data_8TJR # _model_server_result.job_id IDsALB3sfRQ8amF6kHXOEg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-11 21:53:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8tjr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"SA","auth_seq_id":610}' # _entry.id 8TJR # _exptl.entry_id 8TJR _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 48 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TJR _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TJR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 T N N ? 7 U N N ? 7 V N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N ? 7 IB N N ? 7 JB N N ? 7 KB N N ? 7 LB N N ? 7 MB N N ? 7 NB N N ? 7 OB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 5 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 5 ? 5 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n K NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 5 n K NAG 2 P 2 NAG P 2 NAG 5 n K BMA 3 P 3 BMA P 3 BMA 5 n K MAN 4 P 4 MAN P 4 MAN 5 n K MAN 5 P 5 MAN P 5 MAN 5 n K MAN 6 P 6 MAN P 6 MAN 6 n L NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 6 n L NAG 2 Q 2 NAG Q 2 NAG 6 n M NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 6 n M NAG 2 R 2 NAG R 2 NAG 5 n N NAG 1 U 1 NAG U 1 NAG 5 n N NAG 2 U 2 NAG U 2 NAG 5 n N BMA 3 U 3 BMA U 3 BMA 5 n N MAN 4 U 4 MAN U 4 MAN 5 n N MAN 5 U 5 MAN U 5 MAN 5 n N MAN 6 U 6 MAN U 6 MAN 6 n O NAG 1 V 1 NAG V 1 NAG 6 n O NAG 2 V 2 NAG V 2 NAG 6 n P NAG 1 W 1 NAG W 1 NAG 6 n P NAG 2 W 2 NAG W 2 NAG 5 n Q NAG 1 X 1 NAG X 1 NAG 5 n Q NAG 2 X 2 NAG X 2 NAG 5 n Q BMA 3 X 3 BMA X 3 BMA 5 n Q MAN 4 X 4 MAN X 4 MAN 5 n Q MAN 5 X 5 MAN X 5 MAN 5 n Q MAN 6 X 6 MAN X 6 MAN 6 n R NAG 1 Y 1 NAG Y 1 NAG 6 n R NAG 2 Y 2 NAG Y 2 NAG 6 n S NAG 1 Z 1 NAG Z 1 NAG 6 n S NAG 2 Z 2 NAG Z 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 J CYS 22 1_555 A SG CYS 98 J CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 23 K CYS 23 1_555 B SG CYS 93 K CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 24 A CYS 54 1_555 C SG CYS 44 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 89 A CYS 119 1_555 C SG CYS 175 A CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 96 A CYS 126 1_555 C SG CYS 166 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 101 A CYS 131 1_555 C SG CYS 119 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 171 A CYS 210 1_555 C SG CYS 401 A CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 188 A CYS 227 1_555 C SG CYS 217 A CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 198 A CYS 237 1_555 C SG CYS 209 A CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 266 A CYS 305 1_555 C SG CYS 300 A CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 347 A CYS 387 1_555 C SG CYS 413 A CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 354 A CYS 394 1_555 C SG CYS 386 A CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 469 A CYS 510 1_555 D SG CYS 94 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 87 D CYS 598 1_555 D SG CYS 93 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 24 B CYS 54 1_555 E SG CYS 44 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 89 B CYS 119 1_555 E SG CYS 175 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 96 B CYS 126 1_555 E SG CYS 166 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 101 B CYS 131 1_555 E SG CYS 119 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 171 B CYS 210 1_555 E SG CYS 401 B CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 188 B CYS 227 1_555 E SG CYS 217 B CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 198 B CYS 237 1_555 E SG CYS 209 B CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 E SG CYS 266 B CYS 305 1_555 E SG CYS 300 B CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf23 E SG CYS 347 B CYS 387 1_555 E SG CYS 413 B CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 354 B CYS 394 1_555 E SG CYS 386 B CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 469 B CYS 510 1_555 F SG CYS 94 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 87 E CYS 598 1_555 F SG CYS 93 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 22 H CYS 22 1_555 G SG CYS 98 H CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf28 H SG CYS 23 L CYS 23 1_555 H SG CYS 93 L CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 24 C CYS 54 1_555 I SG CYS 44 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 89 C CYS 119 1_555 I SG CYS 175 C CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 96 C CYS 126 1_555 I SG CYS 166 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 101 C CYS 131 1_555 I SG CYS 119 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 171 C CYS 210 1_555 I SG CYS 401 C CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 I SG CYS 188 C CYS 227 1_555 I SG CYS 217 C CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf35 I SG CYS 198 C CYS 237 1_555 I SG CYS 209 C CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 I SG CYS 266 C CYS 305 1_555 I SG CYS 300 C CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 I SG CYS 347 C CYS 387 1_555 I SG CYS 413 C CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf38 I SG CYS 354 C CYS 394 1_555 I SG CYS 386 C CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 I SG CYS 469 C CYS 510 1_555 J SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf40 J SG CYS 87 F CYS 598 1_555 J SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 58 A ASN 88 1_555 FA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 118 A ASN 156 1_555 BA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 122 A ASN 160 1_555 CA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 204 A ASN 243 1_555 T C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 246 A ASN 285 1_555 U C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 265 A ASN 304 1_555 DA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 271 A ASN 310 1_555 EA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 308 A ASN 348 1_555 V C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 324 A ASN 364 1_555 W C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 332 A ASN 372 1_555 X C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 355 A ASN 395 1_555 Y C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 361 A ASN 401 1_555 Z C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 416 A ASN 457 1_555 AA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 D ND2 ASN 100 D ASN 611 1_555 GA C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale15 D ND2 ASN 107 D ASN 618 1_555 HA C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 126 D ASN 637 1_555 IA C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale17 E ND2 ASN 58 B ASN 88 1_555 VA C1 NAG . B NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 118 B ASN 156 1_555 RA C1 NAG . B NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 122 B ASN 160 1_555 SA C1 NAG . B NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 204 B ASN 243 1_555 JA C1 NAG . B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 E ND2 ASN 246 B ASN 285 1_555 KA C1 NAG . B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 265 B ASN 304 1_555 TA C1 NAG . B NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 271 B ASN 310 1_555 UA C1 NAG . B NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 308 B ASN 348 1_555 LA C1 NAG . B NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 324 B ASN 364 1_555 MA C1 NAG . B NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 332 B ASN 372 1_555 NA C1 NAG . B NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 355 B ASN 395 1_555 OA C1 NAG . B NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 361 B ASN 401 1_555 PA C1 NAG . B NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 416 B ASN 457 1_555 QA C1 NAG . B NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale30 F ND2 ASN 100 E ASN 611 1_555 WA C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale31 F ND2 ASN 107 E ASN 618 1_555 XA C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 F ND2 ASN 126 E ASN 637 1_555 YA C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 58 C ASN 88 1_555 LB C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 118 C ASN 156 1_555 HB C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 122 C ASN 160 1_555 IB C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 I ND2 ASN 204 C ASN 243 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale37 I ND2 ASN 246 C ASN 285 1_555 AB C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale38 I ND2 ASN 265 C ASN 304 1_555 JB C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale39 I ND2 ASN 271 C ASN 310 1_555 KB C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale40 I ND2 ASN 308 C ASN 348 1_555 BB C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale41 I ND2 ASN 324 C ASN 364 1_555 CB C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 I ND2 ASN 332 C ASN 372 1_555 DB C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 I ND2 ASN 355 C ASN 395 1_555 EB C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale44 I ND2 ASN 361 C ASN 401 1_555 FB C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale45 I ND2 ASN 416 C ASN 457 1_555 GB C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale46 J ND2 ASN 100 F ASN 611 1_555 MB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale47 J ND2 ASN 107 F ASN 618 1_555 NB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale48 J ND2 ASN 126 F ASN 637 1_555 OB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale49 K O4 NAG . P NAG 1 1_555 K C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale50 K O4 NAG . P NAG 2 1_555 K C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale51 K O3 BMA . P BMA 3 1_555 K C1 MAN . P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale52 K O6 BMA . P BMA 3 1_555 K C1 MAN . P MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale53 K O2 MAN . P MAN 4 1_555 K C1 MAN . P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale54 L O4 NAG . Q NAG 1 1_555 L C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale55 M O4 NAG . R NAG 1 1_555 M C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale56 N O4 NAG . U NAG 1 1_555 N C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale57 N O4 NAG . U NAG 2 1_555 N C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale58 N O3 BMA . U BMA 3 1_555 N C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale59 N O6 BMA . U BMA 3 1_555 N C1 MAN . U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale60 N O2 MAN . U MAN 4 1_555 N C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale61 O O4 NAG . V NAG 1 1_555 O C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale62 P O4 NAG . W NAG 1 1_555 P C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale63 Q O4 NAG . X NAG 1 1_555 Q C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale64 Q O4 NAG . X NAG 2 1_555 Q C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale65 Q O3 BMA . X BMA 3 1_555 Q C1 MAN . X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale66 Q O6 BMA . X BMA 3 1_555 Q C1 MAN . X MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale67 Q O2 MAN . X MAN 4 1_555 Q C1 MAN . X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale68 R O4 NAG . Y NAG 1 1_555 R C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 S O4 NAG . Z NAG 1 1_555 S C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8TJR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code T 7 NAG A 1 601 610 NAG NAG . U 7 NAG A 1 602 617 NAG NAG . V 7 NAG A 1 603 618 NAG NAG . W 7 NAG A 1 604 619 NAG NAG . X 7 NAG A 1 605 620 NAG NAG . Y 7 NAG A 1 606 621 NAG NAG . Z 7 NAG A 1 607 622 NAG NAG . AA 7 NAG A 1 608 623 NAG NAG . BA 7 NAG A 1 609 624 NAG NAG . CA 7 NAG A 1 610 625 NAG NAG . DA 7 NAG A 1 611 628 NAG NAG . EA 7 NAG A 1 612 629 NAG NAG . FA 7 NAG A 1 613 630 NAG NAG . GA 7 NAG D 1 701 701 NAG NAG . HA 7 NAG D 1 702 702 NAG NAG . IA 7 NAG D 1 703 703 NAG NAG . JA 7 NAG B 1 601 610 NAG NAG . KA 7 NAG B 1 602 617 NAG NAG . LA 7 NAG B 1 603 618 NAG NAG . MA 7 NAG B 1 604 619 NAG NAG . NA 7 NAG B 1 605 620 NAG NAG . OA 7 NAG B 1 606 621 NAG NAG . PA 7 NAG B 1 607 622 NAG NAG . QA 7 NAG B 1 608 623 NAG NAG . RA 7 NAG B 1 609 624 NAG NAG . SA 7 NAG B 1 610 625 NAG NAG . TA 7 NAG B 1 611 628 NAG NAG . UA 7 NAG B 1 612 629 NAG NAG . VA 7 NAG B 1 613 630 NAG NAG . WA 7 NAG E 1 701 701 NAG NAG . XA 7 NAG E 1 702 702 NAG NAG . YA 7 NAG E 1 703 703 NAG NAG . ZA 7 NAG C 1 601 610 NAG NAG . AB 7 NAG C 1 602 617 NAG NAG . BB 7 NAG C 1 603 618 NAG NAG . CB 7 NAG C 1 604 619 NAG NAG . DB 7 NAG C 1 605 620 NAG NAG . EB 7 NAG C 1 606 621 NAG NAG . FB 7 NAG C 1 607 622 NAG NAG . GB 7 NAG C 1 608 623 NAG NAG . HB 7 NAG C 1 609 624 NAG NAG . IB 7 NAG C 1 610 625 NAG NAG . JB 7 NAG C 1 611 628 NAG NAG . KB 7 NAG C 1 612 629 NAG NAG . LB 7 NAG C 1 613 630 NAG NAG . MB 7 NAG F 1 701 701 NAG NAG . NB 7 NAG F 1 702 702 NAG NAG . OB 7 NAG F 1 703 703 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . SA 7 199.576 131.846 144.568 1 102.49 ? C1 NAG 610 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . SA 7 199.007 130.473 144.204 1 114.41 ? C2 NAG 610 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . SA 7 200.1 129.584 143.613 1 126.31 ? C3 NAG 610 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . SA 7 200.795 130.287 142.454 1 133.69 ? C4 NAG 610 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . SA 7 201.301 131.654 142.9 1 129.42 ? C5 NAG 610 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . SA 7 201.909 132.457 141.773 1 132.89 ? C6 NAG 610 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . SA 7 197.113 129.495 145.441 1 118.82 ? C7 NAG 610 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . SA 7 196.272 129.81 144.238 1 127.73 ? C8 NAG 610 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . SA 7 198.406 129.835 145.365 1 115.92 ? N2 NAG 610 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . SA 7 199.525 128.362 143.165 1 129.98 ? O3 NAG 610 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . SA 7 201.893 129.505 141.999 1 147.54 ? O4 NAG 610 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . SA 7 200.209 132.428 143.418 1 118.14 ? O5 NAG 610 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . SA 7 201.235 133.695 141.596 1 135.13 ? O6 NAG 610 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . SA 7 196.643 128.957 146.438 1 108.7 ? O7 NAG 610 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 29 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 362 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #