data_8VK4 # _model_server_result.job_id btdMvqHV25a-iUa1vsK5eg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 11:44:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8vk4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":8006}' # _entry.id 8VK4 # _exptl.entry_id 8VK4 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 787.121 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8VK4 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8VK4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 16-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 Z N N ? 8 AA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 VA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 G SG CYS 3171 D CYS 3171 1_555 G SG CYS 3241 D CYS 3241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf2 G SG CYS 4874 D CYS 4874 1_555 G SG CYS 4880 D CYS 4880 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 H SG CYS 3171 A CYS 3171 1_555 H SG CYS 3241 A CYS 3241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf4 H SG CYS 4874 A CYS 4874 1_555 H SG CYS 4880 A CYS 4880 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 I SG CYS 3171 B CYS 3171 1_555 I SG CYS 3241 B CYS 3241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf6 I SG CYS 4874 B CYS 4874 1_555 I SG CYS 4880 B CYS 4880 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf7 J SG CYS 3171 C CYS 3171 1_555 J SG CYS 3241 C CYS 3241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf8 J SG CYS 4874 C CYS 4874 1_555 J SG CYS 4880 C CYS 4880 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc1 B O ASP 25 I ASP 25 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc2 B OD1 ASP 25 I ASP 25 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc3 B OD2 ASP 25 I ASP 25 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc4 B O LYS 28 I LYS 28 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc5 B OE1 GLU 33 I GLU 33 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc6 B OE2 GLU 33 I GLU 33 1_555 Q CA CA . I CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 63 I ASP 63 1_555 R CA CA . I CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc8 B OD1 ASP 67 I ASP 67 1_555 R CA CA . I CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? metalc ? metalc9 B O GLU 69 I GLU 69 1_555 R CA CA . I CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.095 ? metalc ? metalc10 B OE1 GLU 74 I GLU 74 1_555 R CA CA . I CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc11 C O SER 20 J SER 20 1_555 S CA CA . J CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc12 C O ASP 25 J ASP 25 1_555 S CA CA . J CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc13 C O LYS 28 J LYS 28 1_555 S CA CA . J CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc14 C OE1 GLU 33 J GLU 33 1_555 S CA CA . J CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc15 C OD1 ASP 63 J ASP 63 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc16 C OD1 ASN 65 J ASN 65 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc17 C OD1 ASP 67 J ASP 67 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc18 C OD2 ASP 67 J ASP 67 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc19 C O GLU 69 J GLU 69 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc20 C OE1 GLU 74 J GLU 74 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? metalc ? metalc21 C OE2 GLU 74 J GLU 74 1_555 T CA CA . J CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc22 G OE1 GLU 3896 D GLU 3896 1_555 X CA CA . D CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc23 G OE2 GLU 3896 D GLU 3896 1_555 X CA CA . D CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc24 G OE2 GLU 3970 D GLU 3970 1_555 X CA CA . D CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc25 G SG CYS 4956 D CYS 4956 1_555 U ZN ZN . D ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc26 G SG CYS 4959 D CYS 4959 1_555 U ZN ZN . D ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc27 G NE2 HIS 4976 D HIS 4976 1_555 U ZN ZN . D ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? metalc ? metalc28 G ND1 HIS 4981 D HIS 4981 1_555 U ZN ZN . D ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc29 G O THR 4999 D THR 4999 1_555 X CA CA . D CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc30 H OE1 GLU 3896 A GLU 3896 1_555 EA CA CA . A CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc31 H OE2 GLU 3896 A GLU 3896 1_555 EA CA CA . A CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc32 H OE2 GLU 3970 A GLU 3970 1_555 EA CA CA . A CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc33 H SG CYS 4956 A CYS 4956 1_555 BA ZN ZN . A ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc34 H SG CYS 4959 A CYS 4959 1_555 BA ZN ZN . A ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc35 H NE2 HIS 4976 A HIS 4976 1_555 BA ZN ZN . A ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? metalc ? metalc36 H ND1 HIS 4981 A HIS 4981 1_555 BA ZN ZN . A ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc37 H O THR 4999 A THR 4999 1_555 EA CA CA . A CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc38 I OE1 GLU 3896 B GLU 3896 1_555 LA CA CA . B CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc39 I OE2 GLU 3896 B GLU 3896 1_555 LA CA CA . B CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc40 I OE2 GLU 3970 B GLU 3970 1_555 LA CA CA . B CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc41 I SG CYS 4956 B CYS 4956 1_555 IA ZN ZN . B ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc42 I SG CYS 4959 B CYS 4959 1_555 IA ZN ZN . B ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc43 I NE2 HIS 4976 B HIS 4976 1_555 IA ZN ZN . B ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? metalc ? metalc44 I ND1 HIS 4981 B HIS 4981 1_555 IA ZN ZN . B ZN 8001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc45 I O THR 4999 B THR 4999 1_555 LA CA CA . B CA 8004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc46 J OE1 GLU 3896 C GLU 3896 1_555 TA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc47 J OE2 GLU 3896 C GLU 3896 1_555 TA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc48 J OE2 GLU 3970 C GLU 3970 1_555 TA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc49 J SG CYS 4956 C CYS 4956 1_555 QA ZN ZN . C ZN 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc50 J SG CYS 4959 C CYS 4959 1_555 QA ZN ZN . C ZN 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc51 J NE2 HIS 4976 C HIS 4976 1_555 QA ZN ZN . C ZN 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? metalc ? metalc52 J ND1 HIS 4981 C HIS 4981 1_555 QA ZN ZN . C ZN 5102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? metalc ? metalc53 J O THR 4999 C THR 4999 1_555 TA CA CA . C CA 5105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc54 K O ASP 25 K ASP 25 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc55 K OD1 ASP 25 K ASP 25 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc56 K OD2 ASP 25 K ASP 25 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc57 K O LYS 28 K LYS 28 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc58 K OE1 GLU 33 K GLU 33 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc59 K OE2 GLU 33 K GLU 33 1_555 WA CA CA . K CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc60 K OD1 ASP 63 K ASP 63 1_555 XA CA CA . K CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc61 K OD1 ASP 67 K ASP 67 1_555 XA CA CA . K CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? metalc ? metalc62 K O GLU 69 K GLU 69 1_555 XA CA CA . K CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.095 ? metalc ? metalc63 K OE1 GLU 74 K GLU 74 1_555 XA CA CA . K CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc64 L O SER 20 L SER 20 1_555 YA CA CA . L CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc65 L O ASP 25 L ASP 25 1_555 YA CA CA . L CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc66 L O LYS 28 L LYS 28 1_555 YA CA CA . L CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc67 L OE1 GLU 33 L GLU 33 1_555 YA CA CA . L CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc68 L OD1 ASP 63 L ASP 63 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc69 L OD1 ASN 65 L ASN 65 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc70 L OD1 ASP 67 L ASP 67 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc71 L OD2 ASP 67 L ASP 67 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc72 L O GLU 69 L GLU 69 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc73 L OE1 GLU 74 L GLU 74 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc74 L OE2 GLU 74 L GLU 74 1_555 ZA CA CA . L CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc75 M O SER 20 N SER 20 1_555 AB CA CA . N CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc76 M O ASP 25 N ASP 25 1_555 AB CA CA . N CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc77 M O LYS 28 N LYS 28 1_555 AB CA CA . N CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc78 M OE1 GLU 33 N GLU 33 1_555 AB CA CA . N CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc79 M OD1 ASP 63 N ASP 63 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc80 M OD1 ASN 65 N ASN 65 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc81 M OD1 ASP 67 N ASP 67 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc82 M OD2 ASP 67 N ASP 67 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc83 M O GLU 69 N GLU 69 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc84 M OE1 GLU 74 N GLU 74 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? metalc ? metalc85 M OE2 GLU 74 N GLU 74 1_555 BB CA CA . N CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? metalc ? metalc86 N O ASP 25 M ASP 25 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc87 N OD1 ASP 25 M ASP 25 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc88 N OD2 ASP 25 M ASP 25 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc89 N O LYS 28 M LYS 28 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc90 N OE1 GLU 33 M GLU 33 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc91 N OE2 GLU 33 M GLU 33 1_555 CB CA CA . M CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc92 N OD1 ASP 63 M ASP 63 1_555 DB CA CA . M CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc93 N OD1 ASP 67 M ASP 67 1_555 DB CA CA . M CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? metalc ? metalc94 N O GLU 69 M GLU 69 1_555 DB CA CA . M CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.095 ? metalc ? metalc95 N OE1 GLU 74 M GLU 74 1_555 DB CA CA . M CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc96 O O ASP 25 O ASP 25 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc97 O OD1 ASP 25 O ASP 25 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc98 O OD2 ASP 25 O ASP 25 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc99 O O LYS 28 O LYS 28 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc100 O OE1 GLU 33 O GLU 33 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc101 O OE2 GLU 33 O GLU 33 1_555 EB CA CA . O CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc102 O OD1 ASP 63 O ASP 63 1_555 FB CA CA . O CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc103 O OD1 ASP 67 O ASP 67 1_555 FB CA CA . O CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? metalc ? metalc104 O O GLU 69 O GLU 69 1_555 FB CA CA . O CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.095 ? metalc ? metalc105 O OE1 GLU 74 O GLU 74 1_555 FB CA CA . O CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc106 P O SER 20 P SER 20 1_555 GB CA CA . P CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc107 P O ASP 25 P ASP 25 1_555 GB CA CA . P CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc108 P O LYS 28 P LYS 28 1_555 GB CA CA . P CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc109 P OE1 GLU 33 P GLU 33 1_555 GB CA CA . P CA 7001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc110 P OD1 ASP 63 P ASP 63 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc111 P OD1 ASN 65 P ASN 65 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc112 P OD1 ASP 67 P ASP 67 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc113 P OD2 ASP 67 P ASP 67 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc114 P O GLU 69 P GLU 69 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc115 P OE1 GLU 74 P GLU 74 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc116 P OE2 GLU 74 P GLU 74 1_555 HB CA CA . P CA 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? # _chem_comp.formula 'C44 H85 N O8 P 1' _chem_comp.formula_weight 787.121 _chem_comp.id PCW _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms (Z,Z)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-7-[(1-OXO-9-OCTADECENYL)OXY]-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOS-18-EN-1-AMINIUM-4-OXIDE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 PCW sing 309 n n C1 O3P PCW sing 310 n n C1 H11 PCW sing 311 n n C1 H12 PCW sing 312 n n C2 C3 PCW sing 313 n n C2 O2 PCW sing 314 n n C2 H2 PCW sing 315 n n C3 O3 PCW sing 316 n n C3 H31 PCW sing 317 n n C3 H32 PCW sing 318 n n C4 C5 PCW sing 319 n n C4 O4P PCW sing 320 n n C4 H41 PCW sing 321 n n C4 H42 PCW sing 322 n n C5 N PCW sing 323 n n C5 H51 PCW sing 324 n n C5 H52 PCW sing 325 n n C6 N PCW sing 326 n n C6 H61 PCW sing 327 n n C6 H62 PCW sing 328 n n C6 H63 PCW sing 329 n n C7 N PCW sing 330 n n C7 H71 PCW sing 331 n n C7 H72 PCW sing 332 n n C7 H73 PCW sing 333 n n C8 N PCW sing 334 n n C8 H81 PCW sing 335 n n C8 H82 PCW sing 336 n n C8 H83 PCW sing 337 n n C11 C12 PCW sing 338 n n C11 O3 PCW sing 339 n n C11 O11 PCW doub 340 n n C12 C13 PCW sing 341 n n C12 H121 PCW sing 342 n n C12 H122 PCW sing 343 n n C13 C14 PCW sing 344 n n C13 H131 PCW sing 345 n n C13 H132 PCW sing 346 n n C14 C15 PCW sing 347 n n C14 H141 PCW sing 348 n n C14 H142 PCW sing 349 n n C15 C16 PCW sing 350 n n C15 H151 PCW sing 351 n n C15 H152 PCW sing 352 n n C16 C17 PCW sing 353 n n C16 H161 PCW sing 354 n n C16 H162 PCW sing 355 n n C17 C18 PCW sing 356 n n C17 H171 PCW sing 357 n n C17 H172 PCW sing 358 n n C18 C19 PCW sing 359 n n C18 H181 PCW sing 360 n n C18 H182 PCW sing 361 n n C19 C20 PCW doub 362 z n C19 H19 PCW sing 363 n n C20 C21 PCW sing 364 n n C20 H20 PCW sing 365 n n C21 C22 PCW sing 366 n n C21 H211 PCW sing 367 n n C21 H212 PCW sing 368 n n C22 C23 PCW sing 369 n n C22 H221 PCW sing 370 n n C22 H222 PCW sing 371 n n C23 C24 PCW sing 372 n n C23 H231 PCW sing 373 n n C23 H232 PCW sing 374 n n C24 C25 PCW sing 375 n n C24 H241 PCW sing 376 n n C24 H242 PCW sing 377 n n C25 C26 PCW sing 378 n n C25 H251 PCW sing 379 n n C25 H252 PCW sing 380 n n C26 C27 PCW sing 381 n n C26 H261 PCW sing 382 n n C26 H262 PCW sing 383 n n C27 C28 PCW sing 384 n n C27 H271 PCW sing 385 n n C27 H272 PCW sing 386 n n C28 H281 PCW sing 387 n n C28 H282 PCW sing 388 n n C28 H283 PCW sing 389 n n C31 C32 PCW sing 390 n n C31 O2 PCW sing 391 n n C31 O31 PCW doub 392 n n C32 C33 PCW sing 393 n n C32 H321 PCW sing 394 n n C32 H322 PCW sing 395 n n C33 C34 PCW sing 396 n n C33 H331 PCW sing 397 n n C33 H332 PCW sing 398 n n C34 C35 PCW sing 399 n n C34 H341 PCW sing 400 n n C34 H342 PCW sing 401 n n C35 C36 PCW sing 402 n n C35 H351 PCW sing 403 n n C35 H352 PCW sing 404 n n C36 C37 PCW sing 405 n n C36 H361 PCW sing 406 n n C36 H362 PCW sing 407 n n C37 C38 PCW sing 408 n n C37 H371 PCW sing 409 n n C37 H372 PCW sing 410 n n C38 C39 PCW sing 411 n n C38 H381 PCW sing 412 n n C38 H382 PCW sing 413 n n C39 C40 PCW doub 414 z n C39 H39 PCW sing 415 n n C40 C41 PCW sing 416 n n C40 H40 PCW sing 417 n n C41 C42 PCW sing 418 n n C41 H411 PCW sing 419 n n C41 H412 PCW sing 420 n n C42 C43 PCW sing 421 n n C42 H421 PCW sing 422 n n C42 H422 PCW sing 423 n n C43 C44 PCW sing 424 n n C43 H431 PCW sing 425 n n C43 H432 PCW sing 426 n n C44 C45 PCW sing 427 n n C44 H441 PCW sing 428 n n C44 H442 PCW sing 429 n n C45 C46 PCW sing 430 n n C45 H451 PCW sing 431 n n C45 H452 PCW sing 432 n n C46 C47 PCW sing 433 n n C46 H461 PCW sing 434 n n C46 H462 PCW sing 435 n n C47 C48 PCW sing 436 n n C47 H471 PCW sing 437 n n C47 H472 PCW sing 438 n n C48 H481 PCW sing 439 n n C48 H482 PCW sing 440 n n C48 H483 PCW sing 441 n n O1P P PCW sing 442 n n O1P H1P PCW sing 443 n n O2P P PCW doub 444 n n O3P P PCW sing 445 n n O4P P PCW sing 446 n n # _atom_sites.entry_id 8VK4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 4 CA I 1 7001 7001 CA CA . R 4 CA I 1 7002 7002 CA CA . S 4 CA J 1 7001 7001 CA CA . T 4 CA J 1 7002 7002 CA CA . U 5 ZN D 1 8001 8001 ZN ZN . V 6 CFF D 1 8002 8002 CFF CFF . W 7 ATP D 1 8003 8003 ATP ATP . X 4 CA D 1 8004 8004 CA CA . Y 7 ATP D 1 8005 8005 ATP ATP . Z 8 PCW D 1 8006 8007 PCW PCW . AA 8 PCW D 1 8007 8008 PCW PCW . BA 5 ZN A 1 8001 8001 ZN ZN . CA 6 CFF A 1 8002 8002 CFF CFF . DA 7 ATP A 1 8003 8003 ATP ATP . EA 4 CA A 1 8004 8004 CA CA . FA 7 ATP A 1 8005 8005 ATP ATP . GA 8 PCW A 1 8006 8007 PCW PCW . HA 8 PCW A 1 8007 8008 PCW PCW . IA 5 ZN B 1 8001 8001 ZN ZN . JA 6 CFF B 1 8002 8002 CFF CFF . KA 7 ATP B 1 8003 8003 ATP ATP . LA 4 CA B 1 8004 8004 CA CA . MA 7 ATP B 1 8005 8005 ATP ATP . NA 8 PCW B 1 8006 8007 PCW PCW . OA 8 PCW B 1 8007 8008 PCW PCW . PA 8 PCW C 1 5101 8008 PCW PCW . QA 5 ZN C 1 5102 8001 ZN ZN . RA 6 CFF C 1 5103 8002 CFF CFF . SA 7 ATP C 1 5104 8003 ATP ATP . TA 4 CA C 1 5105 8004 CA CA . UA 7 ATP C 1 5106 8005 ATP ATP . VA 8 PCW C 1 5107 8007 PCW PCW . WA 4 CA K 1 7001 7001 CA CA . XA 4 CA K 1 7002 7002 CA CA . YA 4 CA L 1 7001 7001 CA CA . ZA 4 CA L 1 7002 7002 CA CA . AB 4 CA N 1 7001 7001 CA CA . BB 4 CA N 1 7002 7002 CA CA . CB 4 CA M 1 7001 7001 CA CA . DB 4 CA M 1 7002 7002 CA CA . EB 4 CA O 1 7001 7001 CA CA . FB 4 CA O 1 7002 7002 CA CA . GB 4 CA P 1 7001 7001 CA CA . HB 4 CA P 1 7002 7002 CA CA . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 PCW . . . Z 8 207.546 246.035 122.61 1 106.01 ? C1 PCW 8006 D 1 HETATM 2 C C2 PCW . . . Z 8 207.623 245.57 124.07 1 106.01 ? C2 PCW 8006 D 1 HETATM 3 C C3 PCW . . . Z 8 208.956 244.851 124.289 1 106.01 ? C3 PCW 8006 D 1 HETATM 4 C C4 PCW . . . Z 8 203.212 245.337 122.832 1 106.01 ? C4 PCW 8006 D 1 HETATM 5 C C5 PCW . . . Z 8 201.649 245.219 122.737 1 106.01 ? C5 PCW 8006 D 1 HETATM 6 C C6 PCW . . . Z 8 201.633 243.141 123.713 1 106.01 ? C6 PCW 8006 D 1 HETATM 7 C C7 PCW . . . Z 8 199.873 243.08 122.357 1 106.01 ? C7 PCW 8006 D 1 HETATM 8 C C8 PCW . . . Z 8 201.423 243.803 120.999 1 106.01 ? C8 PCW 8006 D 1 HETATM 9 C C11 PCW . . . Z 8 208.82 242.845 125.627 1 106.01 ? C11 PCW 8006 D 1 HETATM 10 C C12 PCW . . . Z 8 208.57 241.325 125.76 1 106.01 ? C12 PCW 8006 D 1 HETATM 11 C C13 PCW . . . Z 8 208.385 240.928 127.253 1 106.01 ? C13 PCW 8006 D 1 HETATM 12 C C14 PCW . . . Z 8 208.668 239.404 127.392 1 106.01 ? C14 PCW 8006 D 1 HETATM 13 C C15 PCW . . . Z 8 208.702 238.984 128.892 1 106.01 ? C15 PCW 8006 D 1 HETATM 14 C C16 PCW . . . Z 8 209.563 237.684 129.024 1 106.01 ? C16 PCW 8006 D 1 HETATM 15 C C17 PCW . . . Z 8 208.922 236.714 130.062 1 106.01 ? C17 PCW 8006 D 1 HETATM 16 C C18 PCW . . . Z 8 209.747 236.682 131.384 1 106.01 ? C18 PCW 8006 D 1 HETATM 17 C C19 PCW . . . Z 8 209.088 235.626 132.297 1 106.01 ? C19 PCW 8006 D 1 HETATM 18 C C20 PCW . . . Z 8 207.763 235.414 132.394 1 106.01 ? C20 PCW 8006 D 1 HETATM 19 C C21 PCW . . . Z 8 206.482 234.704 132.942 1 106.01 ? C21 PCW 8006 D 1 HETATM 20 C C22 PCW . . . Z 8 206.464 234.677 134.494 1 106.01 ? C22 PCW 8006 D 1 HETATM 21 C C23 PCW . . . Z 8 204.991 234.49 134.968 1 106.01 ? C23 PCW 8006 D 1 HETATM 22 C C24 PCW . . . Z 8 204.952 233.56 136.213 1 106.01 ? C24 PCW 8006 D 1 HETATM 23 C C25 PCW . . . Z 8 205.553 234.32 137.431 1 106.01 ? C25 PCW 8006 D 1 HETATM 24 C C26 PCW . . . Z 8 206.427 233.365 138.286 1 106.01 ? C26 PCW 8006 D 1 HETATM 25 C C27 PCW . . . Z 8 205.603 232.121 138.706 1 106.01 ? C27 PCW 8006 D 1 HETATM 26 C C28 PCW . . . Z 8 205.822 231.863 140.213 1 106.01 ? C28 PCW 8006 D 1 HETATM 27 C C31 PCW . . . Z 8 206.651 246.554 126.008 1 106.01 ? C31 PCW 8006 D 1 HETATM 28 C C32 PCW . . . Z 8 207.035 247.157 127.386 1 106.01 ? C32 PCW 8006 D 1 HETATM 29 C C33 PCW . . . Z 8 206.833 246.145 128.546 1 106.01 ? C33 PCW 8006 D 1 HETATM 30 C C34 PCW . . . Z 8 205.372 245.626 128.631 1 106.01 ? C34 PCW 8006 D 1 HETATM 31 C C35 PCW . . . Z 8 205.187 244.851 129.958 1 106.01 ? C35 PCW 8006 D 1 HETATM 32 C C36 PCW . . . Z 8 205.553 243.362 129.727 1 106.01 ? C36 PCW 8006 D 1 HETATM 33 C C37 PCW . . . Z 8 205.223 242.536 130.99 1 106.01 ? C37 PCW 8006 D 1 HETATM 34 C C38 PCW . . . Z 8 205.828 241.121 130.849 1 106.01 ? C38 PCW 8006 D 1 HETATM 35 C C39 PCW . . . Z 8 205.787 240.427 132.22 1 106.01 ? C39 PCW 8006 D 1 HETATM 36 C C40 PCW . . . Z 8 206.918 240.038 132.796 1 106.01 ? C40 PCW 8006 D 1 HETATM 37 C C41 PCW . . . Z 8 206.888 239.347 134.172 1 106.01 ? C41 PCW 8006 D 1 HETATM 38 C C42 PCW . . . Z 8 207.954 240.021 135.074 1 106.01 ? C42 PCW 8006 D 1 HETATM 39 C C43 PCW . . . Z 8 208.72 238.935 135.879 1 106.01 ? C43 PCW 8006 D 1 HETATM 40 C C44 PCW . . . Z 8 209.753 238.229 134.949 1 106.01 ? C44 PCW 8006 D 1 HETATM 41 C C45 PCW . . . Z 8 210.946 237.67 135.781 1 106.01 ? C45 PCW 8006 D 1 HETATM 42 C C46 PCW . . . Z 8 210.966 236.115 135.735 1 106.01 ? C46 PCW 8006 D 1 HETATM 43 C C47 PCW . . . Z 8 210.033 235.549 136.839 1 106.01 ? C47 PCW 8006 D 1 HETATM 44 C C48 PCW . . . Z 8 210.74 235.64 138.212 1 106.01 ? C48 PCW 8006 D 1 HETATM 45 N N PCW . . . Z 8 201.165 243.825 122.465 1 106.01 ? N PCW 8006 D 1 HETATM 46 O O2 PCW . . . Z 8 207.557 246.677 124.922 1 106.01 ? O2 PCW 8006 D 1 HETATM 47 O O3 PCW . . . Z 8 208.737 243.451 124.347 1 106.01 ? O3 PCW 8006 D 1 HETATM 48 O O11 PCW . . . Z 8 209.092 243.483 126.591 1 106.01 ? O11 PCW 8006 D 1 HETATM 49 O O31 PCW . . . Z 8 205.61 246.004 125.856 1 106.01 ? O31 PCW 8006 D 1 HETATM 50 O O1P PCW . . . Z 8 205.589 244.281 121.286 1 106.01 ? O1P PCW 8006 D 1 HETATM 51 O O2P PCW . . . Z 8 205.539 246.299 119.86 1 106.01 ? O2P PCW 8006 D 1 HETATM 52 O O3P PCW . . . Z 8 206.261 246.553 122.351 1 106.01 ? O3P PCW 8006 D 1 HETATM 53 O O4P PCW . . . Z 8 203.698 246.018 121.683 1 106.01 ? O4P PCW 8006 D 1 HETATM 54 P P PCW . . . Z 8 205.289 245.761 121.253 1 106.01 ? P PCW 8006 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 59 _model_server_stats.parse_time_ms 173 _model_server_stats.create_model_time_ms 395 _model_server_stats.query_time_ms 326 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 54 #