data_8TNU # _model_server_result.job_id jRlk9YI7vaNerIreD0OZwA _model_server_result.datetime_utc '2025-08-21 04:22:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8tnu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DB","auth_seq_id":610}' # _entry.id 8TNU # _exptl.entry_id 8TNU _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 37 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TNU _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TNU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N ? 8 RB N N ? 8 SB N N ? 8 TB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 A 1 NAG Z 703 NAG 5 n M NAG 2 A 2 NAG Z 704 NAG 5 n N NAG 1 D 1 NAG G 624 NAG 5 n N NAG 2 D 2 NAG G 706 NAG 5 n O NAG 1 I 1 NAG G 635 NAG 5 n O NAG 2 I 2 NAG G 705 NAG 5 n P NAG 1 M 1 NAG G 636 NAG 5 n P NAG 2 M 2 NAG G 637 NAG 5 n Q NAG 1 N 1 NAG G 639 NAG 5 n Q NAG 2 N 2 NAG G 640 NAG 5 n R NAG 1 O 1 NAG G 641 NAG 5 n R NAG 2 O 2 NAG G 642 NAG 5 n S NAG 1 P 1 NAG G 643 NAG 5 n S NAG 2 P 2 NAG G 644 NAG 5 n T NAG 1 Q 1 NAG G 646 NAG 5 n T NAG 2 Q 2 NAG G 647 NAG 6 n U NAG 1 R 1 NAG G 700 NAG 6 n U NAG 2 R 2 NAG G 701 NAG 6 n U BMA 3 R 3 BMA G 702 BMA 6 n U MAN 4 R 4 MAN G 703 MAN 6 n U MAN 5 R 5 MAN G 704 MAN 5 n V NAG 1 S 1 NAG E 601 NAG 5 n V NAG 2 S 2 NAG E 708 NAG 5 n W NAG 1 T 1 NAG E 615 NAG 5 n W NAG 2 T 2 NAG E 707 NAG 5 n X NAG 1 U 1 NAG E 625 NAG 5 n X NAG 2 U 2 NAG E 626 NAG 5 n Y NAG 1 V 1 NAG E 627 NAG 5 n Y NAG 2 V 2 NAG E 628 NAG 6 n Z NAG 1 W 1 NAG E 700 NAG 6 n Z NAG 2 W 2 NAG E 701 NAG 6 n Z BMA 3 W 3 BMA E 702 BMA 6 n Z MAN 4 W 4 MAN E 703 MAN 6 n Z MAN 5 W 5 MAN E 704 MAN 7 n AA NAG 1 a 1 NAG F 632 NAG 7 n AA NAG 2 a 2 NAG F 652 NAG 7 n AA BMA 3 a 3 BMA F 653 BMA 5 n BA NAG 1 b 1 NAG F 633 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG F 634 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG F 638 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG F 639 NAG 7 n DA NAG 1 d 1 NAG F 640 NAG 7 n DA NAG 2 d 2 NAG F 641 NAG 7 n DA BMA 3 d 3 BMA F 642 BMA 5 n EA NAG 1 e 1 NAG F 643 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG F 644 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG F 645 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG F 646 NAG 7 n GA NAG 1 g 1 NAG F 648 NAG 7 n GA NAG 2 g 2 NAG F 649 NAG 7 n GA BMA 3 g 3 BMA F 650 BMA 5 n HA NAG 1 h 1 NAG X 703 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG X 704 NAG 7 n IA NAG 1 i 1 NAG Y 703 NAG 7 n IA NAG 2 i 2 NAG Y 704 NAG 7 n IA BMA 3 i 3 BMA Y 705 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 21 B CYS 22 1_555 A SG CYS 97 B CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 150 B CYS 151 1_555 A SG CYS 206 B CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 23 C CYS 23 1_555 B SG CYS 88 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 134 C CYS 134 1_555 B SG CYS 194 C CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 87 Z CYS 598 1_555 C SG CYS 93 Z CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 94 Z CYS 605 1_555 H SG CYS 469 G CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.824 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 21 J CYS 22 1_555 D SG CYS 97 J CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 150 J CYS 151 1_555 D SG CYS 206 J CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 23 K CYS 23 1_555 E SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf10 E SG CYS 134 K CYS 134 1_555 E SG CYS 194 K CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf11 F SG CYS 21 H CYS 22 1_555 F SG CYS 97 H CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf12 F SG CYS 150 H CYS 151 1_555 F SG CYS 206 H CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 23 L CYS 23 1_555 G SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 134 L CYS 134 1_555 G SG CYS 194 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf15 H SG CYS 24 G CYS 54 1_555 H SG CYS 44 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 H SG CYS 89 G CYS 119 1_555 H SG CYS 175 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf17 H SG CYS 96 G CYS 126 1_555 H SG CYS 166 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.87 ? disulf ? disulf18 H SG CYS 101 G CYS 131 1_555 H SG CYS 119 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 H SG CYS 171 G CYS 201 1_555 H SG CYS 401 G CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf20 H SG CYS 188 G CYS 218 1_555 H SG CYS 217 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 H SG CYS 198 G CYS 228 1_555 H SG CYS 209 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf22 H SG CYS 266 G CYS 296 1_555 H SG CYS 300 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 H SG CYS 347 G CYS 378 1_555 H SG CYS 413 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 354 G CYS 385 1_555 H SG CYS 386 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 24 E CYS 54 1_555 I SG CYS 44 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 89 E CYS 119 1_555 I SG CYS 175 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 96 E CYS 126 1_555 I SG CYS 166 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 101 E CYS 131 1_555 I SG CYS 119 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 171 E CYS 201 1_555 I SG CYS 401 E CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 188 E CYS 218 1_555 I SG CYS 217 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 198 E CYS 228 1_555 I SG CYS 209 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 266 E CYS 296 1_555 I SG CYS 300 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 347 E CYS 378 1_555 I SG CYS 413 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf34 I SG CYS 354 E CYS 385 1_555 I SG CYS 386 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 I SG CYS 469 E CYS 501 1_555 L SG CYS 94 Y CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 24 F CYS 54 1_555 J SG CYS 44 F CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf37 J SG CYS 89 F CYS 119 1_555 J SG CYS 175 F CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf38 J SG CYS 96 F CYS 126 1_555 J SG CYS 166 F CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 J SG CYS 101 F CYS 131 1_555 J SG CYS 119 F CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf40 J SG CYS 171 F CYS 201 1_555 J SG CYS 401 F CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf41 J SG CYS 188 F CYS 218 1_555 J SG CYS 217 F CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 J SG CYS 198 F CYS 228 1_555 J SG CYS 209 F CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf43 J SG CYS 266 F CYS 296 1_555 J SG CYS 300 F CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf44 J SG CYS 347 F CYS 378 1_555 J SG CYS 413 F CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf45 J SG CYS 354 F CYS 385 1_555 J SG CYS 386 F CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf46 J SG CYS 469 F CYS 501 1_555 K SG CYS 94 X CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf47 K SG CYS 87 X CYS 598 1_555 K SG CYS 93 X CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf48 L SG CYS 87 Y CYS 598 1_555 L SG CYS 93 Y CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 100 Z ASN 611 1_555 KA C1 NAG . Z NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 107 Z ASN 618 1_555 JA C1 NAG . Z NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 126 Z ASN 637 1_555 M C1 NAG . A NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale4 H ND2 ASN 58 G ASN 88 1_555 O C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale5 H ND2 ASN 103 G ASN 133 1_555 LA C1 NAG . G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 H ND2 ASN 118 G ASN 156 1_555 P C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 H ND2 ASN 122 G ASN 160 1_555 Q C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale8 H ND2 ASN 167 G ASN 197 1_555 SA C1 NAG . G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 H ND2 ASN 204 G ASN 234 1_555 S C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 H ND2 ASN 246 G ASN 276 1_555 N C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 H ND2 ASN 265 G ASN 295 1_555 R C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale12 H ND2 ASN 271 G ASN 301 1_555 MA C1 NAG . G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 H ND2 ASN 301 G ASN 332 1_555 NA C1 NAG . G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 H ND2 ASN 308 G ASN 339 1_555 OA C1 NAG . G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 H ND2 ASN 324 G ASN 355 1_555 PA C1 NAG . G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 H ND2 ASN 332 G ASN 363 1_555 QA C1 NAG . G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 H ND2 ASN 355 G ASN 386 1_555 TA C1 NAG . G NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale18 H ND2 ASN 361 G ASN 392 1_555 RA C1 NAG . G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale19 H ND2 ASN 416 G ASN 448 1_555 T C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale20 I ND2 ASN 58 E ASN 88 1_555 V C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale21 I ND2 ASN 103 E ASN 133 1_555 UA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale22 I ND2 ASN 118 E ASN 156 1_555 X C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale23 I ND2 ASN 122 E ASN 160 1_555 Y C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale24 I ND2 ASN 167 E ASN 197 1_555 VA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 I ND2 ASN 204 E ASN 234 1_555 WA C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale26 I ND2 ASN 232 E ASN 262 1_555 Z C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 I ND2 ASN 246 E ASN 276 1_555 W C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 I ND2 ASN 265 E ASN 295 1_555 XA C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 I ND2 ASN 271 E ASN 301 1_555 YA C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale30 I ND2 ASN 301 E ASN 332 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 I ND2 ASN 308 E ASN 339 1_555 AB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 I ND2 ASN 324 E ASN 355 1_555 BB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 332 E ASN 363 1_555 CB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 355 E ASN 386 1_555 DB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 361 E ASN 392 1_555 EB C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 I ND2 ASN 416 E ASN 448 1_555 FB C1 NAG . E NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale37 J ND2 ASN 58 F ASN 88 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale38 J ND2 ASN 103 F ASN 133 1_555 GB C1 NAG . F NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale39 J ND2 ASN 118 F ASN 156 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale40 J ND2 ASN 122 F ASN 160 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale41 J ND2 ASN 167 F ASN 197 1_555 HB C1 NAG . F NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 J ND2 ASN 204 F ASN 234 1_555 PB C1 NAG . F NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale43 J ND2 ASN 232 F ASN 262 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 J ND2 ASN 246 F ASN 276 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale45 J ND2 ASN 265 F ASN 295 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale46 J ND2 ASN 271 F ASN 301 1_555 IB C1 NAG . F NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale47 J ND2 ASN 301 F ASN 332 1_555 JB C1 NAG . F NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 J ND2 ASN 308 F ASN 339 1_555 KB C1 NAG . F NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale49 J ND2 ASN 324 F ASN 355 1_555 LB C1 NAG . F NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale50 J ND2 ASN 332 F ASN 363 1_555 MB C1 NAG . F NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale51 J ND2 ASN 355 F ASN 386 1_555 NB C1 NAG . F NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale52 J ND2 ASN 361 F ASN 392 1_555 OB C1 NAG . F NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale53 J ND2 ASN 416 F ASN 448 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale54 K ND2 ASN 100 X ASN 611 1_555 QB C1 NAG . X NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale55 K ND2 ASN 107 X ASN 618 1_555 RB C1 NAG . X NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale56 K ND2 ASN 126 X ASN 637 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale57 L ND2 ASN 100 Y ASN 611 1_555 TB C1 NAG . Y NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale58 L ND2 ASN 107 Y ASN 618 1_555 SB C1 NAG . Y NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale59 L ND2 ASN 126 Y ASN 637 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale60 M O4 NAG . A NAG 1 1_555 M C1 NAG . A NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale61 N O4 NAG . D NAG 1 1_555 N C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale62 O O4 NAG . I NAG 1 1_555 O C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale63 P O4 NAG . M NAG 1 1_555 P C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale64 Q O4 NAG . N NAG 1 1_555 Q C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale65 R O4 NAG . O NAG 1 1_555 R C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale66 S O4 NAG . P NAG 1 1_555 S C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale67 T O4 NAG . Q NAG 1 1_555 T C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale68 U O4 NAG . R NAG 1 1_555 U C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale69 U O4 NAG . R NAG 2 1_555 U C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale70 U O3 BMA . R BMA 3 1_555 U C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale71 U O6 BMA . R BMA 3 1_555 U C1 MAN . R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale72 V O4 NAG . S NAG 1 1_555 V C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale73 W O4 NAG . T NAG 1 1_555 W C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale74 X O4 NAG . U NAG 1 1_555 X C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale75 Y O4 NAG . V NAG 1 1_555 Y C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale76 Z O4 NAG . W NAG 1 1_555 Z C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale77 Z O4 NAG . W NAG 2 1_555 Z C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale78 Z O3 BMA . W BMA 3 1_555 Z C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale79 Z O6 BMA . W BMA 3 1_555 Z C1 MAN . W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale80 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale81 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale82 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale83 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale84 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale85 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale86 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale87 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale88 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale89 GA O4 NAG . g NAG 2 1_555 GA C1 BMA . g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale90 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale91 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale92 IA O4 NAG . i NAG 2 1_555 IA C1 BMA . i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8TNU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code JA 8 NAG Z 1 701 705 NAG NAG . KA 8 NAG Z 1 702 706 NAG NAG . LA 8 NAG G 1 601 603 NAG NAG . MA 8 NAG G 1 602 627 NAG NAG . NA 8 NAG G 1 603 628 NAG NAG . OA 8 NAG G 1 604 629 NAG NAG . PA 8 NAG G 1 605 630 NAG NAG . QA 8 NAG G 1 606 631 NAG NAG . RA 8 NAG G 1 607 634 NAG NAG . SA 8 NAG G 1 608 638 NAG NAG . TA 8 NAG G 1 609 645 NAG NAG . UA 8 NAG E 1 601 602 NAG NAG . VA 8 NAG E 1 602 608 NAG NAG . WA 8 NAG E 1 603 609 NAG NAG . XA 8 NAG E 1 604 616 NAG NAG . YA 8 NAG E 1 605 617 NAG NAG . ZA 8 NAG E 1 606 618 NAG NAG . AB 8 NAG E 1 607 619 NAG NAG . BB 8 NAG E 1 608 620 NAG NAG . CB 8 NAG E 1 609 621 NAG NAG . DB 8 NAG E 1 610 622 NAG NAG . EB 8 NAG E 1 611 623 NAG NAG . FB 8 NAG E 1 612 624 NAG NAG . GB 8 NAG F 1 601 602 NAG NAG . HB 8 NAG F 1 602 616 NAG NAG . IB 8 NAG F 1 603 625 NAG NAG . JB 8 NAG F 1 604 626 NAG NAG . KB 8 NAG F 1 605 627 NAG NAG . LB 8 NAG F 1 606 628 NAG NAG . MB 8 NAG F 1 607 629 NAG NAG . NB 8 NAG F 1 608 630 NAG NAG . OB 8 NAG F 1 609 631 NAG NAG . PB 8 NAG F 1 610 651 NAG NAG . QB 8 NAG X 1 701 701 NAG NAG . RB 8 NAG X 1 702 705 NAG NAG . SB 8 NAG Y 1 701 707 NAG NAG . TB 8 NAG Y 1 702 708 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . DB 8 125.106 184.199 135.355 1 123.64 ? C1 NAG 610 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . DB 8 126.363 184.979 134.931 1 123.64 ? C2 NAG 610 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . DB 8 125.987 186.393 134.484 1 123.64 ? C3 NAG 610 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . DB 8 124.905 186.355 133.414 1 123.64 ? C4 NAG 610 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . DB 8 123.704 185.564 133.92 1 123.64 ? C5 NAG 610 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . DB 8 122.622 185.4 132.878 1 123.64 ? C6 NAG 610 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . DB 8 128.655 184.975 135.814 1 123.64 ? C7 NAG 610 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . DB 8 129.506 185.045 137.046 1 123.64 ? C8 NAG 610 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . DB 8 127.334 185.032 136.012 1 123.64 ? N2 NAG 610 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . DB 8 127.142 187.058 133.983 1 123.64 ? O3 NAG 610 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . DB 8 124.493 187.678 133.088 1 123.64 ? O4 NAG 610 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . DB 8 124.123 184.243 134.294 1 123.64 ? O5 NAG 610 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . DB 8 122.193 186.657 132.372 1 123.64 ? O6 NAG 610 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . DB 8 129.141 184.871 134.693 1 123.64 ? O7 NAG 610 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 39 _model_server_stats.query_time_ms 249 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #