data_8W9C
#
_model_server_result.job_id            Q2_KdoCeRKStaBLWBTxryw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-25 20:34:04' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8w9c 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":1002}' 
#
_entry.id    8W9C 
#
_exptl.entry_id    8W9C 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    7 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8W9C 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8W9C 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 G N N 
? 5 H N N 
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 K N N 
? 5 N N N 
? 5 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B SG CYS 263 E CYS 263 1_555 G ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 266 E CYS 266 1_555 G ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 275 E CYS 275 1_555 H ZN ZN . E ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 278 E CYS 278 1_555 H ZN ZN . E ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
metalc ? metalc5 B ND1 HIS 283 E HIS 283 1_555 G ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 286 E CYS 286 1_555 G ZN ZN . E ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? 
metalc ? metalc7 B SG CYS 303 E CYS 303 1_555 H ZN ZN . E ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 306 E CYS 306 1_555 H ZN ZN . E ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 420 E CYS 420 1_555 J ZN ZN . E ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 440 E CYS 440 1_555 I ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 443 E CYS 443 1_555 I ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc12 B ND1 HIS 448 E HIS 448 1_555 J ZN ZN . E ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
metalc ? metalc13 B SG CYS 451 E CYS 451 1_555 J ZN ZN . E ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 466 E CYS 466 1_555 I ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc15 G ZN ZN . E ZN 1000 1_555 D NH1 ARG 300 C ARG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc16 C O ASP 184 B ASP 184 1_555 L K K . B K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.138 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 184 B ASP 184 1_555 L K K . B K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc18 C OD1 ASP 186 B ASP 186 1_555 K ZN ZN . B ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
metalc ? metalc19 C O ASP 186 B ASP 186 1_555 L K K . B K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? 
metalc ? metalc20 C O HIS 188 B HIS 188 1_555 L K K . B K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc21 C O PHE 197 B PHE 197 1_555 M K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc22 C O THR 200 B THR 200 1_555 M K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? 
metalc ? metalc23 C O VAL 203 B VAL 203 1_555 M K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? 
metalc ? metalc24 C OG SER 207 B SER 207 1_555 L K K . B K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? 
metalc ? metalc25 C O TYR 232 B TYR 232 1_555 M K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? 
metalc ? metalc26 C OD2 ASP 274 B ASP 274 1_555 K ZN ZN . B ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.981 ? 
metalc ? metalc27 F SG CYS 275 F CYS 275 1_555 O ZN ZN . F ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? 
metalc ? metalc28 F ND1 HIS 283 F HIS 283 1_555 N ZN ZN . F ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc29 F SG CYS 286 F CYS 286 1_555 N ZN ZN . F ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc30 F SG CYS 306 F CYS 306 1_555 O ZN ZN . F ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8W9C 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 5 ZN E 1 1000 1000 ZN ZN . 
H 5 ZN E 1 1001 1001 ZN ZN . 
I 5 ZN E 1 1002 1002 ZN ZN . 
J 5 ZN E 1 1003 1003 ZN ZN . 
K 5 ZN B 1 1000 1000 ZN ZN . 
L 6 K B 1 1001 1001 K K . 
M 6 K B 1 1002 1002 K K . 
N 5 ZN F 1 1000 1000 ZN ZN . 
O 5 ZN F 1 1001 1001 ZN ZN . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         I 
_atom_site.label_entity_id       5 
_atom_site.Cartn_x               157.174 
_atom_site.Cartn_y               148.228 
_atom_site.Cartn_z               159.896 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        53.28 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           1002 
_atom_site.auth_asym_id          E 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              12 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    34 
_model_server_stats.query_time_ms           288 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           1 
#