data_8UF6
#
_model_server_result.job_id            PnTo3EHE-J3xaS6Au_fZzQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 02:02:30' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          8uf6 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":411}' 
#
_entry.id    8UF6 
#
_exptl.entry_id    8UF6 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              114.229 
_entity.id                          9 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            N-OCTANE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_b            118.597 
_cell.length_c            130.873 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8UF6 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 9 S N N 
? 9 T N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 93 1_555 B SG CYS 59 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
covale ? covale1 A OG SER 97 A SER 131 1_555 C C23 WRZ . A WRZ 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? 
covale ? covale2 B OG SER 97 B SER 131 1_555 J C23 WRZ . B WRZ 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? 
metalc ? metalc1 A O THR 108 A THR 142 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 108 A THR 142 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.067 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 108 A THR 142 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc4 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc5 A O ILE 109 A ILE 143 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? 
metalc ? metalc6 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? 
metalc ? metalc7 A O GLY 110 A GLY 144 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? 
metalc ? metalc8 A O PHE 111 A PHE 145 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? 
metalc ? metalc9 A O THR 217 A THR 251 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? 
metalc ? metalc10 A OG1 THR 217 A THR 251 1_555 H K K . A K 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc11 A O THR 217 A THR 251 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? 
metalc ? metalc12 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc13 A O ILE 218 A ILE 252 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? 
metalc ? metalc14 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc15 A O GLY 219 A GLY 253 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? 
metalc ? metalc16 A O PHE 220 A PHE 254 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? 
metalc ? metalc17 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? 
metalc ? metalc18 G K K . A K 405 1_555 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? 
metalc ? metalc19 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc20 G K K . A K 405 1_555 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? 
metalc ? metalc21 H K K . A K 406 1_555 B O THR 108 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? 
metalc ? metalc22 H K K . A K 406 1_555 B OG1 THR 108 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.028 ? 
metalc ? metalc23 H K K . A K 406 1_555 B O THR 217 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? 
metalc ? metalc24 H K K . A K 406 1_555 B OG1 THR 217 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? 
metalc ? metalc25 B O THR 108 B THR 142 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? 
metalc ? metalc26 B O ILE 109 B ILE 143 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc27 B O GLY 110 B GLY 144 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.004 ? 
metalc ? metalc28 B O PHE 111 B PHE 145 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? 
metalc ? metalc29 B O THR 217 B THR 251 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? 
metalc ? metalc30 B O ILE 218 B ILE 252 1_555 N K K . B K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc31 B O GLY 219 B GLY 253 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.016 ? 
metalc ? metalc32 B O PHE 220 B PHE 254 1_555 M K K . B K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? 
metalc ? metalc33 B OE1 GLU 275 B GLU 309 1_555 P CD CD . B CD 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H18' 
_chem_comp.formula_weight    114.229 
_chem_comp.id                OCT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              N-OCTANE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 OCT sing 444 n n 
C1 H11 OCT sing 445 n n 
C1 H12 OCT sing 446 n n 
C1 H13 OCT sing 447 n n 
C2 C3 OCT sing 448 n n 
C2 H21 OCT sing 449 n n 
C2 H22 OCT sing 450 n n 
C3 C4 OCT sing 451 n n 
C3 H31 OCT sing 452 n n 
C3 H32 OCT sing 453 n n 
C4 C5 OCT sing 454 n n 
C4 H41 OCT sing 455 n n 
C4 H42 OCT sing 456 n n 
C5 C6 OCT sing 457 n n 
C5 H51 OCT sing 458 n n 
C5 H52 OCT sing 459 n n 
C6 C7 OCT sing 460 n n 
C6 H61 OCT sing 461 n n 
C6 H62 OCT sing 462 n n 
C7 C8 OCT sing 463 n n 
C7 H71 OCT sing 464 n n 
C7 H72 OCT sing 465 n n 
C8 H81 OCT sing 466 n n 
C8 H82 OCT sing 467 n n 
C8 H83 OCT sing 468 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8UF6 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014936 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008432 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007641 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 WRZ A 1 401 3 WRZ LH9 . 
D 3 D10 A 1 402 1 D10 D10 . 
E 3 D10 A 1 403 2 D10 D10 . 
F 4 K A 1 404 2 K K . 
G 4 K A 1 405 4 K K . 
H 4 K A 1 406 6 K K . 
I 5 16C A 1 407 1 16C 16C . 
J 2 WRZ B 1 401 4 WRZ LH9 . 
K 6 1PE B 1 402 1 1PE 1PE . 
L 4 K B 1 403 1 K K . 
M 4 K B 1 404 3 K K . 
N 4 K B 1 405 5 K K . 
O 7 CD B 1 406 1 CD CD . 
P 7 CD B 1 407 2 CD CD . 
Q 8 D12 B 1 408 1 D12 D12 . 
R 5 16C B 1 409 2 16C 16C . 
S 9 OCT B 1 410 1 OCT OCT . 
T 9 OCT B 1 411 2 OCT OCT . 
U 10 R16 B 1 412 1 R16 R16 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 OCT . . . T 9 -23.16 -30.346 33.741 1 109.26 ? C1 OCT 411 B 1 
HETATM 2 C C2 OCT . . . T 9 -22.478 -31.664 34.089 1 109.88 ? C2 OCT 411 B 1 
HETATM 3 C C3 OCT . . . T 9 -21.103 -31.819 33.447 1 97.69 ? C3 OCT 411 B 1 
HETATM 4 C C4 OCT . . . T 9 -20.535 -33.222 33.62 1 115.43 ? C4 OCT 411 B 1 
HETATM 5 C C5 OCT . . . T 9 -19.17 -33.416 32.972 1 93.12 ? C5 OCT 411 B 1 
HETATM 6 C C6 OCT . . . T 9 -18.523 -34.756 33.299 1 91.79 ? C6 OCT 411 B 1 
HETATM 7 C C7 OCT . . . T 9 -17.634 -35.278 32.175 1 103.04 ? C7 OCT 411 B 1 
HETATM 8 C C8 OCT . . . T 9 -16.312 -35.857 32.667 1 90.73 ? C8 OCT 411 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              18 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    6 
_model_server_stats.query_time_ms           369 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           8 
#