data_8W0G
#
_model_server_result.job_id            Ov3I9t2vfm1vjYk2BJXg1A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-13 08:02:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8w0g 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"EA","auth_seq_id":1001}' 
#
_entry.id    8W0G 
#
_exptl.entry_id    8W0G 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8W0G 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8W0G 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    12-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 N N N 
? 8 P N N 
? 8 S N N 
? 8 U N N 
? 8 Z N N 
? 8 CA N N 
? 8 EA N N 
? 8 HA N N 
? 8 LA N N 
? 8 OA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 L SG CYS 184 F CYS 184 1_555 L SG CYS 206 F CYS 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 329 2 CYS 329 1_555 M ZN ZN . 2 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 352 2 CYS 352 1_555 M ZN ZN . 2 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 355 2 CYS 355 1_555 M ZN ZN . 2 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc4 A OG SER 530 2 SER 530 1_555 N MG MG . 2 MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc5 N MG MG . 2 MG 1001 1_555 O O1B ATP . 2 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.828 ? 
metalc ? metalc6 N MG MG . 2 MG 1001 1_555 O O2G ATP . 2 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? 
metalc ? metalc7 B OG SER 354 3 SER 352 1_555 P MG MG . 3 MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.872 ? 
metalc ? metalc8 P MG MG . 3 MG 1001 1_555 Q O2B ADP . 3 ADP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc9 P MG MG . 3 MG 1001 1_555 Q O3B ADP . 3 ADP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? 
metalc ? metalc10 C SG CYS 309 4 CYS 306 1_555 R ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 312 4 CYS 309 1_555 R ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc12 C SG CYS 331 4 CYS 328 1_555 R ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 334 4 CYS 331 1_555 R ZN ZN . 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc14 C OG SER 520 4 SER 517 1_555 S MG MG . 4 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.732 ? 
metalc ? metalc15 S MG MG . 4 MG 902 1_555 T O1B ATP . 4 ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc16 S MG MG . 4 MG 902 1_555 T O3B ATP . 4 ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? 
metalc ? metalc17 S MG MG . 4 MG 902 1_555 T O3G ATP . 4 ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.854 ? 
metalc ? metalc18 U MG MG . 4 MG 904 1_555 E OG SER 403 6 SER 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? 
metalc ? metalc19 U MG MG . 4 MG 904 1_555 X O2G ATP . 6 ATP 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc20 U MG MG . 4 MG 904 1_555 X O1B ATP . 6 ATP 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc21 D SG CYS 172 5 CYS 172 1_555 V ZN ZN . 5 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc22 D SG CYS 175 5 CYS 175 1_555 V ZN ZN . 5 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc23 D SG CYS 197 5 CYS 197 1_555 V ZN ZN . 5 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc24 E SG CYS 158 6 CYS 158 1_555 W ZN ZN . 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc25 E SG CYS 161 6 CYS 161 1_555 W ZN ZN . 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc26 E SG CYS 180 6 CYS 180 1_555 W ZN ZN . 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc27 E SG CYS 185 6 CYS 185 1_555 W ZN ZN . 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc28 F SG CYS 184 7 CYS 184 1_555 Y ZN ZN . 7 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc29 F SG CYS 187 7 CYS 187 1_555 Y ZN ZN . 7 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc30 F SG CYS 206 7 CYS 206 1_555 Y ZN ZN . 7 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc31 F SG CYS 211 7 CYS 211 1_555 Y ZN ZN . 7 ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc32 F OG SER 388 7 SER 388 1_555 Z MG MG . 7 MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.81 ? 
metalc ? metalc33 Z MG MG . 7 MG 1001 1_555 AA O2G ATP . 7 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc34 Z MG MG . 7 MG 1001 1_555 AA O1B ATP . 7 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? 
metalc ? metalc35 Z MG MG . 7 MG 1001 1_555 AA O3B ATP . 7 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc36 Z MG MG . 7 MG 1001 1_555 AA O1G ATP . 7 ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc37 G SG CYS 329 A CYS 329 1_555 BA ZN ZN . A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc38 G SG CYS 352 A CYS 352 1_555 BA ZN ZN . A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc39 G SG CYS 355 A CYS 355 1_555 BA ZN ZN . A ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc40 G OG SER 530 A SER 530 1_555 CA MG MG . A MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc41 CA MG MG . A MG 1001 1_555 DA O2G ATP . A ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? 
metalc ? metalc42 CA MG MG . A MG 1001 1_555 DA O1B ATP . A ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.827 ? 
metalc ? metalc43 H OG SER 354 B SER 352 1_555 EA MG MG . B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? 
metalc ? metalc44 EA MG MG . B MG 1001 1_555 FA O2B ADP . B ADP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc45 EA MG MG . B MG 1001 1_555 FA O3B ADP . B ADP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? 
metalc ? metalc46 I SG CYS 309 C CYS 306 1_555 GA ZN ZN . C ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc47 I SG CYS 312 C CYS 309 1_555 GA ZN ZN . C ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc48 I SG CYS 331 C CYS 328 1_555 GA ZN ZN . C ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc49 I SG CYS 334 C CYS 331 1_555 GA ZN ZN . C ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc50 I OE2 GLU 595 C GLU 592 1_555 LA MG MG . E MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc51 HA MG MG . C MG 1001 1_555 IA O3G ATP . C ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.874 ? 
metalc ? metalc52 HA MG MG . C MG 1001 1_555 IA O1B ATP . C ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? 
metalc ? metalc53 HA MG MG . C MG 1001 1_555 IA O3B ATP . C ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? 
metalc ? metalc54 J SG CYS 172 D CYS 172 1_555 JA ZN ZN . D ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc55 J SG CYS 175 D CYS 175 1_555 JA ZN ZN . D ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc56 J SG CYS 197 D CYS 197 1_555 JA ZN ZN . D ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc57 K SG CYS 158 E CYS 158 1_555 KA ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc58 K SG CYS 161 E CYS 161 1_555 KA ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc59 K SG CYS 180 E CYS 180 1_555 KA ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc60 K SG CYS 185 E CYS 185 1_555 KA ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc61 K OG SER 403 E SER 403 1_555 LA MG MG . E MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.73 ? 
metalc ? metalc62 LA MG MG . E MG 1001 1_555 MA O2G ATP . E ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc63 LA MG MG . E MG 1001 1_555 MA O1B ATP . E ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc64 L SG CYS 184 F CYS 184 1_555 NA ZN ZN . F ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc65 L SG CYS 187 F CYS 187 1_555 NA ZN ZN . F ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc66 L SG CYS 206 F CYS 206 1_555 NA ZN ZN . F ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc67 OA MG MG . F MG 1001 1_555 PA O1G ATP . F ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc68 OA MG MG . F MG 1001 1_555 PA O2G ATP . F ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
metalc ? metalc69 OA MG MG . F MG 1001 1_555 PA O3B ATP . F ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc70 OA MG MG . F MG 1001 1_555 PA O1B ATP . F ATP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8W0G 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 7 ZN 2 1 1000 1000 ZN ZN . 
N 8 MG 2 1 1001 1001 MG MG . 
O 9 ATP 2 1 1002 1002 ATP ATP . 
P 8 MG 3 1 1001 1001 MG MG . 
Q 10 ADP 3 1 1002 1002 ADP ADP . 
R 7 ZN 4 1 901 1000 ZN ZN . 
S 8 MG 4 1 902 1001 MG MG . 
T 9 ATP 4 1 903 1002 ATP ATP . 
U 8 MG 4 1 904 1001 MG MG . 
V 7 ZN 5 1 1000 1000 ZN ZN . 
W 7 ZN 6 1 901 1000 ZN ZN . 
X 9 ATP 6 1 902 1002 ATP ATP . 
Y 7 ZN 7 1 1000 1000 ZN ZN . 
Z 8 MG 7 1 1001 1001 MG MG . 
AA 9 ATP 7 1 1002 1002 ATP ATP . 
BA 7 ZN A 1 1000 1000 ZN ZN . 
CA 8 MG A 1 1001 1001 MG MG . 
DA 9 ATP A 1 1002 1002 ATP ATP . 
EA 8 MG B 1 1001 1001 MG MG . 
FA 10 ADP B 1 1002 1002 ADP ADP . 
GA 7 ZN C 1 1000 1000 ZN ZN . 
HA 8 MG C 1 1001 1001 MG MG . 
IA 9 ATP C 1 1002 1002 ATP ATP . 
JA 7 ZN D 1 1000 1000 ZN ZN . 
KA 7 ZN E 1 1000 1000 ZN ZN . 
LA 8 MG E 1 1001 1001 MG MG . 
MA 9 ATP E 1 1002 1002 ATP ATP . 
NA 7 ZN F 1 1000 1000 ZN ZN . 
OA 8 MG F 1 1001 1001 MG MG . 
PA 9 ATP F 1 1002 1002 ATP ATP . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         EA 
_atom_site.label_entity_id       8 
_atom_site.Cartn_x               251.275 
_atom_site.Cartn_y               284.318 
_atom_site.Cartn_z               316.607 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        215.27 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           1001 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              60 
_model_server_stats.parse_time_ms           17 
_model_server_stats.create_model_time_ms    454 
_model_server_stats.query_time_ms           287 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           1 
#