data_8UTU
#
_model_server_result.job_id            Grrf2rwE39KqBDpTn6_3aw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 13:32:36' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8utu 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    8UTU 
#
_exptl.entry_id    8UTU 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 G N N 
? 6 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG SER 104 K SER 104 1_555 E MG MG . K MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? 
metalc ? metalc2 A OG SER 215 K SER 215 1_555 E MG MG . K MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc3 E MG MG . K MG 501 1_555 F O2B ANP . K ANP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc4 E MG MG . K MG 501 1_555 F O3G ANP . K ANP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
metalc ? metalc5 B OE2 GLU 71 A GLU 71 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc6 G O1G GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc7 G O1B GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? 
metalc ? metalc8 D OE1 GLU 71 E GLU 71 1_555 L MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? 
metalc ? metalc9 K O1G GTP . E GTP 501 1_555 L MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc10 K O2G GTP . E GTP 501 1_555 L MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? 
metalc ? metalc11 K O3B GTP . E GTP 501 1_555 L MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc12 K O1B GTP . E GTP 501 1_555 L MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 224 n n 
PG O2G GTP sing 225 n n 
PG O3G GTP sing 226 n n 
PG O3B GTP sing 227 n n 
O2G HOG2 GTP sing 228 n n 
O3G HOG3 GTP sing 229 n n 
O3B PB GTP sing 230 n n 
PB O1B GTP doub 231 n n 
PB O2B GTP sing 232 n n 
PB O3A GTP sing 233 n n 
O2B HOB2 GTP sing 234 n n 
O3A PA GTP sing 235 n n 
PA O1A GTP doub 236 n n 
PA O2A GTP sing 237 n n 
PA O5' GTP sing 238 n n 
O2A HOA2 GTP sing 239 n n 
O5' C5' GTP sing 240 n n 
C5' C4' GTP sing 241 n n 
C5' H5' GTP sing 242 n n 
C5' "H5''" GTP sing 243 n n 
C4' O4' GTP sing 244 n n 
C4' C3' GTP sing 245 n n 
C4' H4' GTP sing 246 n n 
O4' C1' GTP sing 247 n n 
C3' O3' GTP sing 248 n n 
C3' C2' GTP sing 249 n n 
C3' H3' GTP sing 250 n n 
O3' HO3' GTP sing 251 n n 
C2' O2' GTP sing 252 n n 
C2' C1' GTP sing 253 n n 
C2' H2' GTP sing 254 n n 
O2' HO2' GTP sing 255 n n 
C1' N9 GTP sing 256 n n 
C1' H1' GTP sing 257 n n 
N9 C8 GTP sing 258 n y 
N9 C4 GTP sing 259 n y 
C8 N7 GTP doub 260 n y 
C8 H8 GTP sing 261 n n 
N7 C5 GTP sing 262 n y 
C5 C6 GTP sing 263 n n 
C5 C4 GTP doub 264 n y 
C6 O6 GTP doub 265 n n 
C6 N1 GTP sing 266 n n 
N1 C2 GTP sing 267 n n 
N1 HN1 GTP sing 268 n n 
C2 N2 GTP sing 269 n n 
C2 N3 GTP doub 270 n n 
N2 HN21 GTP sing 271 n n 
N2 HN22 GTP sing 272 n n 
N3 C4 GTP sing 273 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8UTU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 4 MG K 1 501 501 MG MG . 
F 5 ANP K 1 502 502 ANP ANP . 
G 6 GTP A 1 501 501 GTP GTP . 
H 4 MG A 1 502 502 MG MG . 
I 7 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
J 8 TA1 B 1 502 502 TA1 TA1 . 
K 6 GTP E 1 501 501 GTP GTP . 
L 4 MG E 1 502 502 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . K 6 169.826 184.301 211.697 1 77.52 ? PG GTP 501 E 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . K 6 169.591 185.331 212.773 1 72.61 ? O1G GTP 501 E 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . K 6 169.159 183.005 212.081 1 77.19 ? O2G GTP 501 E 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . K 6 171.307 184.074 211.528 1 76.87 ? O3G GTP 501 E 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . K 6 169.189 184.845 210.323 1 56.9 ? O3B GTP 501 E 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . K 6 169.275 186.409 209.956 1 66.65 ? PB GTP 501 E 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . K 6 168.721 187.236 211.092 1 69.28 ? O1B GTP 501 E 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . K 6 168.531 186.688 208.673 1 77.78 ? O2B GTP 501 E 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . K 6 170.847 186.696 209.771 1 55.04 ? O3A GTP 501 E 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . K 6 171.375 187.29 208.374 1 69.27 ? PA GTP 501 E 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . K 6 170.848 186.445 207.242 1 76.1 ? O1A GTP 501 E 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . K 6 170.948 188.728 208.22 1 69.96 ? O2A GTP 501 E 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . K 6 172.979 187.182 208.444 1 69.07 ? O5' GTP 501 E 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . K 6 173.778 188.172 209.05 1 61.97 ? C5' GTP 501 E 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . K 6 174.68 188.806 207.996 1 62.93 ? C4' GTP 501 E 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . K 6 173.901 189.379 206.968 1 73.68 ? O4' GTP 501 E 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . K 6 175.537 189.924 208.559 1 62.59 ? C3' GTP 501 E 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . K 6 176.854 189.485 208.797 1 71.19 ? O3' GTP 501 E 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . K 6 175.52 191.016 207.511 1 65.58 ? C2' GTP 501 E 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . K 6 176.812 191.19 206.969 1 69 ? O2' GTP 501 E 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . K 6 174.484 190.575 206.485 1 72.84 ? C1' GTP 501 E 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . K 6 173.436 191.6 206.35 1 67.11 ? N9 GTP 501 E 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . K 6 172.378 191.77 207.2 1 64.05 ? C8 GTP 501 E 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . K 6 171.628 192.798 206.748 1 63.31 ? N7 GTP 501 E 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . K 6 172.186 193.281 205.62 1 52.99 ? C5 GTP 501 E 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . K 6 171.822 194.314 204.771 1 54.15 ? C6 GTP 501 E 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . K 6 170.816 194.978 205.003 1 66.4 ? O6 GTP 501 E 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . K 6 172.593 194.595 203.667 1 62.18 ? N1 GTP 501 E 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . K 6 173.721 193.847 203.414 1 66.59 ? C2 GTP 501 E 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . K 6 174.466 194.119 202.347 1 70.76 ? N2 GTP 501 E 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . K 6 174.078 192.82 204.263 1 69.99 ? N3 GTP 501 E 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . K 6 173.323 192.537 205.352 1 61.86 ? C4 GTP 501 E 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              22 
_model_server_stats.parse_time_ms           14 
_model_server_stats.create_model_time_ms    19 
_model_server_stats.query_time_ms           445 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           32 
#