIJ sing 133 n n C15 N4 HIJ doub 134 n y C12 O4 HIJ sing 135 n n C12 C11 HIJ sing 136 n n C13 O4 HIJ sing 137 n n C13 C16 HIJ doub 138 n y C11 C10 HIJ sing 139 n n N4 C16 HIJ sing 140 n y O1 C1 HIJ doub 141 n n C16 C17 HIJ sing 142 n n C1 O2 HIJ sing 143 n n C1 C2 HIJ sing 144 n n C10 O3 HIJ sing 145 n n O3 C9 HIJ sing 146 n n C17 C18 HIJ doub 147 n y C17 C22 HIJ sing 148 n y C3 C2 HIJ sing 149 n n C3 C4 HIJ sing 150 n n C18 C19 HIJ sing 151 n y C22 C21 HIJ doub 152 n y C9 C4 HIJ doub 153 n y C9 C8 HIJ sing 154 n y C4 C5 HIJ sing 155 n y C19 C20 HIJ doub 156 n y C8 C7 HIJ doub 157 n y C21 C20 HIJ sing 158 n y C5 C6 HIJ doub 159 n y C7 C6 HIJ sing 160 n y C10 H1 HIJ sing 161 n n C10 H2 HIJ sing 162 n n C11 H3 HIJ sing 163 n n C11 H4 HIJ sing 164 n n C12 H5 HIJ sing 165 n n C12 H6 HIJ sing 166 n n C18 H7 HIJ sing 167 n n C19 H8 HIJ sing 168 n n C2 H9 HIJ sing 169 n n C2 H10 HIJ sing 170 n n C20 H11 HIJ sing 171 n n C21 H12 HIJ sing 172 n n C22 H13 HIJ sing 173 n n C3 H14 HIJ sing 174 n n C3 H15 HIJ sing 175 n n C5 H16 HIJ sing 176 n n C6 H17 HIJ sing 177 n n C7 H18 HIJ sing 178 n n C8 H19 HIJ sing 179 n n N1 H20 HIJ sing 180 n n N1 H21 HIJ sing 181 n n N3 H22 HIJ sing 182 n n N3 H23 HIJ sing 183 n n O2 H24 HIJ sing 184 n n # _atom_sites.entry_id 8TBR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.034958 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00071 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015076 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.022746 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NAP A 1 201 202 NAP NAP . C 3 HIJ A 1 202 201 HIJ M58 . D 4 HOH A 1 301 25 HOH HOH . D 4 HOH A 2 302 75 HOH HOH . D 4 HOH A 3 303 71 HOH HOH . D 4 HOH A 4 304 84 HOH HOH . D 4 HOH A 5 305 134 HOH HOH . D 4 HOH A 6 306 45 HOH HOH . D 4 HOH A 7 307 14 HOH HOH . D 4 HOH A 8 308 54 HOH HOH . D 4 HOH A 9 309 39 HOH HOH . D 4 HOH A 10 310 63 HOH HOH . D 4 HOH A 11 311 77 HOH HOH . D 4 HOH A 12 312 96 HOH HOH . D 4 HOH A 13 313 62 HOH HOH . D 4 HOH A 14 314 119 HOH HOH . D 4 HOH A 15 315 61 HOH HOH . D 4 HOH A 16 316 82 HOH HOH . D 4 HOH A 17 317 106 HOH HOH . D 4 HOH A 18 318 23 HOH HOH . D 4 HOH A 19 319 161 HOH HOH . D 4 HOH A 20 320 42 HOH HOH . D 4 HOH A 21 321 48 HOH HOH . D 4 HOH A 22 322 109 HOH HOH . D 4 HOH A 23 323 93 HOH HOH . D 4 HOH A 24 324 15 HOH HOH . D 4 HOH A 25 325 122 HOH HOH . D 4 HOH A 26 326 100 HOH HOH . D 4 HOH A 27 327 52 HOH HOH . D 4 HOH A 28 328 1 HOH HOH . D 4 HOH A 29 329 49 HOH HOH . D 4 HOH A 30 330 16 HOH HOH . D 4 HOH A 31 331 38 HOH HOH . D 4 HOH A 32 332 89 HOH HOH . D 4 HOH A 33 333 20 HOH HOH . D 4 HOH A 34 334 139 HOH HOH . D 4 HOH A 35 335 46 HOH HOH . D 4 HOH A 36 336 44 HOH HOH . D 4 HOH A 37 337 121 HOH HOH . D 4 HOH A 38 338 103 HOH HOH . D 4 HOH A 39 339 68 HOH HOH . D 4 HOH A 40 340 22 HOH HOH . D 4 HOH A 41 341 65 HOH HOH . D 4 HOH A 42 342 95 HOH HOH . D 4 HOH A 43 343 3 HOH HOH . D 4 HOH A 44 344 12 HOH HOH . D 4 HOH A 45 345 11 HOH HOH . D 4 HOH A 46 346 70 HOH HOH . D 4 HOH A 47 347 4 HOH HOH . D 4 HOH A 48 348 19 HOH HOH . D 4 HOH A 49 349 10 HOH HOH . D 4 HOH A 50 350 123 HOH HOH . D 4 HOH A 51 351 33 HOH HOH . D 4 HOH A 52 352 17 HOH HOH . D 4 HOH A 53 353 125 HOH HOH . D 4 HOH A 54 354 80 HOH HOH . D 4 HOH A 55 355 53 HOH HOH . D 4 HOH A 56 356 99 HOH HOH . D 4 HOH A 57 357 55 HOH HOH . D 4 HOH A 58 358 32 HOH HOH . D 4 HOH A 59 359 114 HOH HOH . D 4 HOH A 60 360 31 HOH HOH . D 4 HOH A 61 361 138 HOH HOH . D 4 HOH A 62 362 37 HOH HOH . D 4 HOH A 63 363 116 HOH HOH . D 4 HOH A 64 364 142 HOH HOH . D 4 HOH A 65 365 18 HOH HOH . D 4 HOH A 66 366 78 HOH HOH . D 4 HOH A 67 367 30 HOH HOH . D 4 HOH A 68 368 26 HOH HOH . D 4 HOH A 69 369 159 HOH HOH . D 4 HOH A 70 370 24 HOH HOH . D 4 HOH A 71 371 67 HOH HOH . D 4 HOH A 72 372 104 HOH HOH . D 4 HOH A 73 373 90 HOH HOH . D 4 HOH A 74 374 92 HOH HOH . D 4 HOH A 75 375 8 HOH HOH . D 4 HOH A 76 376 60 HOH HOH . D 4 HOH A 77 377 56 HOH HOH . D 4 HOH A 78 378 87 HOH HOH . D 4 HOH A 79 379 2 HOH HOH . D 4 HOH A 80 380 21 HOH HOH . D 4 HOH A 81 381 156 HOH HOH . D 4 HOH A 82 382 51 HOH HOH . D 4 HOH A 83 383 5 HOH HOH . D 4 HOH A 84 384 36 HOH HOH . D 4 HOH A 85 385 94 HOH HOH . D 4 HOH A 86 386 117 HOH HOH . D 4 HOH A 87 387 73 HOH HOH . D 4 HOH A 88 388 131 HOH HOH . D 4 HOH A 89 389 72 HOH HOH . D 4 HOH A 90 390 102 HOH HOH . D 4 HOH A 91 391 113 HOH HOH . D 4 HOH A 92 392 85 HOH HOH . D 4 HOH A 93 393 155 HOH HOH . D 4 HOH A 94 394 64 HOH HOH . D 4 HOH A 95 395 35 HOH HOH . D 4 HOH A 96 396 126 HOH HOH . D 4 HOH A 97 397 47 HOH HOH . D 4 HOH A 98 398 79 HOH HOH . D 4 HOH A 99 399 43 HOH HOH . D 4 HOH A 100 400 162 HOH HOH . D 4 HOH A 101 401 6 HOH HOH . D 4 HOH A 102 402 13 HOH HOH . D 4 HOH A 103 403 58 HOH HOH . D 4 HOH A 104 404 150 HOH HOH . D 4 HOH A 105 405 66 HOH HOH . D 4 HOH A 106 406 128 HOH HOH . D 4 HOH A 107 407 149 HOH HOH . D 4 HOH A 108 408 59 HOH HOH . D 4 HOH A 109 409 110 HOH HOH . D 4 HOH A 110 410 88 HOH HOH . D 4 HOH A 111 411 118 HOH HOH . D 4 HOH A 112 412 83 HOH HOH . D 4 HOH A 113 413 9 HOH HOH . D 4 HOH A 114 414 145 HOH HOH . D 4 HOH A 115 415 29 HOH HOH . D 4 HOH A 116 416 57 HOH HOH . D 4 HOH A 117 417 7 HOH HOH . D 4 HOH A 118 418 127 HOH HOH . D 4 HOH A 119 419 151 HOH HOH . D 4 HOH A 120 420 76 HOH HOH . D 4 HOH A 121 421 141 HOH HOH . D 4 HOH A 122 422 40 HOH HOH . D 4 HOH A 123 423 74 HOH HOH . D 4 HOH A 124 424 34 HOH HOH . D 4 HOH A 125 425 91 HOH HOH . D 4 HOH A 126 426 164 HOH HOH . D 4 HOH A 127 427 107 HOH HOH . D 4 HOH A 128 428 111 HOH HOH . D 4 HOH A 129 429 112 HOH HOH . D 4 HOH A 130 430 140 HOH HOH . D 4 HOH A 131 431 135 HOH HOH . D 4 HOH A 132 432 101 HOH HOH . D 4 HOH A 133 433 108 HOH HOH . D 4 HOH A 134 434 98 HOH HOH . D 4 HOH A 135 435 160 HOH HOH . D 4 HOH A 136 436 115 HOH HOH . D 4 HOH A 137 437 166 HOH HOH . D 4 HOH A 138 438 124 HOH HOH . D 4 HOH A 139 439 97 HOH HOH . D 4 HOH A 140 440 146 HOH HOH . D 4 HOH A 141 441 28 HOH HOH . D 4 HOH A 142 442 144 HOH HOH . D 4 HOH A 143 443 165 HOH HOH . D 4 HOH A 144 444 27 HOH HOH . D 4 HOH A 145 445 163 HOH HOH . D 4 HOH A 146 446 152 HOH HOH . D 4 HOH A 147 447 41 HOH HOH . D 4 HOH A 148 448 81 HOH HOH . D 4 HOH A 149 449 69 HOH HOH . D 4 HOH A 150 450 129 HOH HOH . D 4 HOH A 151 451 158 HOH HOH . D 4 HOH A 152 452 86 HOH HOH . D 4 HOH A 153 453 136 HOH HOH . D 4 HOH A 154 454 154 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 HIJ . . . C 3 -7.551 -13.289 15.441 1 15.91 ? C1 HIJ 202 A 1 HETATM 2 C C10 HIJ . . . C 3 -1.057 -13.402 15.804 1 7.69 ? C10 HIJ 202 A 1 HETATM 3 C C11 HIJ . . . C 3 -0.83 -13.263 14.324 1 7.64 ? C11 HIJ 202 A 1 HETATM 4 C C12 HIJ . . . C 3 -1.351 -11.962 13.752 1 7.79 ? C12 HIJ 202 A 1 HETATM 5 C C13 HIJ . . . C 3 -0.733 -9.623 13.899 1 8.36 ? C13 HIJ 202 A 1 HETATM 6 C C14 HIJ . . . C 3 -0.408 -9.161 12.579 1 9.05 ? C14 HIJ 202 A 1 HETATM 7 C C15 HIJ . . . C 3 -1.141 -7.072 13.136 1 12.1 ? C15 HIJ 202 A 1 HETATM 8 C C16 HIJ . . . C 3 -1.249 -8.679 14.795 1 10.01 ? C16 HIJ 202 A 1 HETATM 9 C C17 HIJ . . . C 3 -1.611 -8.953 16.217 1 11.69 ? C17 HIJ 202 A 1 HETATM 10 C C18 HIJ . . . C 3 -2.609 -9.846 16.574 1 15.89 ? C18 HIJ 202 A 1 HETATM 11 C C19 HIJ . . . C 3 -2.929 -10.051 17.908 1 18.2 ? C19 HIJ 202 A 1 HETATM 12 C C2 HIJ . . . C 3 -6.645 -13.104 16.645 1 21.58 ? C2 HIJ 202 A 1 HETATM 13 C C20 HIJ . . . C 3 -2.265 -9.372 18.9 1 12.53 ? C20 HIJ 202 A 1 HETATM 14 C C21 HIJ . . . C 3 -1.28 -8.475 18.563 1 15.56 ? C21 HIJ 202 A 1 HETATM 15 C C22 HIJ . . . C 3 -0.959 -8.26 17.23 1 16.8 ? C22 HIJ 202 A 1 HETATM 16 C C3 HIJ . . . C 3 -5.213 -13.432 16.314 1 17.26 ? C3 HIJ 202 A 1 HETATM 17 C C4 HIJ . . . C 3 -4.295 -13.391 17.517 1 20.3 ? C4 HIJ 202 A 1 HETATM 18 C C5 HIJ . . . C 3 -4.785 -13.349 18.822 1 19.94 ? C5 HIJ 202 A 1 HETATM 19 C C6 HIJ . . . C 3 -3.935 -13.335 19.915 1 17.13 ? C6 HIJ 202 A 1 HETATM 20 C C7 HIJ . . . C 3 -2.574 -13.356 19.717 1 14.2 ? C7 HIJ 202 A 1 HETATM 21 C C8 HIJ . . . C 3 -2.049 -13.387 18.44 1 17.55 ? C8 HIJ 202 A 1 HETATM 22 C C9 HIJ . . . C 3 -2.904 -13.418 17.347 1 12.79 ? C9 HIJ 202 A 1 HETATM 23 N N1 HIJ . . . C 3 0.124 -9.99 11.643 1 7.99 ? N1 HIJ 202 A 1 HETATM 24 N N2 HIJ . . . C 3 -0.631 -7.901 12.217 1 7.38 ? N2 HIJ 202 A 1 HETATM 25 N N3 HIJ . . . C 3 -1.344 -5.805 12.752 1 8.67 ? N3 HIJ 202 A 1 HETATM 26 N N4 HIJ . . . C 3 -1.45 -7.408 14.41 1 7.9 ? N4 HIJ 202 A 1 HETATM 27 O O1 HIJ . . . C 3 -7.371 -12.557 14.436 1 12.91 ? O1 HIJ 202 A 1 HETATM 28 O O2 HIJ . . . C 3 -8.437 -14.15 15.524 1 15.82 -1 O2 HIJ 202 A 1 HETATM 29 O O3 HIJ . . . C 3 -2.475 -13.441 16.047 1 12.08 ? O3 HIJ 202 A 1 HETATM 30 O O4 HIJ . . . C 3 -0.482 -10.931 14.252 1 7.43 ? O4 HIJ 202 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 59 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 30 #