data_8TJS # _model_server_result.job_id PZAHCMcR6uLLwu4LqbNfCQ _model_server_result.datetime_utc '2025-04-11 20:27:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8tjs # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MB","auth_seq_id":612}' # _entry.id 8TJS # _exptl.entry_id 8TJS _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 48 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TJS _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TJS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 V N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N ? 7 IB N N ? 7 JB N N ? 7 KB N N ? 7 LB N N ? 7 MB N N ? 7 NB N N ? 7 OB N N ? 7 PB N N ? 7 QB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 5 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 5 ? 5 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 A 1 NAG A 1 NAG 5 n M NAG 2 A 2 NAG A 2 NAG 5 n M BMA 3 A 3 BMA A 3 BMA 5 n M MAN 4 A 4 MAN A 4 MAN 5 n M MAN 5 A 5 MAN A 5 MAN 5 n M MAN 6 A 6 MAN A 6 MAN 6 n N NAG 1 C 1 NAG C 1 NAG 6 n N NAG 2 C 2 NAG C 2 NAG 6 n O NAG 1 D 1 NAG D 1 NAG 6 n O NAG 2 D 2 NAG D 2 NAG 5 n P NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 5 n P NAG 2 E 2 NAG E 2 NAG 5 n P BMA 3 E 3 BMA E 3 BMA 5 n P MAN 4 E 4 MAN E 4 MAN 5 n P MAN 5 E 5 MAN E 5 MAN 5 n P MAN 6 E 6 MAN E 6 MAN 6 n Q NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 6 n Q NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG 6 n R NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 6 n R NAG 2 L 2 NAG L 2 NAG 5 n S NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 5 n S NAG 2 F 2 NAG F 2 NAG 5 n S BMA 3 F 3 BMA F 3 BMA 5 n S MAN 4 F 4 MAN F 4 MAN 5 n S MAN 5 F 5 MAN F 5 MAN 5 n S MAN 6 F 6 MAN F 6 MAN 6 n T NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 6 n T NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 6 n U NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 6 n U NAG 2 M 2 NAG M 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 24 G CYS 54 1_555 A SG CYS 44 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 89 G CYS 119 1_555 A SG CYS 175 G CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 96 G CYS 126 1_555 A SG CYS 166 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 101 G CYS 131 1_555 A SG CYS 119 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 171 G CYS 210 1_555 A SG CYS 401 G CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 188 G CYS 227 1_555 A SG CYS 217 G CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 198 G CYS 237 1_555 A SG CYS 209 G CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 266 G CYS 305 1_555 A SG CYS 300 G CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 347 G CYS 387 1_555 A SG CYS 413 G CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 354 G CYS 394 1_555 A SG CYS 386 G CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 87 B CYS 598 1_555 B SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 24 N CYS 54 1_555 C SG CYS 44 N CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 89 N CYS 119 1_555 C SG CYS 175 N CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 96 N CYS 126 1_555 C SG CYS 166 N CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 101 N CYS 131 1_555 C SG CYS 119 N CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 171 N CYS 210 1_555 C SG CYS 401 N CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 188 N CYS 227 1_555 C SG CYS 217 N CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 198 N CYS 237 1_555 C SG CYS 209 N CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 266 N CYS 305 1_555 C SG CYS 300 N CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 347 N CYS 387 1_555 C SG CYS 413 N CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 354 N CYS 394 1_555 C SG CYS 386 N CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 469 N CYS 510 1_555 D SG CYS 94 H CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 87 H CYS 598 1_555 D SG CYS 93 H CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 24 O CYS 54 1_555 E SG CYS 44 O CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 89 O CYS 119 1_555 E SG CYS 175 O CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 E SG CYS 96 O CYS 126 1_555 E SG CYS 166 O CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 101 O CYS 131 1_555 E SG CYS 119 O CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 E SG CYS 171 O CYS 210 1_555 E SG CYS 401 O CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf29 E SG CYS 188 O CYS 227 1_555 E SG CYS 217 O CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf30 E SG CYS 198 O CYS 237 1_555 E SG CYS 209 O CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 266 O CYS 305 1_555 E SG CYS 300 O CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 347 O CYS 387 1_555 E SG CYS 413 O CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 E SG CYS 354 O CYS 394 1_555 E SG CYS 386 O CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 E SG CYS 469 O CYS 510 1_555 F SG CYS 94 I CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 F SG CYS 87 I CYS 598 1_555 F SG CYS 93 I CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf36 G SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 G SG CYS 96 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf37 H SG CYS 23 T CYS 23 1_555 H SG CYS 88 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf38 I SG CYS 22 P CYS 22 1_555 I SG CYS 96 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf39 J SG CYS 23 S CYS 23 1_555 J SG CYS 88 S CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 22 R CYS 22 1_555 K SG CYS 96 R CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 L SG CYS 23 U CYS 23 1_555 L SG CYS 88 U CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 G ASN 88 1_555 HA C1 NAG . G NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 118 G ASN 156 1_555 DA C1 NAG . G NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 122 G ASN 160 1_555 EA C1 NAG . G NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 204 G ASN 243 1_555 V C1 NAG . G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 246 G ASN 285 1_555 W C1 NAG . G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 265 G ASN 304 1_555 FA C1 NAG . G NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 271 G ASN 310 1_555 GA C1 NAG . G NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 308 G ASN 348 1_555 X C1 NAG . G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 324 G ASN 364 1_555 Y C1 NAG . G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 332 G ASN 372 1_555 Z C1 NAG . G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 355 G ASN 395 1_555 AA C1 NAG . G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 361 G ASN 401 1_555 BA C1 NAG . G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 416 G ASN 457 1_555 CA C1 NAG . G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 IA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 107 B ASN 618 1_555 JA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 KA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 58 N ASN 88 1_555 XA C1 NAG . N NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 118 N ASN 156 1_555 TA C1 NAG . N NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 122 N ASN 160 1_555 UA C1 NAG . N NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 204 N ASN 243 1_555 LA C1 NAG . N NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 246 N ASN 285 1_555 MA C1 NAG . N NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 265 N ASN 304 1_555 VA C1 NAG . N NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 271 N ASN 310 1_555 WA C1 NAG . N NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 308 N ASN 348 1_555 NA C1 NAG . N NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 324 N ASN 364 1_555 OA C1 NAG . N NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 332 N ASN 372 1_555 PA C1 NAG . N NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 355 N ASN 395 1_555 QA C1 NAG . N NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 361 N ASN 401 1_555 RA C1 NAG . N NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 416 N ASN 457 1_555 SA C1 NAG . N NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 100 H ASN 611 1_555 YA C1 NAG . H NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale31 D ND2 ASN 107 H ASN 618 1_555 ZA C1 NAG . H NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale32 D ND2 ASN 126 H ASN 637 1_555 AB C1 NAG . H NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 58 O ASN 88 1_555 NB C1 NAG . O NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 118 O ASN 156 1_555 JB C1 NAG . O NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 122 O ASN 160 1_555 KB C1 NAG . O NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 204 O ASN 243 1_555 BB C1 NAG . O NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 246 O ASN 285 1_555 CB C1 NAG . O NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 265 O ASN 304 1_555 LB C1 NAG . O NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale39 E ND2 ASN 271 O ASN 310 1_555 MB C1 NAG . O NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 E ND2 ASN 308 O ASN 348 1_555 DB C1 NAG . O NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale41 E ND2 ASN 324 O ASN 364 1_555 EB C1 NAG . O NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 E ND2 ASN 332 O ASN 372 1_555 FB C1 NAG . O NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 E ND2 ASN 355 O ASN 395 1_555 GB C1 NAG . O NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale44 E ND2 ASN 361 O ASN 401 1_555 HB C1 NAG . O NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale45 E ND2 ASN 416 O ASN 457 1_555 IB C1 NAG . O NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale46 F ND2 ASN 100 I ASN 611 1_555 OB C1 NAG . I NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale47 F ND2 ASN 107 I ASN 618 1_555 PB C1 NAG . I NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale48 F ND2 ASN 126 I ASN 637 1_555 QB C1 NAG . I NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale49 M O4 NAG . A NAG 1 1_555 M C1 NAG . A NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale50 M O4 NAG . A NAG 2 1_555 M C1 BMA . A BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale51 M O3 BMA . A BMA 3 1_555 M C1 MAN . A MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale52 M O6 BMA . A BMA 3 1_555 M C1 MAN . A MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale53 M O2 MAN . A MAN 4 1_555 M C1 MAN . A MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale54 N O4 NAG . C NAG 1 1_555 N C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 O O4 NAG . D NAG 1 1_555 O C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale56 P O4 NAG . E NAG 1 1_555 P C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale57 P O4 NAG . E NAG 2 1_555 P C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 P O3 BMA . E BMA 3 1_555 P C1 MAN . E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale59 P O6 BMA . E BMA 3 1_555 P C1 MAN . E MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale60 P O2 MAN . E MAN 4 1_555 P C1 MAN . E MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale61 Q O4 NAG . J NAG 1 1_555 Q C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale62 R O4 NAG . L NAG 1 1_555 R C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale63 S O4 NAG . F NAG 1 1_555 S C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale64 S O4 NAG . F NAG 2 1_555 S C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale65 S O3 BMA . F BMA 3 1_555 S C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale66 S O6 BMA . F BMA 3 1_555 S C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale67 S O2 MAN . F MAN 4 1_555 S C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale68 T O4 NAG . K NAG 1 1_555 T C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale69 U O4 NAG . M NAG 1 1_555 U C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8TJS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 7 NAG G 1 601 610 NAG NAG . W 7 NAG G 1 602 617 NAG NAG . X 7 NAG G 1 603 618 NAG NAG . Y 7 NAG G 1 604 619 NAG NAG . Z 7 NAG G 1 605 620 NAG NAG . AA 7 NAG G 1 606 621 NAG NAG . BA 7 NAG G 1 607 622 NAG NAG . CA 7 NAG G 1 608 623 NAG NAG . DA 7 NAG G 1 609 624 NAG NAG . EA 7 NAG G 1 610 625 NAG NAG . FA 7 NAG G 1 611 628 NAG NAG . GA 7 NAG G 1 612 629 NAG NAG . HA 7 NAG G 1 613 630 NAG NAG . IA 7 NAG B 1 701 701 NAG NAG . JA 7 NAG B 1 702 702 NAG NAG . KA 7 NAG B 1 703 703 NAG NAG . LA 7 NAG N 1 601 610 NAG NAG . MA 7 NAG N 1 602 617 NAG NAG . NA 7 NAG N 1 603 618 NAG NAG . OA 7 NAG N 1 604 619 NAG NAG . PA 7 NAG N 1 605 620 NAG NAG . QA 7 NAG N 1 606 621 NAG NAG . RA 7 NAG N 1 607 622 NAG NAG . SA 7 NAG N 1 608 623 NAG NAG . TA 7 NAG N 1 609 624 NAG NAG . UA 7 NAG N 1 610 625 NAG NAG . VA 7 NAG N 1 611 628 NAG NAG . WA 7 NAG N 1 612 629 NAG NAG . XA 7 NAG N 1 613 630 NAG NAG . YA 7 NAG H 1 701 701 NAG NAG . ZA 7 NAG H 1 702 702 NAG NAG . AB 7 NAG H 1 703 703 NAG NAG . BB 7 NAG O 1 601 610 NAG NAG . CB 7 NAG O 1 602 617 NAG NAG . DB 7 NAG O 1 603 618 NAG NAG . EB 7 NAG O 1 604 619 NAG NAG . FB 7 NAG O 1 605 620 NAG NAG . GB 7 NAG O 1 606 621 NAG NAG . HB 7 NAG O 1 607 622 NAG NAG . IB 7 NAG O 1 608 623 NAG NAG . JB 7 NAG O 1 609 624 NAG NAG . KB 7 NAG O 1 610 625 NAG NAG . LB 7 NAG O 1 611 628 NAG NAG . MB 7 NAG O 1 612 629 NAG NAG . NB 7 NAG O 1 613 630 NAG NAG . OB 7 NAG I 1 701 701 NAG NAG . PB 7 NAG I 1 702 702 NAG NAG . QB 7 NAG I 1 703 703 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MB 7 200.942 139.074 139.75 1 112.74 ? C1 NAG 612 O 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MB 7 201.508 139.344 138.352 1 120.24 ? C2 NAG 612 O 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MB 7 200.4 139.231 137.303 1 133.97 ? C3 NAG 612 O 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MB 7 199.675 137.895 137.419 1 138.62 ? C4 NAG 612 O 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MB 7 199.176 137.691 138.848 1 127.93 ? C5 NAG 612 O 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MB 7 198.543 136.337 139.071 1 126.42 ? C6 NAG 612 O 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MB 7 203.456 140.836 138.432 1 133.77 ? C7 NAG 612 O 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MB 7 203.935 142.253 138.34 1 141.35 ? C8 NAG 612 O 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MB 7 202.139 140.652 138.289 1 125.77 ? N2 NAG 612 O 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MB 7 200.957 139.372 136.001 1 140.6 ? O3 NAG 612 O 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MB 7 198.57 137.858 136.525 1 154.8 ? O4 NAG 612 O 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MB 7 200.277 137.791 139.766 1 125.55 ? O5 NAG 612 O 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MB 7 197.946 136.251 140.358 1 127.42 ? O6 NAG 612 O 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MB 7 204.225 139.901 138.629 1 137.53 ? O7 NAG 612 O 1 # _model_server_stats.io_time_ms 37 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 32 _model_server_stats.query_time_ms 293 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 14 #