data_8UE2 # _model_server_result.job_id Sslu5J_D6fzmYYgdfQ-OSw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 04:41:41' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8ue2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":409}' # _entry.id 8UE2 # _exptl.entry_id 8UE2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 142.282 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description DECANE _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8UE2 _cell.length_a 66.929 _cell.length_b 119.655 _cell.length_c 128.652 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8UE2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id K _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 93 1_555 B SG CYS 59 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc1 A O THR 108 A THR 142 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? metalc ? metalc2 A O THR 108 A THR 142 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.04 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 108 A THR 142 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.165 ? metalc ? metalc4 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc5 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.819 ? metalc ? metalc6 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? metalc ? metalc7 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc8 A O PHE 111 A PHE 145 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? metalc ? metalc9 A O THR 217 A THR 251 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc10 A O THR 217 A THR 251 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc11 A OG1 THR 217 A THR 251 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc12 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc13 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc14 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.006 ? metalc ? metalc15 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc16 A O PHE 220 A PHE 254 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? metalc ? metalc17 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.159 ? metalc ? metalc18 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 111 B PHE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? metalc ? metalc19 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.164 ? metalc ? metalc20 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 220 B PHE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.816 ? metalc ? metalc21 E K K . A K 403 1_555 B O THR 108 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc ? metalc22 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? metalc ? metalc23 E K K . A K 403 1_555 B O THR 217 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc24 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc25 B O THR 108 B THR 142 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc26 B OG1 THR 108 B THR 142 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.03 ? metalc ? metalc27 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? metalc ? metalc28 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc29 B O THR 217 B THR 251 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.978 ? metalc ? metalc30 B OG1 THR 217 B THR 251 1_555 P K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.992 ? metalc ? metalc31 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc32 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 O K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? # _chem_comp.formula 'C10 H22' _chem_comp.formula_weight 142.282 _chem_comp.id D10 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name DECANE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 D10 sing 83 n n C1 H11 D10 sing 84 n n C1 H12 D10 sing 85 n n C1 H13 D10 sing 86 n n C2 C3 D10 sing 87 n n C2 H21 D10 sing 88 n n C2 H22 D10 sing 89 n n C3 C4 D10 sing 90 n n C3 H31 D10 sing 91 n n C3 H32 D10 sing 92 n n C4 C5 D10 sing 93 n n C4 H41 D10 sing 94 n n C4 H42 D10 sing 95 n n C5 C6 D10 sing 96 n n C5 H51 D10 sing 97 n n C5 H52 D10 sing 98 n n C6 C7 D10 sing 99 n n C6 H61 D10 sing 100 n n C6 H62 D10 sing 101 n n C7 C8 D10 sing 102 n n C7 H71 D10 sing 103 n n C7 H72 D10 sing 104 n n C8 C9 D10 sing 105 n n C8 H81 D10 sing 106 n n C8 H82 D10 sing 107 n n C9 C10 D10 sing 108 n n C9 H91 D10 sing 109 n n C9 H92 D10 sing 110 n n C10 H101 D10 sing 111 n n C10 H102 D10 sing 112 n n C10 H103 D10 sing 113 n n # _atom_sites.entry_id 8UE2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014941 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008357 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007773 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 401 K K . D 2 K A 1 402 402 K K . E 2 K A 1 403 403 K K . F 3 R16 A 1 404 404 R16 R16 . G 3 R16 A 1 405 405 R16 R16 . H 3 R16 A 1 406 409 R16 R16 . I 3 R16 A 1 407 502 R16 R16 . J 3 R16 A 1 408 503 R16 R16 . K 4 D10 A 1 409 504 D10 D10 . L 5 Q6F A 1 410 505 Q6F Q6F . M 3 R16 A 1 411 505 R16 R16 . N 6 CD A 1 412 1 CD CD . O 2 K B 1 401 401 K K . P 2 K B 1 402 402 K K . Q 2 K B 1 403 403 K K . R 6 CD B 1 404 404 CD CD . S 6 CD B 1 405 405 CD CD . T 6 CD B 1 406 406 CD CD . U 3 R16 B 1 407 408 R16 R16 . V 3 R16 B 1 408 409 R16 R16 . W 3 R16 B 1 409 411 R16 R16 . X 3 R16 B 1 410 502 R16 R16 . Y 3 R16 B 1 411 503 R16 R16 . Z 3 R16 B 1 412 504 R16 R16 . AA 5 Q6F B 1 413 506 Q6F Q6F . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 D10 . . . K 4 29.444 -21.825 -15.87 1 117.19 ? C1 D10 409 A 1 HETATM 2 C C2 D10 . . . K 4 30.898 -21.481 -16.187 1 128.7 ? C2 D10 409 A 1 HETATM 3 C C3 D10 . . . K 4 31.008 -19.985 -16.472 1 128.13 ? C3 D10 409 A 1 HETATM 4 C C4 D10 . . . K 4 32.137 -19.394 -15.631 1 135.17 ? C4 D10 409 A 1 HETATM 5 C C5 D10 . . . K 4 31.782 -17.962 -15.238 1 134.22 ? C5 D10 409 A 1 HETATM 6 C C6 D10 . . . K 4 30.795 -17.978 -14.072 1 133.6 ? C6 D10 409 A 1 HETATM 7 C C7 D10 . . . K 4 31.489 -18.51 -12.818 1 146.4 ? C7 D10 409 A 1 HETATM 8 C C8 D10 . . . K 4 30.723 -19.718 -12.281 1 148.14 ? C8 D10 409 A 1 HETATM 9 C C9 D10 . . . K 4 29.273 -19.327 -12.004 1 135.5 ? C9 D10 409 A 1 HETATM 10 C C10 D10 . . . K 4 28.483 -20.57 -11.602 1 138.69 ? C10 D10 409 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 230 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 10 #