data_8UF6 # _model_server_result.job_id IiYGnWa-K5ox8cGcPc4PGg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 16:47:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8uf6 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":406}' # _entry.id 8UF6 # _exptl.entry_id 8UF6 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8UF6 _cell.length_a 66.953 _cell.length_b 118.597 _cell.length_c 130.873 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8UF6 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 N N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 93 1_555 B SG CYS 59 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? covale ? covale1 A OG SER 97 A SER 131 1_555 C C23 WRZ . A WRZ 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale ? covale2 B OG SER 97 B SER 131 1_555 J C23 WRZ . B WRZ 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? metalc ? metalc1 A O THR 108 A THR 142 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 108 A THR 142 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.067 ? metalc ? metalc3 A O THR 108 A THR 142 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc4 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc5 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? metalc ? metalc6 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc7 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? metalc ? metalc8 A O PHE 111 A PHE 145 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? metalc ? metalc9 A O THR 217 A THR 251 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? metalc ? metalc10 A OG1 THR 217 A THR 251 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? metalc ? metalc11 A O THR 217 A THR 251 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? metalc ? metalc12 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? metalc ? metalc13 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc ? metalc14 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc ? metalc15 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? metalc ? metalc16 A O PHE 220 A PHE 254 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc17 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc ? metalc18 G K K . A K 405 1_555 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc19 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc20 G K K . A K 405 1_555 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? metalc ? metalc21 H K K . A K 406 1_555 B O THR 108 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? metalc ? metalc22 H K K . A K 406 1_555 B OG1 THR 108 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.028 ? metalc ? metalc23 H K K . A K 406 1_555 B O THR 217 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc ? metalc24 H K K . A K 406 1_555 B OG1 THR 217 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? metalc ? metalc25 B O THR 108 B THR 142 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc26 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? metalc ? metalc27 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.004 ? metalc ? metalc28 B O PHE 111 B PHE 145 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc29 B O THR 217 B THR 251 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc30 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc31 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.016 ? metalc ? metalc32 B O PHE 220 B PHE 254 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc33 B OE1 GLU 275 B GLU 309 1_555 P CD CD . B CD 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8UF6 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014936 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008432 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007641 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 WRZ A 1 401 3 WRZ LH9 . D 3 D10 A 1 402 1 D10 D10 . E 3 D10 A 1 403 2 D10 D10 . F 4 K A 1 404 2 K K . G 4 K A 1 405 4 K K . H 4 K A 1 406 6 K K . I 5 16C A 1 407 1 16C 16C . J 2 WRZ B 1 401 4 WRZ LH9 . K 6 1PE B 1 402 1 1PE 1PE . L 4 K B 1 403 1 K K . M 4 K B 1 404 3 K K . N 4 K B 1 405 5 K K . O 7 CD B 1 406 1 CD CD . P 7 CD B 1 407 2 CD CD . Q 8 D12 B 1 408 1 D12 D12 . R 5 16C B 1 409 2 16C 16C . S 9 OCT B 1 410 1 OCT OCT . T 9 OCT B 1 411 2 OCT OCT . U 10 R16 B 1 412 1 R16 R16 . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -3.632 _atom_site.Cartn_y -20.449 _atom_site.Cartn_z 27.983 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 70.32 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 406 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 70 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 18 _model_server_stats.query_time_ms 310 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #