data_8Y16 # _model_server_result.job_id GZhiYfDB27Jdn5xvjJl-Rw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-18 01:51:16' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8y16 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":1303}' # _entry.id 8Y16 # _exptl.entry_id 8Y16 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 37 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8Y16 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8Y16 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 AA N N ? 6 BA N N ? 6 CA N N ? 6 DA N N ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N ? 6 QA N N ? 6 RA N N ? 6 SA N N ? 6 TA N N ? 6 UA N N ? 6 VA N N ? 6 WA N N ? 6 XA N N ? 6 YA N N ? 6 ZA N N ? 6 AB N N ? 6 BB N N ? 6 CB N N ? 6 DB N N ? 6 EB N N ? 6 FB N N ? 6 GB N N ? 6 IB N N ? 6 JB N N ? 6 LB N N ? 6 MB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 702 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 706 NAG 3 n G BMA 3 G 3 BMA A 707 BMA 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 703 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 712 NAG 3 n H BMA 3 H 3 BMA A 713 BMA 4 n I NAG 1 I 1 NAG A 708 NAG 4 n I NAG 2 I 2 NAG A 709 NAG 4 n J NAG 1 J 1 NAG A 710 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG A 711 NAG 4 n K NAG 1 K 1 NAG B 1187 NAG 4 n K NAG 2 K 2 NAG B 1188 NAG 4 n L NAG 1 L 1 NAG B 1191 NAG 4 n L NAG 2 L 2 NAG B 1192 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG B 1207 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG B 1208 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG C 1188 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG C 1189 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG C 1207 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG C 1208 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG D 1189 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG D 1190 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG D 1207 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG D 1208 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG E 702 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG E 706 NAG 3 n R BMA 3 R 3 BMA E 707 BMA 3 n S NAG 1 S 1 NAG E 703 NAG 3 n S NAG 2 S 2 NAG E 712 NAG 3 n S BMA 3 S 3 BMA E 713 BMA 4 n T NAG 1 T 1 NAG E 708 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG E 709 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG E 710 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG E 711 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG F 702 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG F 706 NAG 3 n V BMA 3 V 3 BMA F 707 BMA 3 n W NAG 1 W 1 NAG F 703 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG F 712 NAG 3 n W BMA 3 W 3 BMA F 713 BMA 4 n X NAG 1 X 1 NAG F 708 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG F 709 NAG 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG F 710 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG F 711 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 115 A CYS 133 1_555 A SG CYS 123 A CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 326 A CYS 344 1_555 A SG CYS 343 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 512 A CYS 530 1_555 A SG CYS 524 A CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 130 B CYS 131 1_555 B SG CYS 164 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 288 B CYS 291 1_555 B SG CYS 298 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 376 B CYS 379 1_555 B SG CYS 429 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 477 B CYS 480 1_555 B SG CYS 484 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 613 B CYS 617 1_555 B SG CYS 645 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 658 B CYS 662 1_555 B SG CYS 667 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 734 B CYS 738 1_555 B SG CYS 756 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 739 B CYS 743 1_555 B SG CYS 745 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 1028 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1039 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 1078 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1122 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 130 C CYS 131 1_555 C SG CYS 164 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 288 C CYS 291 1_555 C SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 333 C CYS 336 1_555 C SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 376 C CYS 379 1_555 C SG CYS 429 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 477 C CYS 480 1_555 C SG CYS 484 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 613 C CYS 617 1_555 C SG CYS 645 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 658 C CYS 662 1_555 C SG CYS 667 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 734 C CYS 738 1_555 C SG CYS 756 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 739 C CYS 743 1_555 C SG CYS 745 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 1028 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1039 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 1078 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1122 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 130 D CYS 131 1_555 D SG CYS 164 D CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 288 D CYS 291 1_555 D SG CYS 298 D CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 376 D CYS 379 1_555 D SG CYS 429 D CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 477 D CYS 480 1_555 D SG CYS 484 D CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 613 D CYS 617 1_555 D SG CYS 645 D CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 658 D CYS 662 1_555 D SG CYS 667 D CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 734 D CYS 738 1_555 D SG CYS 756 D CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 739 D CYS 743 1_555 D SG CYS 745 D CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 D SG CYS 1028 D CYS 1032 1_555 D SG CYS 1039 D CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 1078 D CYS 1082 1_555 D SG CYS 1122 D CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf35 E SG CYS 115 E CYS 133 1_555 E SG CYS 123 E CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 E SG CYS 326 E CYS 344 1_555 E SG CYS 343 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 512 E CYS 530 1_555 E SG CYS 524 E CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf38 F SG CYS 115 F CYS 133 1_555 F SG CYS 123 F CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 F SG CYS 326 F CYS 344 1_555 F SG CYS 343 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf40 F SG CYS 512 F CYS 530 1_555 F SG CYS 524 F CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 35 A ASN 53 1_555 AA C1 NAG . A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 72 A ASN 90 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 85 A ASN 103 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 304 A ASN 322 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 414 A ASN 432 1_555 BA C1 NAG . A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 528 A ASN 546 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 279 B ASN 282 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 340 B ASN 343 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 351 B ASN 354 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 612 B ASN 616 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 705 B ASN 709 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 713 B ASN 717 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 797 B ASN 801 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 1070 B ASN 1074 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 1094 B ASN 1098 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 1130 B ASN 1134 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 279 C ASN 282 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 340 C ASN 343 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 351 C ASN 354 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 612 C ASN 616 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 705 C ASN 709 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 713 C ASN 717 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 797 C ASN 801 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 1070 C ASN 1074 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 1094 C ASN 1098 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 1130 C ASN 1134 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 62 D ASN 61 1_555 TA C1 NAG . D NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 121 D ASN 122 1_555 GB C1 NAG . D NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale31 D ND2 ASN 163 D ASN 165 1_555 UA C1 NAG . D NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 D ND2 ASN 279 D ASN 282 1_555 ZA C1 NAG . D NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale33 D ND2 ASN 328 D ASN 331 1_555 DB C1 NAG . D NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale34 D ND2 ASN 340 D ASN 343 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale35 D ND2 ASN 351 D ASN 354 1_555 CB C1 NAG . D NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale36 D ND2 ASN 599 D ASN 603 1_555 FB C1 NAG . D NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale37 D ND2 ASN 612 D ASN 616 1_555 VA C1 NAG . D NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale38 D ND2 ASN 653 D ASN 657 1_555 BB C1 NAG . D NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale39 D ND2 ASN 705 D ASN 709 1_555 WA C1 NAG . D NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale40 D ND2 ASN 713 D ASN 717 1_555 XA C1 NAG . D NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale41 D ND2 ASN 797 D ASN 801 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale42 D ND2 ASN 1070 D ASN 1074 1_555 AB C1 NAG . D NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale43 D ND2 ASN 1094 D ASN 1098 1_555 YA C1 NAG . D NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale44 D ND2 ASN 1130 D ASN 1134 1_555 EB C1 NAG . D NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale45 E ND2 ASN 35 E ASN 53 1_555 IB C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 E ND2 ASN 72 E ASN 90 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale47 E ND2 ASN 85 E ASN 103 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale48 E ND2 ASN 304 E ASN 322 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale49 E ND2 ASN 414 E ASN 432 1_555 JB C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 528 E ASN 546 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale51 F ND2 ASN 35 F ASN 53 1_555 LB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale52 F ND2 ASN 72 F ASN 90 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale53 F ND2 ASN 85 F ASN 103 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale54 F ND2 ASN 304 F ASN 322 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale55 F ND2 ASN 414 F ASN 432 1_555 MB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 F ND2 ASN 528 F ASN 546 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale57 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.39 ? covale ? covale58 G O4 NAG . G NAG 2 1_555 G C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale59 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale60 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? covale ? covale61 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale62 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? covale ? covale63 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale64 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? covale ? covale65 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? covale ? covale66 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? covale ? covale67 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? covale ? covale68 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale69 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? covale ? covale70 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.39 ? covale ? covale71 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale72 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale73 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? covale ? covale74 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale75 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? covale ? covale76 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? covale ? covale77 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale78 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale79 W O4 NAG . W NAG 2 1_555 W C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale80 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale81 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 356 A HIS 374 1_555 Z ZN ZN . A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 360 A HIS 378 1_555 Z ZN ZN . A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 384 A GLU 402 1_555 Z ZN ZN . A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 384 A GLU 402 1_555 Z ZN ZN . A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc5 E NE2 HIS 356 E HIS 374 1_555 HB ZN ZN . E ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc6 E NE2 HIS 360 E HIS 378 1_555 HB ZN ZN . E ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc7 E OE1 GLU 384 E GLU 402 1_555 HB ZN ZN . E ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc8 E OE2 GLU 384 E GLU 402 1_555 HB ZN ZN . E ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc9 F NE2 HIS 356 F HIS 374 1_555 KB ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc10 F NE2 HIS 360 F HIS 378 1_555 KB ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc11 F OE1 GLU 384 F GLU 402 1_555 KB ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc12 F OE2 GLU 384 F GLU 402 1_555 KB ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8Y16 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Z 5 ZN A 1 701 700 ZN ZN . AA 6 NAG A 1 702 701 NAG NAG . BA 6 NAG A 1 703 704 NAG NAG . CA 6 NAG B 1 1301 1182 NAG NAG . DA 6 NAG B 1 1302 1183 NAG NAG . EA 6 NAG B 1 1303 1184 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 1304 1185 NAG NAG . GA 6 NAG B 1 1305 1186 NAG NAG . HA 6 NAG B 1 1306 1194 NAG NAG . IA 6 NAG B 1 1307 1206 NAG NAG . JA 6 NAG B 1 1308 1209 NAG NAG . KA 6 NAG C 1 1301 1185 NAG NAG . LA 6 NAG C 1 1302 1186 NAG NAG . MA 6 NAG C 1 1303 1187 NAG NAG . NA 6 NAG C 1 1304 1192 NAG NAG . OA 6 NAG C 1 1305 1195 NAG NAG . PA 6 NAG C 1 1306 1206 NAG NAG . QA 6 NAG C 1 1307 1209 NAG NAG . RA 6 NAG C 1 1308 1210 NAG NAG . SA 6 NAG C 1 1309 1211 NAG NAG . TA 6 NAG D 1 1301 1181 NAG NAG . UA 6 NAG D 1 1302 1182 NAG NAG . VA 6 NAG D 1 1303 1185 NAG NAG . WA 6 NAG D 1 1304 1187 NAG NAG . XA 6 NAG D 1 1305 1188 NAG NAG . YA 6 NAG D 1 1306 1193 NAG NAG . ZA 6 NAG D 1 1307 1199 NAG NAG . AB 6 NAG D 1 1308 1200 NAG NAG . BB 6 NAG D 1 1309 1201 NAG NAG . CB 6 NAG D 1 1310 1206 NAG NAG . DB 6 NAG D 1 1311 1209 NAG NAG . EB 6 NAG D 1 1312 1210 NAG NAG . FB 6 NAG D 1 1313 1211 NAG NAG . GB 6 NAG D 1 1314 1212 NAG NAG . HB 5 ZN E 1 701 700 ZN ZN . IB 6 NAG E 1 702 701 NAG NAG . JB 6 NAG E 1 703 704 NAG NAG . KB 5 ZN F 1 701 700 ZN ZN . LB 6 NAG F 1 702 701 NAG NAG . MB 6 NAG F 1 703 704 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MA 6 183.87 224.816 276.147 1 30 ? C1 NAG 1303 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MA 6 183.066 225.769 277.031 1 30 ? C2 NAG 1303 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MA 6 181.629 225.278 277.174 1 30 ? C3 NAG 1303 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MA 6 181.006 225.065 275.801 1 30 ? C4 NAG 1303 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MA 6 181.883 224.137 274.966 1 30 ? C5 NAG 1303 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MA 6 181.387 223.98 273.548 1 30 ? C6 NAG 1303 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MA 6 183.895 224.959 279.215 1 30 ? C7 NAG 1303 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MA 6 184.551 225.359 280.501 1 30 ? C8 NAG 1303 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MA 6 183.687 225.947 278.335 1 30 ? N2 NAG 1303 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MA 6 180.873 226.235 277.907 1 30 ? O3 NAG 1303 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MA 6 179.71 224.495 275.936 1 30 ? O4 NAG 1303 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MA 6 183.215 224.665 274.881 1 30 ? O5 NAG 1303 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MA 6 182.313 224.518 272.615 1 30 ? O6 NAG 1303 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MA 6 183.571 223.796 278.988 1 30 ? O7 NAG 1303 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 34 _model_server_stats.parse_time_ms 26 _model_server_stats.create_model_time_ms 48 _model_server_stats.query_time_ms 354 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #