data_8UN7 # _model_server_result.job_id O5njq7sJcU5mo_j6Xj7Png _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 20:21:05' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8un7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":303}' # _entry.id 8UN7 # _exptl.entry_id 8UN7 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8UN7 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8UN7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 K N N ? 3 N N N ? 3 Q N N ? 3 T N N ? 3 W N N ? 3 Z N N ? 3 CA N N ? 3 FA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 21 A CYS 41 1_555 A SG CYS 50 A CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 179 A CYS 199 1_555 A SG CYS 192 A CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 21 D CYS 41 1_555 B SG CYS 50 D CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 179 D CYS 199 1_555 B SG CYS 192 D CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 21 B CYS 41 1_555 C SG CYS 50 B CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 179 B CYS 199 1_555 C SG CYS 192 B CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 21 E CYS 41 1_555 D SG CYS 50 E CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 179 E CYS 199 1_555 D SG CYS 192 E CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 21 C CYS 41 1_555 E SG CYS 50 C CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 E SG CYS 179 C CYS 199 1_555 E SG CYS 192 C CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 F SG CYS 21 F CYS 41 1_555 F SG CYS 50 F CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 F SG CYS 179 F CYS 199 1_555 F SG CYS 192 F CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 21 G CYS 41 1_555 G SG CYS 50 G CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 179 G CYS 199 1_555 G SG CYS 192 G CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 H SG CYS 21 H CYS 41 1_555 H SG CYS 50 H CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 H SG CYS 179 H CYS 199 1_555 H SG CYS 192 H CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 67 A ASN 87 1_555 I C1 NAG . A NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 117 A ASN 137 1_555 J C1 NAG . A NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale3 B ND2 ASN 67 D ASN 87 1_555 L C1 NAG . D NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale4 B ND2 ASN 117 D ASN 137 1_555 M C1 NAG . D NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 67 B ASN 87 1_555 O C1 NAG . B NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 117 B ASN 137 1_555 P C1 NAG . B NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale7 D ND2 ASN 67 E ASN 87 1_555 R C1 NAG . E NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 D ND2 ASN 117 E ASN 137 1_555 S C1 NAG . E NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale9 E ND2 ASN 67 C ASN 87 1_555 U C1 NAG . C NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 E ND2 ASN 117 C ASN 137 1_555 V C1 NAG . C NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale11 F ND2 ASN 67 F ASN 87 1_555 X C1 NAG . F NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale12 F ND2 ASN 117 F ASN 137 1_555 Y C1 NAG . F NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale13 G ND2 ASN 67 G ASN 87 1_555 AA C1 NAG . G NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 G ND2 ASN 117 G ASN 137 1_555 BA C1 NAG . G NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale15 H ND2 ASN 67 H ASN 87 1_555 DA C1 NAG . H NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale16 H ND2 ASN 117 H ASN 137 1_555 EA C1 NAG . H NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? metalc ? metalc1 A OG SER 166 A SER 186 1_555 K CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc2 A O THR 167 A THR 187 1_555 K CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 171 A ASP 191 1_555 K CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLN 172 A GLN 192 1_555 K CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc5 B OG SER 166 D SER 186 1_555 N CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc6 B O THR 167 D THR 187 1_555 N CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 171 D ASP 191 1_555 N CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc8 B OE1 GLN 172 D GLN 192 1_555 N CA CA . D CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? metalc ? metalc9 C OG SER 166 B SER 186 1_555 Q CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc10 C O THR 167 B THR 187 1_555 Q CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc11 C OD1 ASP 171 B ASP 191 1_555 Q CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc12 C OE1 GLN 172 B GLN 192 1_555 Q CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc13 D OG SER 166 E SER 186 1_555 T CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc14 D O THR 167 E THR 187 1_555 T CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc15 D OD1 ASP 171 E ASP 191 1_555 T CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc16 D OE1 GLN 172 E GLN 192 1_555 T CA CA . E CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? metalc ? metalc17 E OG SER 166 C SER 186 1_555 W CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc18 E O THR 167 C THR 187 1_555 W CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc19 E OD1 ASP 171 C ASP 191 1_555 W CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc20 E OE1 GLN 172 C GLN 192 1_555 W CA CA . C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc21 F OG SER 166 F SER 186 1_555 Z CA CA . F CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc22 F O THR 167 F THR 187 1_555 Z CA CA . F CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc23 F OD1 ASP 171 F ASP 191 1_555 Z CA CA . F CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc24 F OE1 GLN 172 F GLN 192 1_555 Z CA CA . F CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? metalc ? metalc25 G OG SER 166 G SER 186 1_555 CA CA CA . G CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc26 G O THR 167 G THR 187 1_555 CA CA CA . G CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc27 G OD1 ASP 171 G ASP 191 1_555 CA CA CA . G CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 ? metalc ? metalc28 G OE1 GLN 172 G GLN 192 1_555 CA CA CA . G CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc29 H OG SER 166 H SER 186 1_555 FA CA CA . H CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc30 H O THR 167 H THR 187 1_555 FA CA CA . H CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc31 H OD1 ASP 171 H ASP 191 1_555 FA CA CA . H CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc32 H OE1 GLN 172 H GLN 192 1_555 FA CA CA . H CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8UN7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 2 NAG A 1 301 256 NAG NAG . J 2 NAG A 1 302 257 NAG NAG . K 3 CA A 1 303 258 CA CA . L 2 NAG D 1 301 256 NAG NAG . M 2 NAG D 1 302 257 NAG NAG . N 3 CA D 1 303 258 CA CA . O 2 NAG B 1 301 256 NAG NAG . P 2 NAG B 1 302 257 NAG NAG . Q 3 CA B 1 303 258 CA CA . R 2 NAG E 1 301 256 NAG NAG . S 2 NAG E 1 302 257 NAG NAG . T 3 CA E 1 303 258 CA CA . U 2 NAG C 1 301 256 NAG NAG . V 2 NAG C 1 302 257 NAG NAG . W 3 CA C 1 303 258 CA CA . X 2 NAG F 1 301 256 NAG NAG . Y 2 NAG F 1 302 257 NAG NAG . Z 3 CA F 1 303 258 CA CA . AA 2 NAG G 1 301 256 NAG NAG . BA 2 NAG G 1 302 257 NAG NAG . CA 3 CA G 1 303 258 CA CA . DA 2 NAG H 1 301 256 NAG NAG . EA 2 NAG H 1 302 257 NAG NAG . FA 3 CA H 1 303 258 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id N _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 148.311 _atom_site.Cartn_y 156.386 _atom_site.Cartn_z 142.035 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 85.08 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 303 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 31 _model_server_stats.query_time_ms 326 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #