data_8XUY # _model_server_result.job_id akl1kIymIufuEWmiVChw6w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 01:04:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8xuy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":1307}' # _entry.id 8XUY # _exptl.entry_id 8XUY _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 38 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8XUY _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8XUY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 T N N ? 6 U N N ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 5 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 3 n F NAG 2 E 2 NAG E 2 NAG 3 n G NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 3 n G NAG 2 F 2 NAG F 2 NAG 3 n H NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 3 n H NAG 2 G 2 NAG G 2 NAG 3 n I NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 3 n I NAG 2 H 2 NAG H 2 NAG 3 n J NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 3 n J NAG 2 I 2 NAG I 2 NAG 3 n K NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 3 n K NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG 3 n L NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 3 n L NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 3 n M NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 3 n M NAG 2 L 2 NAG L 2 NAG 3 n N NAG 1 M 1 NAG L 3 NAG 3 n N NAG 2 M 2 NAG L 4 NAG 3 n O NAG 1 N 1 NAG L 5 NAG 3 n O NAG 2 N 2 NAG L 6 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG M 1 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG M 2 NAG 4 n P BMA 3 P 3 BMA M 3 BMA 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG N 1 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG N 2 NAG 5 n Q BMA 3 Q 3 BMA N 3 BMA 5 n Q MAN 4 Q 4 MAN N 4 MAN 5 n Q MAN 5 Q 5 MAN N 5 MAN 4 n R NAG 1 R 1 NAG Q 1 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG Q 2 NAG 4 n R BMA 3 R 3 BMA Q 3 BMA 5 n S NAG 1 S 1 NAG P 1 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG P 2 NAG 5 n S BMA 3 S 3 BMA P 3 BMA 5 n S MAN 4 S 4 MAN P 4 MAN 5 n S MAN 5 S 5 MAN P 5 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 119 A CYS 131 1_555 A SG CYS 153 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 277 A CYS 290 1_555 A SG CYS 287 A CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 322 A CYS 335 1_555 A SG CYS 347 A CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 365 A CYS 378 1_555 A SG CYS 418 A CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 377 A CYS 390 1_555 A SG CYS 510 A CYS 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 466 A CYS 479 1_555 A SG CYS 473 A CYS 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 523 A CYS 536 1_555 A SG CYS 575 A CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 602 A CYS 615 1_555 A SG CYS 634 A CYS 647 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 647 A CYS 660 1_555 A SG CYS 656 A CYS 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 723 A CYS 736 1_555 A SG CYS 745 A CYS 758 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 728 A CYS 741 1_555 A SG CYS 734 A CYS 747 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 1017 A CYS 1030 1_555 A SG CYS 1028 A CYS 1041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1067 A CYS 1080 1_555 A SG CYS 1111 A CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 119 B CYS 131 1_555 B SG CYS 153 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 277 B CYS 290 1_555 B SG CYS 287 B CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 322 B CYS 335 1_555 B SG CYS 347 B CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 365 B CYS 378 1_555 B SG CYS 418 B CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 377 B CYS 390 1_555 B SG CYS 510 B CYS 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 466 B CYS 479 1_555 B SG CYS 473 B CYS 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 523 B CYS 536 1_555 B SG CYS 575 B CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 602 B CYS 615 1_555 B SG CYS 634 B CYS 647 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 647 B CYS 660 1_555 B SG CYS 656 B CYS 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 723 B CYS 736 1_555 B SG CYS 745 B CYS 758 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 728 B CYS 741 1_555 B SG CYS 734 B CYS 747 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 1017 B CYS 1030 1_555 B SG CYS 1028 B CYS 1041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 1067 B CYS 1080 1_555 B SG CYS 1111 B CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 119 C CYS 131 1_555 C SG CYS 153 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 277 C CYS 290 1_555 C SG CYS 287 C CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 322 C CYS 335 1_555 C SG CYS 347 C CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 365 C CYS 378 1_555 C SG CYS 418 C CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 377 C CYS 390 1_555 C SG CYS 510 C CYS 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 466 C CYS 479 1_555 C SG CYS 473 C CYS 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 523 C CYS 536 1_555 C SG CYS 575 C CYS 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 602 C CYS 615 1_555 C SG CYS 634 C CYS 647 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 647 C CYS 660 1_555 C SG CYS 656 C CYS 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 723 C CYS 736 1_555 C SG CYS 745 C CYS 758 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 728 C CYS 741 1_555 C SG CYS 734 C CYS 747 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 1017 C CYS 1030 1_555 C SG CYS 1028 C CYS 1041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 1067 C CYS 1080 1_555 C SG CYS 1111 C CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 115 D CYS 133 1_555 D SG CYS 123 D CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 326 D CYS 344 1_555 D SG CYS 343 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 512 D CYS 530 1_555 D SG CYS 524 D CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 115 O CYS 133 1_555 E SG CYS 123 O CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 326 O CYS 344 1_555 E SG CYS 343 O CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf45 E SG CYS 512 O CYS 530 1_555 E SG CYS 524 O CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 51 A ASN 61 1_555 T C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 110 A ASN 122 1_555 U C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 152 A ASN 165 1_555 V C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 220 A ASN 233 1_555 W C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 268 A ASN 281 1_555 X C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 317 A ASN 330 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 601 A ASN 614 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 642 A ASN 655 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 694 A ASN 707 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 702 A ASN 715 1_555 F C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 786 A ASN 799 1_555 G C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 1059 A ASN 1072 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1083 A ASN 1096 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1119 A ASN 1132 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 110 B ASN 122 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 152 B ASN 165 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 220 B ASN 233 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 268 B ASN 281 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 601 B ASN 614 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 642 B ASN 655 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 694 B ASN 707 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 702 B ASN 715 1_555 H C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 786 B ASN 799 1_555 I C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 1059 B ASN 1072 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 1083 B ASN 1096 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 51 C ASN 61 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 110 C ASN 122 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 152 C ASN 165 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 220 C ASN 233 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 268 C ASN 281 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 329 C ASN 342 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 340 C ASN 353 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 601 C ASN 614 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 642 C ASN 655 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 694 C ASN 707 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 702 C ASN 715 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 786 C ASN 799 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 1059 C ASN 1072 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 1083 C ASN 1096 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 1119 C ASN 1132 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale41 D ND2 ASN 35 D ASN 53 1_555 CB C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale42 D ND2 ASN 72 D ASN 90 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale43 D ND2 ASN 85 D ASN 103 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale44 D ND2 ASN 304 D ASN 322 1_555 AB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale45 D ND2 ASN 414 D ASN 432 1_555 BB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 D ND2 ASN 528 D ASN 546 1_555 M C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale47 E ND2 ASN 35 O ASN 53 1_555 N C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale48 E ND2 ASN 72 O ASN 90 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale49 E ND2 ASN 85 O ASN 103 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 304 O ASN 322 1_555 DB C1 NAG . O NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale51 E ND2 ASN 414 O ASN 432 1_555 EB C1 NAG . O NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale52 E ND2 ASN 528 O ASN 546 1_555 O C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale53 F O4 NAG . E NAG 1 1_555 F C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale54 G O4 NAG . F NAG 1 1_555 G C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 H O4 NAG . G NAG 1 1_555 H C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale56 I O4 NAG . H NAG 1 1_555 I C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale57 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale58 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale59 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale60 M O4 NAG . L NAG 1 1_555 M C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale61 N O4 NAG . M NAG 1 1_555 N C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale62 O O4 NAG . N NAG 1 1_555 O C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale63 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale64 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale65 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale66 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale67 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale68 Q O6 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale70 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale71 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale72 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale73 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale74 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8XUY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code T 6 NAG A 1 1301 1299 NAG NAG . U 6 NAG A 1 1302 1300 NAG NAG . V 6 NAG A 1 1303 1301 NAG NAG . W 6 NAG A 1 1304 1302 NAG NAG . X 6 NAG A 1 1305 1303 NAG NAG . Y 6 NAG A 1 1306 1304 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 1307 1305 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 1308 1306 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 1309 1307 NAG NAG . CA 6 NAG A 1 1310 1308 NAG NAG . DA 6 NAG A 1 1311 1309 NAG NAG . EA 6 NAG A 1 1312 1310 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1301 1299 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1302 1300 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1303 1302 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1304 1303 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1305 1304 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1306 1305 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1307 1306 NAG NAG . MA 6 NAG B 1 1308 1307 NAG NAG . NA 6 NAG B 1 1309 1308 NAG NAG . OA 6 NAG C 1 1301 1299 NAG NAG . PA 6 NAG C 1 1302 1300 NAG NAG . QA 6 NAG C 1 1303 1301 NAG NAG . RA 6 NAG C 1 1304 1302 NAG NAG . SA 6 NAG C 1 1305 1303 NAG NAG . TA 6 NAG C 1 1306 1304 NAG NAG . UA 6 NAG C 1 1307 1305 NAG NAG . VA 6 NAG C 1 1308 1306 NAG NAG . WA 6 NAG C 1 1309 1307 NAG NAG . XA 6 NAG C 1 1310 1308 NAG NAG . YA 6 NAG C 1 1311 1310 NAG NAG . ZA 6 NAG C 1 1312 1311 NAG NAG . AB 6 NAG D 1 701 701 NAG NAG . BB 6 NAG D 1 702 702 NAG NAG . CB 6 NAG D 1 703 703 NAG NAG . DB 6 NAG O 1 701 701 NAG NAG . EB 6 NAG O 1 702 702 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . Z 6 234.56 214.2 165.427 1 121.67 ? C1 NAG 1307 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . Z 6 234.9 215.151 166.567 1 123.32 ? C2 NAG 1307 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . Z 6 233.981 216.367 166.525 1 124.01 ? C3 NAG 1307 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . Z 6 234.028 217.022 165.15 1 124.39 ? C4 NAG 1307 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . Z 6 233.766 215.995 164.05 1 124.15 ? C5 NAG 1307 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . Z 6 233.964 216.556 162.661 1 124.65 ? C6 NAG 1307 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . Z 6 235.763 214.549 168.788 1 123.73 ? C7 NAG 1307 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . Z 6 236.973 215.362 168.435 1 124.08 ? C8 NAG 1307 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . Z 6 234.806 214.483 167.855 1 123.27 ? N2 NAG 1307 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . Z 6 234.386 217.299 167.521 1 124.34 ? O3 NAG 1307 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . Z 6 233.045 218.049 165.072 1 124.34 ? O4 NAG 1307 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . Z 6 234.673 214.889 164.18 1 123.46 ? O5 NAG 1307 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . Z 6 232.755 216.541 161.914 1 124.81 ? O6 NAG 1307 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . Z 6 235.657 213.976 169.869 1 123.75 ? O7 NAG 1307 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 68 _model_server_stats.query_time_ms 343 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 14 #