data_8W7M # _model_server_result.job_id QDLVKCj6vGTk31PNCqyQCQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 08:44:11' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8w7m # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"W","auth_seq_id":1002}' # _entry.id 8W7M # _exptl.entry_id 8W7M _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 16 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 16 R N N ? 16 U N N ? 16 W N N ? 16 AA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 341 2 CYS 341 1_555 S ZN ZN . 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 344 2 CYS 344 1_555 S ZN ZN . 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 364 2 CYS 364 1_555 S ZN ZN . 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 367 2 CYS 367 1_555 S ZN ZN . 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc5 Q O1B ADP . 2 ADP 901 1_555 R MG MG . 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc6 Q O2B ADP . 2 ADP 901 1_555 R MG MG . 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? metalc ? metalc7 Q O1A ADP . 2 ADP 901 1_555 R MG MG . 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc8 Q O2A ADP . 2 ADP 901 1_555 R MG MG . 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc9 Q O3A ADP . 2 ADP 901 1_555 R MG MG . 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.597 ? metalc ? metalc10 T O1B ADP . 3 ADP 1001 1_555 U MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc11 T O3B ADP . 3 ADP 1001 1_555 U MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.914 ? metalc ? metalc12 T O1A ADP . 3 ADP 1001 1_555 U MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc13 T O2A ADP . 3 ADP 1001 1_555 U MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc14 T O3A ADP . 3 ADP 1001 1_555 U MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 349 4 CYS 349 1_555 X ZN ZN . 4 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc16 C SG CYS 352 4 CYS 352 1_555 X ZN ZN . 4 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc17 C SG CYS 371 4 CYS 371 1_555 X ZN ZN . 4 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc18 C SG CYS 376 4 CYS 376 1_555 X ZN ZN . 4 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc19 V O3G AGS . 4 AGS 1001 1_555 W MG MG . 4 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? metalc ? metalc20 V O1B AGS . 4 AGS 1001 1_555 W MG MG . 4 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.822 ? metalc ? metalc21 V O1A AGS . 4 AGS 1001 1_555 W MG MG . 4 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc22 V O2A AGS . 4 AGS 1001 1_555 W MG MG . 4 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.847 ? metalc ? metalc23 D SG CYS 183 5 CYS 183 1_555 Y ZN ZN . 5 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc24 D SG CYS 186 5 CYS 186 1_555 Y ZN ZN . 5 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc25 D SG CYS 211 5 CYS 211 1_555 Y ZN ZN . 5 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc26 D SG CYS 236 5 CYS 236 1_555 Y ZN ZN . 5 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc27 E SG CYS 311 6 CYS 311 1_555 Z ZN ZN . 6 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc28 E SG CYS 314 6 CYS 314 1_555 Z ZN ZN . 6 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc29 E SG CYS 333 6 CYS 333 1_555 Z ZN ZN . 6 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc30 E SG CYS 338 6 CYS 338 1_555 Z ZN ZN . 6 ZN 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc31 F SG CYS 262 7 CYS 262 1_555 CA ZN ZN . 7 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc32 F SG CYS 265 7 CYS 265 1_555 CA ZN ZN . 7 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc33 F SG CYS 284 7 CYS 284 1_555 CA ZN ZN . 7 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc34 F SG CYS 289 7 CYS 289 1_555 CA ZN ZN . 7 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc35 F OG SER 467 7 SER 467 1_555 AA MG MG . 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc ? metalc36 AA MG MG . 7 MG 901 1_555 BA O3B AGS . 7 AGS 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.861 ? metalc ? metalc37 AA MG MG . 7 MG 901 1_555 BA O3A AGS . 7 AGS 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.9 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 8W7M _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 15 ADP 2 1 901 901 ADP ADP . R 16 MG 2 1 902 902 MG MG . S 17 ZN 2 1 903 903 ZN ZN . T 15 ADP 3 1 1001 1001 ADP ADP . U 16 MG 3 1 1002 1002 MG MG . V 18 AGS 4 1 1001 1001 AGS AGS . W 16 MG 4 1 1002 1002 MG MG . X 17 ZN 4 1 1003 1003 ZN ZN . Y 17 ZN 5 1 1600 1600 ZN ZN . Z 17 ZN 6 1 1600 1600 ZN ZN . AA 16 MG 7 1 901 901 MG MG . BA 18 AGS 7 1 902 902 AGS AGS . CA 17 ZN 7 1 903 903 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id W _atom_site.label_entity_id 16 _atom_site.Cartn_x 228.171 _atom_site.Cartn_y 208.867 _atom_site.Cartn_z 304.11 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 339.38 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1002 _atom_site.auth_asym_id 4 _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 25 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 93 _model_server_stats.query_time_ms 330 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #