data_8Y4A # _model_server_result.job_id 9saSdmys2LwCnfOmQxQu6g _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 20:25:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8y4a # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":1305}' # _entry.id 8Y4A # _exptl.entry_id 8Y4A _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 39 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8Y4A _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8Y4A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 V N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 BA N N ? 7 CA N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 2 1 NAG NAG C8 H81 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n H NAG 1 F 1 NAG F 1 NAG 4 n H BMA 2 F 2 BMA F 2 BMA 4 n I NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 4 n I BMA 2 G 2 BMA G 2 BMA 4 n J NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 4 n J BMA 2 I 2 BMA I 2 BMA 5 n K NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG 6 n L NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 6 n L NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 6 n L BMA 3 K 3 BMA K 3 BMA 4 n M NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 4 n M BMA 2 M 2 BMA M 2 BMA 4 n N NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 4 n N BMA 2 N 2 BMA N 2 BMA 4 n O NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 4 n O BMA 2 O 2 BMA O 2 BMA 5 n P NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG P 2 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG Q 2 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 4 n R BMA 2 R 2 BMA R 2 BMA 4 n S NAG 1 S 1 NAG S 1 NAG 4 n S BMA 2 S 2 BMA S 2 BMA 4 n T NAG 1 T 1 NAG T 1 NAG 4 n T BMA 2 T 2 BMA T 2 BMA 5 n U NAG 1 U 1 NAG U 1 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG U 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 130 B CYS 131 1_555 A SG CYS 164 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 333 B CYS 336 1_555 A SG CYS 358 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 376 B CYS 379 1_555 A SG CYS 429 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 388 B CYS 391 1_555 A SG CYS 521 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 477 B CYS 480 1_555 A SG CYS 484 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 613 B CYS 617 1_555 A SG CYS 645 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 658 B CYS 662 1_555 A SG CYS 667 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 739 B CYS 743 1_555 A SG CYS 745 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 836 B CYS 840 1_555 A SG CYS 847 B CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 1028 B CYS 1032 1_555 A SG CYS 1039 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 1078 B CYS 1082 1_555 A SG CYS 1122 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 130 C CYS 131 1_555 B SG CYS 164 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 288 C CYS 291 1_555 B SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 333 C CYS 336 1_555 B SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 376 C CYS 379 1_555 B SG CYS 429 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 477 C CYS 480 1_555 B SG CYS 484 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 658 C CYS 662 1_555 B SG CYS 667 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 734 C CYS 738 1_555 B SG CYS 756 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 739 C CYS 743 1_555 B SG CYS 745 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 836 C CYS 840 1_555 B SG CYS 847 C CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 1028 C CYS 1032 1_555 B SG CYS 1039 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 1078 C CYS 1082 1_555 B SG CYS 1122 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 130 A CYS 131 1_555 C SG CYS 164 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 333 A CYS 336 1_555 C SG CYS 358 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf25 C SG CYS 376 A CYS 379 1_555 C SG CYS 429 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 C SG CYS 388 A CYS 391 1_555 C SG CYS 521 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf27 C SG CYS 477 A CYS 480 1_555 C SG CYS 484 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 C SG CYS 613 A CYS 617 1_555 C SG CYS 645 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 658 A CYS 662 1_555 C SG CYS 667 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 739 A CYS 743 1_555 C SG CYS 745 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 836 A CYS 840 1_555 C SG CYS 847 A CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 1028 A CYS 1032 1_555 C SG CYS 1039 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 1078 A CYS 1082 1_555 C SG CYS 1122 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 22 H CYS 22 1_555 D SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf35 E SG CYS 23 L CYS 23 1_555 E SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf36 F SG CYS 22 D CYS 22 1_555 F SG CYS 96 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf37 G SG CYS 23 E CYS 23 1_555 G SG CYS 88 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 62 B ASN 61 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 121 B ASN 122 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 163 B ASN 165 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 231 B ASN 234 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 242 B ASN 245 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 279 B ASN 282 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 340 B ASN 343 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 351 B ASN 354 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 599 B ASN 603 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 612 B ASN 616 1_555 V C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 653 B ASN 657 1_555 W C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 705 B ASN 709 1_555 X C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 713 B ASN 717 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 797 B ASN 801 1_555 H C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1070 B ASN 1074 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 1094 B ASN 1098 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 1130 B ASN 1134 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 62 C ASN 61 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 121 C ASN 122 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 163 C ASN 165 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 231 C ASN 234 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 242 C ASN 245 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 279 C ASN 282 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 340 C ASN 343 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 351 C ASN 354 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 599 C ASN 603 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 B ND2 ASN 612 C ASN 616 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 B ND2 ASN 653 C ASN 657 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 B ND2 ASN 705 C ASN 709 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 B ND2 ASN 713 C ASN 717 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 B ND2 ASN 797 C ASN 801 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 B ND2 ASN 1070 C ASN 1074 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 B ND2 ASN 1094 C ASN 1098 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale36 B ND2 ASN 1130 C ASN 1134 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 62 A ASN 61 1_555 CB C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 121 A ASN 122 1_555 DB C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 163 A ASN 165 1_555 EB C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 231 A ASN 234 1_555 FB C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 242 A ASN 245 1_555 GB C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 279 A ASN 282 1_555 HB C1 NAG . A NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 C ND2 ASN 328 A ASN 331 1_555 UA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale44 C ND2 ASN 340 A ASN 343 1_555 AB C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale45 C ND2 ASN 351 A ASN 354 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 C ND2 ASN 599 A ASN 603 1_555 BB C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale47 C ND2 ASN 612 A ASN 616 1_555 VA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale48 C ND2 ASN 653 A ASN 657 1_555 WA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale49 C ND2 ASN 705 A ASN 709 1_555 XA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale50 C ND2 ASN 713 A ASN 717 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale51 C ND2 ASN 797 A ASN 801 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale52 C ND2 ASN 1070 A ASN 1074 1_555 YA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale53 C ND2 ASN 1094 A ASN 1098 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale54 C ND2 ASN 1130 A ASN 1134 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale55 H O4 NAG . F NAG 1 1_555 H C1 BMA . F BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 BMA . G BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale57 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 BMA . I BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale58 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale59 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C8 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale ? covale60 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale61 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 BMA . M BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale62 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 BMA . N BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale63 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 BMA . O BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale64 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale65 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale66 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 BMA . R BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale67 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 BMA . S BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale68 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 BMA . T BMA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale69 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8Y4A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 7 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . W 7 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . X 7 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . Y 7 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . Z 7 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . AA 7 NAG B 1 1306 1306 NAG NAG . BA 7 NAG B 1 1307 1307 NAG NAG . CA 7 NAG B 1 1308 1308 NAG NAG . DA 7 NAG B 1 1309 1309 NAG NAG . EA 7 NAG B 1 1310 1310 NAG NAG . FA 7 NAG B 1 1311 1311 NAG NAG . GA 7 NAG B 1 1312 1312 NAG NAG . HA 7 NAG B 1 1313 1313 NAG NAG . IA 7 NAG C 1 1301 1301 NAG NAG . JA 7 NAG C 1 1302 1302 NAG NAG . KA 7 NAG C 1 1303 1303 NAG NAG . LA 7 NAG C 1 1304 1304 NAG NAG . MA 7 NAG C 1 1305 1305 NAG NAG . NA 7 NAG C 1 1306 1306 NAG NAG . OA 7 NAG C 1 1307 1307 NAG NAG . PA 7 NAG C 1 1308 1308 NAG NAG . QA 7 NAG C 1 1309 1309 NAG NAG . RA 7 NAG C 1 1310 1310 NAG NAG . SA 7 NAG C 1 1311 1311 NAG NAG . TA 7 NAG C 1 1312 1312 NAG NAG . UA 7 NAG A 1 1301 1301 NAG NAG . VA 7 NAG A 1 1302 1302 NAG NAG . WA 7 NAG A 1 1303 1303 NAG NAG . XA 7 NAG A 1 1304 1304 NAG NAG . YA 7 NAG A 1 1305 1305 NAG NAG . ZA 7 NAG A 1 1306 1306 NAG NAG . AB 7 NAG A 1 1307 1307 NAG NAG . BB 7 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . CB 7 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . DB 7 NAG A 1 1310 1310 NAG NAG . EB 7 NAG A 1 1311 1311 NAG NAG . FB 7 NAG A 1 1312 1312 NAG NAG . GB 7 NAG A 1 1313 1313 NAG NAG . HB 7 NAG A 1 1314 1314 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . YA 7 216.841 212.64 251.693 1 74.05 ? C1 NAG 1305 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . YA 7 215.599 213.404 251.22 1 70.64 ? C2 NAG 1305 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . YA 7 215.817 213.945 249.809 1 73.06 ? C3 NAG 1305 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . YA 7 217.094 214.77 249.745 1 72.25 ? C4 NAG 1305 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . YA 7 218.272 213.948 250.255 1 74.54 ? C5 NAG 1305 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . YA 7 219.556 214.741 250.324 1 74.31 ? C6 NAG 1305 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . YA 7 213.249 212.952 251.783 1 72.09 ? C7 NAG 1305 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . YA 7 213.212 214.34 252.35 1 66.61 ? C8 NAG 1305 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . YA 7 214.416 212.56 251.261 1 70.34 ? N2 NAG 1305 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . YA 7 214.702 214.742 249.425 1 74.64 ? O3 NAG 1305 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . YA 7 217.347 215.17 248.403 1 72.02 ? O4 NAG 1305 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . YA 7 218 213.485 251.586 1 72.84 ? O5 NAG 1305 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . YA 7 219.497 215.893 249.495 1 73.56 ? O6 NAG 1305 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . YA 7 212.267 212.217 251.8 1 74.01 ? O7 NAG 1305 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 31 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 114 _model_server_stats.query_time_ms 325 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #