data_8XZ8 # _model_server_result.job_id z958NyuIzmT9ubeQ3EjSYg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-03 20:18:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8xz8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"VA","auth_seq_id":1309}' # _entry.id 8XZ8 # _exptl.entry_id 8XZ8 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 36 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8XZ8 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8XZ8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 X N N ? 6 Y N N ? 6 Z N N ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N ? 6 GB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 BMA _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n E NAG 1 E 1 NAG E 1 NAG 3 n E BMA 2 E 2 BMA E 2 BMA 3 n F NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 3 n F BMA 2 F 2 BMA F 2 BMA 3 n G NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 3 n G BMA 2 G 2 BMA G 2 BMA 3 n H NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 3 n H BMA 2 H 2 BMA H 2 BMA 3 n I NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 3 n I BMA 2 I 2 BMA I 2 BMA 3 n J NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 3 n J BMA 2 J 2 BMA J 2 BMA 3 n K NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 3 n K BMA 2 K 2 BMA K 2 BMA 3 n L NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 3 n L BMA 2 L 2 BMA L 2 BMA 3 n M NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 3 n M BMA 2 M 2 BMA M 2 BMA 3 n N NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 3 n N BMA 2 N 2 BMA N 2 BMA 3 n O NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 3 n O BMA 2 O 2 BMA O 2 BMA 3 n P NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 3 n P BMA 2 P 2 BMA P 2 BMA 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 3 n Q BMA 2 Q 2 BMA Q 2 BMA 3 n R NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 3 n R BMA 2 R 2 BMA R 2 BMA 3 n S NAG 1 S 1 NAG S 1 NAG 3 n S BMA 2 S 2 BMA S 2 BMA 3 n T NAG 1 T 1 NAG T 1 NAG 3 n T BMA 2 T 2 BMA T 2 BMA 3 n U NAG 1 U 1 NAG U 1 NAG 3 n U BMA 2 U 2 BMA U 2 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 343 A CYS 343 1_555 A SG CYS 360 A CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 132 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 290 B CYS 291 1_555 B SG CYS 300 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 335 B CYS 336 1_555 B SG CYS 360 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 378 B CYS 379 1_555 B SG CYS 431 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 390 B CYS 391 1_555 B SG CYS 523 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 479 B CYS 480 1_555 B SG CYS 486 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 615 B CYS 617 1_555 B SG CYS 647 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 660 B CYS 662 1_555 B SG CYS 669 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 736 B CYS 738 1_555 B SG CYS 758 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 741 B CYS 743 1_555 B SG CYS 747 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 838 B CYS 840 1_555 B SG CYS 849 B CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 1030 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1041 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 1080 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1124 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 132 C CYS 131 1_555 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 290 C CYS 291 1_555 C SG CYS 300 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 335 C CYS 336 1_555 C SG CYS 360 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 378 C CYS 379 1_555 C SG CYS 431 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 479 C CYS 480 1_555 C SG CYS 486 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 615 C CYS 617 1_555 C SG CYS 647 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 660 C CYS 662 1_555 C SG CYS 669 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 736 C CYS 738 1_555 C SG CYS 758 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 741 C CYS 743 1_555 C SG CYS 747 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 838 C CYS 840 1_555 C SG CYS 849 C CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 1030 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1041 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 1080 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1124 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 132 D CYS 131 1_555 D SG CYS 166 D CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 290 D CYS 291 1_555 D SG CYS 300 D CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 335 D CYS 336 1_555 D SG CYS 360 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 378 D CYS 379 1_555 D SG CYS 431 D CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 479 D CYS 480 1_555 D SG CYS 486 D CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 615 D CYS 617 1_555 D SG CYS 647 D CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 D SG CYS 660 D CYS 662 1_555 D SG CYS 669 D CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 736 D CYS 738 1_555 D SG CYS 758 D CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 D SG CYS 741 D CYS 743 1_555 D SG CYS 747 D CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 838 D CYS 840 1_555 D SG CYS 849 D CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 1030 D CYS 1032 1_555 D SG CYS 1041 D CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 1080 D CYS 1082 1_555 D SG CYS 1124 D CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 53 A ASN 53 1_555 X C1 NAG . A NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 90 A ASN 90 1_555 Y C1 NAG . A NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 298 A ASN 298 1_555 Z C1 NAG . A NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 431 A ASN 431 1_555 AA C1 NAG . A NAG 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 545 A ASN 545 1_555 BA C1 NAG . A NAG 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 B ND2 ASN 64 B ASN 61 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 123 B ASN 122 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 233 B ASN 234 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 281 B ASN 282 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 330 B ASN 331 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 342 B ASN 343 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 614 B ASN 616 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 655 B ASN 657 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 707 B ASN 709 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 715 B ASN 717 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 799 B ASN 801 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 1072 B ASN 1074 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 1096 B ASN 1098 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 1132 B ASN 1134 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 64 C ASN 61 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 123 C ASN 122 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 233 C ASN 234 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 281 C ASN 282 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 330 C ASN 331 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 342 C ASN 343 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 353 C ASN 354 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 614 C ASN 616 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 655 C ASN 657 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 707 C ASN 709 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 715 C ASN 717 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 799 C ASN 801 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 1072 C ASN 1074 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 1096 C ASN 1098 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 1132 C ASN 1134 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale37 D ND2 ASN 64 D ASN 61 1_555 YA C1 NAG . D NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale38 D ND2 ASN 123 D ASN 122 1_555 XA C1 NAG . D NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale39 D ND2 ASN 165 D ASN 165 1_555 ZA C1 NAG . D NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale40 D ND2 ASN 233 D ASN 234 1_555 AB C1 NAG . D NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale41 D ND2 ASN 281 D ASN 282 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale42 D ND2 ASN 330 D ASN 331 1_555 GB C1 NAG . D NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale43 D ND2 ASN 342 D ASN 343 1_555 FB C1 NAG . D NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 D ND2 ASN 353 D ASN 354 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale45 D ND2 ASN 614 D ASN 616 1_555 BB C1 NAG . D NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale46 D ND2 ASN 655 D ASN 657 1_555 CB C1 NAG . D NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale47 D ND2 ASN 707 D ASN 709 1_555 DB C1 NAG . D NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 D ND2 ASN 715 D ASN 717 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale49 D ND2 ASN 799 D ASN 801 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale50 D ND2 ASN 1072 D ASN 1074 1_555 EB C1 NAG . D NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale51 D ND2 ASN 1096 D ASN 1098 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale52 D ND2 ASN 1132 D ASN 1134 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale53 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 BMA . E BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale54 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 BMA . F BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 BMA . G BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale56 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 BMA . H BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale57 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 BMA . I BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale58 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 BMA . J BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale59 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 BMA . K BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale60 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 BMA . L BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale61 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 BMA . M BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale62 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 BMA . N BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale63 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 BMA . O BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale64 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 BMA . P BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale65 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 BMA . R BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale67 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 BMA . S BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale68 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 BMA . T BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale69 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 BMA . U BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? metalc ? metalc1 A O PRO 345 A PRO 345 1_555 V ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 374 A GLU 374 1_555 V ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 374 A GLU 374 1_555 V ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8XZ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 4 ZN A 1 900 900 ZN ZN . W 5 CL A 1 901 901 CL CL . X 6 NAG A 1 902 902 NAG NAG . Y 6 NAG A 1 903 903 NAG NAG . Z 6 NAG A 1 904 904 NAG NAG . AA 6 NAG A 1 905 905 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 906 906 NAG NAG . CA 6 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . DA 6 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . EA 6 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . KA 6 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . LA 6 NAG B 1 1310 1310 NAG NAG . MA 6 NAG B 1 1311 1311 NAG NAG . NA 6 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . OA 6 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . PA 6 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . QA 6 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . RA 6 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . SA 6 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . TA 6 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . UA 6 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . VA 6 NAG C 1 1309 1309 NAG NAG . WA 6 NAG C 1 1310 1310 NAG NAG . XA 6 NAG D 1 1301 1301 NAG NAG . YA 6 NAG D 1 1302 1302 NAG NAG . ZA 6 NAG D 1 1303 1303 NAG NAG . AB 6 NAG D 1 1304 1304 NAG NAG . BB 6 NAG D 1 1305 1305 NAG NAG . CB 6 NAG D 1 1306 1306 NAG NAG . DB 6 NAG D 1 1307 1307 NAG NAG . EB 6 NAG D 1 1308 1308 NAG NAG . FB 6 NAG D 1 1309 1309 NAG NAG . GB 6 NAG D 1 1310 1310 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . VA 6 191.773 201.189 231.052 1 209.76 ? C1 NAG 1309 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . VA 6 190.984 201.596 232.293 1 209.76 ? C2 NAG 1309 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . VA 6 191.626 201.006 233.544 1 209.76 ? C3 NAG 1309 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . VA 6 191.785 199.498 233.396 1 209.76 ? C4 NAG 1309 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . VA 6 192.538 199.171 232.109 1 209.76 ? C5 NAG 1309 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . VA 6 192.628 197.688 231.837 1 209.76 ? C6 NAG 1309 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . VA 6 189.732 203.683 232.597 1 209.76 ? C7 NAG 1309 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . VA 6 189.813 205.177 232.682 1 209.76 ? C8 NAG 1309 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . VA 6 190.888 203.043 232.401 1 209.76 ? N2 NAG 1309 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . VA 6 190.818 201.302 234.677 1 209.76 ? O3 NAG 1309 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . VA 6 192.504 198.973 234.507 1 209.76 ? O4 NAG 1309 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . VA 6 191.864 199.759 230.986 1 209.76 ? O5 NAG 1309 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . VA 6 191.831 197.314 230.721 1 209.76 ? O6 NAG 1309 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . VA 6 188.667 203.082 232.701 1 209.76 ? O7 NAG 1309 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 14 #