data_8UK9 # _model_server_result.job_id oxZXM621Ra520pKn3q79vQ _model_server_result.datetime_utc '2024-12-01 10:52:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8uk9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":403}' # _entry.id 8UK9 # _exptl.entry_id 8UK9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8UK9 _cell.length_a 95.243 _cell.length_b 231.991 _cell.length_c 264.511 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8UK9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 1 PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA 1 1 K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 V N N ? 7 Z N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 HA N N ? 7 KA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B OG1 THR 58 B THR 57 1_555 W MG MG . B MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc2 B OE2 GLU 109 B GLU 108 1_555 W MG MG . B MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc3 V O2B ADP . B ADP 902 1_555 W MG MG . B MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc4 W MG MG . B MG 903 1_555 C OE1 GLU 127 C GLU 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.897 ? metalc ? metalc5 C OG1 THR 58 C THR 57 1_555 X MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc6 C OE2 GLU 109 C GLU 108 1_555 X MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc7 X MG MG . C MG 401 1_555 Z O2B ADP . C ADP 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc8 D OG1 THR 58 D THR 57 1_555 AA MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc9 D OE2 GLU 109 D GLU 108 1_555 AA MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc10 AA MG MG . D MG 401 1_555 CA O2B ADP . D ADP 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc11 E OG1 THR 58 E THR 57 1_555 EA MG MG . E MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc12 DA O3B ADP . E ADP 401 1_555 EA MG MG . E MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc13 K OE2 GLU 109 K GLU 108 1_555 FA MG MG . K MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc14 FA MG MG . K MG 401 1_555 HA O2B ADP . K ADP 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc15 L OG1 THR 58 L THR 57 1_555 IA MG MG . L MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? metalc ? metalc16 L OE2 GLU 109 L GLU 108 1_555 IA MG MG . L MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc17 IA MG MG . L MG 401 1_555 KA O2B ADP . L ADP 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc18 M OG1 THR 58 M THR 57 1_555 LA MG MG . M MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc19 M OE2 GLU 109 M GLU 108 1_555 LA MG MG . M MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc20 LA MG MG . M MG 401 1_555 NA O3B ADP . M ADP 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? metalc ? metalc21 N OG1 THR 58 N THR 57 1_555 PA MG MG . N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc ? metalc22 N OE2 GLU 109 N GLU 108 1_555 PA MG MG . N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc23 OA O2B ADP . N ADP 401 1_555 PA MG MG . N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 I N1 DA 6 I DA 12 1_555 J N3 DT 19 J DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 I N3 DT 7 I DT 13 1_555 J N1 DA 18 J DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 I O4 DT 7 I DT 13 1_555 J N6 DA 18 J DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 I N1 DG 8 I DG 14 1_555 J N3 DC 17 J DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 I N2 DG 8 I DG 14 1_555 J O2 DC 17 J DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 I O6 DG 8 I DG 14 1_555 J N4 DC 17 J DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 I N3 DT 9 I DT 15 1_555 J N1 DA 16 J DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 I O4 DT 9 I DT 15 1_555 J N6 DA 16 J DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 I N1 DA 10 I DA 16 1_555 J N3 DT 15 J DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 I N6 DA 10 I DA 16 1_555 J O4 DT 15 J DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 I N3 DC 11 I DC 17 1_555 J N1 DG 14 J DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 I N4 DC 11 I DC 17 1_555 J O6 DG 14 J DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 I O2 DC 11 I DC 17 1_555 J N2 DG 14 J DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 I N3 DT 12 I DT 18 1_555 J N1 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 I O4 DT 12 I DT 18 1_555 J N6 DA 13 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 I N3 DC 13 I DC 19 1_555 J N1 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 I N4 DC 13 I DC 19 1_555 J O6 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 I O2 DC 13 I DC 19 1_555 J N2 DG 12 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog19 I N2 DG 14 I DG 20 1_555 J O2 DC 11 J DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 I N3 DT 15 I DT 21 1_555 J N1 DA 10 J DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 I O4 DT 15 I DT 21 1_555 J N6 DA 10 J DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 I N1 DA 16 I DA 22 1_555 J N3 DT 9 J DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 I N6 DA 16 I DA 22 1_555 J O4 DT 9 J DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 I N1 DG 17 I DG 23 1_555 J N3 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 I N2 DG 17 I DG 23 1_555 J O2 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 I O6 DG 17 I DG 23 1_555 J N4 DC 8 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 I N3 DT 18 I DT 24 1_555 J N1 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 I O4 DT 18 I DT 24 1_555 J N6 DA 7 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 I N1 DG 19 I DG 25 1_555 J N3 DC 6 J DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 I N2 DG 19 I DG 25 1_555 J O2 DC 6 J DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 I O6 DG 19 I DG 25 1_555 J N4 DC 6 J DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 I N3 DT 20 I DT 26 1_555 J N1 DA 5 J DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 I O4 DT 20 I DT 26 1_555 J N6 DA 5 J DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 I N3 DC 21 I DC 27 1_555 J N1 DG 4 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 I N4 DC 21 I DC 27 1_555 J O6 DG 4 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 I O2 DC 21 I DC 27 1_555 J N2 DG 4 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DC MISPAIR' hydrog37 I O4 DT 22 I DT 28 1_555 J N4 DC 2 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DG MISPAIR' hydrog38 I O6 DG 23 I DG 29 1_555 J N2 DG 1 J DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 O N1 DA 6 O DA 12 1_555 P N3 DT 19 P DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 O N6 DA 6 O DA 12 1_555 P O4 DT 19 P DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 O N3 DT 7 O DT 13 1_555 P N1 DA 18 P DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 O O4 DT 7 O DT 13 1_555 P N6 DA 18 P DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog43 O N2 DG 8 O DG 14 1_555 P O2 DC 17 P DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 O N3 DT 9 O DT 15 1_555 P N1 DA 16 P DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 O O4 DT 9 O DT 15 1_555 P N6 DA 16 P DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DG MISPAIR' hydrog46 O N1 DA 10 O DA 16 1_555 P N1 DG 14 P DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog47 O N1 DA 10 O DA 16 1_555 P N3 DT 15 P DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog48 O N3 DC 11 O DC 17 1_555 P N2 DG 14 P DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 O N3 DT 12 O DT 18 1_555 P N1 DA 13 P DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 O O4 DT 12 O DT 18 1_555 P N6 DA 13 P DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 O N3 DC 13 O DC 19 1_555 P N1 DG 12 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 O N4 DC 13 O DC 19 1_555 P O6 DG 12 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 O O2 DC 13 O DC 19 1_555 P N2 DG 12 P DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 O N1 DG 14 O DG 20 1_555 P N3 DC 11 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 O N2 DG 14 O DG 20 1_555 P O2 DC 11 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 O O6 DG 14 O DG 20 1_555 P N4 DC 11 P DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 O N3 DT 15 O DT 21 1_555 P N1 DA 10 P DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 O O4 DT 15 O DT 21 1_555 P N6 DA 10 P DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 O N1 DA 16 O DA 22 1_555 P N3 DT 9 P DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 O N6 DA 16 O DA 22 1_555 P O4 DT 9 P DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 O N1 DG 17 O DG 23 1_555 P N3 DC 8 P DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 O N2 DG 17 O DG 23 1_555 P O2 DC 8 P DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 O O6 DG 17 O DG 23 1_555 P N4 DC 8 P DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 O N3 DT 18 O DT 24 1_555 P N1 DA 7 P DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 O O4 DT 18 O DT 24 1_555 P N6 DA 7 P DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 O N1 DG 19 O DG 25 1_555 P N3 DC 6 P DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 O N2 DG 19 O DG 25 1_555 P O2 DC 6 P DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 O O6 DG 19 O DG 25 1_555 P N4 DC 6 P DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 O N3 DT 20 O DT 26 1_555 P N1 DA 5 P DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 O O4 DT 20 O DT 26 1_555 P N6 DA 5 P DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 O N3 DC 21 O DC 27 1_555 P N1 DG 4 P DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 O N4 DC 21 O DC 27 1_555 P O6 DG 4 P DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 O O2 DC 21 O DC 27 1_555 P N2 DG 4 P DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 O N3 DT 22 O DT 28 1_555 P N1 DA 3 P DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 O O4 DT 22 O DT 28 1_555 P N6 DA 3 P DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 1 n n PB O2B ADP sing 2 n n PB O3B ADP sing 3 n n PB O3A ADP sing 4 n n O2B HOB2 ADP sing 5 n n O3B HOB3 ADP sing 6 n n PA O1A ADP doub 7 n n PA O2A ADP sing 8 n n PA O3A ADP sing 9 n n PA O5' ADP sing 10 n n O2A HOA2 ADP sing 11 n n O5' C5' ADP sing 12 n n C5' C4' ADP sing 13 n n C5' "H5'1" ADP sing 14 n n C5' "H5'2" ADP sing 15 n n C4' O4' ADP sing 16 n n C4' C3' ADP sing 17 n n C4' H4' ADP sing 18 n n O4' C1' ADP sing 19 n n C3' O3' ADP sing 20 n n C3' C2' ADP sing 21 n n C3' H3' ADP sing 22 n n O3' HO3' ADP sing 23 n n C2' O2' ADP sing 24 n n C2' C1' ADP sing 25 n n C2' H2' ADP sing 26 n n O2' HO2' ADP sing 27 n n C1' N9 ADP sing 28 n n C1' H1' ADP sing 29 n n N9 C8 ADP sing 30 n y N9 C4 ADP sing 31 n y C8 N7 ADP doub 32 n y C8 H8 ADP sing 33 n n N7 C5 ADP sing 34 n y C5 C6 ADP sing 35 n y C5 C4 ADP doub 36 n y C6 N6 ADP sing 37 n n C6 N1 ADP doub 38 n y N6 HN61 ADP sing 39 n n N6 HN62 ADP sing 40 n n N1 C2 ADP sing 41 n y C2 N3 ADP doub 42 n y C2 H2 ADP sing 43 n n N3 C4 ADP sing 44 n y # _atom_sites.entry_id 8UK9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010499 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004311 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003781 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 6 AF3 B 1 901 901 AF3 AF3 . V 7 ADP B 1 902 1001 ADP ADP . W 8 MG B 1 903 801 MG MG . X 8 MG C 1 401 800 MG MG . Y 6 AF3 C 1 402 901 AF3 AF3 . Z 7 ADP C 1 403 1001 ADP ADP . AA 8 MG D 1 401 800 MG MG . BA 6 AF3 D 1 402 901 AF3 AF3 . CA 7 ADP D 1 403 1001 ADP ADP . DA 7 ADP E 1 401 700 ADP ADP . EA 8 MG E 1 402 801 MG MG . FA 8 MG K 1 401 800 MG MG . GA 6 AF3 K 1 402 901 AF3 AF3 . HA 7 ADP K 1 403 1001 ADP ADP . IA 8 MG L 1 401 800 MG MG . JA 6 AF3 L 1 402 901 AF3 AF3 . KA 7 ADP L 1 403 1001 ADP ADP . LA 8 MG M 1 401 800 MG MG . MA 6 AF3 M 1 402 901 AF3 AF3 . NA 7 ADP M 1 403 1001 ADP ADP . OA 7 ADP N 1 401 700 ADP ADP . PA 8 MG N 1 402 801 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . KA 7 68.596 -20.348 -27.737 1 89.9 ? PB ADP 403 L 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . KA 7 68.703 -19.109 -28.593 1 90.03 ? O1B ADP 403 L 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . KA 7 67.666 -20.189 -26.556 1 89.04 ? O2B ADP 403 L 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . KA 7 69.923 -20.985 -27.401 1 89.69 -1 O3B ADP 403 L 1 HETATM 5 P PA ADP . . . KA 7 67.998 -23.006 -28.411 1 92.39 ? PA ADP 403 L 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . KA 7 69.446 -23.429 -28.455 1 92.35 -1 O1A ADP 403 L 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . KA 7 67.178 -23.285 -27.174 1 91.83 ? O2A ADP 403 L 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . KA 7 67.907 -21.427 -28.714 1 91.63 ? O3A ADP 403 L 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . KA 7 67.225 -23.631 -29.678 1 94.31 ? O5' ADP 403 L 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . KA 7 66.135 -24.522 -29.46 1 95.12 ? C5' ADP 403 L 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . KA 7 65.598 -25.056 -30.782 1 97.09 ? C4' ADP 403 L 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . KA 7 66.121 -24.325 -31.895 1 97.51 ? O4' ADP 403 L 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . KA 7 65.997 -26.506 -30.975 1 98.38 ? C3' ADP 403 L 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . KA 7 64.897 -27.362 -30.665 1 99.2 ? O3' ADP 403 L 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . KA 7 66.359 -26.626 -32.437 1 100.03 ? C2' ADP 403 L 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . KA 7 65.276 -27.238 -33.141 1 101.66 ? O2' ADP 403 L 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . KA 7 66.552 -25.206 -32.936 1 99.29 ? C1' ADP 403 L 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . KA 7 67.999 -24.966 -33.132 1 98.91 ? N9 ADP 403 L 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . KA 7 68.673 -23.954 -32.558 1 97.28 ? C8 ADP 403 L 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . KA 7 69.979 -23.978 -32.914 1 97.5 ? N7 ADP 403 L 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . KA 7 70.159 -25.024 -33.735 1 99.32 ? C5 ADP 403 L 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . KA 7 71.305 -25.61 -34.465 1 100.64 ? C6 ADP 403 L 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . KA 7 72.54 -25.06 -34.376 1 100.03 ? N6 ADP 403 L 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . KA 7 71.075 -26.707 -35.219 1 102.62 ? N1 ADP 403 L 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . KA 7 69.848 -27.255 -35.309 1 103.35 ? C2 ADP 403 L 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . KA 7 68.765 -26.774 -34.672 1 102.23 ? N3 ADP 403 L 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . KA 7 68.85 -25.676 -33.883 1 100.24 ? C4 ADP 403 L 1 # _model_server_stats.io_time_ms 55 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 72 _model_server_stats.query_time_ms 405 _model_server_stats.encode_time_ms 12 _model_server_stats.element_count 27 #