data_8TPL
#
_model_server_result.job_id            4reCMmNG_bK9tJyQ3WDUfQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 04:16:12' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8tpl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":700}' 
#
_entry.id    8TPL 
#
_exptl.entry_id    8TPL 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              507.181 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    7 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8TPL 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8TPL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      7 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 H N N 
? 2 J N N 
? 2 L N N 
? 2 N N N 
? 2 P N N 
? 2 R N N 
? 2 T N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG SER 237 A SER 237 1_555 I MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? 
metalc ? metalc2 H O3B ATP . A ATP 700 1_555 I MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc3 H O1A ATP . A ATP 700 1_555 I MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc4 H O2A ATP . A ATP 700 1_555 I MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc5 H O3A ATP . A ATP 700 1_555 I MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? 
metalc ? metalc6 B OG SER 237 B SER 237 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? 
metalc ? metalc7 J O2B ATP . B ATP 700 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc8 J O3B ATP . B ATP 700 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? 
metalc ? metalc9 J O1A ATP . B ATP 700 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc10 J O2A ATP . B ATP 700 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc11 J O3A ATP . B ATP 700 1_555 K MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc12 C OG SER 237 C SER 237 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.771 ? 
metalc ? metalc13 L O2G ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? 
metalc ? metalc14 L O2B ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc15 L O3B ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.906 ? 
metalc ? metalc16 L O1A ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc17 L O2A ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? 
metalc ? metalc18 L O3A ATP . C ATP 700 1_555 M MG MG . C MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc19 D OG SER 237 D SER 237 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc20 N O2G ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? 
metalc ? metalc21 N O2B ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? 
metalc ? metalc22 N O3B ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.907 ? 
metalc ? metalc23 N O1A ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc24 N O2A ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc25 N O3A ATP . D ATP 700 1_555 O MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? 
metalc ? metalc26 E OG SER 237 E SER 237 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc27 P O2G ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? 
metalc ? metalc28 P O2B ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.819 ? 
metalc ? metalc29 P O3B ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.882 ? 
metalc ? metalc30 P O1A ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
metalc ? metalc31 P O2A ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc32 P O3A ATP . E ATP 700 1_555 Q MG MG . E MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc33 F OG SER 237 F SER 237 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? 
metalc ? metalc34 R O2B ATP . F ATP 700 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? 
metalc ? metalc35 R O3B ATP . F ATP 700 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.878 ? 
metalc ? metalc36 R O1A ATP . F ATP 700 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? 
metalc ? metalc37 R O2A ATP . F ATP 700 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc38 R O3A ATP . F ATP 700 1_555 S MG MG . F MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc39 G OG SER 237 G SER 237 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? 
metalc ? metalc40 T O2B ATP . G ATP 700 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc41 T O3B ATP . G ATP 700 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.953 ? 
metalc ? metalc42 T O1A ATP . G ATP 700 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc43 T O2A ATP . G ATP 700 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc44 T O3A ATP . G ATP 700 1_555 U MG MG . G MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O13 P3' 
_chem_comp.formula_weight    507.181 
_chem_comp.id                ATP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G ATP doub 70 n n 
PG O2G ATP sing 71 n n 
PG O3G ATP sing 72 n n 
PG O3B ATP sing 73 n n 
O2G HOG2 ATP sing 74 n n 
O3G HOG3 ATP sing 75 n n 
PB O1B ATP doub 76 n n 
PB O2B ATP sing 77 n n 
PB O3B ATP sing 78 n n 
PB O3A ATP sing 79 n n 
O2B HOB2 ATP sing 80 n n 
PA O1A ATP doub 81 n n 
PA O2A ATP sing 82 n n 
PA O3A ATP sing 83 n n 
PA O5' ATP sing 84 n n 
O2A HOA2 ATP sing 85 n n 
O5' C5' ATP sing 86 n n 
C5' C4' ATP sing 87 n n 
C5' "H5'1" ATP sing 88 n n 
C5' "H5'2" ATP sing 89 n n 
C4' O4' ATP sing 90 n n 
C4' C3' ATP sing 91 n n 
C4' H4' ATP sing 92 n n 
O4' C1' ATP sing 93 n n 
C3' O3' ATP sing 94 n n 
C3' C2' ATP sing 95 n n 
C3' H3' ATP sing 96 n n 
O3' HO3' ATP sing 97 n n 
C2' O2' ATP sing 98 n n 
C2' C1' ATP sing 99 n n 
C2' H2' ATP sing 100 n n 
O2' HO2' ATP sing 101 n n 
C1' N9 ATP sing 102 n n 
C1' H1' ATP sing 103 n n 
N9 C8 ATP sing 104 n y 
N9 C4 ATP sing 105 n y 
C8 N7 ATP doub 106 n y 
C8 H8 ATP sing 107 n n 
N7 C5 ATP sing 108 n y 
C5 C6 ATP sing 109 n y 
C5 C4 ATP doub 110 n y 
C6 N6 ATP sing 111 n n 
C6 N1 ATP doub 112 n y 
N6 HN61 ATP sing 113 n n 
N6 HN62 ATP sing 114 n n 
N1 C2 ATP sing 115 n y 
C2 N3 ATP doub 116 n y 
C2 H2 ATP sing 117 n n 
N3 C4 ATP sing 118 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     8TPL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
H 2 ATP A 1 700 700 ATP ATP . 
I 3 MG A 1 701 701 MG MG . 
J 2 ATP B 1 700 700 ATP ATP . 
K 3 MG B 1 701 701 MG MG . 
L 2 ATP C 1 700 700 ATP ATP . 
M 3 MG C 1 701 701 MG MG . 
N 2 ATP D 1 700 700 ATP ATP . 
O 3 MG D 1 701 701 MG MG . 
P 2 ATP E 1 700 700 ATP ATP . 
Q 3 MG E 1 701 701 MG MG . 
R 2 ATP F 1 700 700 ATP ATP . 
S 3 MG F 1 701 701 MG MG . 
T 2 ATP G 1 700 700 ATP ATP . 
U 3 MG G 1 701 701 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG ATP . . . J 2 173.054 173.149 174.33 1 118.41 ? PG ATP 700 B 1 
HETATM 2 O O1G ATP . . . J 2 171.682 173.33 174.879 1 96.41 ? O1G ATP 700 B 1 
HETATM 3 O O2G ATP . . . J 2 173.108 173.091 172.803 1 96.09 ? O2G ATP 700 B 1 
HETATM 4 O O3G ATP . . . J 2 173.789 171.935 174.898 1 97.93 ? O3G ATP 700 B 1 
HETATM 5 P PB ATP . . . J 2 174.703 175.011 175.977 1 94.71 ? PB ATP 700 B 1 
HETATM 6 O O1B ATP . . . J 2 173.799 175.098 177.138 1 93.59 ? O1B ATP 700 B 1 
HETATM 7 O O2B ATP . . . J 2 175.987 174.217 176.195 1 91.71 ? O2B ATP 700 B 1 
HETATM 8 O O3B ATP . . . J 2 173.976 174.389 174.715 1 98.68 ? O3B ATP 700 B 1 
HETATM 9 P PA ATP . . . J 2 175.476 177.076 174.014 1 84.72 ? PA ATP 700 B 1 
HETATM 10 O O1A ATP . . . J 2 174.497 176.672 172.986 1 89.4 ? O1A ATP 700 B 1 
HETATM 11 O O2A ATP . . . J 2 176.924 176.71 173.702 1 89.66 ? O2A ATP 700 B 1 
HETATM 12 O O3A ATP . . . J 2 175.125 176.442 175.424 1 88.55 ? O3A ATP 700 B 1 
HETATM 13 O O5' ATP . . . J 2 175.383 178.628 174.28 1 83.74 ? O5' ATP 700 B 1 
HETATM 14 C C5' ATP . . . J 2 174.199 179.373 173.928 1 85.93 ? C5' ATP 700 B 1 
HETATM 15 C C4' ATP . . . J 2 174.467 180.846 174.096 1 83.22 ? C4' ATP 700 B 1 
HETATM 16 O O4' ATP . . . J 2 175.422 181.048 175.162 1 77.5 ? O4' ATP 700 B 1 
HETATM 17 C C3' ATP . . . J 2 175.043 181.542 172.863 1 84.27 ? C3' ATP 700 B 1 
HETATM 18 O O3' ATP . . . J 2 174.489 182.843 172.707 1 91.9 ? O3' ATP 700 B 1 
HETATM 19 C C2' ATP . . . J 2 176.54 181.592 173.169 1 85.22 ? C2' ATP 700 B 1 
HETATM 20 O O2' ATP . . . J 2 177.174 182.692 172.529 1 96.99 ? O2' ATP 700 B 1 
HETATM 21 C C1' ATP . . . J 2 176.525 181.79 174.682 1 77.82 ? C1' ATP 700 B 1 
HETATM 22 N N9 ATP . . . J 2 177.727 181.317 175.357 1 79.38 ? N9 ATP 700 B 1 
HETATM 23 C C8 ATP . . . J 2 177.826 180.28 176.246 1 87.55 ? C8 ATP 700 B 1 
HETATM 24 N N7 ATP . . . J 2 179.039 180.077 176.7 1 88.39 ? N7 ATP 700 B 1 
HETATM 25 C C5 ATP . . . J 2 179.793 181.051 176.064 1 79.29 ? C5 ATP 700 B 1 
HETATM 26 C C6 ATP . . . J 2 181.161 181.375 176.113 1 75.18 ? C6 ATP 700 B 1 
HETATM 27 N N6 ATP . . . J 2 182.053 180.723 176.865 1 75.72 ? N6 ATP 700 B 1 
HETATM 28 N N1 ATP . . . J 2 181.59 182.406 175.355 1 84.35 ? N1 ATP 700 B 1 
HETATM 29 C C2 ATP . . . J 2 180.705 183.062 174.601 1 88.45 ? C2 ATP 700 B 1 
HETATM 30 N N3 ATP . . . J 2 179.394 182.847 174.473 1 84.68 ? N3 ATP 700 B 1 
HETATM 31 C C4 ATP . . . J 2 178.997 181.823 175.234 1 82.08 ? C4 ATP 700 B 1 
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