data_8WHU # _model_server_result.job_id USHqNsH9d-19tRsYQnMAgw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 20:00:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8whu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":1308}' # _entry.id 8WHU # _exptl.entry_id 8WHU _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 41 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 DB N N ? 4 EB N N ? 4 FB N N ? 4 GB N N ? 4 JB N N ? 4 KB N N ? 4 LB N N ? 4 MB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 BMA _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 3 n F BMA 2 F 2 BMA F 2 BMA 3 n G NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 3 n G BMA 2 G 2 BMA G 2 BMA 3 n H NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 3 n H BMA 2 H 2 BMA H 2 BMA 3 n I NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 3 n I BMA 2 I 2 BMA I 2 BMA 3 n J NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 3 n J BMA 2 J 2 BMA J 2 BMA 3 n K NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 3 n K BMA 2 K 2 BMA K 2 BMA 3 n L NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 3 n L BMA 2 L 2 BMA L 2 BMA 3 n M NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 3 n M BMA 2 M 2 BMA M 2 BMA 3 n N NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 3 n N BMA 2 N 2 BMA N 2 BMA 3 n O NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 3 n O BMA 2 O 2 BMA O 2 BMA 3 n P NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 3 n P BMA 2 P 2 BMA P 2 BMA 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 3 n Q BMA 2 Q 2 BMA Q 2 BMA 3 n R NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 3 n R BMA 2 R 2 BMA R 2 BMA 3 n S NAG 1 S 1 NAG S 1 NAG 3 n S BMA 2 S 2 BMA S 2 BMA 3 n T NAG 1 T 1 NAG T 1 NAG 3 n T BMA 2 T 2 BMA T 2 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 132 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 290 A CYS 291 1_555 A SG CYS 300 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 335 A CYS 336 1_555 A SG CYS 360 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 378 A CYS 379 1_555 A SG CYS 431 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 390 A CYS 391 1_555 A SG CYS 523 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 479 A CYS 480 1_555 A SG CYS 486 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 536 A CYS 538 1_555 A SG CYS 588 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 615 A CYS 617 1_555 A SG CYS 647 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 660 A CYS 662 1_555 A SG CYS 669 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 736 A CYS 738 1_555 A SG CYS 758 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 741 A CYS 743 1_555 A SG CYS 747 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 838 A CYS 840 1_555 A SG CYS 849 A CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1030 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1041 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1080 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1124 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 132 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 290 B CYS 291 1_555 B SG CYS 300 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 335 B CYS 336 1_555 B SG CYS 360 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 378 B CYS 379 1_555 B SG CYS 431 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 390 B CYS 391 1_555 B SG CYS 523 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 479 B CYS 480 1_555 B SG CYS 486 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 615 B CYS 617 1_555 B SG CYS 647 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 660 B CYS 662 1_555 B SG CYS 669 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 736 B CYS 738 1_555 B SG CYS 758 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 741 B CYS 743 1_555 B SG CYS 747 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 838 B CYS 840 1_555 B SG CYS 849 B CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1030 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1041 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 1080 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1124 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 132 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 290 C CYS 291 1_555 C SG CYS 300 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 335 C CYS 336 1_555 C SG CYS 360 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 378 C CYS 379 1_555 C SG CYS 431 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 479 C CYS 480 1_555 C SG CYS 486 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 615 C CYS 617 1_555 C SG CYS 647 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 660 C CYS 662 1_555 C SG CYS 669 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 736 C CYS 738 1_555 C SG CYS 758 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 741 C CYS 743 1_555 C SG CYS 747 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 838 C CYS 840 1_555 C SG CYS 849 C CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1030 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1041 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 1080 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1124 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 115 D CYS 133 1_555 D SG CYS 123 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 326 D CYS 344 1_555 D SG CYS 343 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 512 D CYS 530 1_555 D SG CYS 524 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 115 E CYS 133 1_555 E SG CYS 123 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 326 E CYS 344 1_555 E SG CYS 343 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf45 E SG CYS 512 E CYS 530 1_555 E SG CYS 524 E CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 64 A ASN 61 1_555 V C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 123 A ASN 122 1_555 U C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 X C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 233 A ASN 234 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 281 A ASN 282 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 330 A ASN 331 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 342 A ASN 343 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 353 A ASN 354 1_555 W C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 614 A ASN 616 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 655 A ASN 657 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 707 A ASN 709 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 715 A ASN 717 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 799 A ASN 801 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1072 A ASN 1074 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 1096 A ASN 1098 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1132 A ASN 1134 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 64 B ASN 61 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 123 B ASN 122 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 233 B ASN 234 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 281 B ASN 282 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 330 B ASN 331 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 342 B ASN 343 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 353 B ASN 354 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 614 B ASN 616 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 655 B ASN 657 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 707 B ASN 709 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 715 B ASN 717 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 799 B ASN 801 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 1072 B ASN 1074 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 1096 B ASN 1098 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 1132 B ASN 1134 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 64 C ASN 61 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 123 C ASN 122 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 233 C ASN 234 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 281 C ASN 282 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 330 C ASN 331 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 342 C ASN 343 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 353 C ASN 354 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 614 C ASN 616 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 655 C ASN 657 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 707 C ASN 709 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 715 C ASN 717 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 799 C ASN 801 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 1072 C ASN 1074 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 1096 C ASN 1098 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 1132 C ASN 1134 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale49 D ND2 ASN 35 D ASN 53 1_555 GB C1 NAG . D NAG 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale50 D ND2 ASN 72 D ASN 90 1_555 EB C1 NAG . D NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale51 D ND2 ASN 304 D ASN 322 1_555 FB C1 NAG . D NAG 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale52 D ND2 ASN 528 D ASN 546 1_555 DB C1 NAG . D NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale53 E ND2 ASN 35 E ASN 53 1_555 LB C1 NAG . E NAG 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale54 E ND2 ASN 72 E ASN 90 1_555 MB C1 NAG . E NAG 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 304 E ASN 322 1_555 KB C1 NAG . E NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 E ND2 ASN 528 E ASN 546 1_555 JB C1 NAG . E NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale57 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 BMA . F BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 BMA . G BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale59 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 BMA . H BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale60 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 BMA . I BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale61 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 BMA . J BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale62 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 BMA . K BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale63 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 BMA . L BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale64 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 BMA . M BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale65 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 BMA . N BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale66 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 BMA . O BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? covale ? covale67 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 BMA . P BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale68 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale69 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 BMA . R BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale70 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 BMA . S BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale71 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 BMA . T BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? metalc ? metalc1 D NE2 HIS 356 D HIS 374 1_555 BB ZN ZN . D ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc2 D NE2 HIS 360 D HIS 378 1_555 BB ZN ZN . D ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc3 D OE2 GLU 384 D GLU 402 1_555 BB ZN ZN . D ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc4 E NE2 HIS 356 E HIS 374 1_555 HB ZN ZN . E ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8WHU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 4 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . V 4 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . W 4 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . X 4 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . Y 4 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . Z 4 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . AA 4 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . BA 4 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . CA 4 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . DA 4 NAG A 1 1310 1310 NAG NAG . EA 4 NAG A 1 1311 1311 NAG NAG . FA 4 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . GA 4 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . HA 4 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . IA 4 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . JA 4 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . KA 4 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . LA 4 NAG B 1 1307 1308 NAG NAG . MA 4 NAG B 1 1308 1309 NAG NAG . NA 4 NAG B 1 1309 1310 NAG NAG . OA 4 NAG B 1 1310 1311 NAG NAG . PA 4 NAG B 1 1311 1301 NAG NAG . QA 4 NAG C 1 1301 1302 NAG NAG . RA 4 NAG C 1 1302 1303 NAG NAG . SA 4 NAG C 1 1303 1304 NAG NAG . TA 4 NAG C 1 1304 1305 NAG NAG . UA 4 NAG C 1 1305 1306 NAG NAG . VA 4 NAG C 1 1306 1307 NAG NAG . WA 4 NAG C 1 1307 1308 NAG NAG . XA 4 NAG C 1 1308 1309 NAG NAG . YA 4 NAG C 1 1309 1311 NAG NAG . ZA 4 NAG C 1 1310 1312 NAG NAG . AB 4 NAG C 1 1311 1313 NAG NAG . BB 5 ZN D 1 901 901 ZN ZN . CB 6 CL D 1 902 902 CL CL . DB 4 NAG D 1 903 903 NAG NAG . EB 4 NAG D 1 904 904 NAG NAG . FB 4 NAG D 1 905 905 NAG NAG . GB 4 NAG D 1 906 906 NAG NAG . HB 5 ZN E 1 901 901 ZN ZN . IB 6 CL E 1 902 902 CL CL . JB 4 NAG E 1 903 903 NAG NAG . KB 4 NAG E 1 904 905 NAG NAG . LB 4 NAG E 1 905 906 NAG NAG . MB 4 NAG E 1 906 907 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MA 4 213.134 161.245 133.608 1 51.57 ? C1 NAG 1308 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MA 4 212.911 159.732 133.853 1 54.35 ? C2 NAG 1308 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MA 4 214.038 159.153 134.714 1 56.39 ? C3 NAG 1308 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MA 4 215.405 159.509 134.153 1 55.72 ? C4 NAG 1308 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MA 4 215.518 161.013 133.967 1 55.12 ? C5 NAG 1308 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MA 4 216.818 161.426 133.318 1 53.51 ? C6 NAG 1308 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MA 4 211.046 158.276 134.51 1 55.22 ? C7 NAG 1308 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MA 4 209.72 158.197 135.21 1 54.14 ? C8 NAG 1308 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MA 4 211.627 159.479 134.487 1 57.17 ? N2 NAG 1308 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MA 4 213.917 157.737 134.754 1 54.5 ? O3 NAG 1308 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MA 4 216.418 159.07 135.051 1 54.73 ? O4 NAG 1308 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MA 4 214.465 161.462 133.105 1 54.42 ? O5 NAG 1308 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MA 4 217.428 160.335 132.641 1 56.15 ? O6 NAG 1308 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MA 4 211.565 157.295 133.988 1 53.11 ? O7 NAG 1308 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 110 _model_server_stats.query_time_ms 341 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #