data_8TQ1 # _model_server_result.job_id QUbgld6cRXq9Fk1lOP3GDw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 02:50:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8tq1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":702}' # _entry.id 8TQ1 # _exptl.entry_id 8TQ1 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 45 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8TQ1 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8TQ1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 13-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 Z N N ? 9 AA N N ? 9 BA N N ? 9 CA N N ? 9 DA N N ? 9 EA N N ? 9 FA N N ? 9 GA N N ? 9 HA N N ? 9 IA N N ? 9 JA N N ? 9 KA N N ? 9 LA N N ? 9 MA N N ? 9 NA N N ? 9 OA N N ? 9 PA N N ? 9 QA N N ? 9 RA N N ? 9 SA N N ? 9 TA N N ? 9 UA N N ? 9 VA N N ? 9 WA N N ? 9 XA N N ? 9 YA N N ? 9 ZA N N ? 9 AB N N ? 9 BB N N ? 9 CB N N ? 9 DB N N ? 9 EB N N ? 9 FB N N ? 9 GB N N ? 9 HB N N ? 9 IB N N ? 9 JB N N ? 9 KB N N ? 9 LB N N ? 9 MB N N ? 9 NB N N ? 9 OB N N ? 9 PB N N ? 9 QB N N ? 9 RB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 7 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 6 n N NAG 1 L 1 NAG A 606 NAG 6 n N NAG 2 L 2 NAG A 624 NAG 6 n O NAG 1 O 1 NAG A 625 NAG 6 n O NAG 2 O 2 NAG A 626 NAG 6 n P NAG 1 P 1 NAG A 627 NAG 6 n P NAG 2 P 2 NAG A 628 NAG 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 629 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 630 NAG 7 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 631 BMA 7 n Q MAN 4 Q 4 MAN A 632 MAN 7 n Q MAN 5 Q 5 MAN A 633 MAN 6 n R NAG 1 R 1 NAG A 634 NAG 6 n R NAG 2 R 2 NAG A 635 NAG 6 n S NAG 1 S 1 NAG J 606 NAG 6 n S NAG 2 S 2 NAG J 624 NAG 6 n T NAG 1 T 1 NAG J 625 NAG 6 n T NAG 2 T 2 NAG J 626 NAG 7 n U NAG 1 U 1 NAG J 628 NAG 7 n U NAG 2 U 2 NAG J 629 NAG 7 n U BMA 3 U 3 BMA J 630 BMA 7 n U MAN 4 U 4 MAN J 631 MAN 7 n U MAN 5 U 5 MAN J 632 MAN 8 n V NAG 1 V 1 NAG E 606 NAG 8 n V NAG 2 V 2 NAG E 624 NAG 8 n V BMA 3 V 3 BMA E 631 BMA 8 n V MAN 4 V 4 MAN E 632 MAN 6 n W NAG 1 W 1 NAG E 627 NAG 6 n W NAG 2 W 2 NAG E 628 NAG 8 n X NAG 1 X 1 NAG E 633 NAG 8 n X NAG 2 X 2 NAG E 634 NAG 8 n X BMA 3 X 3 BMA E 635 BMA 8 n X MAN 4 X 4 MAN E 636 MAN 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 637 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 638 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 54 1_555 A SG CYS 79 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 124 A CYS 119 1_555 A SG CYS 210 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 131 A CYS 126 1_555 A SG CYS 201 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 136 A CYS 131 1_555 A SG CYS 154 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 233 A CYS 228 1_555 A SG CYS 244 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 301 A CYS 296 1_555 A SG CYS 335 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 382 A CYS 378 1_555 A SG CYS 448 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 389 A CYS 385 1_555 A SG CYS 421 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 87 B CYS 598 1_555 B SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 20 D CYS 23 1_555 D SG CYS 88 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 59 J CYS 54 1_555 E SG CYS 79 J CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 124 J CYS 119 1_555 E SG CYS 210 J CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 131 J CYS 126 1_555 E SG CYS 201 J CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 136 J CYS 131 1_555 E SG CYS 154 J CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 223 J CYS 218 1_555 E SG CYS 252 J CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 233 J CYS 228 1_555 E SG CYS 244 J CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 301 J CYS 296 1_555 E SG CYS 335 J CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 382 J CYS 378 1_555 E SG CYS 448 J CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 389 J CYS 385 1_555 E SG CYS 421 J CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 504 J CYS 501 1_555 F SG CYS 94 K CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 87 K CYS 598 1_555 F SG CYS 93 K CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 22 M CYS 22 1_555 G SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 20 N CYS 23 1_555 H SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 59 E CYS 54 1_555 I SG CYS 79 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 124 E CYS 119 1_555 I SG CYS 210 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 131 E CYS 126 1_555 I SG CYS 201 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 136 E CYS 131 1_555 I SG CYS 154 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 223 E CYS 218 1_555 I SG CYS 252 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 233 E CYS 228 1_555 I SG CYS 244 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 301 E CYS 296 1_555 I SG CYS 335 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 382 E CYS 378 1_555 I SG CYS 448 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 389 E CYS 385 1_555 I SG CYS 421 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 I SG CYS 504 E CYS 501 1_555 J SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf35 J SG CYS 87 F CYS 598 1_555 J SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 22 G CYS 22 1_555 K SG CYS 96 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf37 L SG CYS 20 I CYS 23 1_555 L SG CYS 88 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf38 M SG CYS 109 H CYS 109 1_555 M SG CYS 119 H CYS 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 115 H CYS 115 1_555 M SG CYS 124 H CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf40 M SG CYS 120 H CYS 120 1_555 M SG CYS 131 H CYS 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 93 A ASN 88 1_555 Z C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 138 A ASN 133 1_555 AA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 153 A ASN 156 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 157 A ASN 160 1_555 N C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 202 A ASN 197 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 239 A ASN 234 1_555 BA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 267 A ASN 262 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 281 A ASN 276 1_555 CA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 300 A ASN 295 1_555 DA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 306 A ASN 301 1_555 EA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 336 A ASN 332 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 343 A ASN 339 1_555 FA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 359 A ASN 355 1_555 GA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 367 A ASN 363 1_555 HA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 390 A ASN 386 1_555 JA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 396 A ASN 392 1_555 IA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 451 A ASN 448 1_555 KA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 LA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 MA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 93 J ASN 88 1_555 NA C1 NAG . J NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale21 E ND2 ASN 138 J ASN 133 1_555 OA C1 NAG . J NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 153 J ASN 156 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 157 J ASN 160 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 202 J ASN 197 1_555 XA C1 NAG . J NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 239 J ASN 234 1_555 PA C1 NAG . J NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 267 J ASN 262 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 281 J ASN 276 1_555 QA C1 NAG . J NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 300 J ASN 295 1_555 RA C1 NAG . J NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 306 J ASN 301 1_555 SA C1 NAG . J NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 336 J ASN 332 1_555 TA C1 NAG . J NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 343 J ASN 339 1_555 UA C1 NAG . J NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 359 J ASN 355 1_555 VA C1 NAG . J NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 367 J ASN 363 1_555 ZA C1 NAG . J NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 390 J ASN 386 1_555 YA C1 NAG . J NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 396 J ASN 392 1_555 WA C1 NAG . J NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 451 J ASN 448 1_555 AB C1 NAG . J NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale37 F ND2 ASN 100 K ASN 611 1_555 BB C1 NAG . K NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale38 F ND2 ASN 126 K ASN 637 1_555 CB C1 NAG . K NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale39 I ND2 ASN 93 E ASN 88 1_555 DB C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale40 I ND2 ASN 138 E ASN 133 1_555 EB C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale41 I ND2 ASN 153 E ASN 156 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale42 I ND2 ASN 157 E ASN 160 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale43 I ND2 ASN 202 E ASN 197 1_555 NB C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale44 I ND2 ASN 239 E ASN 234 1_555 FB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale45 I ND2 ASN 267 E ASN 262 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale46 I ND2 ASN 281 E ASN 276 1_555 GB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale47 I ND2 ASN 300 E ASN 295 1_555 HB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 I ND2 ASN 306 E ASN 301 1_555 IB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale49 I ND2 ASN 336 E ASN 332 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale50 I ND2 ASN 343 E ASN 339 1_555 JB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale51 I ND2 ASN 359 E ASN 355 1_555 KB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale52 I ND2 ASN 367 E ASN 363 1_555 LB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale53 I ND2 ASN 390 E ASN 386 1_555 OB C1 NAG . E NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale54 I ND2 ASN 396 E ASN 392 1_555 MB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 I ND2 ASN 451 E ASN 448 1_555 PB C1 NAG . E NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 J ND2 ASN 100 F ASN 611 1_555 QB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale57 J ND2 ASN 126 F ASN 637 1_555 RB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale58 N O4 NAG . L NAG 1 1_555 N C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale59 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale60 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale61 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale63 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale64 Q O6 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale65 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale66 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale67 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale68 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale69 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale70 U O3 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale71 U O6 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale72 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale73 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale74 V O3 BMA . V BMA 3 1_555 V C1 MAN . V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale75 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale76 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale77 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale78 X O3 BMA . X BMA 3 1_555 X C1 MAN . X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale79 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8TQ1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Z 9 NAG A 1 601 601 NAG NAG . AA 9 NAG A 1 602 602 NAG NAG . BA 9 NAG A 1 603 609 NAG NAG . CA 9 NAG A 1 604 614 NAG NAG . DA 9 NAG A 1 605 615 NAG NAG . EA 9 NAG A 1 606 616 NAG NAG . FA 9 NAG A 1 607 618 NAG NAG . GA 9 NAG A 1 608 619 NAG NAG . HA 9 NAG A 1 609 620 NAG NAG . IA 9 NAG A 1 610 623 NAG NAG . JA 9 NAG A 1 611 636 NAG NAG . KA 9 NAG A 1 612 637 NAG NAG . LA 9 NAG B 1 701 701 NAG NAG . MA 9 NAG B 1 702 704 NAG NAG . NA 9 NAG J 1 601 601 NAG NAG . OA 9 NAG J 1 602 602 NAG NAG . PA 9 NAG J 1 603 609 NAG NAG . QA 9 NAG J 1 604 614 NAG NAG . RA 9 NAG J 1 605 615 NAG NAG . SA 9 NAG J 1 606 616 NAG NAG . TA 9 NAG J 1 607 617 NAG NAG . UA 9 NAG J 1 608 618 NAG NAG . VA 9 NAG J 1 609 619 NAG NAG . WA 9 NAG J 1 610 623 NAG NAG . XA 9 NAG J 1 611 627 NAG NAG . YA 9 NAG J 1 612 633 NAG NAG . ZA 9 NAG J 1 613 634 NAG NAG . AB 9 NAG J 1 614 635 NAG NAG . BB 9 NAG K 1 701 701 NAG NAG . CB 9 NAG K 1 702 704 NAG NAG . DB 9 NAG E 1 601 601 NAG NAG . EB 9 NAG E 1 602 602 NAG NAG . FB 9 NAG E 1 603 609 NAG NAG . GB 9 NAG E 1 604 614 NAG NAG . HB 9 NAG E 1 605 615 NAG NAG . IB 9 NAG E 1 606 616 NAG NAG . JB 9 NAG E 1 607 618 NAG NAG . KB 9 NAG E 1 608 619 NAG NAG . LB 9 NAG E 1 609 620 NAG NAG . MB 9 NAG E 1 610 623 NAG NAG . NB 9 NAG E 1 611 629 NAG NAG . OB 9 NAG E 1 612 639 NAG NAG . PB 9 NAG E 1 613 640 NAG NAG . QB 9 NAG F 1 701 701 NAG NAG . RB 9 NAG F 1 702 704 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MA 9 226.393 180.672 191.058 1 95.3 ? C1 NAG 702 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MA 9 226.241 179.233 190.583 1 95.36 ? C2 NAG 702 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MA 9 226.583 178.291 191.724 1 96.65 ? C3 NAG 702 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MA 9 228.003 178.571 192.194 1 99.45 ? C4 NAG 702 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MA 9 228.115 180.035 192.616 1 97.81 ? C5 NAG 702 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MA 9 229.522 180.427 193.002 1 95.94 ? C6 NAG 702 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MA 9 224.603 178.722 188.819 1 94.72 ? C7 NAG 702 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MA 9 223.159 178.48 188.514 1 92.17 ? C8 NAG 702 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MA 9 224.893 178.978 190.099 1 96.7 ? N2 NAG 702 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MA 9 226.472 176.945 191.277 1 95.33 ? O3 NAG 702 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MA 9 228.324 177.735 193.3 1 96.96 ? O4 NAG 702 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MA 9 227.738 180.883 191.517 1 96.03 ? O5 NAG 702 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MA 9 229.569 181.741 193.54 1 94.38 ? O6 NAG 702 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MA 9 225.464 178.693 187.946 1 93.78 ? O7 NAG 702 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 368 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 14 #