data_8XP8
#
_model_server_result.job_id            PUF3ziZzY4f5Kosvk9NwqA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-06 06:42:52' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8xp8 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":102}' 
#
_entry.id    8XP8 
#
_exptl.entry_id    8XP8 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              174.156 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            2-CARBOXYQUINOXALINE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            8XP8 
_cell.length_a            46.329 
_cell.length_b            46.329 
_cell.length_c            47.954 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8XP8 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        151 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 31 1 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 H N N 
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 C SG N2C 3 D N2C 3 1_555 C SG NCY 7 D NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? 
disulf ? disulf2 D SG N2C 3 E N2C 3 1_555 D SG NCY 7 E NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? 
covale ? covale1 B O3' DG 3 B DG 3 1_555 B P 5CM 4 B 5CM 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? 
covale ? covale2 B O3' DG 3 B DG 3 1_555 B P 5CM 4 B 5CM 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? 
covale ? covale3 B O3' 5CM 4 B 5CM 4 1_555 B P DC 5 B DC 5 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? 
covale ? covale4 B O3' 5CM 4 B 5CM 4 1_555 B P DC 5 B DC 5 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? 
covale ? covale5 C C DSN 1 D DSN 1 1_555 C N ALA 2 D ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? 
covale ? covale6 C OG DSN 1 D DSN 1 1_555 C C MVA 8 D MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? 
covale ? covale7 C N DSN 1 D DSN 1 1_555 H C QUI . D QUI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? 
covale ? covale8 C C ALA 2 D ALA 2 1_555 C N N2C 3 D N2C 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? 
covale ? covale9 C C N2C 3 D N2C 3 1_555 C N MVA 4 D MVA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? 
covale ? covale10 C CB N2C 3 D N2C 3 1_555 C SG NCY 7 D NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
covale ? covale11 C C MVA 4 D MVA 4 1_555 C OG DSN 5 D DSN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? 
covale ? covale12 C C DSN 5 D DSN 5 1_555 C N ALA 6 D ALA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? 
covale ? covale13 C N DSN 5 D DSN 5 1_555 I C QUI . D QUI 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? 
covale ? covale14 C C ALA 6 D ALA 6 1_555 C N NCY 7 D NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? 
covale ? covale15 C C NCY 7 D NCY 7 1_555 C N MVA 8 D MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? 
covale ? covale16 D C DSN 1 E DSN 1 1_555 D N ALA 2 E ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? 
covale ? covale17 D OG DSN 1 E DSN 1 1_555 D C MVA 8 E MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? 
covale ? covale18 D N DSN 1 E DSN 1 1_555 J C QUI . E QUI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? 
covale ? covale19 D C ALA 2 E ALA 2 1_555 D N N2C 3 E N2C 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? 
covale ? covale20 D C N2C 3 E N2C 3 1_555 D N MVA 4 E MVA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? 
covale ? covale21 D CB N2C 3 E N2C 3 1_555 D SG NCY 7 E NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? 
covale ? covale22 D C MVA 4 E MVA 4 1_555 D OG DSN 5 E DSN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? 
covale ? covale23 D C DSN 5 E DSN 5 1_555 D N ALA 6 E ALA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? 
covale ? covale24 D N DSN 5 E DSN 5 1_555 K C QUI . E QUI 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? 
covale ? covale25 D C ALA 6 E ALA 6 1_555 D N NCY 7 E NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? 
covale ? covale26 D C NCY 7 E NCY 7 1_555 D N MVA 8 E MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? 
metalc ? metalc1 A N7 DG 3 A DG 3 1_555 F MN MN . A MN 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc2 A N7 DG 6 A DG 6 1_555 E MN MN . A MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc3 E MN MN . A MN 101 1_555 L O HOH . A HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc4 E MN MN . A MN 101 1_555 L O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc5 E MN MN . A MN 101 1_555 L O HOH . A HOH 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc6 E MN MN . A MN 101 1_555 L O HOH . A HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc7 E MN MN . A MN 101 1_555 L O HOH . A HOH 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc8 F MN MN . A MN 102 1_555 L O HOH . A HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc9 F MN MN . A MN 102 1_555 L O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc10 F MN MN . A MN 102 6_557 B N7 DG 3 B DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc11 F MN MN . A MN 102 1_555 M O HOH . B HOH 205 6_557 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc12 F MN MN . A MN 102 1_555 M O HOH . B HOH 213 6_557 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc13 B N7 DG 6 B DG 6 1_555 G MN MN . B MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
metalc ? metalc14 G MN MN . B MN 101 1_555 M O HOH . B HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc15 G MN MN . B MN 101 1_555 M O HOH . B HOH 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc16 G MN MN . B MN 101 1_555 M O HOH . B HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 DA 1 A DA 1 1_555 B N3 DT 7 B DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N6 DA 1 A DA 1 1_555 B O4 DT 7 B DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N3 DC 2 A DC 2 1_555 B N1 DG 6 B DG 6 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 DC 2 A DC 2 1_555 B N1 DG 6 B DG 6 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 DC 2 A DC 2 1_555 B O6 DG 6 B DG 6 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N4 DC 2 A DC 2 1_555 B O6 DG 6 B DG 6 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A O2 DC 2 A DC 2 1_555 B N2 DG 6 B DG 6 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O2 DC 2 A DC 2 1_555 B N2 DG 6 B DG 6 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N1 DG 3 A DG 3 1_555 B N3 DC 5 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N2 DG 3 A DG 3 1_555 B O2 DC 5 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O6 DG 3 A DG 3 1_555 B N4 DC 5 B DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N1 DG 4 A DG 4 1_555 B N3 5CM 4 B 5CM 4 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N2 DG 4 A DG 4 1_555 B O2 5CM 4 B 5CM 4 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 B N4 5CM 4 B 5CM 4 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 DC 5 A DC 5 1_555 B N1 DG 3 B DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N4 DC 5 A DC 5 1_555 B O6 DG 3 B DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A O2 DC 5 A DC 5 1_555 B N2 DG 3 B DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N1 DG 6 A DG 6 1_555 B N3 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N1 DG 6 A DG 6 1_555 B N3 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 B O2 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 B O2 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 B N4 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 B N4 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N3 DT 7 A DT 7 1_555 B N1 DA 1 B DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O4 DT 7 A DT 7 1_555 B N6 DA 1 B DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C9 H6 N2 O2' 
_chem_comp.formula_weight    174.156 
_chem_comp.id                QUI 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-CARBOXYQUINOXALINE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N1 C2 QUI doub 271 n y 
N1 C9 QUI sing 272 n y 
C2 C3 QUI sing 273 n y 
C2 C QUI sing 274 n n 
C3 N4 QUI doub 275 n y 
C3 H3 QUI sing 276 n n 
N4 C10 QUI sing 277 n y 
C5 C6 QUI doub 278 n y 
C5 C10 QUI sing 279 n y 
C5 H5 QUI sing 280 n n 
C6 C7 QUI sing 281 n y 
C6 H6 QUI sing 282 n n 
C7 C8 QUI doub 283 n y 
C7 H7 QUI sing 284 n n 
C8 C9 QUI sing 285 n y 
C8 H8 QUI sing 286 n n 
C9 C10 QUI doub 287 n y 
C O1 QUI doub 288 n n 
C O2 QUI sing 289 n n 
O2 HO2 QUI sing 290 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     8XP8 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.021585 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.012462 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.024924 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.020853 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 4 MN A 1 101 1 MN MN . 
F 4 MN A 1 102 2 MN MN . 
G 4 MN B 1 101 37 MN MN . 
H 5 QUI D 1 101 8 QUI LIG . 
I 5 QUI D 1 102 8 QUI LIG . 
J 5 QUI E 1 101 9 QUI LIG . 
K 5 QUI E 1 102 9 QUI LIG . 
L 6 HOH A 1 201 1 HOH HOH . 
L 6 HOH A 2 202 19 HOH HOH . 
L 6 HOH A 3 203 13 HOH HOH . 
L 6 HOH A 4 204 50 HOH HOH . 
L 6 HOH A 5 205 12 HOH HOH . 
L 6 HOH A 6 206 7 HOH HOH . 
L 6 HOH A 7 207 4 HOH HOH . 
L 6 HOH A 8 208 15 HOH HOH . 
L 6 HOH A 9 209 14 HOH HOH . 
L 6 HOH A 10 210 20 HOH HOH . 
L 6 HOH A 11 211 16 HOH HOH . 
L 6 HOH A 12 212 22 HOH HOH . 
L 6 HOH A 13 213 11 HOH HOH . 
L 6 HOH A 14 214 18 HOH HOH . 
L 6 HOH A 15 215 24 HOH HOH . 
L 6 HOH A 16 216 5 HOH HOH . 
L 6 HOH A 17 217 10 HOH HOH . 
L 6 HOH A 18 218 9 HOH HOH . 
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