data_8TO9 # _model_server_result.job_id DY7vwG2tboAMEeffetJO3A _model_server_result.datetime_utc '2025-08-21 03:03:16' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8to9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QA","auth_seq_id":613}' # _entry.id 8TO9 # _exptl.entry_id 8TO9 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 42 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TO9 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TO9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N ? 7 IB N N ? 7 JB N N ? 7 KB N N ? 7 LB N N ? 7 MB N N ? 7 NB N N ? 7 OB N N ? 7 PB N N ? 7 QB N N ? 7 RB N N ? 7 SB N N ? 7 TB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 K 1 NAG A 507 NAG 5 n M NAG 2 K 2 NAG A 508 NAG 6 n N NAG 1 M 1 NAG A 509 NAG 6 n N NAG 2 M 2 NAG A 510 NAG 6 n N BMA 3 M 3 BMA A 511 BMA 5 n O NAG 1 N 1 NAG A 512 NAG 5 n O NAG 2 N 2 NAG A 513 NAG 5 n P NAG 1 O 1 NAG A 514 NAG 5 n P NAG 2 O 2 NAG A 515 NAG 5 n Q NAG 1 P 1 NAG A 520 NAG 5 n Q NAG 2 P 2 NAG A 521 NAG 5 n R NAG 1 Q 1 NAG A 525 NAG 5 n R NAG 2 Q 2 NAG A 526 NAG 5 n S NAG 1 R 1 NAG B 507 NAG 5 n S NAG 2 R 2 NAG B 508 NAG 6 n T NAG 1 S 1 NAG B 509 NAG 6 n T NAG 2 S 2 NAG B 510 NAG 6 n T BMA 3 S 3 BMA B 511 BMA 5 n U NAG 1 T 1 NAG B 512 NAG 5 n U NAG 2 T 2 NAG B 513 NAG 5 n V NAG 1 U 1 NAG B 514 NAG 5 n V NAG 2 U 2 NAG B 515 NAG 5 n W NAG 1 V 1 NAG B 520 NAG 5 n W NAG 2 V 2 NAG B 521 NAG 5 n X NAG 1 W 1 NAG B 525 NAG 5 n X NAG 2 W 2 NAG B 526 NAG 5 n Y NAG 1 X 1 NAG C 507 NAG 5 n Y NAG 2 X 2 NAG C 508 NAG 6 n Z NAG 1 Y 1 NAG C 509 NAG 6 n Z NAG 2 Y 2 NAG C 510 NAG 6 n Z BMA 3 Y 3 BMA C 511 BMA 5 n AA NAG 1 a 1 NAG C 512 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG C 513 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG C 514 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG C 515 NAG 6 n CA NAG 1 c 1 NAG C 520 NAG 6 n CA NAG 2 c 2 NAG C 521 NAG 6 n CA BMA 3 c 3 BMA C 522 BMA 5 n DA NAG 1 d 1 NAG C 525 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG C 526 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 54 1_555 A SG CYS 42 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 87 A CYS 119 1_555 A SG CYS 167 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 94 A CYS 126 1_555 A SG CYS 158 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 99 A CYS 131 1_555 A SG CYS 119 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 180 A CYS 218 1_555 A SG CYS 209 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 190 A CYS 228 1_555 A SG CYS 201 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 258 A CYS 296 1_555 A SG CYS 292 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 338 A CYS 378 1_555 A SG CYS 395 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 345 A CYS 385 1_555 A SG CYS 368 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 451 A CYS 501 1_555 I SG CYS 94 I CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 22 B CYS 54 1_555 B SG CYS 42 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 87 B CYS 119 1_555 B SG CYS 167 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 94 B CYS 126 1_555 B SG CYS 158 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 99 B CYS 131 1_555 B SG CYS 119 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 180 B CYS 218 1_555 B SG CYS 209 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 190 B CYS 228 1_555 B SG CYS 201 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 258 B CYS 296 1_555 B SG CYS 292 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 338 B CYS 378 1_555 B SG CYS 395 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 345 B CYS 385 1_555 B SG CYS 368 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 451 B CYS 501 1_555 J SG CYS 94 J CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 22 C CYS 54 1_555 C SG CYS 42 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 87 C CYS 119 1_555 C SG CYS 167 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 94 C CYS 126 1_555 C SG CYS 158 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 99 C CYS 131 1_555 C SG CYS 119 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 180 C CYS 218 1_555 C SG CYS 209 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 190 C CYS 228 1_555 C SG CYS 201 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 258 C CYS 296 1_555 C SG CYS 292 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 338 C CYS 378 1_555 C SG CYS 395 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 345 C CYS 385 1_555 C SG CYS 368 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 451 C CYS 501 1_555 L SG CYS 94 Z CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 98 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 98 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 F SG CYS 23 F CYS 23 1_555 F SG CYS 88 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf34 G SG CYS 23 G CYS 23 1_555 G SG CYS 88 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf35 H SG CYS 22 H CYS 22 1_555 H SG CYS 98 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 I SG CYS 87 I CYS 598 1_555 I SG CYS 93 I CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 J SG CYS 87 J CYS 598 1_555 J SG CYS 93 J CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 23 L CYS 23 1_555 K SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf39 L SG CYS 87 Z CYS 598 1_555 L SG CYS 93 Z CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 56 A ASN 88 1_555 KA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 98 A ASN 130 1_555 MA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 118 A ASN 156 1_555 PA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 122 A ASN 160 1_555 EA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 159 A ASN 197 1_555 FA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 192 A ASN 230 1_555 M C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 196 A ASN 234 1_555 N C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 203 A ASN 241 1_555 O C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 224 A ASN 262 1_555 P C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 238 A ASN 276 1_555 GA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 257 A ASN 295 1_555 HA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 263 A ASN 301 1_555 LA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 300 A ASN 339 1_555 OA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 316 A ASN 356 1_555 QA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 346 A ASN 386 1_555 R C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 352 A ASN 392 1_555 NA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 392 A ASN 442 1_555 IA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 398 A ASN 448 1_555 JA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 56 B ASN 88 1_555 XA C1 NAG . B NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 98 B ASN 130 1_555 AB C1 NAG . B NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 118 B ASN 156 1_555 CB C1 NAG . B NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 122 B ASN 160 1_555 RA C1 NAG . B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 159 B ASN 197 1_555 SA C1 NAG . B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 192 B ASN 230 1_555 S C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 196 B ASN 234 1_555 T C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 203 B ASN 241 1_555 U C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 224 B ASN 262 1_555 V C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 238 B ASN 276 1_555 TA C1 NAG . B NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 257 B ASN 295 1_555 UA C1 NAG . B NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 263 B ASN 301 1_555 BB C1 NAG . B NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 293 B ASN 332 1_555 W C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 300 B ASN 339 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 B ND2 ASN 316 B ASN 356 1_555 DB C1 NAG . B NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale34 B ND2 ASN 346 B ASN 386 1_555 X C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 B ND2 ASN 352 B ASN 392 1_555 VA C1 NAG . B NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 B ND2 ASN 392 B ASN 442 1_555 YA C1 NAG . B NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale37 B ND2 ASN 398 B ASN 448 1_555 WA C1 NAG . B NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 56 C ASN 88 1_555 LB C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 98 C ASN 130 1_555 OB C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 118 C ASN 156 1_555 PB C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 122 C ASN 160 1_555 EB C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 159 C ASN 197 1_555 FB C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 192 C ASN 230 1_555 Y C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 196 C ASN 234 1_555 Z C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 203 C ASN 241 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 224 C ASN 262 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 238 C ASN 276 1_555 GB C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 257 C ASN 295 1_555 HB C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale49 C ND2 ASN 263 C ASN 301 1_555 NB C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale50 C ND2 ASN 300 C ASN 339 1_555 MB C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale51 C ND2 ASN 316 C ASN 356 1_555 QB C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale52 C ND2 ASN 346 C ASN 386 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale53 C ND2 ASN 352 C ASN 392 1_555 JB C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale54 C ND2 ASN 392 C ASN 442 1_555 IB C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 C ND2 ASN 398 C ASN 448 1_555 KB C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale56 I ND2 ASN 126 I ASN 637 1_555 RB C1 NAG . I NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale57 J ND2 ASN 126 J ASN 637 1_555 SB C1 NAG . J NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale58 L ND2 ASN 126 Z ASN 637 1_555 TB C1 NAG . Z NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale59 M O4 NAG . K NAG 1 1_555 M C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale60 N O4 NAG . M NAG 1 1_555 N C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale61 N O4 NAG . M NAG 2 1_555 N C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale62 O O4 NAG . N NAG 1 1_555 O C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 P O4 NAG . O NAG 1 1_555 P C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale64 Q O4 NAG . P NAG 1 1_555 Q C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale65 R O4 NAG . Q NAG 1 1_555 R C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 S O4 NAG . R NAG 1 1_555 S C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale67 T O4 NAG . S NAG 1 1_555 T C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale68 T O4 NAG . S NAG 2 1_555 T C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale69 U O4 NAG . T NAG 1 1_555 U C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale70 V O4 NAG . U NAG 1 1_555 V C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale71 W O4 NAG . V NAG 1 1_555 W C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale72 X O4 NAG . W NAG 1 1_555 X C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 Y O4 NAG . X NAG 1 1_555 Y C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale74 Z O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale75 Z O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale76 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale77 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale78 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale79 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale80 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8TO9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code EA 7 NAG A 1 601 505 NAG NAG . FA 7 NAG A 1 602 506 NAG NAG . GA 7 NAG A 1 603 516 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 604 517 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 605 519 NAG NAG . JA 7 NAG A 1 606 528 NAG NAG . KA 7 NAG A 1 607 533 NAG NAG . LA 7 NAG A 1 608 534 NAG NAG . MA 7 NAG A 1 609 535 NAG NAG . NA 7 NAG A 1 610 537 NAG NAG . OA 7 NAG A 1 611 538 NAG NAG . PA 7 NAG A 1 612 539 NAG NAG . QA 7 NAG A 1 613 540 NAG NAG . RA 7 NAG B 1 601 505 NAG NAG . SA 7 NAG B 1 602 506 NAG NAG . TA 7 NAG B 1 603 516 NAG NAG . UA 7 NAG B 1 604 517 NAG NAG . VA 7 NAG B 1 605 527 NAG NAG . WA 7 NAG B 1 606 528 NAG NAG . XA 7 NAG B 1 607 529 NAG NAG . YA 7 NAG B 1 608 532 NAG NAG . ZA 7 NAG B 1 609 533 NAG NAG . AB 7 NAG B 1 610 534 NAG NAG . BB 7 NAG B 1 611 535 NAG NAG . CB 7 NAG B 1 612 536 NAG NAG . DB 7 NAG B 1 613 537 NAG NAG . EB 7 NAG C 1 601 505 NAG NAG . FB 7 NAG C 1 602 506 NAG NAG . GB 7 NAG C 1 603 516 NAG NAG . HB 7 NAG C 1 604 517 NAG NAG . IB 7 NAG C 1 605 519 NAG NAG . JB 7 NAG C 1 606 527 NAG NAG . KB 7 NAG C 1 607 528 NAG NAG . LB 7 NAG C 1 608 530 NAG NAG . MB 7 NAG C 1 609 532 NAG NAG . NB 7 NAG C 1 610 533 NAG NAG . OB 7 NAG C 1 611 534 NAG NAG . PB 7 NAG C 1 612 535 NAG NAG . QB 7 NAG C 1 613 536 NAG NAG . RB 7 NAG I 1 701 656 NAG NAG . SB 7 NAG J 1 701 657 NAG NAG . TB 7 NAG Z 1 701 654 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . QA 7 170.752 221.031 176.003 1 30 ? C1 NAG 613 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . QA 7 171.776 220.358 176.917 1 30 ? C2 NAG 613 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . QA 7 172.258 221.36 177.96 1 30 ? C3 NAG 613 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . QA 7 172.804 222.605 177.277 1 30 ? C4 NAG 613 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . QA 7 171.739 223.191 176.354 1 30 ? C5 NAG 613 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . QA 7 172.247 224.364 175.548 1 30 ? C6 NAG 613 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . QA 7 171.622 217.941 177.248 1 30 ? C7 NAG 613 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . QA 7 170.923 216.834 177.975 1 30 ? C8 NAG 613 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . QA 7 171.238 219.179 177.562 1 30 ? N2 NAG 613 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . QA 7 173.245 220.753 178.782 1 30 ? O3 NAG 613 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . QA 7 173.145 223.573 178.265 1 30 ? O4 NAG 613 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . QA 7 171.297 222.198 175.406 1 30 ? O5 NAG 613 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . QA 7 173.34 223.981 174.716 1 30 ? O6 NAG 613 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . QA 7 172.491 217.724 176.409 1 30 ? O7 NAG 613 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 39 _model_server_stats.query_time_ms 251 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 14 #